Indirect likelihood inference

Given a sample from a fully specified parametric model, let Zn be a given finite-dimensional statistic - for example, an initial estimator or a set of sample moments. We propose to (re-)estimate the parameters of the model by maximizing the likelihood of Zn. We call this the maximum indirect likelihood (MIL) estimator. We also propose a computationally tractable Bayesian version of the estimator which we refer to as a Bayesian Indirect Likelihood (BIL) estimator. In most cases, the density of the statistic will be of unknown form, and we develop simulated versions of the MIL and BIL estimators. We show that the indirect likelihood estimators are consistent and asymptotically normally distributed, with the same asymptotic variance as that of the corresponding efficient two-step GMM estimator based on the same statistic. However, our likelihood-based estimators, by taking into account the full finite-sample distribution of the statistic, are higher order efficient relative to GMM-type estimators. Furthermore, in many cases they enjoy a bias reduction property similar to that of the indirect inference estimator. Monte Carlo results for a number of applications including dynamic and nonlinear panel data models, a structural auction model and two DSGE models show that the proposed estimators indeed have attractive finite sample properties.

Factores de rendimiento en aplicaciones híbridas

En el entorno actual, diversas ramas de las ciencias, tienen la necesidad de auxiliarse de la computación de altas prestaciones para la obtención de resultados a relativamente corto plazo. Ello es debido fundamentalmente, al alto volumen de información que necesita ser procesada y también al costo computacional que demandan dichos cálculos. El beneficio al realizar este procesamiento de manera distribuida y paralela, logra acortar los tiempos de espera en la obtención de los resultados y de esta forma posibilita una toma decisiones con mayor anticipación. Para soportar ello, existen fundamentalmente dos modelos de programación ampliamente extendidos: el modelo de paso de mensajes a través de librerías basadas en el estándar MPI, y el de memoria compartida con la utilización de OpenMP. Las aplicaciones híbridas son aquellas que combinan ambos modelos con el fin de aprovechar en cada caso, las potencialidades específicas del paralelismo en cada uno. Lamentablemente, la práctica ha demostrado que la utilización de esta combinación de modelos, no garantiza necesariamente una mejoría en el comportamiento de las aplicaciones. Por lo tanto, un análisis de los factores que influyen en el rendimiento de las mismas, nos beneficiaría a la hora de implementarlas pero también, sería un primer paso con el fin de llegar a predecir su comportamiento. Adicionalmente, supondría una vía para determinar que parámetros de la aplicación modificar con el fin de mejorar su rendimiento. En el trabajo actual nos proponemos definir una metodología para la identificación de factores de rendimiento en aplicaciones híbridas y en congruencia, la identificación de algunos factores que influyen en el rendimiento de las mismas.

Nanotermoparells: heterounions de nanowires

Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la University of California a Irvine, EEUU, entre juliol del 2007 i gener del 2008. Els termoparells són actualment els sensors de temperatura més populars i més utilitzats per a un ampli rang d’aplicacions: industrials, domèstiques, etc. Aconseguir miniaturar els dispositius fins a dimensions extremadament petites obra un ampli rang de noves aplicacions per aquests dispositius, per exemple, en el camp de la tecnologia lab-on-a-chip. En aquesta investigació, el concepte de termoparell, és a dir, dos cables de diferent metall connectats per un extrem s’ha extrapolat a l’escala nanomètrica, utilitzant nanowires com a element de construcció. Aquests nanowires s’han sintetitzat a través d’un nou procediment desenvolupat en el grup d’investigació de la Universitat de California, Irvine, que ha permès treballar amb nanowires de diferents dimensions (control independent de l’alçada i amplada) i un major grau d’èxit en la fabricació d’aquests termometres. El mètode també permet dipositar aquestes nanoestructures sobre substractes no conductors de manera controlable, simplificant notablement tot el procés de fabricació. L’obtenció d’aquests dispositius ha permès demostrar que, a part de ser bons sensors de temperatura a nivell macroscòpic (fonts de calor ambientals), també permet la determinació de temperatura a nivell microscòpic (fonts de calor focalitzada, com és el cas de feixos làser). Per a la seva caracterització ha estat necessari l’ús de tecnologia puntera (làsers, amplificadors, microscopis de forces atòmiques) i inclòs el disseny de nous dispositius. Aquests nanotermoparells presenten propietats extraordinàries, com una gran sensitivitat, gran velocitat de resposta a estímuls tèrmics, i un comportament estable vers l’ús i el temps.

Generación de interfaces para aplicaciones por línea de comandos

Generación dinámica de interfaces web basadas en ficheros descriptivos XML para el control de la parametrización compleja y ejecución de programas por línea de comandos. La necesidad surge con la aplicación mlcoalsim, utilizada por investigadores de la UAB, cuya parametrización requiere la edición manual de un fichero de texto la sintaxis del cual es complicada y pesada. Con la generación de interfaces web se pretende ayudar a los usuarios en la correcta parametrización y ejecución de aplicaciones como mlcoalsim.

SwissDock, a protein-small molecule docking web service based on EADock DSS.

Most life science processes involve, at the atomic scale, recognition between two molecules. The prediction of such interactions at the molecular level, by so-called docking software, is a non-trivial task. Docking programs have a wide range of applications ranging from protein engineering to drug design. This article presents SwissDock, a web server dedicated to the docking of small molecules on target proteins. It is based on the EADock DSS engine, combined with setup scripts for curating common problems and for preparing both the target protein and the ligand input files. An efficient Ajax/HTML interface was designed and implemented so that scientists can easily submit dockings and retrieve the predicted complexes. For automated docking tasks, a programmatic SOAP interface has been set up and template programs can be downloaded in Perl, Python and PHP. The web site also provides an access to a database of manually curated complexes, based on the Ligand Protein Database. A wiki and a forum are available to the community to promote interactions between users. The SwissDock web site is available online at http://www.swissdock.ch. We believe it constitutes a step toward generalizing the use of docking tools beyond the traditional molecular modeling community.

iCompound : una aplicació per l'estudi de la química sobre iOS

El treball de final de carrera és la culminació de molts anys d'estudi, i una oportunitat excel·lent de posar en pràctica molts dels coneixements adquirits. A més, poder treballar en l'àrea que ocupa (disseny d'aplicacions per iOS), ha estat la millor oportunitat per intentar crear una eina de qualitat per aquelles persones que, essent usuaris de dispositius mòbils d'Apple (iPhone, iPod, iPad), i estant lligats (d'una manera o altre) al món de la química, vulguin tenir a la seva disposició una aplicació que els ajudi a resoldre petits problemes lligats a aquesta disciplina científica.

Gestió acadèmica d'un centre de formació

En aquest treball hi ha un doble objectiu, el primer és el de posar a la pràctica els coneixements adquirits durant la carrera i el segon és el d'iniciar-se en el desenvolupament d'aplicacions utilitzant la plataforma tecnològica .NET

Plataforma GNU/Linux : Servidor de Base de Dades

L'objectiu d'aquest projecte és aconseguir una distribució basada en el projecte Metadistros capaç d'arrencar des del CD. L'avantatge d'aquest tipus de distribucions és disposar de tot un sistema operatiu juntament amb tot un lot d'aplicacions sense necessitat d'instal·lar res al disc dur.

Herramientas open source para la creación de portales

En aquest treball es proposa una aproximació al món del codi font obert des del punt de vista de la realització de portals col·laboratius i les seves eines involucrades. Per fer-ho, es passa revista als diferents tipus d'aplicacions, plataformes i utilitats que trobem disponibles, i s'agrupen en diferents categories: infraestructura i sistemes, serveis de comunicació, serveis de comunitat, serveis genèrics de portal, eines d'interacció amb sistemes mòbils, eines per al desenvolupament i prova i llibreries de suport.

Anàlisi, diseny i implementació d'un aplicació de gestió d'espais fent servir l'arquitectura J2EE

L'objectiu principal d'aquest treball és exposar tots els passos seguits per a desenvolupar un projecte (anàlisi, disseny, implementació i proves) que utilitza una tecnologia determinada: l'arquitectura J2EE, una arquitectura escalable que permet un desenvolupament simplificat dels projectes d'aplicacions. El projecte escollit és una aplicació de gestió d'espais, la finalitat del qual és gestionar els espais que pertanyen a una entitat multiespacial, com ara una universitat o un hospital.

Gestió de Rutes iGeocodificació

El present PFC pretén introduir i donar les bases, tant teòriques com pràctiques, per tractar una de les possibles aplicacions d¿aquests sistemes: la gestió de rutes. Mésconcretament, es vol establir la base per la creació d¿aplicacions que permetin calcular rutes òptimesentre diferents punts georeferenciats.

Implementació d'un esquema criptogràfic per gestionar de forma segura els historials mèdics dels pacients a través d'una xarxa decomunicacions.

El projecte ha de generar un seguit d'aplicacions per a que els usuaris i elsmetges puguin accedir a través d'una xarxa de comunicacions als historials clínicsmantenint sempre els requisits de seguretat.

Poly-epsilon-caprolactone intravitreous devices: an in vivo study.

PURPOSE: The objective of this study was to evaluate the long-term safety and pharmacokinetic profile of a dexamethasone-loaded poly-epsilon-caprolactone (PCL) intravitreous implant. METHODS: The PCL devices were prepared by compression and were inserted into the vitreous of pigmented rabbits. At different time points, vitreous samples were retrieved, and dexamethasone concentration was analyzed by high-performance liquid chromatography. The biodegradation of the implants was evaluated by scanning electron microscopy, and the dexamethasone remaining was evaluated at the end of follow-up. Clinical and histologic examinations were performed to evaluate the implant's tolerance. RESULTS: The PCL implant allows for a controlled and prolonged delivery of dexamethasone in rabbits eyes since it released the drug within the therapeutic range for at least 55 weeks. At 55 weeks approximately 79% of the drug was still present in the implant. Biodegradation study showed that PCL implants degradation is very slow. Clinical and histologic observations showed that the devices were very well tolerated in the rabbit eye. CONCLUSIONS: This study demonstrates the feasibility and tolerance of intravitreous PCL drug delivery systems, which can offer a wide range of applications for intraocular drug delivery because of their controlled and prolonged release over months or even years.

Sistema de monitorització d'equips informàtics

El projecte que es presenta, desenvolupa un conjunt d'aplicacions que en conjunt formen un sistema de monitorització d'equips informàtics. Com a tal, el seu propòsit és guardar dades de monitorització de diferents ordinadors, per tal de poder analitzar-les, mostrar-les i avisar al responsable en cas que es pugi produir una fallada del sistema o si ja s'ha produït

Pla de màrqueting per al llançament d'un nou producte en el mercat dels motors elèctrics per a bancs de proves

Ningú no dubte ja del canvi de mentalitat que s’ha produït en els darrers anys en els compradors pel què fa al mercat de l’automòbil. La seguretat i el respecte per el medi ambient, són actualment dos dels factors claus que el consumidor té en compte a l’hora de comprar un vehicle. D’altra banda en els darrers anys la Unió Europea, ha fixat tota una sèrie normatives per tal de reduir les emissions nocives a l’atmosfera. Així doncs, més seguretat i menys emissions, signifiquen vehicles que incorporin components i sistemas cada cop més sofisticats, els quals, a la vegada, necessiten de bancs d’assaig i equips de test per tal de ser validats. Aquest fet ha provocat una revolució dins dels sistemes de test per a vehicles, per als quals han augmentat enormement les exigències en quan a precisions i repetibilitat per tal d’intentar reproduir, amb la màxima fiabilitat possible, les condicions de treball que hauran de suportar els components durant el seu ús real. Les característiques dels motors elèctrics, resulten ideals per a accionar aquest tipus d’aplicacions, ja que permeten un control del parell molt acurat i una repetibilitat quasi perfecte enfront d’altres sistemas utilitzats fins no fa massa temps. Aquesta demanda creixent d’aquest tipus de màquines elèctriques, obra una nova oportunitat de negoci per a les empreses fabricants de motors elèctrics. L’objectiu principal d’aquest treball és identificar i satisfer les necessitats dels clients, dins d’un mercat industrial concret: el mercat dels motors elèctrics per a bancs de proves de components per a la indústria de l’automoció. La fita és doncs la de proporcionar les eines necessàries per tal de que una empresa, fabricant de motors elèctrics de velocitat variable, pugui realitzar el disseny, desenvolupament i llançament comercial d’un nou tipus de motor, específicament pensat per aquest mercat, amb les màximes garanties d’èxit. Com a principal conclusió, el treball argumenta que el nou producte representa una oportunitat de negoci força atractiva i rendible per a l’empresa, i permetrà diversificar la oferta de la companyia cap a un nou sector fins ara no explotat.