O uso do eucalipto em sistemas silvipastoril: acúmulo de fitomassa arbórea e de pastagem

O presente estudo foi dividido em três capitulos, todos realizados na Estação Experimental de Ciências Florestais de Anhembi/SP, entre os anos de 2014 e 2015. O primeiro estudo intitulado de \"Variação mensal da fitomassa da forragem em função do grau de cobertura do dossel em sistemas silvipastoris\", foi realizado em 3 monoculturas de 13 anos de idade, com área útil de 50 m x 30 m para coleta de pasto as mesmas efectuadas mensalmente. Os resultados apresentaram que não há relação significativa entre a cobertura do dossel e fitomassa da forragem pelo caso de que o sub-bosque estava muito sombreado. Entretanto, houve uma relação indireta entre área basal e fitomassa. Evidenciando-se que o talhão de Eucalipto urograndis apresentou as melhores condições de crescimento e disponibilidade de materia seca mensal para Bachiaria decumbens além de obter a maior porcentagem de folha entre todos os tratamentos. Ao contrario, no talhão de Pinus tecunumanii, foi encontrada a menor disponibilidade de materia seca mensal e por consequência, menor porcentagem de folha. O segundo estudo foi chamado de: \"Disponibilidade de fitomassa de B. decumbens, em um sistema silvipastoril com eucalipto: o papel da radiação\" onde o componente florestal foi o eucalyptus (COP-1377) de 2 anos de idade plantado em uma área útil de 10 ha, dividido em 3 tratamentos (onda longa-OL (39 m), onda curta-OC (21 m), e testemunha-T) e instalado em 4 blocos distintos. Foram realizadas duas coletas dutante o período de verão e de inverno, onde foi possível verificar que o tratamento OL mostrou maior disponibilidade de fitomassa a 65% de irradiância além de obter maior porcentagem da fração folha. Este foi favorecido pelo maior espaçamento entre as aléias. Contudo, houve ataque de cigarinha na pastagem, mantendo a queda da disponibilidade no período de inverno. O terceiro estudo intitulado de: \"Variaçoes arquiteturais de uma monocultura de E. urograndis em função de sua posição espacial\", foi também realizado na monocultura do primeiro estudo, numa área de 7 ha. Para este estudo, realizou-se um inventario florestal, logo após, dividiu-se as árvores por sua classe diamétrica e selecionou-se aleatoriamente 60 árvores para cubagem, e destas, escolheu-se 15 para determinação da fitomassa e respectiva densidade da madeira. Para a obtenção da fitomassa dividiu-se as árvores em três frações de análise: tronco, galhos e folha. Além disso, as 15 árvores foram divididas em: bordadura, intermediária e centro da parcela, de acordo com a sua localização. Verificou-se que a bordadura apresentou os maiores crescimentos em DAP, altura, largura de copa e, que por consequência, obteve maior volume e fitomassa em todas suas frações. Também foi possível observar que tanto a bordadura quanto o centro apresentaram maior densidade básica em função da maior copa e altura das árvores incentivando a geração de mais fitomassa foliar. Finalmente conforme os três estudos realizados neste trabalho de pesquisa, concluiu-se que a radiação solar é fator chave na produtividade da cultura forrageira, demonstrando a necessidade de mais pesquisas sobre os sistemas agroforestais e silvipastoris para o sucesso de futuros emprendimentos.

Identification of differentially expressed genes in a Giardia lamblia WB C6 clone resistant to nitazoxanide and metronidazole.

OBJECTIVES The characterization of differential gene expression in Giardia lamblia WB C6 strain C4 resistant to metronidazole and nitazoxanide using microarray technology and quantitative real-time PCR. METHODS In a previous study, we created and characterized the G. lamblia WB C6 clone C4 resistant to nitazoxanide and metronidazole. In this study, using a microarray-based approach, we have identified open-reading frames (ORFs) that were differentially expressed in C4 when compared with its wild-type WB C6. Using quantitative real-time PCR, we have validated the expression patterns of some of those ORFs, focusing on chaperones such as heat-shock proteins in wild-type and C4 trophozoites. In order to induce an antigenic shift, trophozoites of both strains were subjected to a cycle of en- and excystation. Expression of selected genes and resistance to nitazoxanide and metronidazole were investigated after this cycle. RESULTS Forty of a total of 9115 ORFs were found to be up-regulated and 46 to be down-regulated in C4 when compared with wild-type. After a cycle of en- and excystation, resistance of C4 to nitazoxanide and metronidazole was lost. Resistance formation and en-/excystation were correlated with changes in expression of ORFs encoding for major surface antigens such as the variant surface protein TSA417 or AS7 ('antigenic shift'). Moreover, expression patterns of the cytosolic heat-shock protein HSP70 B2, HSP40, and of the previously identified nitazoxanide-binding proteins nitroreductase and protein disulphide isomerase PDI4 were correlated with resistance and loss of resistance after en-/excystation. C4 trophozoites had a higher thermotolerance level than wild-type trophozoites. After en-/excystation, this tolerance was lost. CONCLUSIONS These results suggest that resistance formation in Giardia to nitazoxanide and metronidazole is correlated with altered expression of genes involved in stress response such as heat-shock proteins.

Quantitative assessment of sense and antisense transcripts from genes involved in antigenic variation (vsp genes) and encystation (cwp 1 gene) of Giardia lamblia clone GS/M-83-H7.

Antigenic variation of the intestinal protozoan parasite Giardia lamblia is caused by an exchange of the parasite's variant surface protein (VSP) coat. Many investigations on antigenic variation were performed with G. lamblia clone GS/M-83-H7 which produces surface antigen VSP H7. To generate novel information on giardial vsp gene transcription, vsp RNA levels were assessed by quantitative reverse transcription-(RT)-PCR in both axenic VSP H7-type trophozoites and subvariants obtained after negative selection of GS/M-83-H7 trophozoites by treatment with a cytotoxic, VSP H7-specific monoclonal antibody. Our investigation was not restricted to the assessment of the sense vsp transcript levels but also included an approach aimed at the detection of complementary antisense vsp transcripts within the two trophozoite populations. We found that sense vsp H7 RNA predominated in VSP H7-type trophozoites while sense RNA from only one (vsp IVg) of 8 subvariant vsp genes totally analysed predominated in subvariant-type trophozoites. Interestingly, the two trophozoite populations exhibited a similar relative distribution regarding the vsp H7 and vsp IVg antisense RNA molecules. An analogous sense versus antisense RNA pattern was also observed when the transcripts of gene cwp 1 (encoding cyst wall protein 1) were investigated. Here, both types of RNA molecules only appeared after cwp 1 had been induced through in vitro encystation of the parasite. These findings for the first time demonstrated that giardial antisense RNA production did not occur in a constitutive manner but was directly linked to complementary sense RNA production after activation of the respective gene systems.

Experimental infections of neonatal mice with cysts of Giardia lamblia clone GS/M-83-H7 are associated with an antigenic reset of the parasite.

Transmission of the protozoan parasite Giardia lamblia from one to another host individuum occurs through peroral ingestion of cysts which, following excystation in the small intestine, release two trophozoites each. Many studies have focused on the major surface antigen, VSP (for variant surface protein), which is responsible for the antigenic variability of the parasite. By using trophozoites of G. lamblia clone GS/M-83-H7 (expressing VSP H7) and the neonatal mouse model for experimental infections, we quantitatively assessed the process of antigenic variation of the parasite on the transcriptional level. In the present study, variant-specific regions identified on different GS/M-83-H7 vsp sequences served as targets for quantitative reverse transcription-PCR to monitor alterations in vsp mRNA levels during infection. Respective results demonstrated that antigenic switching of both the duodenal trophozoite and the cecal cyst populations was associated with a massive reduction in vsp H7 mRNA levels but not with a simultaneous increase in transcripts of any of the subvariant vsp genes analyzed. Most importantly, we also explored giardial variant-type formation and vsp mRNA levels after infection of mice with cysts. This infection mode led to an antigenic reset of the parasite in that a VSP H7-negative inoculum "converted" into a population of intestinal trophozoites that essentially consisted of the original VSP H7 type. This antigenic reset appears to be associated with excystation rather than with a selective process which favors expansion of a residual population of VSP H7 types within the antigenically diversified cyst inoculum. Based on these findings, the VSP H7 type has to be regarded as a predominant variant of G. lamblia clone GS/M-83-H7 which (re-)emerges during early-stage infection and may contribute to an optimal establishment of the parasite within the intestine of the experimental murine host.

Performance of two-clone crosses in alfalfa and an unanticipated self-pollination problem /

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mecA locus diversity in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates in Brisbane, Australia, and the development of a novel diagnostic procedure for the Western Samoan phage pattern clone

An emerging public health phenomenon is the increasing incidence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) infections that are acquired outside of health care facilities. One lineage of community-acquired MRSA (CA-MRSA) is known as the Western Samoan phage pattern (WSPP) clone. The central aim of this study was to develop an efficient genotyping procedure for the identification of WSPP isolates. The approach taken was to make use of the highly variable region downstream of mecA in combination with a single nucleotide polymorphism (SNP) defined by the S. aureus multilocus sequence typing (MLST) database. The premise was that a combinatorial genotyping method that interrogated both a highly variable region and the genomic backbone would deliver a high degree of informative power relative to the number of genetic polymorphisms-interrogated. Thirty-five MRSA isolates were used for this study, and their gene contents and order downstream of mecA were determined. The CA-MRSA isolates were found to contain a truncated mecA downstream region consisting of mecA-HVR-IS431 mec-dcs-Ins117, and a PCR-based method for identifying this structure was developed. The hospital-acquired isolates were found to contain eight different mecA downstream regions, three of which were novel. The Minimum SNPs computer software program was used to mine the S. aureus MLST database, and the arcC 2726 polymorph was identified as 82% discriminatory for ST-30. A real-time PCR assay was developed to interrogate this SNP. We found that the assay for the truncated mecA downstream region in combination with the interrogation of arcC position 272 provided an unambiguous identification of WSPP isolates.

Improving recombinant eukaryotic membrane protein yields in Pichia pastoris:the importance of codon optimization and clone selection

In the last 15 years, 80% of all recombinant proteins reported in the literature were produced in the bacterium, Escherichia coli, or the yeast, Pichia pastoris. Nonetheless, developing effective general strategies for producing recombinant eukaryotic membrane proteins in these organisms remains a particular challenge. Using a validated screening procedure together with accurate yield quantitation, we therefore wished to establish the critical steps contributing to high yields of recombinant eukaryotic membrane protein in P. pastoris. Whilst the use of fusion partners to generate chimeric constructs and directed mutagenesis have previously been shown to be effective in bacterial hosts, we conclude that this approach is not transferable to yeast. Rather, codon optimization and the preparation and selection of high-yielding P. pastoris clones are effective strategies for maximizing yields of human aquaporins.

Immunologically silent cancer clone transmission from mother to offspring

Rare cases of possible materno-fetal transmission of cancer have been recorded over the past 100 years but evidence for a shared cancer clone has been very limited. We provide genetic evidence for mother to offspring transmission, in utero, of a leukemic cell clone. Maternal and infant cancer clones shared the same unique BCR-ABL1 genomic fusion sequence, indicating a shared, single-cell origin. Microsatellite markers in the infant cancer were all of maternal origin. Additionally, the infant, maternally- derived cancer cells had a major deletion on one copy of chromosome 6p that included deletion of HLA alleles that were not inherited by the infant (i.e., foreign to the infant), suggesting a possible mechanism for immune evasion.

Incidence and clinicobiologic characteristics of leukemic B-cell chronic lymphoproliferative disorders with more than one B-cell clone.

Leukemic B-chronic lymphoproliferative disorders (B-CLPDs) are generally believed to derive from a monoclonal B cell; biclonality has only occasionally been reported. In this study, we have explored the incidence of B-CLPD cases with 2 or more B-cell clones and established both the phenotypic differences between the coexisting clones and the clinicobiologic features of these patients. In total, 53 B-CLPD cases with 2 or more B-cell clones were studied. Presence of 2 or more B-cell clones was suspected by immunophenotype and confirmed by molecular/genetic techniques in leukemic samples (n = 42) and purified B-cell subpopulations (n = 10). Overall, 4.8% of 477 consecutive B-CLPDs had 2 or more B-cell clones, their incidence being especially higher among hairy cell leukemia (3 of 13), large cell lymphoma (2 of 10), and atypical chronic lymphocytic leukemia (CLL) (4 of 29). In most cases the 2 B-cell subsets displayed either different surface immunoglobulin (sIg) light chain (n = 37 of 53) or different levels of the same sIg (n = 9 of 53), usually associated with other phenotypic differences. Compared with monoclonal cases, B-CLL patients with 2 or more clones had lower white blood cell (WBC) and lymphocyte counts, more frequently displayed splenomegaly, and required early treatment. Among these, the cases in which a CLL clone coexisted with a non-CLL clone were older and more often displayed B symptoms, a monoclonal component, and diffuse infiltration of bone marrow and required early treatment more frequently than cases with monoclonal CLL or 2 CLL clones.

Toxicidade de extratos vegetais ao percevejo bronzeado do eucalipto Thaumastocoris peregrinus (hemiptera: heteroptera: thaumastocoridae) e organismos não-alvo

Thaumastocoris peregrinus (Hemiptera: Thaumastocoridae ) is an insect from Australia which is causing severe damage to eucalyptus crops around the world. When feeding from the leaves sap, it causes bronzening, and in extreme cases, may lead to the tree death. Control methods have been studied and the most promising so far is the egg parasitoid Cleruchoides noackae (Hymenoptera: Mymaridae). Alternative products from plants with insecticidal properties could also be a viable option, and they might even be used concomitantly with C. noackae, aiming for a most effective control, but still safe for the environment. Thus, the objective of this work was to verify the action of 5% aqueous plant extracts of Matricaria chamomilla, Echinodorus grandiflorus, Punica granatum, Maytenus ilicifolia a n d Origanum majorana on T. peregrinus. In addition, we aimed to study the extracts potential toxicity to C. noackae and Gallus domesticus L., since the plant compounds might have negative effect upon the non-target organisms. At first, HPLC (High Performance Liquid Chromatography) was used to verify which phenolic compounds would be found in the plant extracts. These were tested on bronze bug adults, in confinement test (to verify the insecticidal action of the extracts) and free-choice test (to verify the repellency). The extracts that showed better results were selected for further tests with non-target organisms. Regarding C. noackae, pre-parasitism and post-parasitism, confinement and free-choice tests were performed to verify if the extracts would affect the host-choosing by the female or the development of the immature stages of the parasitoid. To verify if the extracts would be toxic to G. domesticus, the plant extracts were added to young birds feed for five days. Parameters such as weight gain, food intake, quantification of serum enzymes and histopathological analysis were carried out. HPLC analysis detected gallic, ferulic, vanillic, caffeic and cumaric acid in the extracts samples. All plant extracts tested reduced T. peregrinus survival, but E. grandiflorus, Matricaria chamomilla Maytenus ilicifolia had also a repellent effect, and were tested on the non-target organisms. None of these extracts affected neither the host choice by C. noackae nor adult emergency, when compared to the control group. In addition, the extracts did not cause alterations in any of the studied parameters. Thus, we verified that E. grandiflorus, Matricaria chamomilla and Maytenus ilicifolia have potential to be used to control T. peregrinus and are safe to C. noackae and G. domesticus.

Extração de ácidos triterpénicos a partir da casca de eucalipto utilizando líquidos iónicos

Os recursos renováveis têm sido um forte alvo de investigação científica nos últimos anos, onde o aproveitamento de biomassa e seus resíduos para a obtenção de compostos de valor acrescentado, combustíveis e energia têm sido abordados no conceito de biorrefinaria integrada. As indústrias de papel geram quantidades significativas de resíduos, nomeadamente a casca de eucalipto que é atualmente queimada para a geração de energia. De forma a valorizar este resíduo, a presente dissertação teve como objetivo extrair compostos triterpénicos, a partir casca externa de Eucalyptus globulus, utilizando solventes de extração alternativos - soluções aquosas de líquidos iónicos (LIs) – para substituir os solventes orgânicos actualmente utilizados. Os ácidos triterpénicos apresentam um elevado interesse na indústria cosmética, farmacêutica e alimentar graças às suas propriedades antiinflamatórias, antitumurais, entre outras. Primeiramente, caracterizou-se a casca externa de Eucalyptus globulus, e posteriormente procedeu-se ao estudo de solubilidade de ácido ursólico (AU, utilizado como molécula modelo) a 25 ºC em soluções aquosas de LIs e surfactantes de modo a selecionar os solventes mais eficientes para a extração. Deste trabalho conclui-se que a capacidade surfactante das soluções aquosas de LIs, particularmente [C4C1im][C8H17SO4], [C16C1im]Cl e [C14C1im]Cl, desempenham um papel fundamental para a solubilização de AU em água, podendo aumentar quase 16000 vezes a sua solubilidade, e permitiu recuperar cerca de 89% deste composto com simples adição de água como anti-solvente. Por fim, compararam-se as quantidades de ácidos triterpénicos extraídas a partir da casca de eucalipto com soluções aquosas de [C14C1im]Cl, metanol e com extração em soxhlet com diclorometano.

Modificação da pasta kraft de eucalipto para novas aplicações

Este trabalho constou num estudo da modificação da pasta kraft de eucalipto, utilizando uma técnica de processamento por alta pressão hidrostática com o intuito de melhorar a sua performance para novas aplicações tal como o papel tissue ou o papel para embalagens. Para tal pretendia-se melhorar algumas propriedades da pasta com a utilização da técnica de alta pressão hidrostática. Realizou-se um estudo preliminar onde se submeteu uma pasta branqueada A, não refinada, a um tratamento hiperbárico (TH) numa gama de pressões de 5000-8000 bar. Para uma pressão de 6000 bar constatou-se uma melhoria de cerca de 16 % no alongamento percentual na rotura, 17 % na resistência à tração, 27 % no índice de rebentamento e cerca de 19 % no índice de rasgamento. Posteriormente, e tendo em conta os resultados positivos verificados na pasta A, estudou-se o efeito do TH numa pasta branqueada B variando a consistência de tratamento (1,5% ou 3%) e o tempo de processamento (5 ou 10 minutos). Foi estudado também o efeito do TH quando aplicado antes e após a refinação da pasta. A pasta branca foi submetida à refinação num moinho PFI entre 1000 e 3000 rotações. Os resultados obtidos mostram que o TH realizado a menores consistências apresenta um efeito mais significativo nas propriedades físico-mecânicas de pastas e que o efeito é distinto quando o processamento é aplicado antes e depois da refinação, tendo-se registado melhoramentos das propriedades mecânicas apenas quando o TH ocorre após a refinação. A pasta kraft foi também modificada com anidrido alquenil succínico (ASA). A modificação da pasta de celulose com ASA resultou numa diminuição das propriedades mecânicas e para além disso não gerou qualquer alteração na termoplasticidade do material, no entanto registou-se um aumento na resistência à molhabilidade. Concluiu-se que o TH conduz a alterações ao nível de propriedades mecânicas e estruturais da pasta de interesse para a aplicação em papéis tissue no caso da pasta B. Para além disso a modificação da pasta com ASA resultou em alterações de interesse particular para papéis de embalagem.

CRESCIMENTO INICIAL E CONCENTRAÇÃO DE NUTRIENTES EM CLONES DE Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis SOB INTERFERÊNCIA DE PLANTAS DANINHAS

A presença de plantas daninhas em plantios de eucalipto, especialmente nos dois primeiros anos, pode acarretar grandes prejuízos à produtividade, pois reduz a eficiência de aproveitamento dos recursos de crescimento pela cultura. Assim, objetivou-se com este trabalho avaliar os efeitos da interferência de plantas daninhas sobre o crescimento inicial de dois clones de Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis e a concentração foliar de nutrientes na cultura e nas plantas daninhas. O experimento foi instalado em esquema fatorial 2 x 5 + 7, sendo dois clones de híbridos de Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis, identificados como CNB001 e CNB016, em competição com cinco plantas daninhas Urochloa decumbens (capim-braquiária), Ipomoea nil (corda-de-viola), Commelina diffusa (trapoeraba), Spermacoce latifolia (erva-quente) e Panicum maximum (capim-colonião). Adicionalmente, foram cultivados os dois clones de eucalipto e as cinco plantas daninhas em monocultivo como padrão de comparação, no delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições. Foram avaliados eucalipto através da altura de plantas, o diâmetro do coleto, o número de ramos, a área foliar, a matéria seca e, o teor foliar de nutrientes do eucalipto, bem como o teor de nutrientes nas folhas das plantas daninhas. O clone CNB001 apresentou crescimento inicial superior ao clone CNB016, no entanto, livre da interferência de plantas daninhas, verificaram-se teores foliares semelhantes para a maioria dos nutrientes em ambos os genótipos. O clone CNB016 mostrou maior sensibilidade à interferência negativa das plantas daninhas que o clone CNB001, sendo seu crescimento inicial mais afetado por Ipomoea nil e a concentração de nutrientes reduzida pelas espécies Panicum maximum, Urochloa decumbens e Commelina diffusa. Panicum maximum apresentou maior interferência com o clone CNB001, enquanto Ipomoea nil pouco influenciou o crescimento e o teor de nutrientes deste híbrido. As plantas daninhas apresentaram elevada capacidade de extrair nutrientes do solo, mesmo em convivência com os clones de Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis. A interferência imposta à cultura é dependente da espécie infestante e do genótipo de eucalipto.

Cloning of the ω-secalin gene family in a wheat 1BL/1RS translocation line using BAC clone sequencing

Background: Wheat 1BL/1RS translocation lines are planted around the world for their disease resistance and high yield. Most of them are poor in bread making, which is partially caused by ω-secalins that are encoded by the ω-secalin gene family, which is located on the short arm of rye chromosome 1R (1RS). However, information on the structure and evolution of the ω-secalin gene family is still limited. Results: We first generated a physicalmap of the ω-secalin gene family covering 195 kb of the Sec-1 locus based on sequencing three bacterial artificial chromosome (BAC) clones of the 1BL/1RS translocation wheat cultivar Shimai 15. A BAC contig was constructed spanning 168 kb of the Sec-1 locus on 1RS. Twelve ω-secalin genes were arranged in a head-to-tail fashion, separated by 8.2–21.6 kb spacers on the contig, whereas six other ω-secalin genes were arranged head-to-tail, separated by 8.2–8.4 kb of spacers on clone BAC125. The 18 ω-secalin genes can be classified into six types among which eight ω-secalin genes were expressed during seed development. The ω-secalin genes with the 1074-bp open reading frame (ORF) represented the main population. Except for two pseudogenes, the N-terminal of the ω-secalin gene was conserved, whereas variations in the C-terminal led to a change in ORF length. The spacers can be sorted into two classes. Class-1 spacers contained conserved and non-conservative sequences. Conclusion: The ω-secalin gene family consisted of at least 18 members in the 1BL/1RS translocation line cv. Shimai 15. Eight ω-secalin genes were expressed during seed development. Eighteen members may originate from a progenitor with a 1,074-bp ORF. The spacers differed in length and sequence conservation.

Efeito do aumento da concentração de CO2 atmosférico sobre o desenvolvimento de ferrugem em mudas de eucalipto.

Alterações dos componentes atmosféricos, principalmente o aumento nas concentrações do dióxido de carbono, reconhecido como um dos principais gases de efeito estufa, estão levando a um progressivo e acelerado aumento da temperatura média global, a qual poderá alcançar de 2 a 4,5 ºC até o fim do século XXI, segundo dados do IPCC (2007). Desta forma, devido à importância do ambiente para o desenvolvimento de doenças de plantas, é estratégico o estudo dos efeitos do aumento da concentração do dióxido de carbono e das demais alterações climáticas sobre o desenvolvimento das doenças de importantes culturas do país. Este trabalho teve como objetivo verificar os efeitos de diferentes concentrações de CO2 atmosférico sobre o desenvolvimento da ferrugem (Puccinia psidii) em mudas de eucalipto. O experimento foi conduzido em sala climatizada, com as mudas mantidas em caixas plásticas transparentes e fechadas com uma placa de vidro. Após 13 dias da inoculação, verificou-se que o aumento da concentração de CO2 conduziu à redução do número de folhas lesionadas e uma tendência de redução do número de pústulas por planta.