Molecular heterogeneity of progenitors and radial migration in the developing cerebral cortex revealed by transgene expression.

We have analyzed the developmental pattern of beta-galactosidase (beta-gal) expression in the cerebral cortex of the beta 2nZ3'1 transgenic mouse line, which was generated using regulatory elements of the beta 2-microglobulin gene and shows ectopic expression in nervous tissue. From embryonic day 10 onward, beta-gal was expressed in the medial and dorsal cortices, including the hippocampal region, whereas lateral cortical areas were devoid of labeling. During the period of cortical neurogenesis (embryonic days 11-17), beta-gal was expressed by selective precursors in the proliferative ventricular zone of the neocortex and hippocampus, as well as by a number of migrating and postmigratory neurons arranged into narrow radial stripes above the labeled progenitors. Thus, the transgene labels a subset of cortical progenitors and their progeny. Postnatally, radial clusters of beta-gal-positive neurons were discernible until postpartum day 10. At this age, the clusters were 250 to 500 microns wide, composed of neurons spanning all the cortical layers and exhibiting several neuronal phenotypes. These data suggest molecular heterogeneity of cortical progenitors and of the cohorts of postmitotic neurons originating from them, which implies intrinsic molecular mosaicism in both cortical progenitors and developing neurons. Furthermore, the data show that neurons committed to the expression of the transgene migrate along very narrow, radial stripes.

Detection of membrane-bound HLA-G translated products with a specific monoclonal antibody.

A monomorphic anti-HLA-G monoclonal antibody (mAb) was obtained by immunization of HLA-B27/human beta 2-microglobulin double-transgenic mice with transfected murine L cells expressing both HLA-G and human beta 2-microglobulin. This mAb, designated BFL.1, specifically recognizes, by flow cytometry analysis, the immunizing HLA-G-expressing cells, whereas it does not bind to parental untransfected or to HLA-B7- and HLA-A3-transfected L cells, suggesting that it distinguishes between classical HLA-A and -B and nonclassical HLA-G class I molecules. This was further assessed by the absence of BFL.1 reactivity with a number of human cell lines known to express classical HLA class I proteins. In addition, we showed that the BFL.1 mAb also labels HLA-G-naturally-expressing JEG-3 and HLA-G-transfected JAR human choriocarcinoma cell lines as well as a subpopulation of first-trimester placental cytotrophoblast cells. Further biochemical studies were performed by immunoprecipitation of biotinylated membrane lysates: BFL.1, like the monomorphic W6/32 mAb, immunoprecipitated a 39-kDa protein in HLA-G-expressing cell lines, a size corresponding to the predicted full-length HLA-G1 isoform. However, in contrast to W6/32, which immunoprecipitates both classical and nonclassical HLA class I heavy chains, BFL.1 mAb does not recognize the class Ia products. Such a mAb should be a useful tool for analysis of HLA-G protein expression in various normal and pathological human tissues and for determination of the function(s) of translated HLA-G products.

Differentiation of short-wavelength-sensitive cones by NADPH diaphorase histochemistry.

NADPH diaphorase (NADPH dehydrogenase; EC 1.6.99.1) histochemistry labels neurons that synthesize the neurotransmitter nitric oxide (NO). In retina, it has been demonstrated that NO can affect the metabolism of cGMP in rod photoreceptors. To investigate potential involvement of NO in cone photoreceptor activity, we utilized NADPH diaphorase histochemistry to study the cone-dominated retina of the tree shrew (Tupaia belangeri). Unexpectedly, our results revealed different NADPH diaphorase activity in the cellular subcompartments of the spectral classes of cone photoreceptors. Although all cones showed intense labeling of inner segment ellipsoids, the short-wavelength-sensitive (SWS or "blue-sensitive") cones and the rods displayed intense staining of the myoid inner segment subcompartment as well. Furthermore, only SWS cones and rods displayed surface labeling of their nuclei. These findings indicate a manner in which SWS cones differ biochemically from other cone types and in which they are more similar to rods. Such differences may underlie some of the unusual functional properties of the SWS cone system, which have been attributed to postreceptoral processes.

Base de dados de informação nutricional, relacionados com doenças crônicas não transmissíveis, de alimentos comercializados no Brasil

A recente evolução das doenças crônicas não transmissíveis (DCNT), possivelmente associadas às mudanças de hábitos alimentares, tem sido um desafio para a promoção da alimentação saudável em vários países, inclusive no Brasil, onde o sódio tem sido o foco de atenção, pela possibilidade da redução da sua elevada ingestão ser uma das medidas com melhor custo benefício para saúde pública. É necessário conhecer o conteúdo de sódio e de componentes específicos, relacionados às DCNT nos alimentos comercializados no país, para orientar o consumidor na seleção adequada dos alimentos e mesmo para modificar sua composição; no entanto, nas bases de dados, o conteúdo desse mineral está presente em um número reduzido de alimentos. O objetivo da presente pesquisa foi a elaboração de uma base de dados de alimentos processados com componentes específicos associados às DCNT, dando ênfase ao sódio, e avaliar o uso dessa base de dados para estimar a sua ingestão. Informações nutricionais de rótulos e de websites de indústrias de alimentos foram coletadas para inclusão na base de dados, elaborada de acordo com as diretrizes do International collaborative project to compare and monitor the nutritional composition of processed foods, coordenado pelo The George Institute for Global Health (Austrália). A avaliação da variação do conteúdo de sódio foi realizada para alguns alimentos processados presentes na base de dados, considerando os de maior consumo nacional. O conteúdo de sódio em refeições de restaurantes populares de São Paulo foi analisado por espectrofotometria de absorção atômica de chama e estimado pela base de dados elaborada para comparação. Na base de dados estão incluídas informações de 2.319 alimentos distribuídos em 14 grupos. Foi observada grande variação no conteúdo de sódio entre diferentes tipos de pães de forma industrializados, de salsichas, de linguiças, de queijos e iogurtes. O conteúdo de sódio analisado nas refeições (base integral) variou de 215,9 mg a 427,9 mg por 100 kcal, enquanto que o conteúdo de sódio estimado variou de 204,2 mg a 486,8 mg por 100 kcal (418 kJ). A análise do coeficiente de correlação entre valores analíticos e estimados do conteúdo de sódio em refeições mostrou forte correlação entre esses dados para dois restaurantes (r=0,703 e 0,897) e moderada correlação para outros dois (r=0,513 e 0,622) dos cinco restaurantes estudados, indicando que através da base de dados elaborada é possível obter uma estimativa da ingestão de sódio. A importância de se conhecer o conteúdo de sódio de refeições e/ou alimentos está na possibilidade de uso dessas informações para orientar a redução do sal empregado no preparo da refeição, e ampliar para o consumidor informações que permitam identificar alternativas para redução do consumo de sal.

Determinação de vitaminas antioxidantes em suplementos e avaliação da rotulagem nutricional

Introdução: Diante das mudanças nos hábitos de consumo alimentar da população brasileira, suplementos vitamínicos e alimentos enriquecidos são veículos comumente empregados para atender as necessidades de ingestão de micronutrientes. A diversidade de suplementos vitamínicos comercializados atualmente leva à necessidade de desenvolvimento de métodos analíticos de fácil execução e alta produtividade. Informações confiáveis sobre os teores de vitaminas poderão ser obtidas somente com métodos analíticos validados. Objetivos: Validar metodologias analíticas e avaliar o teor de vitaminas antioxidantes em suplementos adquiridos no comércio do município de São Paulo - Brasil, o efeito do armazenamento nestes compostos e confrontar os valores analisados com os valores declarados na rotulagem. Métodos: As metodologias analíticas para determinação de vitaminas antioxidantes por cromatografia líquida de alta eficiência com detector de arranjo de diodos (CLAE-DAD) e de vitamina C por titulação potenciométrica foram validadas para as matrizes sólidas, oleosas e líquidas de suplementos vitamínicos. A estabilidade das vitaminas foi avaliada a cada 6 meses durante 12 meses de armazenamento e a avaliação da rotulagem foi realizada de acordo com as legislações vigentes no Brasil. Resultados: Para os métodos cromatográficos, os limites de detecção (LDs) e de quantificação (LQs) variaram entre 0,3 e 4,3 µg/mL, e entre 0,5 e 14,0 µg/mL respectivamente. As recuperações dos padrões adicionados nas matrizes variaram entre 92 por cento e 109 por cento e entre 86 por cento e 108 por cento no material de referência. A repetitividade foi calculada pelo desvio padrão relativo (RSD), apresentando valores entre 0,2 por cento e 9,6 por cento . Para a determinação de vitamina C pelo método potenciométrico, o LD e o LQ foram respectivamente 1 mg e 3 mg; a recuperação no material de referência foi de 99,8 por cento e a precisão variou entre 0,4 e 3,9 por cento . Das 57 amostras avaliadas, 59 por cento e 35 por cento apresentaram teores de vitaminas A e E respectivamente, abaixo dos valores declarados no rótulo; por outro lado, 20 por cento das amostras apresentaram teores de vitamina E acima dos valores declarados. Em relação aos teores de vitamina C, 60 por cento das amostras estavam de acordo com os valores declarados. O estudo da estabilidade demonstrou degradação significativa das vitaminas A, E e C em aproximadamente 90 por cento das amostras com 12 meses de armazenamento. Na avaliação da rotulagem dos suplementos vitamínicos, 47 das amostras apresentaram uma ou mais irregularidades. Conclusão: Os métodos propostos se mostraram adequados para análise de diferentes matrizes de suplementos vitamínicos. Os resultados das análises de vitaminas nestes produtos mostraram a necessidade urgente de monitoramento em conjunto com ações de fiscalização, pois verificou-se que a maioria das amostras não atenderam a legislação, principalmente quanto aos teores declarados na informação nutricional da rotulagem. A sobredosagem de vitaminas pode ser necessária para manter os teores declarados durante o armazenamento, porém, a quantidade adicional de vitamina a ser incluída no suplemento deve estar dentro de limites seguros e depende de cada amostra, pois além da matriz, diversos fatores relacionados aos compostos e à embalagem também podem influenciar na estabilidade das vitaminas.

Structural Polymorphism in Tau Filaments: An Implication for Neurodegenerative Diseases

Tau filaments are the pathological hallmark of >20 neurodegenerative diseases including Alzheimer's disease, Pick's disease, and progressive supranuclear palsy. In the adult human brain, six isoforms of tau are expressed that differ by presence or absence of the second of the four semiconserved repeats. As a consequence, half of the tau isoforms have three repeats (3R tau), whereas the other half has four repeats (4R tau). Site-directed spin labeling of recombinant tau in conjunction with electron paramagnetic resonance spectroscopy was used to obtain structural insights into tau filaments. The studies showed that the filaments of 4R tau and 3R tau share a highly ordered core structure in the third repeat with parallel, in-register arrangement of beta-strands. This structure in 3R and 4R is conserved regardless of whether full-length isoforms (htau40 and htau23) or truncated constructs (K18 and K19) are used. When mixed, 3R tau and 4R tau coassembled into heterogeneous filaments. Hence, these findings indicate that there are at least three compositionally distinct types of filaments: homogeneous 3R tau, homogeneous 4R tau, and heterogeneous 3R/4R tau. In vitro experiments show that the seeded filament growth, a prerequisite for tau spreading in tissue culture and brain, is crucially dependent on the isoform composition of individual seeds. Seeds of 3R tau and 3R/4R tau recruit both types of isoforms whereas seeds of 4R tau can recruit 4R tau, but not 3R tau, establishing an asymmetric barrier. Conformational templating of 4R tau onto 3R tau seeds eliminates this barrier, giving rise to a new type of tau filament. Conformational studies at the molecular level of tau filaments were done using Double electron-electron resonance spectroscopy, which allows the determination of distances between pairs of spin labels. These studies revealed structural differences between filaments of 3R tau and 4R tau. Furthermore, they indicated that 4R tau assumed the conformation of 3R tau when templated on 3R tau seeds. Our measurements have also provided insights into the heterogeneity of tau filament structure. Conformational differences due to variation in filament composition and seeding properties of tau filaments have shown that they are structurally polymorphic in nature. This structural polymorphism of tau filaments has widespread implications in understanding and treatment of neurodegenerative diseases.

Mechanistic Importance of Redox Potentials and Conformational Flexibility in Electron-Transferring Flavoproteins

The mitochondrial matrix flavoproteins electron transfer flavoprotein (ETF) and electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase (ETF-QO) are responsible for linking fatty acid β-oxidation with the main mitochondrial respiratory chain. Electrons derived from flavoprotein dehydrogenases are transferred sequentially through ETF and ETF-QO to ubiquinone and then into the respiratory chain via complex III. In this study, the effects of changes in ETF-QO redox potentials on its activity and the conformational flexibility of ETF were investigated. ETF-QO contains one [4Fe-4S]2+,1+ and one flavin adenine dinucleotide (FAD). In the porcine protein, threonine 367 is hydrogen bonded to N1 and O2 of the flavin ring of the FAD. The analogous site in Rhodobacter sphaeroides ETF-QO is asparagine 338. Mutations N338T and N338A were introduced into the R. sphaeroides protein by site-directed mutagenesis to determine the impact of hydrogen bonding at this site on redox potentials and activity. FAD redox potentials were measured by potentiometric titration probed by electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy. The N338T and N338A mutations lowered the midpoint potentials, which resulted in a decrease in the quinone reductase activity and negligible impact on disproportionation of ETF1e- catalyzed by ETF-QO. These observations indicate that the FAD is involved in electron transfer to ubiquinone, but not in electron transfer from ETF to ETF-QO. Therefore it is proposed that the iron-sulfur cluster is the immediate acceptor from ETF. It has been proposed that the αII domain of ETF is mobile, allowing promiscuous interactions with structurally different partners. Double electron-electron resonance (DEER) was used to measure the distance between spin labels at various sites and an enzymatically reduced FAD cofactor in Paracoccus denitrificans ETF. Two or three interspin distance distributions were observed for spin-labels in the αI (A43C) and βIII (A111C) domains, but only one is observed for a label in the βII (A210C) domain. This suggests that the αII domain adopts several stable conformations which may correspond to a closed/inactive conformation and an open/active conformation. An additional mutation, E162A, was introduced to increase the mobility of the αII domain. The E162A mutation doubled the activity compared to wild-type and caused the distance distributions to become wider. The DEER method has the potential to characterize conformational changes in ETF that occur when it interacts with various redox partners.

A prematuridade no discurso materno: de que se trata?

Quais os efeitos do diagnóstico de prematuridade no discurso das mães e suas repercussões na relação mãe-criança? Partindo desta questão, que surgiu na experiência psicanalítica em um hospital pediátrico, o presente estudo visa analisar os efeitos do diagnóstico de prematuridade no discurso materno a partir de entrevistas psicanalíticas preliminares com mães de crianças prematuras. Trata-se de uma pesquisa clínica qualitativa que propõe uma articulação entre clínica e teoria a partir da construção de quatro casos clínicos fundamentados pelo referencial teórico da psicanálise de Freud, Lacan e autores contemporâneos. Se no imaginário social a prematuridade é associada a dificuldades em diversos contextos da vida, a análise de cada caso revela que este diagnóstico pode ou não ser encadeado pelo sujeito aos significantes que o marcam de forma prevalente. Nesta via, a prematuridade se desloca do lugar determinante de algo que sempre marca e decide, para um lugar que só pode ser escutado no um a um. Para a análise dos casos, elencou-se a divisão mãe-mulher como operador conceitual central dada sua prevalência nos discursos, em um percurso teórico que parte da história do amor materno ao exame psicanalítico da maternidade a partir da sexualidade feminina. Tais considerações partem do mito do amor materno de Badinter, em direção à equivalência do filho como substituto da falta fálica em Freud, até à ênfase ao desejo da mulher na mãe em Lacan. A discussão apresenta os diferentes lugares atribuídos à prematuridade por cada sujeito feminino e a prevalência de impasses próprios à conjunção e disjunção mãe-mulher incidindo na relação mãe-criança

Pieter Bruegel the Elder’s Netherlandish Proverbs and Sixteenth Century Dutch Semiotics

"In 1559, Pieter Bruegel the Elder‘s depiction of {7f2015}Netherlandish Proverbs‖ illustrated his profound understanding of the Dutch love for proverbs, their contemporary values, and appreciation for moral lessons in art forms. Depicting gestures and poses that represented proverbial phrases enabled Bruegel‘s leap from didactic labels employed by other artists to his inscription-free success of {7f2015}Netherlandish Proverbs.‖ My examination reveals that Bruegel‘s employment of gestural imagery, indicating rhetorical phrases or proverbs, was reinforced by a history of scholarly curatorship for written proverb collections, humanist interest in proverbs, and use of Dutch vernacular to bolster protonational pride"

Video of the labelling of projected Placido rings through the scanning annulus

The Elliptical Scanning Algorithm is an effective method to individually detect and label the projected rings. It consecutively defines an elliptical annulus of one pixel wide which grows pixel by pixel and sweeps the image, from centre to periphery, until it detects and labels each whole ring. In a way, it works like a snake-annealing algorithm. Active contour models (snakes) are energy-minimising curves that deform to fit image features. Elliptical Scanning Algorithm changes its geometry in order to label reflected rings.

Evaluating the robustness of EmotiBlog for sentiment analysis and opinion mining

Preliminary research demonstrated the EmotiBlog annotated corpus relevance as a Machine Learning resource to detect subjective data. In this paper we compare EmotiBlog with the JRC Quotes corpus in order to check the robustness of its annotation. We concentrate on its coarse-grained labels and carry out a deep Machine Learning experimentation also with the inclusion of lexical resources. The results obtained show a similarity with the ones obtained with the JRC Quotes corpus demonstrating the EmotiBlog validity as a resource for the SA task.

Evaluating EmotiBlog robustness for sentiment analysis tasks

EmotiBlog is a corpus labelled with the homonymous annotation schema designed for detecting subjectivity in the new textual genres. Preliminary research demonstrated its relevance as a Machine Learning resource to detect opinionated data. In this paper we compare EmotiBlog with the JRC corpus in order to check the EmotiBlog robustness of annotation. For this research we concentrate on its coarse-grained labels. We carry out a deep ML experimentation also with the inclusion of lexical resources. The results obtained show a similarity with the ones obtained with the JRC demonstrating the EmotiBlog validity as a resource for the SA task.

Análisis del uso de métodos de similitud léxica con conocimiento semántico superficial para mapear la información de enfermería en español

Uno de los problemas actuales en el dominio de la salud es reutilizar y compartir la información clínica entre profesionales, ya que ésta se encuentra escrita usando terminologías específicas. Una posible solución es usar un recurso de conocimiento común sobre el que mapear la información existente. Nuestro objetivo es comprobar si la adición de conocimiento semántico superficial puede mejorar los mapeados establecidos. Para ello experimentamos con un conjunto de etiquetas de NANDA-I y con un conjunto de descripciones de SNOMED-CT en castellano. Los resultados obtenidos en los experimentos muestran que la inclusión de conocimiento semántico superficial mejora significativamente el mapeado léxico entre los dos recursos estudiados.

Removing noisy mentions for distant supervision

Los métodos para Extracción de Información basados en la Supervisión a Distancia se basan en usar tuplas correctas para adquirir menciones de esas tuplas, y así entrenar un sistema tradicional de extracción de información supervisado. En este artículo analizamos las fuentes de ruido en las menciones, y exploramos métodos sencillos para filtrar menciones ruidosas. Los resultados demuestran que combinando el filtrado de tuplas por frecuencia, la información mutua y la eliminación de menciones lejos de los centroides de sus respectivas etiquetas mejora los resultados de dos modelos de extracción de información significativamente.

Nueva técnica de fusión de clasificadores aplicada a la mejora de la segmentación de audio

Este artículo presenta un nuevo algoritmo de fusión de clasificadores a partir de su matriz de confusión de la que se extraen los valores de precisión (precision) y cobertura (recall) de cada uno de ellos. Los únicos datos requeridos para poder aplicar este nuevo método de fusión son las clases o etiquetas asignadas por cada uno de los sistemas y las clases de referencia en la parte de desarrollo de la base de datos. Se describe el algoritmo propuesto y se recogen los resultados obtenidos en la combinación de las salidas de dos sistemas participantes en la campaña de evaluación de segmentación de audio Albayzin 2012. Se ha comprobado la robustez del algoritmo, obteniendo una reducción relativa del error de segmentación del 6.28% utilizando para realizar la fusión el sistema con menor y mayor tasa de error de los presentados a la evaluación.