Avaliação do potencial antimutagênico de extrato etanólico de própolis verde e de Baccharis dracunculifolia (Asteraceae), por meio de sistema-teste de Allium e células de mamíferos (HTC)

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Biologia Celular e Molecular) - IBRC

Caracterização da composição química dos óleos essenciais de Lychnophora pinaster Mart. em função da sazonalidade

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Acidovorax citruli: genetic analyses and protocol for its detection in seeds

Bacterial fruit blotch of cucurbits (BFB), caused by the seed borne Gramnegative bacterium Acidovorax citrulli is a serious threat to cucurbit industry worldwide. Since late 1980`s after devastating outbreaks in watermelon fields in southern United States, BFB has spread worldwide and has been reported in other cucurbit crops such as melon, pumpkin, cucumber and squash. To date, there is evidence for the existence of at least two genetically and pathogenically distinct populations of A. citrulli. In Brazil, the first report of BFB was in 1991, in a watermelon field in São Paulo. Although widespread in the country, BFB has been a major problem to melon production. More precisely, BFB has caused significant yield losses to melon production in northeastern Brazil, which concentrates > 90% of the country`s melon production. Despite the management efforts and the recent advances in A. citrulli research, BFB is still a continuous threat to the cucurbit industry, including seed producers, growers and transplant nurseries. To better understand the population structure of A. citrulli strains in Brazil, and to provide a basis for the integrated management of BFB, we used pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence analysis (MLSA) of housekeeping and virulence-associated genes and pathogenicity tests on different cucurbit seedlings to characterize a Brazilian population of A. citrulli strains from different hosts and regions. Additionally, we conducted for the first time a comparative analysis of the A. citrulli group I and II population at genomic level and showed that these two groups differ on their genome sizes due to the presence of eight DNA segments, which are present in group II and absent in group I genomes. We also provide the first evidence to suggest that temperature might be a driver in the ecological adaptation of A. citrulli populations under nutrient-rich or -depleted conditions. Finally, in order to improve the routine detection of A. citrulli on melon seedlots, we designed a new primer set that is able to detect the different Brazilian haplotypes, thus minimizing the risk of false-negatives on PCR-based seed health testing.

Minerais em méis de abelhas Apis mellífera L. produzidos na região do Pólo Cuesta, Estado de São Paulo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Caracterização fitossociológica da vegetação ripária e qualidade da água do córrego do cintra (Botucatu SP) em função da ação antrópica

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Genetic characterisation of populations of the critically endangered Goliath grouper (Epinephelus itajara, Serranidae) from the Northern Brazilian coast through analyses of mtDNA

The Goliath grouper (Epinephelus itajara) is one of the most endangered species of fish of the subfamily Epinephelinae. Slow to develop and mature, and dependent on mangrove habitats for breeding, the species also suffers intense harvesting, which has reduced drastically in numbers in many areas. To contribute to the understanding of the characteristics of E. itajara populations, we conducted a molecular genetics study of the species, focusing on populations from the Northern Brazilian coast. The mtDNA control region (D-loop) of 116 individuals from five localities (Bragança, Ajuruteua, Parnaíba, Fortaleza and Natal) was analysed, and a sequence of 499 base pairs identified. Analyses of the sequences indicated that genetic variability was generally lower in E. itajara than in other endangered species of the genus. AMOVA found no significant grouping structure among the populations. Nested Clade Analysis revealed a significant association between genetic variability and geographic distribution among only three populations (Ajuruteua, Parnaíba and Natal). Genetic diversity was higher in populations from the Amazon region, which may be related to the better conservation of mangrove habitats in this area. Therefore, the present study could be used for the implementation of conservation and management measures in order to protect and consolidate these populations.

Hermenêutica botânica e antropização na Amazônia: exsicatas de verbenáceas da Amazônia Legal no Herbário do New York Botanical Garden

Este artigo tem como base informações de uma série histórica de exsicatas datadas de 1819 a 2002, reunindo contribuições de pesquisadores de instituições governamentais e não governamentais das Américas do Norte, do Sul e Europa. Tem foco nas verbenáceas, pela reconhecida gama de espécies aromáticas e medicinais desta família e o seu reconhecido uso no Brasil. Analisa notas descritivas e críticas sobre a coleção do New York Botanical Garden referente à Amazônia, revelando o espírito da cooperação entre instituições brasileiras e estrangeiras nesta região. Alterações do meio ambiente, rede de pesquisadores, mudanças na linguagem, na tecnologia dos registros e absorção de termos regionais são detectados ao longo de quase dois séculos de trabalho científico em que se projeta a formação continuada de cientistas e a interação com saberes locais.

Inventário da araneofauna (Arachnida, Araneae) do Parque Nacional de Sete Cidades, Piauí, Brasil

Foi realizado o inventário da araneofauna do Parque Nacional de Sete Cidades (municípios de Brasileira e Piracuruca, Piauí), utilizando amostragem padronizada para permitir comparações entre as assembléias de aranhas de seis fitofisionomias existentes na área de estudo e obter estimativas de riqueza. Utilizaram-se dados oriundos amostragem com armadilhas de queda (PTF), extratores de Winkler (WIN), guarda-chuva entomológico (GCE), rede de varredura (RV) e coletas manuais noturnas (MN), totalizando 1386 amostras; além do exame de todos os demais espécimes já coletados na área de estudo (n=1166). As análises estatísticas foram realizadas utilizando-se os dados obtidos com GCE, RV e MN. Ao todo, foram coletados 14.890 indivíduos (4491 adultos), segregados em 364 espécies. Destas, 72 foram determinadas a nível específico, 62 são novos registros para a área de estudo, 2 são novos registros para o Brasil e 48 foram reconhecidas como espécies novas por especialistas. A aplicação dos métodos GCE, RV e MN resultou em 11.085 aranhas, pertencentes a 303 espécies. As estimativas de riqueza variaram entre 355 (Bootstrap) e 467 (Jack 2). Entretanto o estimador que apresentou maior tendência a atingir a assíntota foi Chao 2 (403 spp.). A riqueza observada foi maior na mata seca semi-decídua (131 spp.), seguida pela mata de galeria (104 spp.), campo limpo (102 spp.), cerradão (91 spp.), cerrado típico (88 spp.) e cerrado rupestre (78 spp.). A eficiência dos métodos de coleta exibiu variação de acordo com a fitofisionomia onde o método foi aplicado, destacando-se a elevada eficiência da rede de varredura em áreas abertas. A composição de espécies variou entre as fitofisionomias e pode ser, em parte, explicada pela complexidade estrutural das áreas em questão. Os resultados das análises de agrupamento sugerem que em condições de dominância elevada, estes testes sejam realizados com coeficientes que utilizem dados qualitativos, a fim de anular-se o efeito da escolha do coeficiente e/ou a necessidade de transformação dos dados. De maneira geral, a araneofauna do Parque Nacional de Sete Cidades não segue padrões de agrupamento como sugerido para as análises botânicas, em que fitofisionomias campestre, savânicas e florestais são agrupadas.

Evaluation of morpho-anatomical and chemical differences between varieties of the medicinal plant Casearia sylvestris Swartz

Casearia sylvestris Swartz (Salicaceae) é uma planta utilizada na medicina tradicional, cujos extratos de folhas demonstraram importantes ações farmacológicas. A espécie apresenta variação morfológica, genética e química. Duas variedades são consideradas devido a diferenças morfológicas: C. sylvestris var. sylvestris e var. lingua. Há dificuldades na definição destas variedades. O objetivo deste trabalho é avaliar diferenças morfo-anatômicas e químicas entre as variedades de C. sylvestris que permitam sua diferenciação com aplicação farmacêutica ou botânica. Seções transversais e paradérmicas de folhas foram preparadas para análises morfo-anatômicas, histoquímicas e microscopia quantitativa (indices de estômatos e paliçada). Análises cromatográficas (CLAE-DAD e CCD) foram realizadas para obter o perfil de diterpenos clerodânicos. Os resultados das análises morfo-anatômicas demonstraram diferenças significativas entre as variedades somente em cortes paradérmicos: var. sylvestris - paredes celulares epidérmicas poligonais e hipoestomática, var. lingua - paredes celulares epidérmicas arredondadas e anfiestomática. Os índices de estômatos não revelaram diferenças; os valores dos índices de paliçada foram de 2,8 para var. lingua e 3,9 para var. sylvestris. As análises cromatográficas confirmaram resultados prévios, demonstrando predomínio de diterpenos na var. sylvestris. Este trabalho sugere que análises cromatográficas e morfo-anatômicas podem ser ferramentas aplicáveis na distinção das variedades da espécie.

Reutilization of chemical waste in methodologies for analyses of neutral detergent fiber and acid detergent fiber

The disposal of chemical waste and the precision of analyses of the neutral (NDF) and acid (ADF) detergent fiber contents were evaluated utilizing conventional (Van Soest) and alternative methods of analyses. The recovery of acetone promoted both economic and environmental gains, with a recovery rate of 84.12%. The precision of the analyses was not observed in most of the determinations with reutilization of chemical waste in all the analytical methods tested, in spite of promoting decrease in cost, time invested in the preparation of solutions and the disposal of chemical waste.

Cluster and meta-analyses of genetic parameters for feed intake traits in growing beef cattle

A data set based on 50 studies including feed intake and utilization traits was used to perform a meta-analysis to obtain pooled estimates using the variance between studies of genetic parameters for average daily gain (ADG); residual feed intake (RFI); metabolic body weight (MBW); feed conversion ratio (FCR); and daily dry matter intake (DMI) in beef cattle. The total data set included 128 heritability and 122 genetic correlation estimates published in the literature from 1961 to 2012. The meta-analysis was performed using a random effects model where the restricted maximum likelihood estimator was used to evaluate variances among clusters. Also, a meta-analysis using the method of cluster analysis was used to group the heritability estimates. Two clusters were obtained for each trait by different variables. It was observed, for all traits, that the heterogeneity of variance was significant between clusters and studies for genetic correlation estimates. The pooled estimates, adding the variance between clusters, for direct heritability estimates for ADG, DMI, RFI, MBW and FCR were 0.32 +/- 0.04, 0.39 +/- 0.03, 0.31 +/- 0.02, 0.31 +/- 0.03 and 0.26 +/- 0.03, respectively. Pooled genetic correlation estimates ranged from -0.15 to 0.67 among ADG, DMI, RFI, MBW and FCR. These pooled estimates of genetic parameters could be used to solve genetic prediction equations in populations where data is insufficient for variance component estimation. Cluster analysis is recommended as a statistical procedure to combine results from different studies to account for heterogeneity.

Pseudoplatystoma metaense and P. orinocoense (Siluriformes: Pimelodidae) from the Orinoco basin, Venezuela: cytogenetic and molecular analyses

The genus Pseudoplatystoma includes catfish species distributed throughout the fresh waters of South America. These species are important fisheries resources and play a significant ecological role due to their piscivorous and migratory habits. The taxonomy of this genus is still debated: traditionally, only three species have been recognised, but recently, this number was raised to eight. The validity of these eight morphospecies, however, was not confirmed by two subsequent molecular phylogenetic studies, which identified either five or four main clades. In this study, we focused on the two morphospecies restricted to the Orinoco basin, P. metaense and P. orinocoense, which have been assigned to either the same or different clades in previous studies. We carried out cytogenetic analyses to describe their unknown karyotypes and to look for cytotaxonomic markers. We also analysed their mitochondrial sequences in order to assign the sampled specimens to the previously identified molecular clades. The two presumptive species show similar karyotypes (2n=56, 42 biarmed and 14 uniarmed chromosomes) and cytogenetic features in terms of the constitutive heterochromatin distribution and the number and location of minor and major ribosomal genes. Thus, no species-specific chromosome markers could be identified. The analysis of cytochrome b and cytochrome oxidase I mitochondrial genes (carried out by retrieving all the mtDNA Pseudoplatystoma sequences available in GenBank) distributed the sampled specimens into two distinct molecular clades and confirmed the need to re-evaluate, by parallel morphological and molecular analyses, the monophyly of some lineages.

Comparison of changes in dental and bone radiographic densities in the presence of different soft-tissue simulators using pixel intensity and digital subtraction analyses

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Elapid Snake Venom Analyses Show the Specificity of the Peptide Composition at the Level of Genera Naja and Notechis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Mechanical and chemical analyses across dental porcelain fused to CP titanium or Ti6Al4V

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)