Phenotypic switching in Pseudomonas brassicacearum involves GacS- and GacA-dependent Rsm small RNAs.

The plant-beneficial bacterium Pseudomonas brassicacearum forms phenotypic variants in vitro as well as in planta during root colonization under natural conditions. Transcriptome analysis of typical phenotypic variants using microarrays containing coding as well as noncoding DNA fragments showed differential expression of several genes relevant to secondary metabolism and of the small RNA (sRNA) genes rsmX, rsmY, and rsmZ. Naturally occurring mutations in the gacS-gacA system accounted for phenotypic switching, which was characterized by downregulation of antifungal secondary metabolites (2,4-diacetylphloroglucinol and cyanide), indoleacetate, exoenzymes (lipase and protease), and three different N-acyl-homoserine lactone molecules. Moreover, in addition to abrogating these biocontrol traits, gacS and gacA mutations resulted in reduced expression of the type VI secretion machinery, alginate biosynthesis, and biofilm formation. In a gacA mutant, the expression of rsmX was completely abolished, unlike that of rsmY and rsmZ. Overexpression of any of the three sRNAs in the gacA mutant overruled the pleiotropic changes and restored the wild-type phenotypes, suggesting functional redundancy of these sRNAs. In conclusion, our data show that phenotypic switching in P. brassicacearum results from mutations in the gacS-gacA system.

First international workshop for small animal arthroscopy : matkakertomus

Jarmo Rintasalo, Pentti Tapio

Escacs, un sistema intel·ligent

Des dels inicis dels ordinadors com a màquines programables, l’home ha intentat dotar-los de certa intel•ligència per tal de pensar o raonar el més semblant possible als humans. Un d’aquests intents ha sigut fer que la màquina sigui capaç de pensar de tal manera que estudiï jugades i guanyi partides d’escacs. En l’actualitat amb els actuals sistemes multi tasca, orientat a objectes i accés a memòria i gràcies al potent hardware del que disposem, comptem amb una gran varietat de programes que es dediquen a jugar a escacs. Però no hi ha només programes petits, hi ha fins i tot màquines senceres dedicades a calcular i estudiar jugades per tal de guanyar als millors jugadors del món. L’objectiu del meu treball és dur a terme un estudi i implementació d’un d’aquests programes, per això es divideix en dues parts. La part teòrica o de l’estudi, consta d’un estudi dels sistemes d’intel•ligència artificial que es dediquen a jugar a escacs, estudi i cerca d’una funció d’avaluació vàlida i estudi dels algorismes de cerca. La part pràctica del treball es basa en la implementació d’un sistema intel•ligent capaç de jugar a escacs amb certa lògica. Aquesta implementació es porta a terme amb l’ajuda de les llibreries SDL, utilitzant l’algorisme minimax amb poda alfa-beta i codi c++. Com a conclusió del projecte m’agradaria remarcar que l’estudi realitzat m’ha deixat veure que crear un joc d’escacs no era tan fàcil com jo pensava però m’ha aportat la satisfacció d’aplicar tot el que he après durant la carrera i de descobrir moltes altres coses noves.

Aplicatiu per gestionar la informació administrativa, tècnica i comptable per una empresa constructora

Les tendencies del mercat actual i futur obliguen a les empreses a ser cada vegada més competitives. Tota empresa que desitgi competir en el mercat actual ha de considerar la informació com un dels seus principals actius. Per aquesta raó, és necessari que l’empresa disposi dels sistemes d’informació adequats per ser gestionada. En les pimes ( petites i mitjanes empreses ), i en la majoria dels casos, la seva informació es troba repartida en diversos aplicatius informàtifcs. Això comporta principalment una duplicitat de dades, costos de manteniment i possibles errades en la informació. Dins del sector de les pimes, es troben empreses contructores d’un volum petit o mig, les quals enmagatzemen molta informació tècnica i de planificació per desemvolupar els seus projectes. Aquesta necessitat els hi suposa, tenir un aplicatiu eficient per la gestió i seguiment de la producció de les seves tasques i per altra banda l’aplicatiu necessari com qualsevol pime a nivell administratiu i comptable. L’objectiu principal d’aquest treball és generar un aplicatiu que integri la informació administrativa, comptable i tècnica per una empresa constructora. Amb l’assoliment d’aquest objectiu l’empresa constructora guanya temps en l’entrada i accés a les dades, evita la seva duplicitat i redueix el seu manteniment. En resum, redueix els costos de l’empresa i augmenta la seva seguretat en la informació. Un el mercat, existeixen aplicatius anomenats ERP ( Enterprise resource planning o sistemes de planificació de recursos ) els quals la seva gran virtud es la integració de les dades. Aprofitant aquests aplicatius i seleccionant-ne el més adequat, s’ha generat la part de gestió i planificació necessària per l’empresa constructora integrant-la i personalitzant-la en els processos existents de l’aplicació ( comptabilitat, ventes, compres, recursos humans, magatzems, etc… ) Entre les conclusions més rellevants obtingudes en aquest treball, voldriem destacar la millora i reducció d’entrada, accés i manteniment de la informació, l’històric que proporciona l’eina i per tan la millora de la gestío i planificació de l’empresa.

Efecto de la suplementación con ácidos grasos de cadena media sobre la evolución de peso en lechones con poco peso al nacimiento

La evolución de peso en los períodos de lactación y transición de 583 lechones fue estudiada mediante un análisis estadístico, evaluando el efecto de la suplementación con ácidos grasos de cadena media (AGCM) en lechones con poco peso al nacimiento. 188 de los 375 lechones que nacieron con un peso al nacimiento (PN) &1250 g recibieron 3mL de AGCM cada 24 h durante los primeros 3 días de vida; su peso medio al destete (día 28) fue inferior respecto al grupo control (lechones no suplementados) (-114,17 g). No obstante, 106 de los 180 lechones nacidos con un PN &1000 g fueron suplementados, y su peso medio al destete y a finales de transición (día 63) fue superior respecto al grupo control (destete: +315,16 g; día 63: +775,47 g). Finalmente, los lechones suplementados con PN&800 g tuvieron los peores resultados: su diferencia de peso medio al destete fue de -177,58 g respecto al grupo control. Por lo tanto, en esta prueba fueron estudiados los lechones con un PN entre 800 y 999 g porque el grupo suplementado al destete tuvo una diferencia de peso medio considerable respecto al grupo control:+511,58 g. Asimismo, considerando una probabilidad de error inferior a 0,05, no hubieron diferencias significativas en las diferentes categorías de PN analizadas. De todas maneras, es importante destacar el alto grado de significación en la suplementación con AGCM en lechones con PN entre 800 y 999g (P=0,059). Por otra parte, el PN del grupo suplementado con PN&1000 g fue inferior que el del grupo no suplementado con PN&1000 g; esta diferencia de PN fue significativa (P=0,004) y como consecuencia el grado de significación en la suplementación con AGCM en lechones con PN entre 800 y 999 g fue inferior al esperado. Además, en esta prueba se incluyeron algunos resultados generales y también un análisis simple de supervivencia, aunque no era el objetivo principal

Two GacA-dependent small RNAs modulate the quorum-sensing response in Pseudomonas aeruginosa.

In Pseudomonas aeruginosa, the GacS/GacA two-component system positively controls the quorum-sensing machinery and the expression of extracellular products via two small regulatory RNAs, RsmY and RsmZ. An rsmY rsmZ double mutant and a gacA mutant were similarly impaired in the synthesis of the quorum-sensing signal N-butanoyl-homoserine lactone, the disulfide bond-forming enzyme DsbA, and the exoproducts hydrogen cyanide, pyocyanin, elastase, chitinase (ChiC), and chitin-binding protein (CbpD). Both mutants showed increased swarming ability, azurin release, and early biofilm development.

Adiposity in children born small for gestational age.

Epidemiological studies indicate that children born small for gestational age (SGA) have an increased risk of metabolic and cardiovascular disorders as adults. This suggests that foetal undernutrition leads to permanent metabolic alterations, which predispose to metabolic abnormalities upon exposure to environmental factors such as low physical activity and/or high-energy intake in later life (thrifty phenotype hypothesis). However, this relationship is not restricted to foetal undernutrition or intrauterine growth retardation, but is also found for children born premature, or for high birth weight children. Furthermore, early post-natal nutrition, and more specifically catch-up growth, appear to modulate cardiovascular risk as well. Intrauterine growth retardation can be induced in animal models by energy/protein restriction, or ligation of uterine arteries. In such models, altered glucose homeostasis, including low beta-cell mass, low insulin secretion and insulin resistance is observed after a few weeks of age. In humans, several studies have confirmed that children born SGA have insulin resistance as adolescents and young adults. Alterations of glucose homeostasis and increased lipid oxidation can indeed be observed already in non-diabetic children born SGA at early pubertal stages. These children also have alterations of stature and changes in body composition (increased fat mass), which may contribute to the pathogenesis of insulin resistance. Permanent metabolic changes induced by foetal/early neonatal nutrition (metabolic inprinting) may involve modulation of gene expression through DNA methylation, or alterations of organ structure. It is also possible that events occurring during foetal/neonatal development lead to long-lasting alterations of the hypothalamo-pituitary-adrenal axis or the hypothalamo-pituitary-insulin-like growth factor-1 axis.

Targeted Small Business Link

Fall 2009, Volume 2, Number 4

Small scale underwater change detection

In this paper, we present a method to deal with the constraints of the underwater medium for finding changes between sequences of underwater images. One of the main problems of underwater medium for automatically detecting changes is the low altitude of the camera when taking pictures. This emphasise the parallax effect between the images as they are not taken exactly at the same position. In order to solve this problem, we are geometrically registering the images together taking into account the relief of the scene

Small dense lipoproteins, apolipoprotein B, and risk of coronary events in HIV-infected patients on antiretroviral therapy: the Swiss HIV Cohort Study.

OBJECTIVES: HIV infection and exposure to certain antiretroviral drugs is associated with dyslipidemia and increased risk for coronary events. Whether this risk is mediated by highly atherogenic lipoproteins is unclear. We investigated the association of highly atherogenic small dense low-density lipoproteins (LDLs) and apolipoprotein B and coronary events in HIV-infected individuals receiving antiretroviral therapy. METHODS: We conducted a case-control study nested into the Swiss HIV Cohort Study to investigate the association of small dense LDL and apolipoprotein B and coronary events in 98 antiretroviral drug-treated patients with a first coronary event (19 fatal and 79 nonfatal coronary events with 53 definite and 15 possible myocardial infarctions, 11 angioplasties or bypasses) and 393 treated controls matched for age, gender, and smoking status. Lipids were measured by ultracentrifugation. RESULTS: In models including cholesterol, triglycerides, high-density lipoprotein cholesterol, blood pressure, central obesity, diabetes, and family history, there was an independent association between small dense LDL and coronary events [odds ratio (OR) for 1 mg/dL increase: 1.06, 95% confidence interval (CI): 1.00 to 1.11] and apolipoprotein B (OR for 10 mg/dL increase: 1.16, 95% CI: 1.02 to 1.32). When adding HIV and antiretroviral therapy-related variables, ORs were 1.04 (95% CI: 0.99 to 1.10) for small dense LDL and 1.13 (95% CI: 0.99 to 1.30) for apolipoprotein B. In both models, blood pressure and HIV viral load was independently associated with the odds for coronary events. CONCLUSIONS: HIV-infected patients receiving antiretroviral therapy with elevate small dense LDL and apolipoprotein B are at increased risk for coronary events as are patients without sustained HIV suppression.