Free-breathing 3 T magnetic resonance t(2)-mapping of the heart.

OBJECTIVES: This study sought to establish an accurate and reproducible T(2)-mapping cardiac magnetic resonance (CMR) methodology at 3 T and to evaluate it in healthy volunteers and patients with myocardial infarct. BACKGROUND: Myocardial edema affects the T(2) relaxation time on CMR. Therefore, T(2)-mapping has been established to characterize edema at 1.5 T. A 3 T implementation designed for longitudinal studies and aimed at guiding and monitoring therapy remains to be implemented, thoroughly characterized, and evaluated in vivo. METHODS: A free-breathing navigator-gated radial CMR pulse sequence with an adiabatic T(2) preparation module and an empirical fitting equation for T(2) quantification was optimized using numerical simulations and was validated at 3 T in a phantom study. Its reproducibility for myocardial T(2) quantification was then ascertained in healthy volunteers and improved using an external reference phantom with known T(2). In a small cohort of patients with established myocardial infarction, the local T(2) value and extent of the edematous region were determined and compared with conventional T(2)-weighted CMR and x-ray coronary angiography, where available. RESULTS: The numerical simulations and phantom study demonstrated that the empirical fitting equation is significantly more accurate for T(2) quantification than that for the more conventional exponential decay. The volunteer study consistently demonstrated a reproducibility error as low as 2 ± 1% using the external reference phantom and an average myocardial T(2) of 38.5 ± 4.5 ms. Intraobserver and interobserver variability in the volunteers were -0.04 ± 0.89 ms (p = 0.86) and -0.23 ± 0.91 ms (p = 0.87), respectively. In the infarction patients, the T(2) in edema was 62.4 ± 9.2 ms and was consistent with the x-ray angiographic findings. Simultaneously, the extent of the edematous region by T(2)-mapping correlated well with that from the T(2)-weighted images (r = 0.91). CONCLUSIONS: The new, well-characterized 3 T methodology enables robust and accurate cardiac T(2)-mapping at 3 T with high spatial resolution, while the addition of a reference phantom improves reproducibility. This technique may be well suited for longitudinal studies in patients with suspected or established heart disease.

Interpretation of wind components as compositional variables

The classical statistical study of the wind speed in the atmospheric surface layer is madegenerally from the analysis of the three habitual components that perform the wind data,that is, the component W-E, the component S-N and the vertical component,considering these components independent.When the goal of the study of these data is the Aeolian energy, so is when wind isstudied from an energetic point of view and the squares of wind components can beconsidered as compositional variables. To do so, each component has to be divided bythe module of the corresponding vector.In this work the theoretical analysis of the components of the wind as compositionaldata is presented and also the conclusions that can be obtained from the point of view ofthe practical applications as well as those that can be derived from the application ofthis technique in different conditions of weather

Towards a real-time vision-based navigation system for a small-class UUV

This paper deals with the problem of navigation for an unmanned underwater vehicle (UUV) through image mosaicking. It represents a first step towards a real-time vision-based navigation system for a small-class low-cost UUV. We propose a navigation system composed by: (i) an image mosaicking module which provides velocity estimates; and (ii) an extended Kalman filter based on the hydrodynamic equation of motion, previously identified for this particular UUV. The obtained system is able to estimate the position and velocity of the robot. Moreover, it is able to deal with visual occlusions that usually appear when the sea bottom does not have enough visual features to solve the correspondence problem in a certain area of the trajectory

Adding QoS protection in order to enhance MPLS QoS routing

In this paper, a method for enhancing current QoS routing methods by means of QoS protection is presented. In an MPLS network, the segments (links) to be protected are predefined and an LSP request involves, apart from establishing a working path, creating a specific type of backup path (local, reverse or global). Different QoS parameters, such as network load balancing, resource optimization and minimization of LSP request rejection should be considered. QoS protection is defined as a function of QoS parameters, such as packet loss, restoration time, and resource optimization. A framework to add QoS protection to many of the current QoS routing algorithms is introduced. A backup decision module to select the most suitable protection method is formulated and different case studies are analyzed

MAPI: towards the integrated exploitation of bioinformatics Web Services.

BACKGROUND. Bioinformatics is commonly featured as a well assorted list of available web resources. Although diversity of services is positive in general, the proliferation of tools, their dispersion and heterogeneity complicate the integrated exploitation of such data processing capacity. RESULTS. To facilitate the construction of software clients and make integrated use of this variety of tools, we present a modular programmatic application interface (MAPI) that provides the necessary functionality for uniform representation of Web Services metadata descriptors including their management and invocation protocols of the services which they represent. This document describes the main functionality of the framework and how it can be used to facilitate the deployment of new software under a unified structure of bioinformatics Web Services. A notable feature of MAPI is the modular organization of the functionality into different modules associated with specific tasks. This means that only the modules needed for the client have to be installed, and that the module functionality can be extended without the need for re-writing the software client. CONCLUSIONS. The potential utility and versatility of the software library has been demonstrated by the implementation of several currently available clients that cover different aspects of integrated data processing, ranging from service discovery to service invocation with advanced features such as workflows composition and asynchronous services calls to multiple types of Web Services including those registered in repositories (e.g. GRID-based, SOAP, BioMOBY, R-bioconductor, and others).

Blood pressure loci identified with a gene-centric array.

Raised blood pressure (BP) is a major risk factor for cardiovascular disease. Previous studies have identified 47 distinct genetic variants robustly associated with BP, but collectively these explain only a few percent of the heritability for BP phenotypes. To find additional BP loci, we used a bespoke gene-centric array to genotype an independent discovery sample of 25,118 individuals that combined hypertensive case-control and general population samples. We followed up four SNPs associated with BP at our p < 8.56 × 10(-7) study-specific significance threshold and six suggestively associated SNPs in a further 59,349 individuals. We identified and replicated a SNP at LSP1/TNNT3, a SNP at MTHFR-NPPB independent (r(2) = 0.33) of previous reports, and replicated SNPs at AGT and ATP2B1 reported previously. An analysis of combined discovery and follow-up data identified SNPs significantly associated with BP at p < 8.56 × 10(-7) at four further loci (NPR3, HFE, NOS3, and SOX6). The high number of discoveries made with modest genotyping effort can be attributed to using a large-scale yet targeted genotyping array and to the development of a weighting scheme that maximized power when meta-analyzing results from samples ascertained with extreme phenotypes, in combination with results from nonascertained or population samples. Chromatin immunoprecipitation and transcript expression data highlight potential gene regulatory mechanisms at the MTHFR and NOS3 loci. These results provide candidates for further study to help dissect mechanisms affecting BP and highlight the utility of studying SNPs and samples that are independent of those studied previously even when the sample size is smaller than that in previous studies.

Expression of non-TLR pattern recognition receptors in the spleen of BALB/c mice infected with Plasmodium yoelii and Plasmodium chabaudi chabaudi AS

The spleen plays a crucial role in the development of immunity to malaria, but the role of pattern recognition receptors (PRRs) in splenic effector cells during malaria infection is poorly understood. In the present study, we analysed the expression of selected PRRs in splenic effector cells from BALB/c mice infected with the lethal and non-lethal Plasmodium yoelii strains 17XL and 17X, respectively, and the non-lethal Plasmodium chabaudi chabaudi AS strain. The results of these experiments showed fewer significant changes in the expression of PRRs in AS-infected mice than in 17X and 17XL-infected mice. Mannose receptor C type 2 (MRC2) expression increased with parasitemia, whereas Toll-like receptors and sialoadhesin (Sn) decreased in mice infected with P. chabaudi AS. In contrast, MRC type 1 (MRC1), MRC2 and EGF-like module containing mucin-like hormone receptor-like sequence 1 (F4/80) expression decreased with parasitemia in mice infected with 17X, whereas MRC1 an MRC2 increased and F4/80 decreased in mice infected with 17XL. Furthermore, macrophage receptor with collagenous structure and CD68 declined rapidly after initial parasitemia. SIGNR1 and Sn expression demonstrated minor variations in the spleens of mice infected with either strain. Notably, macrophage scavenger receptor (Msr1) and dendritic cell-associated C-type lectin 2 expression increased at both the transcript and protein levels in 17XL-infected mice with 50% parasitemia. Furthermore, the increased lethality of 17X infection in Msr1 -/- mice demonstrated a protective role for Msr1. Our results suggest a dual role for these receptors in parasite clearance and protection in 17X infection and lethality in 17XL infection.

The prognostic value of health-related quality-of-life data in predicting survival in glioblastoma cancer patients: results from an international randomised phase III EORTC Brain Tumour and Radiation Oncology Groups, and NCIC Clinical Trials Group study.

This is one of the few studies that have explored the value of baseline symptoms and health-related quality of life (HRQOL) in predicting survival in brain cancer patients. Baseline HRQOL scores (from the EORTC QLQ-C30 and the Brain Cancer Module (BN 20)) were examined in 490 newly diagnosed glioblastoma cancer patients for the relationship with overall survival by using Cox proportional hazards regression models. Refined techniques as the bootstrap re-sampling procedure and the computation of C-indexes and R(2)-coefficients were used to try and validate the model. Classical analysis controlled for major clinical prognostic factors selected cognitive functioning (P=0.0001), global health status (P=0.0055) and social functioning (P<0.0001) as statistically significant prognostic factors of survival. However, several issues question the validity of these findings. C-indexes and R(2)-coefficients, which are measures of the predictive ability of the models, did not exhibit major improvements when adding selected or all HRQOL scores to clinical factors. While classical techniques lead to positive results, more refined analyses suggest that baseline HRQOL scores add relatively little to clinical factors to predict survival. These results may have implications for future use of HRQOL as a prognostic factor in cancer patients.

Function and regulation of the scaffold protein IB1/JIP-1 in the uro-genital tract.

RESUME Ce mémoire de thèse traite de l'étude de la « scaffold »protéine ou protéine «échafaud», « Islet-Brain1/ JNK Interacting Protein 1 » (IB1/JIP-1) dans la vessie et la prostate, deux organes importants de l'appareil uro-genital. Cette protéine, mise en évidence dans notre laboratoire à la fin des année 90, a été reconnue pour réguler la voie de signalisation des « Mitogen-Activated Protein Kinases » (MAPKs), et en particulier de la MAPK appelée c-Jun N-terminal Kinase (JNK). Le réseau de voie de signalisation permet aux cellules de percevoir les changements dans le milieu extracellulaire et de permettre une réponse appropriée à ces différents stimuli. La connaissance des voies de signalisation a permis de mettre en évidence leur rôle crucial tant dans l'homéostase des tissus sains que dans des processus pathologiques comme l'oncogenèse. Parmi une vingtaine de voie de signalisation, la voie de signalisation des «MAPKinases » est une des plus importantes et a été montrée pour participer à diverses fonctions cellulaires telles que la différentiation, la motilité, la division et la mort cellulaire. La voie de signalisation des « MAPKinases » est typiquement constituée d'un module de trois kinases qui s'activent séquentiellement par phosphorylation. On note la présence d'une MAPK, d'un activateur de MAPK et d'un activateur de l'activateur de MAPK. Une fois la MAPK activée, elle permettra la régulation de différentes cibles dont certain facteur de transcription. Chez les mammifères, il existe 3 grands groupes de MAPKs : the extracellular signal-regulated kinase 1 and 2 (ERK 1/2) cascade, qui régule préférentiellement la croissance et la différentiation cellulaire, ainsi que les cascades JNK et p38 qui régulent préférentiellement la réponse à différents stress cellulaires telle que l'inflammation ou l'apoptose. JNK est activé par différents stress cellulaire telle que les cytokines inflammatoires. JNK est également requis au cours du développement embryonnaire et contribue à la mort (apoptose) ou à la prolifération cellulaire. Plusieurs études ont mis en évidence le rôle de JNK durant le processus tumoral, sans que son rôle soit clairement identifié. JNK pourrait avoir des fonctions différentes durant l'initiation puis de la progression tumorale. Chez les mammifères, les voies de signalisation intracellulaires forment un réseau complexe et elles interagissent entre elles, ce qui permet aux cellules une réponse adéquate aux multitudes de stimuli existants dans les organismes pluricellulaires. Parmi plusieurs mécanismes de régulation, les protéines dites « scaffold » ou «échafaud » jouent un rôle crucial dans l'homéostase de la voie de signalisation des «MAPKinase ». L'introduction revoit brièvement ces différents aspects, de la voie de signalisation des «MAPKinase et des connaissance sur IB1/JIP-1. Les premières études effectuées sur IB1/JIP-1 ont montré une expression relativement spécifique de cette protéine dans certains types de neurones ainsi que dans la cellule beta-sécrétrice d'insuline. IB1/JIP-1 régule la voie de signalisation JNK par interaction avec les différents composants du module, modifiant ainsi le spectre de substrats activés par JNK. La fonction précise de IB1/JIP-1 n'était pas encore élucidée, mais plusieurs travaux mettaient en lumière un rôle dans la régulation, et la sous-location cellulaire des composants de la voie de signalisation JNK, ainsi que dans la survie cellulaire à certain stress. Cette expression relativement spécifique est intrigante car elle suggère que sa présence serait nécessaire à une régulation spécifique de la MAPKinase JNK ou à certaines autres fonctions cellulaires également spécifiques de certains tissus. Le premier but de ce travail a consisté à mettre en évidence l'expression de IB1/JIP-1 dans l'appareil uro-génital et plus particulièrement dans la vessie et la prostate. Nos résultats ont montré que IB1/JIP-1 est spécifiquement exprimé au niveau de l'urothélium vésical, mais pas dans le muscle lisse. Il en est de même au niveau de la prostate où IB1/JIP-1 est exprimé spécifiquement au niveau de l'épithélium sécrétoire et absent au niveau du stroma fibro-musculaire. La vessie et la prostate sont des organes ou l'activité JNK pourrait être crucial tant dans l' homeostase tissulaire que dans le développement de pathologies bénignes ou malignes. La vessie et la prostate sont le siège fréquent de tumeur. La base pour le développement du cancer est complexe et implique plusieurs anomalies génétiques. Ce processus complexe lié au développement tumoral est encore loin d`être complètement élucidé, raison pour laquelle il est crucial de poursuivre l'étude des différents gènes pouvant être impliqué dans ces processus ou pouvant être utilisé comme outil thérapeutique. Dans l'urothelium de la vessie, la fonction de la MAPK JNK n'a été que très peu étudiée. Il existe quelques études, in vitro, suggérant une implication possible de cette voie de signalisation dans des processus telle que le développement ou la progression tumorale. Le chapitre 1 décrit une étude in vivo dans la vessie un modèle de stress mécanique, connu pour activer les MAPKinase. La dilatation vésicale, due à une obstruction urétrale, a mis en évidence une diminution de l'expression de IB1/JIP-1 ainsi qu'une activation de la MAPKinase JNK. Dans ce modèle, la régulation de IB1/JIP-1, par l'intermédiaire d'un vecteur viral, a permis de démontrer que IB1/JIP-1 régulait l'activité de JNK dans ce tissu. Pour poursuivre l'étude de cette fonction d' IB1/JIP-1 dans l'urothélium, nous avons investigué l'activité JNK dans des souris génétiquement modifiées et porteuse d'une délétion de 1 des 2 allèles du gène codant pour IB1/JIP-1, avec un contenu en IB1/JIP-1 diminué de moitié. L'activation de JNK est également augmentée dans l'urothelium au repos de ces souris, ce qui confirme la fonction régulatrice de JNK par IB1/JIP-1. Ces résultats ont permis de mettre en évidence un rôle critique de celle-ci dans l'homéostase de I`urothelium et suggère une nouvelle cible pour réguler la voie de signalisation dans ce tissu. En outre, la modulation des niveaux d'expression d'IB1/JIP-1 dans la vessie, in vivo, par l'intermédiaire de vecteurs viraux s'est révélée réalisable et indique un moyen élégant pour développer une thérapie génique dans cet organe. Un autre élément de ce travail de thèse, révélée au chapitre 2, a été d'étudier la régulation dans la vessie de rat de la communication intercellulaire de type « GAP ». Les cellules adjacentes partagent des ions, messagers secondaires et des petits métabolites par l'intermédiaire de canaux intercellulaire qui forment les jonctions de type « GAP ». Ce type de communications intercellulaire permet une activité cellulaire coordonnée, une caractéristique importante pour l'homéostase des organismes multicellulaire. Ce type de communication intercellulaire est formé de 2 demi-canaux appelés connexons. Chaque connexon est formé de six protéines appelées connexins (Cx). Il existe environ vingt connexines différentes nommées par leur poids moléculaire respectif. Les jonctions de type canaux "GAP" permettent aux cellules de communiquer avec les cellules voisines au quelles elles sont mécaniquement ou électriquement couplées. La vessie peut être particulièrement dépendante de la communication intercellulaire par les canaux « Gap » qui permettrait de coordonner la réponse de la musculature ainsi que de l'urothélium à l'augmentation de la pression transmurale du à l'accumulation d'urine, situation fréquemment observée dans le cadre de l'hyperplasie bénigne de la prostate. Dans la vessie de rat, la connexine26 est exprimée uniquement dans l'urothelium. La Cx26, a été montrée pour être un possible « tumor suppressor gene » dans le cancer de vessie. Une augmentation de la Cx26 ainsi que du couplage des cellules urothéliales a été démontré dans notre modèle de stress mécanique sur la vessie de rat et est dépendante de 2 éléments de réponses connues pour interagir avec AP-1. La régulation de IB1/JIP-1 a permis de montrer que celle-ci régulait l'activité JNK, ainsi que l'activité du facteur de transcription AP-1, composé de c-Jun lui-même cible de JNK. Cette réduction de l'activité de AP-1 est associée à une diminution de l'expression du transcipt de la Cx26. En résumé, la Cx26 pourrait être régulée par le complexe AP-1 lui-même dépendant du contenu en IB1/JIP-1. Dans le chapitre 3, l'étude de IB1/J1P-1 s'est portée sur la prostate. Cet organe, siège fréquent de pathologie telle que le cancer ou l'hyperplasie bénigne de la prostate, exprime IB1/JIP-1 au niveau de son épithélium sécrétoire. Cette expression est maintenue dans une lignée cellulaire humaine largement étudiée est reconnue comme un modèle adéquat de cellules tumorales de type androgène-sensible. IB1/JIP-1 a été investigué dans un modèle in vitro d'apoptose en réponse à un agent appelé N-(4-hydroxyphenyl)retinamide (4-HPR) qui induit une activation de la MAPK JNK ainsi que également un diminution du contenu en IB1/JIP-1. La surexpression de IB1/JIP-1 en utilisant à nouveau des virus comme vecteur a démontré que IB1/JIP-1 était capable de réguler l'activité de JNK ainsi que les taux d'apoptose. Dans le cancer de la prostate, certains travaux ont montré que la différentiation neuroendocrine des cellules tumorales est associée à la progression tumorale et à la perte de sensibilité aux androgènes. Ce travail a permis de dévoiler l'augmentation d'expression de IB1/JIP-1 dans un modèle de neurodifferentiation des cellules d'une lignée prostatique humaine (LNCaP). Les mécanismes qui permettent une expression spécifique de IB1/JIP-1 ont été partiellement investiguée dans notre laboratoire. Son promoteur humain contient un « Neuron Restricive Silencer Element » (NRSE) connu pour se lier a répresseur transcriptionel appelé « RE-1 Silencer Transcription Factor » ou « Neuron Restrictive Silencer Factor » (REST/NRSF). NRSF/REST est capable de réprimer l'expression de gènes neuronaux en dehors du système neuronal. Il prend part à la différentiation terminale des gènes neuronaux. Dans le chapitre 3, on observe que l'activité de REST/NRSF est diminuée dans les cellules LNCaP qui se transdifferencient de manière neuroendocrine, et que REST/NRSF est capable de moduler l'expression de ces gènes cibles dans ce type cellulaire. Ces travaux laissent suggérer que NRSF/REST participe à l'acquisition du phénotype neuroendocrinien et pourrait être une cible pour réguler ce phénomène. En conclusion, ce travail de thèse présente l'expression de IB1/JIP-1 dans 2 organes de l'appareil uro-génital ; la vessie et la prostate. La fonction de IB1/JIP-1 a été étudiée in vivo dans la vessie de rat, ce qui a mis en évidence sa fonction régulatrice de l'activité de la MAPKinase JNK, et de l'activité du facteur de transcription AP-1 ; ainsi que sa possible implication régulatrice de gène cible tel que la Connexin 26 (Cx26). AP-1 et la Cx26 pourraient jouer un rôle dans le processus oncologique, tant dans le control de l'invasion cellulaire ou le control de la croissance cellulaire. Dans la prostate, IB1/JIP-1 régule également l'activité JNK; crucial dans la transmission de certains stimulis pro-apoptotiques. Dans un modèle de transdifférenciation neuroendocrinienne, phénotype possiblement lié au caractère agressif du cancer de la prostate, l'expression de IB1/JIP-1 est augmenté, suggérant soit un rôle possible dans le développement du phénotype neuronal ou une implication dans une fonction anti-apoptotique. Ce travail a donc permis d'élargir nos connaissances sur la régulation et le control de la voie de signalisation des MAPKinases par IB1/JIP-1, qui pourrait avoir encore d'autres fonctions dans ces tissus.

Integrating Metalib and SFX into the BV-SSPA

Introduction To guarantee the success of a virtual library it is essential that all users can access all the library resources independently of the user’s location. Achieving this goal in the Andalusian Public Health System has been a particularly difficult task, due to it is made up of 10 research centers and 95.000 health-care professionals. Aims Since the BV-SSPA started three years ago, one of its mayor aims has been to provide remote access to all its resources in this complex scenario, as well as facilitate the access to the virtual library to both professionals and citizens. IP access was guaranteed because health-care professionals could access everything from their workplaces thanks to the intranet, but it was restricted when they were not there. The BV-SSPA solved this problem by installing a federated authentication and authorization system called PAPI and a PAPI rewriting proxy. After three years the BV-SSPA has met a new challenge: adapting its federated access system to Metalib and SFX, specifically the access management module PDS had to be connected with the existing PAPI system. This new challenge came along with the introduction of a new metasearcher and link resolver. Material and Methods Initially there were three independent systems: • A Metalib and SFX PDS module, • A federated authentication and authorization system: PAPI. • A PAPI Rewriting Proxy. The chosen solution went through the reutilization of the existing software. To achieve this goal, a PHP connector between these applications was developed and several modules in the PDS configuration were modified. On the other hand, providing a simplified access to Metalib has been solved using Xerxes and integrating it in a Drupal website. Results Thanks to this connector the BV-SSPA was able to get all its users remotely accessing its new metasearcher without changing the way they used to validate, or without having to remember a new username and password. Futhermore, thanks to Xerxes, it is possible to use Metalib from a simple interface and without having to leave the BV-SSPA website to go its native interface.

Timetable database restructuring

Heriot-Watt University uses a software package called Syllabus Plus for its timetabling. This package can perform scheduling functions however it is currently employed only as a room booking system at present. In academic session 2008-2009 the university will be restructuring its academic year from 3 terms of 10 weeks to semesters of 14 weeks and therefore major changes will be required to the timetabling information. This project has two functions, both with practical and relevant applications to the timetabling of the university. The aims of the project are the ability to change population number of modules and activities, delete term 3 modules and activities, the ability to change module and activity name, and change the teaching week pattern from the semester

Telehealth system (e-CUIDATE) to improve quality of life in breast cancer survivors: rationale and study protocol for a randomized clinical trial.

BACKGROUND Breast cancer survivors suffer physical impairment after oncology treatment. This impairment reduces quality of life (QoL) and increase the prevalence of handicaps associated to unhealthy lifestyle (for example, decreased aerobic capacity and strength, weight gain, and fatigue). Recent work has shown that exercise adapted to individual characteristics of patients is related to improved overall and disease-free survival. Nowadays, technological support using telerehabilitation systems is a promising strategy with great advantage of a quick and efficient contact with the health professional. It is not known the role of telerehabilitation through therapeutic exercise as a support tool to implement an active lifestyle which has been shown as an effective resource to improve fitness and reduce musculoskeletal disorders of these women. METHODS / DESIGN This study will use a two-arm, assessor blinded, parallel randomized controlled trial design. People will be eligible if: their diagnosis is of stages I, II, or IIIA breast cancer; they are without chronic disease or orthopedic issues that would interfere with ability to participate in a physical activity program; they had access to the Internet and basic knowledge of computer use or living with a relative who has this knowledge; they had completed adjuvant therapy except for hormone therapy and not have a history of cancer recurrence; and they have an interest in improving lifestyle. Participants will be randomized into e-CUIDATE or usual care groups. E-CUIDATE give participants access to a range of contents: planning exercise arranged in series with breathing exercises, mobility, strength, and stretching. All of these exercises will be assigned to women in the telerehabilitation group according to perceived needs. The control group will be asked to maintain their usual routine. Study endpoints will be assessed after 8 weeks (immediate effects) and after 6 months. The primary outcome will be QoL measured by The European Organization for Research and Treatment of Cancer Quality of Life Questionnaire Core 30 version 3.0 and breast module called The European Organization for Research and Treatment of Cancer Breast Cancer-Specific Quality of Life questionnaire. The secondary outcomes: pain (algometry, Visual Analogue Scale, Brief Pain Inventory short form); body composition; physical measurement (abdominal test, handgrip strength, back muscle strength, and multiple sit-to-stand test); cardiorespiratory fitness (International Fitness Scale, 6-minute walk test, International Physical Activity Questionnaire-Short Form); fatigue (Piper Fatigue Scale and Borg Fatigue Scale); anxiety and depression (Hospital Anxiety and Depression Scale); cognitive function (Trail Making Test and Auditory Consonant Trigram); accelerometry; lymphedema; and anthropometric perimeters. DISCUSSION This study investigates the feasibility and effectiveness of a telerehabilitation system during adjuvant treatment of patients with breast cancer. If this treatment option is effective, telehealth systems could offer a choice of supportive care to cancer patients during the survivorship phase. TRIAL REGISTRATION ClinicalTrials.gov Identifier: NCT01801527.

A temporal hierarchy for conspecific vocalization discrimination in humans.

Introduction: Discrimination of species-specific vocalizations is fundamental for survival and social interactions. Its unique behavioral relevance has encouraged the identification of circumscribed brain regions exhibiting selective responses (Belin et al., 2004), while the role of network dynamics has received less attention. Those studies that have examined the brain dynamics of vocalization discrimination leave unresolved the timing and the inter-relationship between general categorization, attention, and speech-related processes (Levy et al., 2001, 2003; Charest et al., 2009). Given these discrepancies and the presence of several confounding factors, electrical neuroimaging analyses were applied to auditory evoked-potential (AEPs) to acoustically and psychophysically controlled non-verbal human and animal vocalizations. This revealed which region(s) exhibit voice-sensitive responses and in which sequence. Methods: Subjects (N=10) performed a living vs. man-made 'oddball' auditory discrimination task, such that on a given block of trials 'target' stimuli occurred 10% of the time. Stimuli were complex, meaningful sounds of 500ms duration. There were 120 different sound files in total, 60 of which represented sounds of living objects and 60 man-made objects. The stimuli that were the focus of the present investigation were restricted to those of living objects within blocks where no response was required. These stimuli were further sorted between human non-verbal vocalizations and animal vocalizations. They were also controlled in terms of their spectrograms and formant distributions. Continuous 64-channel EEG was acquired through Neuroscan Synamps referenced to the nose, band-pass filtered 0.05-200Hz, and digitized at 1000Hz. Peri-stimulus epochs of continuous EEG (-100ms to 900ms) were visually inspected for artifacts, 40Hz low-passed filtered and baseline corrected using the pre-stimulus period . Averages were computed from each subject separately. AEPs in response to animal and human vocalizations were analyzed with respect to differences of Global Field Power (GFP) and with respect to changes of the voltage configurations at the scalp (reviewed in Murray et al., 2008). The former provides a measure of the strength of the electric field irrespective of topographic differences; the latter identifies changes in spatial configurations of the underlying sources independently of the response strength. In addition, we utilized the local auto-regressive average distributed linear inverse solution (LAURA; Grave de Peralta Menendez et al., 2001) to visualize and statistically contrast the likely underlying sources of effects identified in the preceding analysis steps. Results: We found differential activity in response to human vocalizations over three periods in the post-stimulus interval, and this response was always stronger than that to animal vocalizations. The first differential response (169-219ms) was a consequence of a modulation in strength of a common brain network localized into the right superior temporal sulcus (STS; Brodmann's Area (BA) 22) and extending into the superior temporal gyrus (STG; BA 41). A second difference (291-357ms) also followed from strength modulations of a common network with statistical differences localized to the left inferior precentral and prefrontal gyrus (BA 6/45). These two first strength modulations correlated (Spearman's rho(8)=0.770; p=0.009) indicative of functional coupling between temporally segregated stages of vocalization discrimination. A third difference (389-667ms) followed from strength and topographic modulations and was localized to the left superior frontal gyrus (BA10) although this third difference did not reach our spatial criterion of 12 continuous voxels. Conclusions: We show that voice discrimination unfolds over multiple temporal stages, involving a wide network of brain regions. The initial stages of vocalization discrimination are based on modulations in response strength within a common brain network with no evidence for a voice-selective module. The latency of this effect parallels that of face discrimination (Bentin et al., 2007), supporting the possibility that voice and face processes can mutually inform one another. Putative underlying sources (localized in the right STS; BA 22) are consistent with prior hemodynamic imaging evidence in humans (Belin et al., 2004). Our effect over the 291-357ms post-stimulus period overlaps the 'voice-specific-response' reported by Levy et al. (Levy et al., 2001) and the estimated underlying sources (left BA6/45) were in agreement with previous findings in humans (Fecteau et al., 2005). These results challenge the idea that circumscribed and selective areas subserve con-specific vocalization processing.

The role of nonhematopoietic MHC class II expression in immune responses and tolerance

Si les rôles fonctionnels de diverses cellules immunitaires infiltrant des tissus enflammés sont assez bien compris, par contre, étonnamment, on connaît bien moins la capacité des cellules non hématopoïétiques résidant dans des tissus, à moduler l'activité biologique des cellules immunitaires immigrantes, et donc le résultat de la réponse immunitaire. La présentation des antigènes, dans le contexte des molécules du CMH de classe II (CMHII) à la surface des cellules présentatrices d'antigènes (CPA) professionnelles à une sous- population de lymphocytes T, est cruciale pour le développement des réponses immunitaires protectives spécifiques de l'antigène. En général, l'expression de CMHII est réservée aux CPAs. Toutefois, au cours des pathologies inflammatoires spécifiques d'organe, telles que l'auto-immunité ou la maladie inflammatoire de l'intestin, l'expression de CMHII est également induite par la cytokine interféron (IFN)-y sur des cellules non hématopoïétiques qui résident dans des tissus enflammés. Les conséquences de ce phénomène sont encore peu comprises. Dans cette étude, nous avons utilisé une souche de souris génétiquement modifiées, qui n'a pas la capacité d'induire l'expression de CMHII sur les cellules non hématopoïétiques, mais a maintenu la régulation normale d'expression de CMHII sur les cellules hématopoïétiques. Nous avons appliqué ces souris à différents modèles d'inflammation intestinale et à un modèle de maladie qui imite la maladie auto-immune de l'inflammation du muscle cardiaque (myocardite) chez l'homme. Nous avons pu montrer que, au cours de l'inflammation intestinale, l'expression du CMHII nonhématopoïétique, ou encore l'expression du CMHII par les cellules épithéliales de l'intestin, confère une protection contre la maladie, en réduisant les cellules immunitaires inflammatoires et en augmentant les cellules Τ régulatrices anti-inflammatoires. Ces résultats pourraient expliquer l'échec des traitements d'anti-IFN-γ dans les maladies intestinales inflammatoires chez l'homme. En revanche, dans la myocardite auto-immune, nos résultats indiquent que la présentation d'antigènes par les cellules non hématopoïétiques du coeur est nécessaire pour l'apparition de la pathologie cardiaque, comme nos souris sont résistantes à la maladie. Toutefois, cela n'est pas dû à un défaut d'activation des lymphocytes T, car les lymphocytes Τ des souris mutantes sont parfaitement capables de promouvoir la maladie après le transfert adoptif dans des animaux de type naturel. Nos résultats suggèrent que, durant les maladies inflammatoires spécifiques d'organe, la présentation d'antigène par des cellules non hématopoïétiques module et contribue au résultat de la réponse immunitaire d'une manière opposée, conférant soit la protection contre la maladie ou sa promotion. Nos résultats pourraient ouvrir la voie à des thérapies qui prennent en compte la contribution de la présentation d'antigènes par les cellules non hématopoïétiques, au cours des maladies inflammatoires spécifiques d'organe. - Les molécules du CMH de classe II (CMHII) sont fondamentales pour la présentation des antigènes aux lymphocytes Τ CD4+, car elles permettent le développement des réponses immunitaires spécifiques de l'antigène. Il est largement admis que l'expression de CMHII est réservée aux cellules présentatrices d'antigènes (CPA). Cependant, dans des conditions inflammatoires, l'expression de CMHII est en principe également induite par l'interféron (IFN)-y sur les cellules non hématopoïétiques, telles que les cellules épithéliales et les cardiomyocytes. Une controverse existe jusqu'à présent au sujet de la fonction de cette présentation d'antigènes non professionnelle, pour savoir si elle favorise la tolérance ou l'immunité dépendante des lymphocytes Τ in vivo. Pour répondre à cette question, nous avons testé des souris qui ne sont pas capables d'induire l'expression du CMHII sur les cellules non hématopoïétiques (souris PIV-/- K14 CIITA Tg) parmi différents modèles murins de pathologies inflammatoires, à savoir les modèles de vaccination pour induire des réponses spécifiques d'antigènes des lymphocytes B, plusieurs modèles de colite et un modèle de myocardite auto-immune expérimental (EAM). Pour cela, nous avons administré à ces souris un modèle de colite atténuée, induite par une infection chronique à Helicobacter hepaticus et par l'administration d'anticorps monoclonaux bloquant le récepteur de l'interleukine (IL)-10 (anti-IL-10R). Dans ce système, nous avons pu observer que l'expression abrogée de CMHII a aggravé la colite bactérienne, soit par les cellules non hématopoïétiques, soit exclusivement par les cellules épithéliales intestinales (CEI) dans un autre modèle murin (souris plV_fl/fl vil-Cre Tg). Ce phénotype du côlon a été associé à une augmentation des fréquences de cellules immunitaires innées, de lymphocytes Th1 CD4+, et d'expression des cytokines et de chimiokines pro-inflammatoires, y compris l'IFN-γ. Notamment, l'expression défectueuse de CMHII non hématopoïétique a également réduit les cellules Τ régulatrices (Treg) Forkhead box P3 (FoxP3)+, sans influencer les fréquences des cellules innées lymphoïdes et des cellules Th17. Ces résultats suggèrent un rôle tolérogène de CEIs CMHII+ qui contribue à l'homéostasie immunitaire intestinale. En revanche, dans le modèle d'EAM, les souris ayant subi une ablation de CMHII non hématopoïétique étaient résistantes à l'induction de la maladie, alors que la progression de la pathologie cardiaque, dans les souris de type naturel ou hétérozygotes, a été accompagnée par une régulation positive de l'expression de CMHII du myocarde. Cependant, l'inflammation cardiaque pourrait être transférée de manière adoptive depuis des souris amorcées PIV-/- K14 CIITA Tg vers des souris de type naturel, indiquant l'absence de défaut intrinsèque d'amorçage des cellules T CD4+ dans notre modèle de souris. Ces observations impliquent un rôle à jouer pour des cellules CMHII+ non hématopoïétiques résidentes du coeur, dans la promotion active de ΙΈΑΜ. En conclusion, nos résultats, provenant de diverses pathologies inflammatoires spécifiques d'organes, suggèrent un rôle complexe et divergent, soit tolérogène, soit immunogène/ pathologique, pour l'expression de CMHII non hématopoïétique au cours des pathologies inflammatoires. L'expression non professionnelle de CMHII semble influencer le résultat des réponses immunitaires en fonction de différents facteurs, tels que le tissu cible, le(s) type(s) de cellule(s) non hématopoïétique(s) participante(s) et l'origine de l'inflammation. Nos résultats pourraient potentiellement ouvrir la voie à des applications thérapeutiques, qui tiennent compte de la contribution de la présentation d'antigènes par des CPAs non professionnelles, au cours de l'inflammation spécifique d'organe. - MHC class II (MHCII) molecules are fundamental for the presentation of antigens to CD4+ Τ cells, allowing the development of antigen-specific immune responses. It is widely accepted that MHCII expression is restricted to antigen-presenting cells (APC). However, under inflammatory conditions, MHCII expression is typically also induced by interferon (IFN)-y on nonhematopoietic cells such as epithelial cells and cardiomyocytes. So far, it remains controversial whether this nonprofessional antigen-presentation function promotes CD4+ Τ cell-dependent tolerance or immunity in vivo. To address this issue, we utilised mice which lack inducible MHCII expression on nonhematopoietic cells (pIV-/- K14 CIITA Tg mice) in different mouse models of inflammatory pathologies, namely immunisation models to induce antigen-specific Β cell responses, various colitis models and a model of experimental autoimmune myocarditis (EAM). In an attenuated model of colitis induced by chronic Helicobacter hepaticus infection and treatment with anti-interleukin (IL)-10 receptor (anti-IL-10R) monoclonal blocking antibody, we observed that abrogated MHCII expression by nonhematopoietic cells or, in an alternative tamoxifen-inducible mouse model (plV_fl/fl vil-Cre Tg mice), exclusively by intestinal epithelial cells (IEC), exacerbated bacterial-driven colitis, which was associated with increased colonic frequencies of innate immune cells, CD4+ Th1 cells and expression of proinflammatory cytokines and chemokines, including IFN-γ. Notably, defective nonhematopoietic MHCII expression also resulted in reduced Forkhead box P3 (FoxP3)+ regulatory Τ (Treg) cells without influencing innate lymphoid cell (ILC) and Th17 cell frequencies. These findings suggest a tolerogenic role of MHClT lECs to contribute to intestinal immune homeostasis. In contrast, in the EAM model, mice ablated of nonhematopoietic MHCII were resistant to disease induction, whereas progression of cardiac pathology in WT and heterozygous control mice was accompanied by upregulation of myocardial MHCII expression. However, cardiac inflammation could be adoptively transferred from primed pIV-/- K14 CIITA Tg mice into WT mice, indicating no intrinsic defect of CD4+ Τ activation in our mouse model. These observations imply a role for MHCIT heart-resident nonhematopoietic cells in actively promoting EAM. In conclusion, our findings from different organ-specific inflammatory pathologies suggest a complex and diverging role - either tolerogenic or immunogenic/ pathologic - for nonhematopoietic MHCII expression during inflammatory pathologies: Nonprofessional MHCII expression appears to influence the outcome of immune responses depending on 7 factors such as the target tissue, participating non hematopoietic cell type(s) and the origin of inflammation. Our findings may potentially open the way to therapeutic applications taking into account the contribution of antigen presentation by nonprofessional, tissue-resident APCs during organ-specific inflammation.

Blood pressure loci identified with a gene-centric array.

Raised blood pressure (BP) is a major risk factor for cardiovascular disease. Previous studies have identified 47 distinct genetic variants robustly associated with BP, but collectively these explain only a few percent of the heritability for BP phenotypes. To find additional BP loci, we used a bespoke gene-centric array to genotype an independent discovery sample of 25,118 individuals that combined hypertensive case-control and general population samples. We followed up four SNPs associated with BP at our p < 8.56 × 10(-7) study-specific significance threshold and six suggestively associated SNPs in a further 59,349 individuals. We identified and replicated a SNP at LSP1/TNNT3, a SNP at MTHFR-NPPB independent (r(2) = 0.33) of previous reports, and replicated SNPs at AGT and ATP2B1 reported previously. An analysis of combined discovery and follow-up data identified SNPs significantly associated with BP at p < 8.56 × 10(-7) at four further loci (NPR3, HFE, NOS3, and SOX6). The high number of discoveries made with modest genotyping effort can be attributed to using a large-scale yet targeted genotyping array and to the development of a weighting scheme that maximized power when meta-analyzing results from samples ascertained with extreme phenotypes, in combination with results from nonascertained or population samples. Chromatin immunoprecipitation and transcript expression data highlight potential gene regulatory mechanisms at the MTHFR and NOS3 loci. These results provide candidates for further study to help dissect mechanisms affecting BP and highlight the utility of studying SNPs and samples that are independent of those studied previously even when the sample size is smaller than that in previous studies.