Caratterizzazione tecnologica di lieviti isolati dal processo di lavorazione delle olive

In questa tesi si sono analizzati campioni di olio di oliva ottenuti anche mediante processo di co- frangitura tra olive e sottoprodotto del pomodoro, al fine di ottenere un olio ricco in licopene. Appena prodotti, gli oli di oliva possono mostrare un aspetto opalescente a causa della presenza di particelle solide e micro-gocce di acqua di vegetazione, che possono contenere microrganismi, principalmente lieviti, provenienti dalla carposfera delle olive che passano nell’olio durante la loro frantumazione. A seconda delle specie di lievito e delle specifiche attività metaboliche possono influenzare anche negativamente la qualità dell’olio. In questo contesto, le attività di laboratorio alla base di questo elaborato sono state finalizzate alla caratterizzazione tecnologica di 30 ceppi di lieviti isolati da olio di oliva prodotto presso il Campus di Scienze degli Alimenti dal gruppo di ricerca della dott.ssa Bendini. In particolare, gli isolati sono stati caratterizzati mediante analisi RAPD-PCR e se ne sono valutate alcune attività enzimatiche quali l’attività proteasica, lipasica, β-glucosidasica, pectinasica e poligalatturonasica e la capacità di degradare alcuni composti fenolici. Sebbene i risultati di questa sperimentazione siano preliminari, sono promettenti in quanto da tale matrice si sono isolati numerosi ceppi che presentano un’ampia e differenziata gamma di attività enzimatiche che potrebbero essere sfruttate per il recupero e/o valorizzazione di componenti organiche ad alto valore dei sottoprodotti dell’industria alimentare.

Reduction of the “ngege”, Oreochromis esculentus (Teleostei: Cichlidae) populations, and resultant population genetic status in the Lake Victoria region

Ngege, Oreochromis esculentus, originally formed the mainstay of the Lake Victoria Region (LVR) fisheries. Together with its indigenous congener O. variabilis, it was displaced from Lakes Victoria and Kyoga of LVR and was found to survive as isolated small populations within the peripheral minor lakes and reservoirs around the two lakes. Displacement of the two LVR indigenous tilapiines was thought to be principally driven by changed lake environment and predation by the introduced Nile perch, but also competition and genetic swamping by the closely related introduced and comparatively more ecologically versatile tilapine species. In a study carried out in the LVR between 1993 and 2003, micro satellites and RAPD markers were used to analyse the remnant populations so as to establish the population structure and extant genetic diversity of O. esculentus. Analyses indicated that the surviving O. esculentus retained a high proportion of genetic diversity with high differentiation between units an indication of genetic exchange between indigenous and introduced Nile tilapia where the two forms co-existed. While this heightened concern for genetic swamping of the remnant population units by the introduced tilapiines it was noteworthy that in a few of the satellite lakes where the O. esculentus was dominant evidence for introgression was weak.

Dephosphorization of Iron Ore through Bioleaching

Phosphorus, as phosphate, is frequently found as a constituent of many of the world iron resources. Phosphorus is an extremely harmful element found in iron ore used as a raw material in the steelmaking process because it will affect the quality of iron and steel products. Allowable phosphorus concentration in high quality steel is usually less than 0.08%. Dephosphorization of iron ore has been studied for a long time. Although there are described physical beneficiation and chemical leaching processes, involving inorganic acids, to reduce phosphorus content of iron ores, these processes have several limitations such as poor recovery, require high energy quantity, capital costs and cause environmental pollution. Use of microorganisms in leaching of mineral ores is gaining importance due to the implementation of stricter environmental rules. Microbes convert metal compounds into their water soluble forms and are biocatalysts of leaching processes. Biotechnology is considered as an eco-friendly, promising, and revolutionary solution to these problems. Microorganisms play a critical role in natural phosphorus cycle and the process of phosphate solubilization by microorganisms has been known for many years. This study was performed to analyze the possibility of using bioleaching as a process for the dephosphorization of an iron ore from Northeast of Portugal. For bioleaching, Acidithiobacillus ferrooxidans bacterium were used. For this study two experiments were done with different conditions, which lasts 6 weeks for first experiment and 5 weeks for second experiment. From the result of these preliminary studies, it was observed that for first experiment 6.2 % and for second experiment 3.7 % of phosphorus was removed from iron ore.

Empleo de marcadores moleculares para el análisis de la prevalencia y diseminación de cepas de beauveria bassiana

El hongo entomopatógeno Beauveria bassiana se emplea en todo el mundo gracias a su comprobada virulencia y su amplio rango de hospederos. El objetivo de este estudio fue comparar diferentes técnicas clásicas y de biología molecular, con el fin de comparar las diferencias de metabolismo y su adaptación en cepas y aislados de suelos agrícolas de B. bassiana, y por otra parte analizar una cepa confirmada como su uso como bioinsecticida (BB38) y la comparación con 42 aislamientos. Con el fin de detectar su prevalencia y diseminación en suelo de campos agrícolas de Guanajuato previamente tratados con bioinsecticidas para control de plagas se desarrolló esta estrategia para asociar dichos marcadores con las cepas de liberación. El ADN extraído de cada aislamiento se amplificó mediante la técnica RAPD-PCR. Al realizar el análisis de las secuencias purificadas de regiones de los transcritos de espaciadores internos (ITS), en conjunto con el ADN amplificado, no se observaron diferencias que pudieran determinar un patrón distintivo. Los resultados de diferenciación usando oligonucleótidos partidores de las series OPA-A, OPA-B y OPA-AB, seleccionados para B. bassiana, mostraron que las cepas nativas BBPTG1, BBPTG2, BBPTG4 y BBPTG6 tuvieron polimorfismos distintivos entre ellas, pero al compararlas contra los 42 aislamientos de suelo, tanto el aislamiento de estudio BB38 como la cepa de referencia GHA (Mycotech) mostraron el mismo patrón que el observado por el aislamiento BBPTG2. Al estudiar la producción de proteasas y de las toxinas beauvericina y basianólido por RT-PCR con oligonucleótidos seleccionados, las 4 cepas nativas amplificaron los transcritos, aunque con la cepa BBPTG6 se observó en general una reducción en la expresión. Por otra parte, se analizaron los intrones presentes en la subunidad grande del ADN ribosomal (LSU) de los 42 aislamientos de campo frente a los del aislamiento BB38, cuyo patrón permitiera distinguir entre los aislamientos y así determinar prevalencia y diseminación en suelos agrícolas. Mientras que en otro análisis en base a las secuencias de las ITSs se realizó la construcción de un árbol filogenético y se determinó el porcentaje de identidad para evaluar la diferencia genética entre cepas, lo que ayudó a validar los resultados obtenidos previamente y así poder seleccionar marcadores que apoyen a la identidad de la cepas y aislados.

Correction of the misclassification of species in the Portuguese collection of Cucurbita pepo L. using DNA markers

In this study, the genetic variability among 130 accessions of the Portuguese germplasm collection of Cucurbita pepo L. maintained at the Banco Portugues de Germoplasma Vegetal was assessed using AFLP (amplified fragment length polymorphism) and RAPD (random amplified polymorphic DNA) techniques for the identification of a genetically diverse core group of accessions for field phenotypic analysis. The surprisingly completely different molecular patterns exhibited by multiple accessions was later confirmed in the distribution of the putative C. pepo plants into two clusters drastically separated at a very low level of genetic similarity (DICE coefficient = 0.37). Additional analyses with RAPD and ISSR (inter single sequence repeat) markers and the introduction of standard genotypes of C. maxima L. and C. moschata L. into the analyses allowed the identification of multiple accessions of the last species wrongly included in the C. pepo collection. This study is a good example of the usefulness of DNA markers in the establishment and management of plant germplasm collections.

Differential expression in “rogue” paramutation in peas (Pisum sativum L.)

Dissertação de Mestrado, Engenharia Biológica, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2014

Monitoramento da variabilidade genética de pacu, Piaractus mesopotamicus, do programa de aumento de estoque do rio Paranapanema

Avaliou-se a variabilidade genética dos estoques de reprodutores e dos peixes jovens de Piaractus mesopotamicus de três pisciculturas do estado do Paraná, utilizadas no programa de aumento de estoque de peixes no rio Paranapanema. Foi utilizado o marcador RAPD para avaliar as amostras do estoque de reprodutores e dos peixes jovens das pisciculturas de Palotina, Cambará e Andirá. A porcentagem de fragmentos polimórficos e o índice de diversidade genética de Shannon dos estoques de reprodutores variaram de 75,0% a 71,4% e de 0,434 a 0,376, respectivamente. Os peixes jovens das pisciculturas apresentaram valores mais elevados para ambos os parâmetros, com exceção da piscicultura de Palotina, na qual o índice de diversidade genética de Shannon foi semelhante. Os estoques de reprodutores apresentaram alta variabilidade genética, e esta foi mantida nos peixes jovens.

Correction of the misclassification of species in the Portuguese collection of Cucurbita pepo L. using DNA markers

In this study, the genetic variability among 130 accessions of the Portuguese germplasm collection of Cucurbita pepo L. maintained at the Banco Portugues de Germoplasma Vegetal was assessed using AFLP (amplified fragment length polymorphism) and RAPD (random amplified polymorphic DNA) techniques for the identification of a genetically diverse core group of accessions for field phenotypic analysis. The surprisingly completely different molecular patterns exhibited by multiple accessions was later confirmed in the distribution of the putative C. pepo plants into two clusters drastically separated at a very low level of genetic similarity (DICE coefficient = 0.37). Additional analyses with RAPD and ISSR (inter single sequence repeat) markers and the introduction of standard genotypes of C. maxima L. and C. moschata L. into the analyses allowed the identification of multiple accessions of the last species wrongly included in the C. pepo collection. This study is a good example of the usefulness of DNA markers in the establishment and management of plant germplasm collections.

Resposta da lagarta-do-cartucho à aplicação do fosfito em milho doce e divergência genética de populações de lagartas-da-espiga

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2016.

Variabilidade patogênica e molecular entre isolados de Colletotrichum lindemuthianum oriundos de diferentes regiões produtoras de feijão no Brasil.

Este trabalho teve por objetivo estudar a distribuição populacional de isolados do fungo C. lindemuthianum provenientes de diferentes regiões do Brasil, além de identificar se a variação genética existente é intra ou inter-racial, utilizando cultivares diferenciadoras e marcadores RAPD.

Geographic pattern of genetic diversity in natural populations of rosewood (Aniba rosaeodora), in the Central Amazonia.

Padrão geográfico de diversidade genética em populações naturais de Pau-rosa (Aniba rosaeodora), na Amazônia Central.