Assessing the effects of complexity in cross-temporal transferability of species distribution modelling predictions using palaeobotanical data

Valoración de la transferencia temporal de los modelos de distribución de especies para su aplicación en nuestros días utilizando datos paleobotánicos Corilus avellana y Alnus glutinosa.

Looking for the Holy Grail of Software Development

The history of Software Engineering has been marked by many famous project failures documented in papers, articles and books. This pattern of lack of success has prompted the creation of dozens of software analysis, requirements definition, and design methods, programming languages, software development environments and software development processes all promoted as solving ?the software problem.? What we hear less about are software projects that were successful. This article reports on the findings of an extensive analysis of successful software projects that have been reported in the literature. It discusses the different interpretations of success and extracts the characteristics that successful projects have in common. These characteristics provide Software Project Managers with an agenda of topics to be addressed that will help ensure, not guarantee, that their software project will be successful.

Phase variation of the lpf operon is a mechanism to evade cross-immunity between Salmonella serotypes

Conventional wisdom holds that phase variation is a mechanism for immune evasion. However, despite fimbrial phase variation, mice previously exposed to Salmonella typhimurium are protected against a subsequent challenge. We evaluated whether lpf phase variation instead may be a mechanism to evade cross-immunity between Salmonella serotypes. Mice were immunized orally with S. typhimurium aroA mutants either that expressed the lpf operon (phase-on variant) or in which the entire lpf operon had been removed by deletion. During a subsequent challenge with virulent Salmonella enteritidis a selection against lpf phase-on variants was observed in mice previously exposed to S. typhimurium long polar fimbriae. Vaccination with S. typhimurium did not confer protection against challenge with S. enteritidis, presumably because lpf phase-off variants were able to evade cross-immunity. We propose that lpf phase variation is a mechanism to evade cross-immunity between Salmonella serotypes, thereby allowing their coexistence in a host population.

Peptides containing glutamine repeats as substrates for transglutaminase-catalyzed cross-linking: Relevance to diseases of the nervous system

Many proteins contain reiterated glutamine residues, but polyglutamine of excessive length may result in human disease by conferring new properties on the protein containing it. One established property of a glutamine residue, depending on the nature of the flanking residues, is its ability to act as an amine acceptor in a transglutaminase-catalyzed reaction and to make a glutamyl–lysine cross-link with a neighboring polypeptide. To learn whether glutamine repeats can act as amine acceptors, we have made peptides with variable lengths of polyglutamine flanked by the adjacent amino acid residues in the proteins associated with spinocerebellar ataxia type 1 (SCA1), Machado–Joseph disease (SCA3), or dentato-rubral pallido-luysian atrophy (DRPLA) or those residues adjacent to the preferred cross-linking site of involucrin, or solely by arginine residues. The polyglutamine was found to confer excellent substrate properties on any soluble peptide; under optimal conditions, virtually all the glutamine residues acted as amine acceptors in the reaction with glycine ethyl-ester, and lengthening the sequence of polyglutamine increased the reactivity of each glutamine residue. In the presence of transglutaminase, peptides containing polyglutamine formed insoluble aggregates with the proteins of brain extracts and these aggregates contained glutamyl–lysine cross-links. Repeated glutamine residues exposed on the surface of a neuronal protein should form cross-linked aggregates in the presence of any transglutaminase activated by the presence of Ca2+.

Viral cross talk: intracellular inactivation of the hepatitis B virus during an unrelated viral infection of the liver.

Hepatitis B virus (HBV) infection is thought to be controlled by virus-specific cytotoxic T lymphocytes (CTL). We have recently shown that HBV-specific CTL can abolish HBV replication noncytopathically in the liver of transgenic mice by secreting tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) and interferon gamma (IFN-gamma) after antigen recognition. We now demonstrate that hepatocellular HBV replication is also abolished noncytopathically during lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) infection, and we show that this process is mediated by TNF-alpha and IFN-alpha/beta produced by LCMV-infected hepatic macrophages. These results confirm the ability of these inflammatory cytokines to abolish HBV replication; they elucidate the mechanism likely to be responsible for clearance of HBV in chronically infected patients who become superinfected by other hepatotropic viruses; they suggest that pharmacological activation of intrahepatic macrophages may have therapeutic value in chronic HBV infection; and they raise the possibility that conceptually similar events may be operative in other viral infections as well.

Protein kinase cross-talk: membrane targeting of the beta-adrenergic receptor kinase by protein kinase C.

The beta-adrenergic receptor kinase (betaARK) is the prototypical member of the family of cytosolic kinases that phosphorylate guanine nucleotide binding-protein-coupled receptors and thereby trigger uncoupling between receptors and guanine nucleotide binding proteins. Herein we show that this kinase is subject to phosphorylation and regulation by protein kinase C (PKC). In cell lines stably expressing alpha1B- adrenergic receptors, activation of these receptors by epinephrine resulted in an activation of cytosolic betaARK. Similar data were obtained in 293 cells transiently coexpressing alpha1B- adrenergic receptors and betaARK-1. Direct activation of PKC with phorbol esters in these cells caused not only an activation of cytosolic betaARK-1 but also a translocation of betaARK immunoreactivity from the cytosol to the membrane fraction. A PKC preparation purified from rat brain phospborylated purified recombinant betaARK-1 to a stoichiometry of 0.86 phosphate per betaARK-1. This phosphorylation resulted in an increased activity of betaARK-1 when membrane-bound rhodopsin served as its substrate but in no increase of its activity toward a soluble peptide substrate. The site of phosphorylation was mapped to the C terminus of betaARK-1. We conclude that PKC activates betaARK by enhancing its translocation to the plasma membrane.

A Cross-Cultural Examination of the Use of Multimodal Metaphor in English and Arabic Cartoons of the ‘Arab Spring’ in Egypt

El estudio de Lakoff y Johnson Metáforas de la vida cotidiana (1980) ha dotado al campo de la metáfora de un renovado interés, y a éste siguieron numerosas publicaciones abordándolo desde diversas perspectivas. Lakoff y Johnson (1980) aseguran que la metáfora es, de hecho, una característica del pensamiento y, por consiguiente, ya no es una propiedad exclusiva del lenguaje. La metáfora sería en realidad un reflejo de cómo concebimos e interpretamos el mundo en que vivimos, en la medida en que está conformada por nuestras experiencias corporales, un fenómeno al que Lakoff y Johnson se refieren como la “mente corpórea”. La metáfora cumple la función de “comprender” y facilitar la interpretación de un ámbito o experiencia en los términos de otro ámbito o experiencia (Lakoff & Johnson, 1980: 36). Los conceptos abstractos son difíciles de ser pensados per se; consecuentemente, las personas recurren a la metáfora para concebirlos en los términos de otras nociones más concretas que están, en cierto grado, vinculadas a nuestras experiencias somáticas. Si bien no escasean las investigaciones en el campo de las metáforas, parece haber, sin embargo, cierto vacío en lo tocante a la manifestación de la metáfora en modos distintos del modo verbal. Forceville (2009: 19) afirma que uno de los principios fundamentales de la Teoría de la Metáfora Conceptual es la idea de que el variado empleo de metáforas por parte del ser humano sugiere “que piensa en gran medida metafóricamente”. Esto lleva a la conclusión de que la manifestación de la metáfora debería estar presente en los diversos modos del pensamiento, y no únicamente en el verbal. Estos otros modos de pensamiento incluyen, entre otros, las imágenes, la música, los sonidos y los gestos. Asimismo, la mayoría de estudios que se han realizado en el área de las metáforas multimodales ha sido aplicada al terreno de la publicidad. Los anunciantes parecen advertir el ! 2! poder que se invierte en las metáforas, y las usan profusamente para transmitir mensajes a los consumidores. No obstante, recientemente existe un nuevo interés por investigar el uso de metáforas multimodales en las caricaturas (véase, por ejemplo, El Refaie 2003, 2009; Schilperoord y Maes 2009; Yus 2009; Bergen 2003; Marin Aresse 2008). Las tiras cómicas se distinguen de los anuncios principalmente por el hecho de que las caricaturas transmiten una postura negativa frente a un sujeto particular, mientras que los anuncios presentan una actitud positiva. Igualmente, les diferencia el hecho de que las tiras cómicas requieren un conocimiento social y político específico. El presente escrito examina y compara el uso de metáforas multimodales en caricaturas políticas – tanto inglesas como árabes – que retratan la Primavera Árabe en Egipto, con el fin de determinar: (1) si la mayoría de caricaturas son conceptualmente específicas o culturalmente específicas; (2) los principales dominios fuente empleados por los caricaturistas ingleses y árabes para interpretar la Primavera Árabe; (3) si hay semejanzas o diferencias entre las caricaturas inglesas y las árabes en su elección del dominio meta; y (4) observar también cómo los distintos modos (aquí esencialmente los modos verbal y pictórico) contribuyen a representar la Primavera Árabe. El corpus para este estudio se compone de un total de 50 tiras cómicas, 25 de ellas inglesas y las 25 restantes árabes. En cada una de estas tiras debe haber al menos una metáfora que representa la Primavera Árabe o alguno de sus subtemas. Las tiras han sido seleccionadas aleatoriamente a través de Internet. Para el análisis, la investigadora ha seguido el marco teórico propuesto por Bounegru y Forceville (2011) en cuanto a la determinación de metáforas en general, así como la determinación de metáforas multimodales de tipo verbovisual en particular. Por cada tira cómica se ha llevado a cabo un análisis independiente, determinando el dominio fuente y el dominio meta, las metáforas, las asignaciones, qué se está representando verbalmente y qué se representa pictóricamente. Además, la autora ha analizado ! 3! posteriormente si estas metáforas son culturalmente específicas o no, y/o si están relacionadas con metáforas más genéricas o universales. El análisis que comprende este trabajo se divide en dos secciones. La primera parte es un estudio detallado de los dos corpora, abordando los distintos escenarios de los dominios fuente empleados por los dibujantes según su similitud. Esta sección presenta a su vez un análisis de los diversos modos que se utilizan para revelar el dominio fuente así como el dominio meta. Del mismo modo, se incluyen las metáforas específicas manejadas en cada tira cómica y, cuando se da el caso, aquellas metáforas genéricas o universales a las que remite. La segunda sección del análisis presenta una comparativa entre ambos corpora basada en el análisis expuesto en la primera parte. Además, trata varios de los fenómenos lingüísticos a los que han recurrido frecuentemente los dibujantes ingleses y árabes. Estos fenómenos son principalmente la metonimia y la personificación. Igualmente, en esta sección la autora investiga en mayor profundidad las metáforas usadas por los dibujantes ingleses y los árabes, determinando si son ora conceptualmente específicas, ora culturalmente específicas, a partir del hecho de que las metáforas sirven como herramienta para reconocer la forma en que personas distintas, o bien culturas distintas, interpretan varias cuestiones. Por ejemplo, a la hora de conceptualizar el futuro, algunas culturas lo representan espacialmente como delante del hablante, mientras que otras se refieren al mismo como localizado detrás del sujeto (Lakoff y Johnson 1980: 14). Este trabajo ha permitido varios hallazgos. En cuanto a las metáforas empleadas para representar la Primavera Árabe, tanto las tiras inglesas como las árabes han recurrido a una cierta variedad de metáforas. Algunas de las tiras presentan más de una metáfora operando a la vez. Los dibujantes ingleses y árabes parecen haberse apoyado siempre en el modo pictórico para presentar el dominio fuente, así como en el modo verbal para mostrar el dominio meta. ! 4! Además, respecto a la naturaleza de las metáforas que figuran en sendos corpora, casi todas las metáforas son conceptuales en cuanto que se corresponden con nuestras experiencias corporales; no hay, por otro lado, ninguna metáfora culturalmente específica. Asimismo, la única diferencia a este respecto entre ambos corpora es una variación en lo que constituye el prototipo de una categoría particular – aquí concretamente la categoría “primavera” en cada una de las culturas –. En las tiras inglesas, una flor es empleada para representar la primavera, mientras que en las árabes el elemento natural más frecuente para simbolizar la primavera es un árbol.

Student's cross-perception of the economic crises in the European Union and in Southeast Asia. EU Centre in Singapore Working Paper No. 11, December 2012

The financial crisis of 1997-1998 in Southeast Asia and the European Union’s financial crisis of 2008 followed by the sovereign debt crisis represented major policy events in the regions and beyond. The crises triggered policy adjustments with implications on economic and other policies. This paper aims at evaluating the perception of university students in the European Union (EU) and Southeast Asia on the management of these crises. It strives to confirm several ex ante assumptions about the relationship between students’ background, their policy orientation and their knowledge of the European Union and ASEAN policies. It also provides an analysis of the students’ evaluation of the geopolitical importance of the global regions and the EU and ASEAN policies. The paper is based on opinion surveys conducted during the first part of 2012 at four universities, two in the EU and two in ASEAN countries. In the eyes of EU and ASEAN students, the EU crisis is not being managed appropriately. The citizens of the EU surveyed were even significantly more critical of the EU’s anti-crisis measures than any other surveyed group. Their ASEAN counterparts were generally more positive in their evaluations.

Wschodnia granica zewnetrzna rozszerzonej Unii Europejskiej. Wspolpraca transgraniczna na nowej granicy wshodniej Unii Europejskiej. Rosyjskojezyczni na Lotwie i w Estonii. Prace OSW 14/2004. The Eastern external border of the enlarge European Union. Cross-border co-operation at the new Eastern border of the European Union. Russian-speakers in Latvia and Estonia. OSW Study 14/2004

Russians or so-called Russian-speakers in Latvia and Estonia pose a significant problem for both countries. Russian-speakers are a numerous minority in Latvia and Estonia, which causes deep division in these countries from the ethnical point of view. The problem of highest importance in the legal aspect is the unregulated status of the Russian-speakers. Though they are permanent residents of Latvia and Estonia many of them still do not have these countries' citizenship. The complex naturalisation procedure introduced by Latvia and Estonia soon after restoring independence in 1991 is considered to be main responsible for this.