PÓS-GRADUAÇÃO, PRODUÇÃO ACADÊMICA, INTERDISCIPLINARIDADE E SOCIALIZAÇÃO DO CONHECIMENTO: A PRODUÇÃO CIENTÍFICA DO GRANDE ABC À LUZ DO PNPG 2011-2020

O objetivo desta investigação foi verificar se, diante da autonomia e vocação que possuem, bem como da possibilidade de receber amparo e incentivos governamentais, as universidades pertencentes à região do Grande ABC atenderam as recomendações feitas pelo PNPG vigente. Para tanto, foram analisadas cinquenta e sete dissertações e duas teses da área de ciências sociais aplicadas, publicadas no período entre 2011 e 2014, pelas seguintes instituições: Universidade Metodista de São Paulo (UMESP); Universidade Municipal de São Caetano do Sul (USCS); Universidade Federal do ABC (UFABC) e Faculdade de Engenharia Industrial (FEI). Essa averiguação se deu ao redor de dois eixos organizadores do PNPG 2011-2014: o terceiro eixo – o aperfeiçoamento da avaliação e sua expansão para outros segmentos do sistema de CT&I (formação de pós-graduados voltados para atividades extra-acadêmicas/setor empresarial) e o quarto eixo – a multi e a interdisciplinaridade entre as principais características da pós-graduação e importantes temas da pesquisa (promover, por meio de programas, áreas de concentração e linhas de pesquisa, a convergência de temas e compartilhamento de problemas em oposição à sua mera associação ou sobreposição). Este estudo – qualitativo, bibliográfico, documental, exploratório, descritivo, tipo estado do conhecimento – se desenvolveu por meio de pesquisa documental e de análise de conteúdo temático categorial. A coleta de dados foi feita por meio dos repositórios digitais de teses e dissertações mantidos na internet pelas Universidades, cuja produção científica foi investigada. Após a análise dos dados ficou demonstrado que aproximadamente 68,96% da produção científica da área de ciências sociais aplicadas, publicada pelas universidades do Grande ABC, no período entre 2011 e 2014, corresponde às expectativas do PNPG atual no que diz respeito às recomendações constantes no terceiro eixo. Em relação às recomendações feitas no texto do quarto eixo, vemos que aproximadamente 31,03% dos trabalhos selecionados atendem às expectativas do Plano, apresentando em sua estrutura, segundo a fundamentação teórica utilizada neste trabalho, características de interdisciplinaridade.

PÓS-GRADUAÇÃO, PRODUÇÃO ACADÊMICA, INTERDISCIPLINARIDADE E SOCIALIZAÇÃO DO CONHECIMENTO: A PRODUÇÃO CIENTÍFICA DO GRANDE ABC À LUZ DO PNPG 2011-2020

O objetivo desta investigação foi verificar se, diante da autonomia e vocação que possuem, bem como da possibilidade de receber amparo e incentivos governamentais, as universidades pertencentes à região do Grande ABC atenderam as recomendações feitas pelo PNPG vigente. Para tanto, foram analisadas cinquenta e sete dissertações e duas teses da área de ciências sociais aplicadas, publicadas no período entre 2011 e 2014, pelas seguintes instituições: Universidade Metodista de São Paulo (UMESP); Universidade Municipal de São Caetano do Sul (USCS); Universidade Federal do ABC (UFABC) e Faculdade de Engenharia Industrial (FEI). Essa averiguação se deu ao redor de dois eixos organizadores do PNPG 2011-2014: o terceiro eixo – o aperfeiçoamento da avaliação e sua expansão para outros segmentos do sistema de CT&I (formação de pós-graduados voltados para atividades extra-acadêmicas/setor empresarial) e o quarto eixo – a multi e a interdisciplinaridade entre as principais características da pós-graduação e importantes temas da pesquisa (promover, por meio de programas, áreas de concentração e linhas de pesquisa, a convergência de temas e compartilhamento de problemas em oposição à sua mera associação ou sobreposição). Este estudo – qualitativo, bibliográfico, documental, exploratório, descritivo, tipo estado do conhecimento – se desenvolveu por meio de pesquisa documental e de análise de conteúdo temático categorial. A coleta de dados foi feita por meio dos repositórios digitais de teses e dissertações mantidos na internet pelas Universidades, cuja produção científica foi investigada. Após a análise dos dados ficou demonstrado que aproximadamente 68,96% da produção científica da área de ciências sociais aplicadas, publicada pelas universidades do Grande ABC, no período entre 2011 e 2014, corresponde às expectativas do PNPG atual no que diz respeito às recomendações constantes no terceiro eixo. Em relação às recomendações feitas no texto do quarto eixo, vemos que aproximadamente 31,03% dos trabalhos selecionados atendem às expectativas do Plano, apresentando em sua estrutura, segundo a fundamentação teórica utilizada neste trabalho, características de interdisciplinaridade.

Identification of the vitamin K-dependent carboxylase active site: Cys-99 and Cys-450 are required for both epoxidation and carboxylation

The vitamin K-dependent carboxylase modifies and renders active vitamin K-dependent proteins involved in hemostasis, cell growth control, and calcium homeostasis. Using a novel mechanism, the carboxylase transduces the free energy of vitamin K hydroquinone (KH2) oxygenation to convert glutamate into a carbanion intermediate, which subsequently attacks CO2, generating the γ-carboxylated glutamate product. How the carboxylase effects this conversion is poorly understood because the active site has not been identified. Dowd and colleagues [Dowd, P., Hershline, R., Ham, S. W. & Naganathan, S. (1995) Science 269, 1684–1691] have proposed that a weak base (cysteine) produces a strong base (oxygenated KH2) capable of generating the carbanion. To define the active site and test this model, we identified the amino acids that participate in these reactions. N-ethyl maleimide inhibited epoxidation and carboxylation, and both activities were equally protected by KH2 preincubation. Amino acid analysis of 14C- N-ethyl maleimide-modified human carboxylase revealed 1.8–2.3 reactive residues and a specific activity of 7 × 108 cpm/hr per mg. Tryptic digestion and liquid chromatography electrospray mass spectrometry identified Cys-99 and Cys-450 as active site residues. Mutation to serine reduced both epoxidation and carboxylation, to 0.2% (Cys-99) or 1% (Cys-450), and increased the Kms for a glutamyl substrate 6- to 8-fold. Retention of some activity indicates a mechanism for enhancing cysteine/serine nucleophilicity, a property shared by many active site thiol enzymes. These studies, which represent a breakthrough in defining the carboxylase active site, suggest a revised model in which the glutamyl substrate indirectly coordinates at least one thiol, forming a catalytic complex that ionizes a thiol to initiate KH2 oxygenation.

Subgenome chromosome walking in wheat: A 450-kb physical contig in Triticum monococcum L. spans the Lr10 resistance locus in hexaploid wheat (Triticum aestivum L.)

For many agronomically important plant genes, only their position on a genetic map is known. In the absence of an efficient transposon tagging system, such genes have to be isolated by map-based cloning. In bread wheat Triticum aestivum, the genome is hexaploid, has a size of 1.6 × 1010 bp, and contains more than 80% of repetitive sequences. So far, this genome complexity has not allowed chromosome walking and positional cloning. Here, we demonstrate that chromosome walking using bacterial artificial chromosome (BAC) clones is possible in the diploid wheat Triticum monococcum (Am genome). BAC end sequences were mostly repetitive and could not be used for the first walking step. New probes corresponding to rare low-copy sequences were efficiently identified by low-pass DNA sequencing of the BACs. Two walking steps resulted in a physical contig of 450 kb on chromosome 1AmS. Genetic mapping of the probes derived from the BAC contig demonstrated perfect colinearity between the physical map of T. monococcum and the genetic map of bread wheat on chromosome 1AS. The contig genetically spans the Lr10 leaf rust disease resistance locus in bread wheat, with 0.13 centimorgans corresponding to 300 kb between the closest flanking markers. Comparison of the genetic to physical distances has shown large variations within 350 kb of the contig. The physical contig can now be used for the isolation of the orthologous regions in bread wheat. Thus, subgenome chromosome walking in wheat can produce large physical contigs and saturate genomic regions to support positional cloning.

Expression of γ-aminobutyric acid ρ1 and ρ1Δ450 as gene fusions with the green fluorescent protein

The functional characteristics and cellular localization of the γaminobutyric acid (GABA) ρ1 receptor and its nonfunctional isoform ρ1Δ450 were investigated by expressing them as gene fusions with the enhanced version of the green fluorescent protein (GFP). Oocytes injected with ρ1-GFP had receptors that gated chloride channels when activated by GABA. The functional characteristics of these receptors were the same as for those of wild-type ρ1 receptors. Fluorescence, because of the chimeric receptors expressed, was over the whole oocyte but was more intense near the cell surface and more abundant in the animal hemisphere. Similar to the wild type, ρ1Δ450-GFP did not lead to the expression of functional GABA receptors, and injected oocytes failed to generate currents even after exposure to high concentrations of GABA. Nonetheless, the fluorescence displayed by oocytes expressing ρ1Δ450-GFP was distributed similarly to that of ρ1-GFP. Mammalian cells transfected with the ρ1-GFP or ρ1Δ450-GFP constructs showed mostly intracellularly distributed fluorescence in confocal microscope images. A sparse localization of fluorescence was observed in the plasma membrane regardless of the cell line used. We conclude that ρ1Δ450 is expressed and transported close to, and perhaps incorporated into, the plasma membrane. Thus, ρ1- and ρ1Δ450-GFP fusions provide a powerful tool to visualize the traffic of GABA type C receptors.