Molecular epidemiology of the SH (small hydrophobic) gene of human respiratory syncytial virus (HRSV), over 2 consecutive years

Human respiratory syncytial virus (HRSV) strains were isolated from nasopharyngeal aspirates collected from 965 children between 2004 and 2005, yielding 424 positive samples. We sequenced the small hydrophobic protein (SH) gene of 117 strains and compared them with other viruses identified worldwide. Phylogenetic analysis showed a low genetic variability among the isolates but allowed us to classify the viruses into different genotypes for both groups, HRSVA and HRSVB. It is also shown that the novel BA-like genotype was well segregated from the others, indicating that the mutations are not limited to the G gene. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Geochemical evidence of the 8.2 ka event and other Holocene environmental changes recorded in paleolagoon sediments, southeastern Brazil

The paleoclimatic record of Jureia Paleolagoon, coastal southeastem Brazil, includes cyclic and gradual changes with different intensities and frequencies through geological time, and it is controlled by astronomical, geophysical, and geological phenomena. These variations are not due to one single cause, but they result from the interaction of several factors, which act at different temporal and spatial scales. Here, we describe paleoenvironmental evidence regarding climatic and sea level changes from the last 9400 cal yr BP at the Jureia Paleolagoon - one of the main groups of protected South Atlantic ecosystems. Geochemical evidences were used to identify anomalies from multi-proxy analyses of a paleolagoon sediment core. The anomalies of centennial scale were correlated to climate and transgression-regression cycles from the Holocene period. Decadal scale anomalous oscillations in the Quaternary paleolagoon sediments occur between 9400 and 7500 cal yr BP, correlated with long- and short-term natural events, which generated high sedimentation rates, mainly between 8385 and 8375 cal yr BP (10 cm/yr). Our results suggest that a modem-day short-duration North Atlantic climatic event, such as the 82 ka event, could affect the environmental equilibrium in South America and intensify the South American Summer Monsoon. (C) 2011 University of Washington. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

Kernspektroskopie an N=40 und N=82 Nukliden

Der astrophysikalische r-Prozeß (schneller Neutroneneinfang), ist verantwortlich für die Nukleosynthese einer großen Zahl von Elementen, die schwerer als Eisen sind. Benutzt man das ''waiting-point''-Modell, so kann die Häufigkeitsverteilung der Elemente durch drei nukleare und drei stellare Input-Parameter beschrieben werden. Für einen gegebenen Satz von stellaren Parametern definiert die Neutronenseparationsenergie (Sn) den r-Prozeß-Pfad. Die beta-Zerfall-Halbwertszeit (T1/2) der Kerne im r-Prozeß-Pfad bestimmt die Häufigkeit des Vorläufers und bezieht man die Neutronenemissionswahrscheinlichkeit (Pn) mit ein, so auch die endgültige Häufigkeitsverteilung. Von besonderer Wichtigkeit sind die neutronenreichen ''waiting-point''-Isotope. Zum Beispiel sind die N=82 Isotope verantwortlich für den solaren A~130 Häufigkeits-Peak. Diese Arbeit befaßt sich mit der Identifizierung und der Untersuchung von Zerfallseigenschaften neutronenreicher Isotope des Mangan (A=61 bis 69) und Cadmium (A=130 bis 132). Neutronenreiche Nuklide zu erzeugen und zu detektieren ist ein komplizierter und zeitaufwendiger Prozeß, nichts desto trotz erfolgreich. Das Hauptproblem bei dieser Art von Experimenten ist der hohe isobare Untergrund. Aus diesem Grunde wurden speziell entwickelte Anregungsschemata für Mangan und Cadmium eingesetzt, um die gewünschten Isotope mittels Laser-Resonanzionisation chemisch selektiv zu ionisieren. Bei CERN/ISOLDE war es möglich im Massenbereich von 60^Mn bis 69^Mn neue Halbwertszeiten und Pn-Werte zu bestimmen. Für 64^Mn und 66^Mn konnten darüber hinaus erstmals noch partielle Zerfallsschemata aufgestellt werden. Es zeigte sich, daß die Ergebnisse teilweise recht überraschend waren, da sie nicht durch das QRPA-Modell vorhergesagt wurden. Mit Hilfe vergleichender Studien des Gesamttrends der Niveausystematiken der gg-Kerne von 26_Fe, 30_Zn, 32_Ge, 24_Cr und 28_Ni konnte ein Verschwinden der sphärischen N=40 Unterschale und die Existenz einer neuen Region mit signifikanter Deformation nachgewiesen werden, die vermutlich ihr ''Zentrum'' bei 64^Cr hat. Ebenfalls zeigen Studien der Niveausystematik bei 48Cd und der Vergleich mit 46_Pd, 54_Xe, 52_Te und 50_Sn, erste Hinweise eines Schalenquenchings bei N=82. Es wurde die Messung der Halbwertszeit von 130^Cd verbessert und die Halbwertszeiten von 131^Cd und 132^Cd erstmals bestimmt. Die neuen Daten können nur erklärt werden, wenn man bei der QRPA-Rechnung verbotene Übergänge mitberücksichtigt. Es genügt nicht, die Rechnung für reinen Gamow-Teller-Zerfall durchzuführen.

COX-2 expression in operable triple negative breast cancer: A hospital based cross-sectional study

Objectives. Triple Negative Breast Cancer (TNBC) lack expression of estrogen receptors (ER), progesterone receptors (PR), and absence of Her2 gene amplification. Current literature has identified TNBC and over-expression of cyclo-oxygenase-2 (COX-2) protein in primary breast cancer to be independent markers of poor prognosis in terms of overall and distant disease free survival. The purpose of this study was to compare COX-2 over-expression in TNBC patients to those patients who expressed one or more of the three tumor markers (i.e. ER, and/or PR, and/or Her2).^ Methods. Using a secondary data analysis, a cross-sectional design was implemented to examine the association of interest. Data collected from two ongoing protocols titled "LAB04-0657: a model for COX-2 mediated bone metastasis (Specific aim 3)" and "LAB04-0698: correlation of circulating tumor cells and COX-2 expression in primary breast cancer metastasis" was used for analysis. A sample of 125 female patients was analyzed using Chi-square tests and logistic regression models. ^ Results. COX-2 over-expression was present in 33% (41/125) and 28% (35/124) patients were identified as having TNBC. TNBC status was associated with elevated COX-2 expression (OR= 3.34; 95% CI= 1.40–8.22) and high tumor grade (OR= 4.09; 95% CI= 1.58–10.82). In a multivariable analysis, TNBC status was an important predictor of COX-2 expression after adjusting for age, menopausal status, BMI, and lymph node status (OR= 3.31; 95% CI: 1.26–8.67; p=0.01).^ Conclusion. TNBC is associated with COX-2 expression—a known marker of poor prognosis in patients with operable breast cancer. Replication of these results in a study with a larger sample size, or a future randomized clinical trial demonstrating an improved prognosis with COX-2 suppression in these patients would support this hypothesis.^