MyHits: a new interactive resource for protein annotation and domain identification.

The MyHits web server (http://myhits.isb-sib.ch) is a new integrated service dedicated to the annotation of protein sequences and to the analysis of their domains and signatures. Guest users can use the system anonymously, with full access to (i) standard bioinformatics programs (e.g. PSI-BLAST, ClustalW, T-Coffee, Jalview); (ii) a large number of protein sequence databases, including standard (Swiss-Prot, TrEMBL) and locally developed databases (splice variants); (iii) databases of protein motifs (Prosite, Interpro); (iv) a precomputed list of matches ('hits') between the sequence and motif databases. All databases are updated on a weekly basis and the hit list is kept up to date incrementally. The MyHits server also includes a new collection of tools to generate graphical representations of pairwise and multiple sequence alignments including their annotated features. Free registration enables users to upload their own sequences and motifs to private databases. These are then made available through the same web interface and the same set of analytical tools. Registered users can manage their own sequences and annotations using only web tools and freeze their data in their private database for publication purposes.

Revue critique d'instruments pour evaluer la douleur chez les personnes cérébrolésées non communicantes aux soins intensifs [Critical review of instruments to assess pain in the non communicative brain injured persons in intensive care].

The purpose of this review is to critically appraise the pain assessment tools for non communicative persons in intensive care available in the literature and to determine their relevance for those with brain injury. Nursing and medical electronic databases were searched to identify pain tools, with a description of psychometric proprieties, in English and French. Seven of the ten tools were considered relevant and systematically evaluated according to the criteria and the indicators in the following five areas: conceptualisation, target population, feasibility and clinical utility, reliability and validity. Results indicate a number of well designed pain tools, but additional work is necessary to establish their accuracy and adequacy for the brain injured non communicative person in intensive care. Recommendations are made to choose the best tool for clinical practice and for research.

The InterPro Database, 2003 brings increased coverage and new features.

InterPro, an integrated documentation resource of protein families, domains and functional sites, was created in 1999 as a means of amalgamating the major protein signature databases into one comprehensive resource. PROSITE, Pfam, PRINTS, ProDom, SMART and TIGRFAMs have been manually integrated and curated and are available in InterPro for text- and sequence-based searching. The results are provided in a single format that rationalises the results that would be obtained by searching the member databases individually. The latest release of InterPro contains 5629 entries describing 4280 families, 1239 domains, 95 repeats and 15 post-translational modifications. Currently, the combined signatures in InterPro cover more than 74% of all proteins in SWISS-PROT and TrEMBL, an increase of nearly 15% since the inception of InterPro. New features of the database include improved searching capabilities and enhanced graphical user interfaces for visualisation of the data. The database is available via a webserver (http://www.ebi.ac.uk/interpro) and anonymous FTP (ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro).

Clustering of Schistosoma mansoni mRNA sequences and analysis of the most transcribed genes: implications in metabolism and biology of different developmental stages

The study of the Schistosoma mansoni genome, one of the etiologic agents of human schistosomiasis, is essential for a better understanding of the biology and development of this parasite. In order to get an overview of all S. mansoni catalogued gene sequences, we performed a clustering analysis of the parasite mRNA sequences available in public databases. This was made using softwares PHRAP and CAP3. The consensus sequences, generated after the alignment of cluster constituent sequences, allowed the identification by database homology searches of the most expressed genes in the worm. We analyzed these genes and looked for a correlation between their high expression and parasite metabolism and biology. We observed that the majority of these genes is related to the maintenance of basic cell functions, encoding genes whose products are related to the cytoskeleton, intracellular transport and energy metabolism. Evidences are presented here that genes for aerobic energy metabolism are expressed in all the developmental stages analyzed. Some of the most expressed genes could not be identified by homology searches and may have some specific functions in the parasite.

Localitzador Gràfic de Direccions IP 'IpLocInspector'

En aquest treball s'ha desenvolupat una aplicació capaç de localitzar adreces IP.

Implantación de una solución SIG para la ayuda a la toma dedecisiones para la explotación de recursos del subsuelo

L'objectiu és una aplicació que permeti realitzar el càlcul del volum de terres disponibles en el subsòl d'un àrea seleccionada. L'objectiu final del projecte serà crear un Sistema d'Informació Geogràfica SIG que ajudi a valorar quines parcel¿les de l'àrea seleccionada són les que disposen de més volum de terres per iniciar la seva explotació. Per a això, es disposa del programari gvSIG i les seves extensions (SEXTANTE) i de tota la informació que es pugui obtenir sobre els SIG, Cartografia, Geodèsia... Per dur a terme aquest projecte es necessita tenir experiència en Bases de dades, Programació Orientada a Objectes i seria recomanable tenir coneixements sobre Enginyeria del Programador. El projecte se centrarà en la utilització de gvSIG, com un exemple concret de programari SIG de lliure accés, solució desenvolupada per la ¿Conselleria d%o2019Obris Publiquis de la Generalitat Valenciana¿. Una part d'aquest projecte consistirà a avaluar aquest programari. El resultat final serà l'obtenció dels coneixements necessaris per poder treballar amb dades espacials a més d'una aplicació SIG per al càlcul del volum de terres d'un àrea seleccionada.

TFC de base de dades relacionals

El projecte consisteix en crear un disseny de base de dades segons els requeriments del client, en aquest cas la comunitat Europea, que emmagatzemi les dades de la futura aplicació que gestionarà les votacions ciutadanes. A més del disseny de la base de dades, el projecte haurà d'incorporar una sèrie de processos que consultin dades que podran ser demanades pel programari que faci la interacció amb els usuaris. Programari que no està inclòs en aquesta fase del pla de la Comunitat Europea.

Sistema de votació ciutadana a nivell europeu a través d¿Internet

Hem de dissenyar una base de dades que serveixi a la Comunitat Europea de magatzem d'informació per a la futura aplicació de votacions ciutadanes a través d'Internet. En aquest document presentem l'anàlisi, el disseny i l'estructura implementada detallant les taules i els seus atributs i les funcions i procediments emmagatzemats posats a disposició dels programadors de l'aplicació de gestió.

Disseny i implementació d'un sistema de gestió de votacions a través d'Internet en l'àmbit europeu

Treball de fi de carrera que consisteix en el disseny i implementació d'una base de dades relacional que serveixi com a magatzem de dades per a una aplicació de votacions a través d'internet en l'àmbit europeu.

Disseny i implementació d'una base de dades relacional per al manteniment d'aparells d'una empresa

Aquest projecte neix de la necessitat de la nostra empresa client de controlar la gestió del manteniment de tots els equips que té instal·lats en 32 centres i del qual s'encarreguen diverses empreses de serveis especialitzades. Així, per una banda, es tracta de fer l'anàlisi i disseny de la base de dades operacional, els scripts de creació necessaris per a crear la base de dades e implementar els procediments mitjançant els quals es gestionarà i accedirà a la informació de la base de dades. I per una altra banda, es tracta de fer l'anàlisi, disseny e implementació d'un magatzem de dades, per tal de poder explotar la informació per a la presa de decisions.

Disseny i implementació d'un sistema de votació ciutadana a nivell europeu a través d'Internet

El següent treball de final de carrera té com a objectiu dissenyar i implementar una base de dades que serveixi de magatzem d'informació, per a una aplicació de votacions ciutadanes a través d'Internet i així poder donar resposta a la petició feta per la Comunitat Europea, complint tots els requisits especificats en aquesta petició.

Disseny i implementació d'una base de dades relacional per al manteniment d'aparells d'una empresa

Realización del diseño e implementación de una base de datos relacional que cubra las necesidades del mantenimiento de los equipos instalados en los diferentes centros de una empresa. El acceso a las tablas y datos se ha realizado mediante la creación de procedimientos almacenados.

Disseny i implementació de la base de dades : Sistema de votació ciutadana a nivell Europeu a través d'Internet

La Comunitat Europea ha encarregat el disseny i implementació d'una base de dades per a un futur sistema de votacions ciutadanes per Internet. Aquest projecte realitza una proposta del disseny de la base de dades segons els requeriments especificats, i la seva implementació en un sistema de gestió de bases de dades, que en aquest cas és l'ORACLE.

Disseny i implementació d'una base de dades relacional

Bases de dades i magatzems de dades: disseny i implementació d'una base de dades relacional per al manteniment d'aparells d'una empresa.

Disseny i implementació de la base de dades d'un sistema de votació ciutadà a nivell Europeu a través d'Internet

La Comunitat Europea desitja implementar una aplicació per a gestionar les votacions ciutadanes a través d'Internet. Aquesta, dins de la partida pressupostària destinada a fomentar la participació ciutadana dins de l'àmbit polític Europeu, ha decidit obrir un concurs públic per rebre propostes sobre el disseny d'una base de dades (BD) que els hi serveixi de magatzem d'informació per a la futura aplicació.