Combining food web and species distribution models for improved community projections

The ability to model biodiversity patterns is of prime importance in this era of severe environmental crisis. Species assemblage along environmental gradient is subject to the interplay of biotic interactions in complement to abiotic environmental filtering. Accounting for complex biotic interactions for a wide array of species remains so far challenging. Here, we propose to use food web models that can infer the potential interaction links between species as a constraint in species distribution models. Using a plant-herbivore (butterfly) interaction dataset, we demonstrate that this combined approach is able to improve both species distribution and community forecasts. Most importantly, this combined approach is very useful in rendering models of more generalist species that have multiple potential interaction links, where gap in the literature may be recurrent. Our combined approach points a promising direction forward to model the spatial variation of entire species interaction networks. Our work has implications for studies of range shifting species and invasive species biology where it may be unknown how a given biota might interact with a potential invader or in future climate.

The value of ultrasonography in assessment of portal hypertension in hepatosplenic schistosomiasis

Ultrasonography can reveal most of the manifestations of portal hypertension complicating hepatosplenic, schistosomiasis. However, direct demonstration of gastroesophageal varices by ultrasonography is still very difficult. An attempt was done to correlate sonographic features of portal hypertension with the degree of fibrosis to screen patients having varices and predicting their chance of bleeding. The results obtained were found to be consistent with the esophagogastric endoscopy and with history of hematemesis. Four parameters were used, size of spleen, degree of periportal fibrosis, presence of collaterals and portal vein diameter. A pilot field survey was also done adopting the same principle.

Desarrollo de una aplicación web para representación de datos de posicionamiento

En aquesta memòria s’explica el desenvolupament d’una eina útil que permet a l’usuari visualitzar en l’aplicació Google Maps les dades de posicionament captats en una sessió GPS. En aquest projecte, hem dissenyat una aplicació Web en la qual recollim les dades ingressades per l’usuari mitjançant un formulari. Un cop emmagatzemades aquestes dades en el servidor, la nostra eina hi executa l’aplicació encarregada del càlcul de les posicions. Aquesta és un script desenvolupat en MATLAB, que s’encarrega d’interpretar les dades subministrades per l’usuari, amb les quals es poden calcular les coordenades captades pel receptor GPS. Una vegada calculades, el software les emmagatzema en el servidor, en un arxiu .xml, que serà el que posteriorment interpretarà Google Maps gràcies al seu API. D’aquesta manera, l’usuari obtindrà el resultat visual de la sessió GPS que hagi decidit carregar sense necessitat des disposar de cap software específic per a la interpretació i el càlcul de les dades que hi ha capturat.

Portal hypertension in schistosomiasis: pathophysiology and treatment

In heavily infected young patients, there is a "non-congestive" phase of the disease with splenomegaly which can improve after chemoterapy. A strong correlation between hepatosplenic form and worm burden in young patients has been repeatedly shown. The pattern of vascular intrhepatic lesions seems to depend on two mechanisms: (a) egg embolization, with a partial blocking of the portal vasculature; (b) the appearance of small portal collaterals along the intrahepatic portal sistem. The role played by hepatitis B virus (HBV) and C virus infections in the pathogenesis of liver lesions is variably considered. Selective arteriography shows a reduced diameter of hepatic artery with thin and arched branches outlining vascular gaps. A rich arterial network , as described in autopsy cases, is usually not seen in vivo, except after splenectomy or shunt surgery. An augmented hepatic arterial flow was demonstrated in infected animals. These facts suggest that the poor intrahepatic arterial vascularization demonstrated by selective arteriography in humans is due to a "functional deviation"of arterial blood to the splenic territory. The best results obtained in treatment of portal hypertension were: esophagogastric desvascularization and splenectomy (EGDS), although risk of rebleeding persists; classical (proximal) splenorenal shunt (SRS) should be abandoned; distal splenorenal shunt may complicate with hepatic encephalopaty, although later and in a lower percentage than in SRS. Propranolol is currently under investigation. In our Department, schistosomotic patients with esophageal varices bleeding are treated by EGDS and, if rebleeding occurs, by sclerosis of the varices.

Avaliação crítica da cirurgia na hipertensão portal esquistossômica

There are over 100.000 patients affected by schistosomotic portal hipertension, that may suffer rupture of the esophageal varices. Besides the portal hypertension, local factors must be emphazised as responsible for the three distal centimeters of the esophagus, called "zona vulnerável" (vulnerable zone). The beter liver functional reserve of these schistosomotic patients as compared to the cirrhotic, present two favorable condititions: (1) beter possibility of conservative treatment during acute hemorrhage; (2) elective surgical treatment may be undergo without a mandatory step of large portal descompression. The Author only indicate surgical treatment in patients with hemorrhage antecedence and his preference consist in splenectomy plus obliterative suture of the varices at the "vulnerable zone" and when possible, ligature of left gastric vein also; 358 patients were undergone surgery with operative mortality 3.07%, 347 were followed during 1 to 25 years; late mortality 8.38%; recurrence hemorrage 11.58%; none porto-sustemic encephalopaty was observed.

A web-based pilot study of inter-pathologist reproducibility using the ISHLT 2004 working formulation for biopsy diagnosis of cardiac allograft rejection: The European experience.

BACKGROUND: The aim of this study was to assess, at the European level and using digital technology, the inter-pathologist reproducibility of the ISHLT 2004 system and to compare it with the 1990 system We also assessed the reproducibility of the morphologic criteria for diagnosis of antibody-mediated rejection detailed in the 2004 grading system. METHODS: The hematoxylin-eosin-stained sections of 20 sets of endomyocardial biopsies were pre-selected and graded by two pathologists (A.A. and M.B.) and digitized using a telepathology digital pathology system (Aperio ImageScope System; for details refer to http://aperio.com/). Their diagnoses were considered the index diagnoses, which covered all grades of acute cellular rejection (ACR), early ischemic lesions, Quilty lesions, late ischemic lesions and (in the 2005 system) antibody-mediated rejection (AMR). Eighteen pathologists from 16 heart transplant centers in 7 European countries participated in the study. Inter-observer reproducibility was assessed using Fleiss's kappa and Krippendorff's alpha statistics. RESULTS: The combined kappa value of all grades diagnosed by all 18 pathologists was 0.31 for the 1990 grading system and 0.39 for the 2005 grading system, with alpha statistics at 0.57 and 0.55, respectively. Kappa values by grade for 1990/2005, respectively, were: 0 = 0.52/0.51; 1A/1R = 0.24/0.36; 1B = 0.15; 2 = 0.13; 3A/2R = 0.29/0.29; 3B/3R = 0.13/0.23; and 4 = 0.18. For the 2 cases of AMR, 6 of 18 pathologists correctly suspected AMR on the hematoxylin-eosin slides, whereas, in each of 17 of the 18 AMR-negative cases a small percentage of pathologists (range 5% to 33%) overinterpreted the findings as suggestive for AMR. CONCLUSIONS: Reproducibility studies of cardiac biopsies by pathologists in different centers at the international level were feasible using digitized slides rather than conventional histology glass slides. There was a small improvement in interobserver agreement between pathologists of different European centers when moving from the 1990 ISHLT classification to the "new" 2005 ISHLT classification. Morphologic suspicion of AMR in the 2004 system on hematoxylin-eosin-stained slides only was poor, highlighting the need for better standardization of morphologic criteria for AMR. Ongoing educational programs are needed to ensure standardization of diagnosis of both acute cellular and antibody-mediated rejection.

Sistema Web para compartir plazas de parking

El proyecto da la posibilidad a las personas que tienen una plaza de aparcamiento y que durante el día, la noche, fines de semana o en un horario variable la dejan libre para ir al trabajo o para estudiar fuera de los municipios, la puedan intercambiar, alquilar o vender con otras personas que vengan a trabajar y/o estudiar a la ciudad donde se encuentra la plaza. En este proyecto se presenta un buscador inteligente que lista las plazas por proximidad y la georeferencia en un mapa para saber la localización. Además: el servicio Web da la posibilidad de subir fotografías para más detalle, se dota al usuario de contratos legales, cumple las normativas de accesibilidad a nivel AA, así como los test de validación de xHtml y Css, y además se puede integrar perfectamente en las páginas de los clientes.

SWORD : utilitat per a la integració de repositoris amb aplicacions de gestió docent

A la Universitat Politècnica de Catalunya (UPC) el procés de gestió de les memòries dels projectes de final de carrera i màster està en funció del model organitzatiu de cada escola o facultat. Aquest escenari implica diferents fluxos de treball i de temps per al dipòsit d'aquestes memòries en el repositori del portal d'accés obert al coneixement UPCommons (www.upcommons.edu) Amb la voluntat de no incidir en aquests processos de cada escola o facultat, s'ha desenvolupat amb la Facultat d'Informàtica de Barcelona (FIB) un sistema d'integració de les memòries i les seves dades associats de forma transparent durant el procés administratiu per mitjà d'uns connectors desenvolupats conjuntament pel servei de Biblioteques de la UPC i el laboratori de càlcul de la FIB. Aquests connectors es basen en la tecnologia SWORD (Simple Web-services Offering Repository Deposit) que per mitjà de XML codifiquen les dades introduïdes i els pre-bolquen en el dipòsit de treballs acadèmics abans de la lectura de la memòria.

DUGi, portal d'accés als materials en obert de la UdG

Desprès d'un cert temps de rodatge amb els tres repositoris institucionals de la UdG: DUGiDocs, DUGiMedia i DUGiFonsEspecials, haver-los migrat a la versió 1.5.2 de Dspace, i millorat les prestacions que ens permet el programari, ha arribat el moment de millorar l'eina que ens permet fer que el DUGi sigui un portal útil des del punt de vista de la usabilitat, visibilitat i difusió dels materials que es poden consultar als diferents repositoris.

Migració d’una aplicació estàndard de gestió (catàleg fotogràfic del parc de Collserola) a entorn web

La constant evolució que estan experimentant les tecnologies d’informació fa que cada vegada els programes es vagin quedant més obsolets, a la vegada que cada vegada són més els programes nous, amb noves funcionalitats, nous avantatges, llicències gratuïtes, etc. El Consorci del Parc de Collserola es veu amb la necessitat d’investigar en aquests nous camps que van sorgint per anar actualitzant-se. La nostra aplicació pretén ser un model de migració i desenvolupament d’una aplicació ja existent, que gestiona l’arxiu fotogràfic del parc de Collserola, a una aplicació de programari lliure que sigui d’accés a tot el públic via Internet, capaç de gestionar el catàleg de fotografies a la vegada que s’incorporen noves funcionalitats a l’aplicació. Pel desenvolupament de l’aplicació es farà servir Microsoft Visual Web Developer 2008 Express Edition afegint-hi una API de Google Maps, tots dos software de codi lliure.

Creación de una aplicación web basada en software libre para la visualización y consulta de información catastral del Ajuntament de Cerdanyola del Vallès

La aplicación web creada tiene como objetivo convertirse en un instrumento útil para la consulta de información catastral del municipio de Cerdanyola del Vallès, ampliando el alcance de la información al personal del Ajuntament. Entre esta información, se incluye cartografía catastral urbana y rústica de diferentes años y la posibilidad de efectuar una serie de consultas alfanuméricas sencillas sobre la misma.

Diseño, Desarrollo e Implementación de una aplicación WEB-MAP para la visualización y consulta de los proyectos ejecutados por AudingIntraesa

Consiste en el desarrollo de una aplicación WEB-MAP para la visualización y consulta de los proyectos ejecutados por AudingIntraesa. La tecnología utilizada fue MySQL como sistema de gestión de bases de datos, HTTP Apache como servidor web y Adobe Flex como entorno de desarrollo. Se creó una base de datos. Se diseñó una interfaz de usuario intuitiva, eficiente y atractiva. Se desarrollaron rutinas en AS3 para dotar de funcionalidades a la aplicación. Incluyen la consulta y actualización en tiempo de ejecución, descarga de ficheros externos, la fácil navegación por el mapa con capacidades de zoom, pan, cambio de mapas.

CAT (Curator Archiving Tool): improving access to web archives

PADICAT is the web archive created in 2005 in Catalonia (Spain ) by the Library of Catalonia (BC ) , the National Library of Catalonia , with the aim of collecting , processing and providing permanent access to the digital heritage of Catalonia . Its harvesting strategy is based on the hybrid model ( of massive harvesting . SPA top level domain ; selective compilation of the web site output of Catalan organizations; focused harvesting of public events) . The system provides open access to the whole collection , on the Internet . We consider necessary to complement the current search for new and visualization software with open source software tool, CAT ( Curator Archiving Tool) , composed by three modules aimed to effectively managing the processes of human cataloguing ; to publish directories where the digital resources and special collections ; and to offer statistical information of added value to end users. Within the framework of the International Internet Preservation Consortium meeting ( Vienna 2010) , the progress in the development of this new tool, and the philosophy that has motivated his design, are presented to the international community.