The effect of post harvest handling on selected native food plants

A commercial issue currently facing native plant food producers and food processors, and identified by the industry itself, is that of delivering quality products consistently and at reasonable cost to end users based on a sound food technology and nutrition platform. A literature survey carried out in July 2001 by the DPI&F’s Centre for Food Technology, Brisbane in collaboration with the University of Queensland to collect the latest information at that time on the functional food market as it pertained to native food plants, indicated that little or no work had been published on this topic. This project addresses two key RIRDC sub program strategies: to identify and evaluate processes or products with prospects of commercial viability and to assist in the development of integrated production, harvesting, processing and marketing systems. This project proposal also reflects a key RIRDC R&D issue for 2002-2003; that of linking with prospective members of the value chain. The purpose of this project was to obtain chemical data on the post harvest stability of functional nutritional components (bio actives) in commercially available, hand harvested bush tomato and Kakadu plum. The project concentrated on evaluating bioactive stability as a measure of ingredient quality.

Localisation of discrete change in a transformer winding: a network-function-loci approach

An entirely different approach for localisation of winding deformation based on terminal measurements is presented. Within the context of this study, winding deformation means, a discrete and specific change externally imposed at a particular position on the winding. The proposed method is based on pre-computing and plotting the complex network-function loci e.g. driving-point impedance (DPI)] at a selected frequency, for a meaningful range of values for each element (increasing and decreasing) of the ladder network which represents the winding. This loci diagram is called the nomogram. After introducing a discrete change, amplitude and phase of DPI are measured. By plotting this single measurement on the nomogram, it is possible to estimate the location and identify the extent of change. In contrast to the existing approach, the proposed method is fast, non-iterative and yields reasonably good localisation. Experimental results for actual transformer windings (interleaved and continuous disc) are presented.

Identification of immuno-dominant antigens of Trypanosoma evansi for detection of chronic trypanosomosis using experimentally infected equines

Trypanosoma evansi is the most extensively distributed trypanosome responsible for disease called surra in livestock in many countries including frequent outbreaks in India. The prevalence of this disease is most commonly reported by standard parasitological detection methods (SPDM); however, antibody ELISA is being in practice by locally produced whole cell lysate (WCL) antigens in many countries. In the present investigation, we attempted to identify and purify immuno dominant, infection specific trypanosome antigens from T. evansi proteome using experimentally infected equine serum by immuno blot. Three immuno dominant clusters of proteins i.e. 62-66 kDa, 52-55 kDa and 41-43 kDa were identified based on their consistent reactivity with donkey sequential serum experimentally infected T. evansi up to 280 days post infection (dpi). The protein cluster of 62-66 kDa was purified in bulk in native form and comparatively evaluated with whole cell lysate antigen (WCL). ELISA and immuno blot showed that polypeptide of this cluster is 100% sensitive in detection of early and chronic infection. Further, this protein cluster was also found immuno reactive against hyper immune serum raised against predominantly 66 kDa exo antigen, revealed that this is a common immunodominant moieties in proteome and secretome of T. evansi.

Epoch extraction based on integrated linear prediction residual using plosion index

Epoch is defined as the instant of significant excitation within a pitch period of voiced speech. Epoch extraction continues to attract the interest of researchers because of its significance in speech analysis. Existing high performance epoch extraction algorithms require either dynamic programming techniques or a priori information of the average pitch period. An algorithm without such requirements is proposed based on integrated linear prediction residual (ILPR) which resembles the voice source signal. Half wave rectified and negated ILPR (or Hilbert transform of ILPR) is used as the pre-processed signal. A new non-linear temporal measure named the plosion index (PI) has been proposed for detecting `transients' in speech signal. An extension of PI, called the dynamic plosion index (DPI) is applied on pre-processed signal to estimate the epochs. The proposed DPI algorithm is validated using six large databases which provide simultaneous EGG recordings. Creaky and singing voice samples are also analyzed. The algorithm has been tested for its robustness in the presence of additive white and babble noise and on simulated telephone quality speech. The performance of the DPI algorithm is found to be comparable or better than five state-of-the-art techniques for the experiments considered.

Online_DPI: a web server to calculate the diffraction precision index for a protein structure

An online computing server, Online_DPI (where DPI denotes the diffraction precision index), has been created to calculate the `Cruickshank DPI' value for a given three-dimensional protein or macromolecular structure. It also estimates the atomic coordinate error for all the atoms available in the structure. It is an easy-to-use web server that enables users to visualize the computed values dynamically on the client machine. Users can provide the Protein Data Bank (PDB) identification code or upload the three-dimensional atomic coordinates from the client machine. The computed DPI value for the structure and the atomic coordinate errors for all the atoms are included in the revised PDB file. Further, users can graphically view the atomic coordinate error along with `temperature factors' (i.e. atomic displacement parameters). In addition, the computing engine is interfaced with an up-to-date local copy of the Protein Data Bank. New entries are updated every week, and thus users can access all the structures available in the Protein Data Bank. The computing engine is freely accessible online at http://cluster.physics.iisc.ernet.in/dpi/.

Ultrasonic Guided Wave Sensor Network Optimization for Monitoring Rivet Line

Guided waves using piezo-electric wafer active sensors (PWAS) is one of the useful techniques of damage detection. Sensor network optimization with minimal network hardware footprint and maximal area of coverage remains a challenging problem. PWAS sensors are placed at discrete locations in order to inspect damages in plates and the idea has the potential to be extended to assembled structures. Various actuator-sensor configurations are possible within the network in order to identify and locate damages. In this paper we present a correlation based approach to monitor cracks emanating from rivet line using a simulated guided wave signal whose sensor is operating in pulse echo mode. Discussions regarding the identification of phase change due to reflections from the crack are also discussed in this paper.

Damage Detection Sensitivity, Specificity and Classification Data Analysis for SHM Systems Design, Verification and Validation

In this paper, we consider applying derived knowledge base regarding the sensitivity and specificity of damage(s) to be detected by an SHM system being designed and qualified. These efforts are necessary toward developing capabilities in SHM system to classify reliably various probable damages through sequence of monitoring, i.e., damage precursor identification, detection of damage and monitoring its progression. We consider the particular problem of visual and ultrasonic NDE based SHM system design requirements, where the damage detection sensitivity and specificity data definitions for a class of structural components are established. Methodologies for SHM system specification creation are discussed in details. Examples are shown to illustrate how the physics of damage detection scheme limits particular damage detection sensitivity and specificity and further how these information can be used in algorithms to combine various different NDE schemes in an SHM system to enhance efficiency and effectiveness. Statistical and data driven models to determine the sensitivity and probability of damage detection (POD) has been demonstrated for plate with varying one-sided line crack using optical and ultrasonic based inspection techniques.

Uncertainty Quantification in Ultrasonic Wave Based Detection of Delamination in Composite Structures

In this paper we consider the problem of guided wave scattering from delamination in laminated composite and further the problem of estimating delamination size and layer-wise location from the guided wave measurement. Damage location and region/size can be estimated from time of flight and wave packet spread, whereas depth information can be obtained from wavenumber modulation in the carrier packet. The key challenge is that these information are highly sensitive to various uncertainties. Variation in reflected and transmitted wave amplitude in a bar due to boundary/interface uncertainty is studied to illustrate such effect. Effect of uncertainty in material parameters on the time of flight are estimated for longitudinal wave propagation. To evaluate the effect of uncertainty in delamination detection, we employ a time domain spectral finite element (tSFEM) scheme where wave propagation is modeled using higher-order interpolation with shape function have spectral convergence properties. A laminated composite beam with layer-wise placement of delamination is considered in the simulation. Scattering due to the presence of delamination is analyzed. For a single delamination, two identical waveforms are created at the two fronts of the delamination, whereas waves in the two sub-laminates create two independent waveforms with different wavelengths. Scattering due to multiple delaminations in composite beam is studied.

Ultrasonic Guided Wave Based Damage Detection Using Low-dimensional Data from Laser Doppler Scan

In the current state of the art, it remains an open problem to detect damage with partial ultrasonic scan data and with measurements at coarser spatial scale when the location of damage is not known. In the present paper, a recent development of finite element based model reduction scheme in frequency domain that employs master degrees of freedom covering the surface scan region of interests is reported in context of non-contact ultrasonic guided wave based inspection. The surface scan region of interest is grouped into master and slave degrees of freedom. A finite element wise damage factor is derived which represents damage state over distributed areas or sharp condition of inter-element boundaries (for crack). Laser Doppler Vibrometer (LDV) scan data obtained from plate type structure with inaccessible surface line crack are considered along with the developed reduced order damage model to analyze the extent of scan data dimensional reduction. The proposed technique has useful application in problems where non-contact monitoring of complex structural parts are extremely important and at the same time LDV scan has to be done on accessible surfaces only.

Cumulative Impulse Strength for Epoch Extraction

Algorithms for extracting epochs or glottal closure instants (GCIs) from voiced speech typically fall into two categories: i) ones which operate on linear prediction residual (LPR) and ii) those which operate directly on the speech signal. While the former class of algorithms (such as YAGA and DPI) tend to be more accurate, the latter ones (such as ZFR and SEDREAMS) tend to be more noise-robust. In this letter, a temporal measure termed the cumulative impulse strength is proposed for locating the impulses in a quasi-periodic impulse-sequence embedded in noise. Subsequently, it is applied for detecting the GCIs from the inverted integrated LPR using a recursive algorithm. Experiments on two large corpora of speech with simultaneous electroglottographic recordings demonstrate that the proposed method is more robust to additive noise than the state-of-the-art algorithms, despite operating on the LPR.

Microtomografia com Raio X e processamento de imagem na obtenção da porosidade do concreto

O objetivo principal desse trabalho foi utilizar métodos não destrutivos (END), como a microtomografia com Raio X e técnicas de obtenção e processamento de imagens, para obtenção da porosidade do concreto. Foram utilizados dois métodos. Em um método as imagens foram obtidas por meio de microtomografia por Raio X e no outro foi utilizado um escâner comercial para obtenção das imagens. Essas imagens foram processadas por meio de técnicas de processamento de pixel e morfologia matemática. Os resultados obtidos para a porosidade foram comparados com resultado obtido por meio do método proposto pela NBR 9778 (2005) (Absorção de água, índice de vazios e massa específica em argamassa e concreto endurecido). As imagens microtomográficas das amostras de concreto foram obtidas num sistema Skyscan 1172 com 256 tons de cinza, ajustadas em contraste, binarizadas e filtradas. No outro método foi utilizado um Escâner Comercial com resolução de 2400 dpi para adquirir as imagens, sendo também utilizadas técnicas de processamento de pixel e morfologia matemática para processá-las. Os resultados dos valores da porosidade mostraram compatibilidade entre os dois métodos apresentados e o método proposto pela NBR 9778 (2005). Observou-se que os resultados obtidos por microtomografia foram mais confiáveis, mas o método utilizando o escâner comercial se apresentou como um método aceitável por seus resultados e principalmente por seu baixo custo e facilidade de operação.

Desenvolvimento do sistema reprodutivo de Echinostoma paraensei (Trematoda: Digenea) de hamsters (Mesocricetus auratus) experimentalmente infectados, analisado por microscopia de luz de campo e microscopia laser confocal

O conhecimento da morfologia e ultraestrutura dos helmintos permite a correta classificação destes organismos, bem como fornece subsídios que poderão ser utilizados para diagnóstico e controle. A microscopia laser confocal é uma ferramenta para estudar a organização estrutural de várias espécies de helmintos, possibilitando acesso a detalhes morfológicos não evidenciados pela microscopia óptica. Echinostoma paraensei é um trematódeo, digenético, hermafrodita parasito de numerosos hospedeiros vertebrados. Neste trabalho foi investigado o desenvolvimento dos órgãos reprodutivo e a morfometria de E. paraensei, desde a fase jovem até a adulta, como contribuição ao conhecimento do desenvolvimento reprodutivo desta espécie. Os trematódeos foram recuperados aos 3, 4, 5, 6, 7, 10, 14 e 21 dias posterior à infecção (dpi) experimental em hamsters. Estes foram corados em carmim clorídrico, desidratados em série alcoólica e montados em lâmina permanente em bálsamo do Canadá, fotografados e medidos usando microscopia de luz de campo claro (MCC) e microscopia de varredura laser confocal (MVLC). Entre 3 e 4 dpi, os primórdios genitais estavam presentes e nenhuma organização do sistema reprodutivo foi visualizada por MCC e MVLC. Os primórdio do ovário, dos testículos e da bolsa do cirro foram visualizados por MCC aos 5 e 6 dpi, no entanto, MVLC dos helmintos aos 5dpi mostra que estes primórdios, o ootipo e o útero estavam presentes, como estruturas individualizadas. A bolsa do cirro apresenta metratermo e o ovário com primórdio do oótipo adjacente aos 7dpi por MVLC. A vesícula seminal, receptáculo seminal, células diferenciadas nos testículos, ducto e reservatório vitelínico e oviducto foram visualizados após 10 dias, enquanto os espermatozóides na vesícula seminal, ovos e oócitos, células vitelínicas, poro e canal de Laurer aos 14 dias. A morfometria evidencia um acelerado crescimento dos órgãos reprodutores a partir do 7 dia. Os testículos apresentam aumento significativo no comprimento do 7 ao 21 dia e o ovário durante o período de 7 à 10 dpi. Aos 21 dpi, todos os helmintos apresentaram glândulas vitelínicas, útero contendo ovos e espermatozóides no oviducto enquanto outros ovos estão sendo formados. As mudanças morfológicas acentuadas durante a gametogênese consistem no aumento do comprimento do helminto, maturação das gônadas, desenvolvimento e maturação das glândulas vitelínicas. O desenvolvimento do helminto como um todo está relacionado à maturação dos órgãos reprodutivo masculino e feminino indicando o investimento deste trematódeo em garantir a produção e eliminação dos ovos ao meio exterior.

A assistência mútua em matéria penal e as penas vedadas no direito brasileiro

A criminalidade transnacional é um dos males da atualidade e tem seu crescimento associado à complexidade dos processos da globalização. Quão mais interligadas estão a economia, cultura e demais comunicações dos Estados, mais vulneráveis estão às ações criminosas. Diante desta constatação a comunidade internacional escolheu o Direito Penal Internacional como um dos instrumentos destinados a fazer frente a este problema contemporâneo. O DPI, como especialização do Direito Penal, atende às exigências da comunidade internacional, por ser constituído pelo binômio criminalização e instituições de repressão e por contemplar dois distintos referenciais, quais sejam o do observador nacional que vê a projeção de seu ordenamento jurídico para fora das fronteiras territoriais e a do observador internacional que vê a projeção das normas internacionais para dentro do território dos Estados. A importância do DPI para o combate ao crime se faz pela pluralidade de espécies de cooperação (administrativa e jurídica) e de formas, que vão desde as mais clássicas como a extradição, a carta rogatória e a homologação da sentença estrangeira às mais modernas como a transferência de presos e a assistência mútua. As formas mais clássicas da cooperação têm se mostrado pouco eficazes e muito burocráticas para alcançar os resultados pretendidos, principalmente pelas barreiras jurídicas impostas pelos Estados, A assistência mútua vai ao encontro das expectativas internacionais, por simplificar a tramitação dos pedidos, em razão da tramitação dos mesmos por Autoridades Centrais e não por vias diplomáticas, por reduzir as barreiras jurídicas, pois há a possibilidade de mitigação do princípio da identidade, a redução dos motivos de recusa e a desnecessidade de submeter ao crivo do Superior Tribunal de Justiça pedidos que notoriamente dispensam juízo de delibação. Embora a assistência mútua traga muitas vantagens para facilitar a persecução penal, o desprendimento às formalidades e às barreiras jurídicas não pode significar desapego às garantias materiais e processuais das pessoas que são os destinatários da ação estatal persecutória, em especial à garantia de não ter contra si aplicadas penas vedadas constitucionalmente (art. 5, XLVII da CF/88). Neste sentido torna-se necessário reconhecer a existência de uma obrigação de não fazer e não cooperar por parte dos Estados que possa ser invocada para obstar atos de cooperação que possam contribuir para a aplicação das penas vedadas.

Modulação das vias de sinalização intracelulares pelo sistema NAD(P)H oxidase em melanoma humano

Evidências têm mostrado que as espécies reativas de oxigênio (ROS) geradas pela NAD(P)H oxidase são importantes moduladores de diversas funções celulares como migração, crescimento, proliferação e sobrevivência. Estudos recentes demonstraram o envolvimento da atividade da NAD(P)H oxidase no crescimento e sobrevivência de células de melanoma. Neste trabalho, investigamos o efeito da inibição da NAD(P)H oxidase por difenileneiodônio (DPI) sobre o crescimento das células de melanoma humano MV3 e observamos que este composto reduziu o crescimento destas células em aproximadamente 50%. A inibição da NAD(P)H oxidase induziu mudanças no formato celular, com arredondamento, diminuição do espraiamento e descolamento celular. Esta redução foi acompanhada por um rearranjo do citoesqueleto de actina, diminuição da fosforilação no resíduo Tyr397 da quinase de adesão focal (FAK) e redução na associação de FAK com actina e com a tirosina quinase c-Src. Isto indica que a inibição da geração de ROS está modulando negativamente vias de sinalização ativadas por integrinas, o que freqüentemente conduz a um tipo particular de morte celular conhecida por anoikis. Comprovando a ocorrência deste fenômeno, observamos que a inibição da atividade da NAD(P)H oxidase aumentou a apoptose das células de melanoma e induziu a ativação da caspase-3. Nossos resultados mostram ainda que a inibição da viabilidade celular por DPI foi revertida com o pré-tratamento das células MV3 com um inibidor de tirosina fosfatases (ortovanadato de sódio). Em resumo, este estudo mostra que a geração de ROS por NAD(P)H oxidase está envolvida nos mecanismos de sobrevivência em células de melanoma, uma vez que afetam as vias de sinalização dependentes de FAK-Src, através da inibição da atividade de proteína tirosina fosfatases.

Interfacial immobilization of monoclonal antibody and detection of human prostate-specific antigen.

Antibody orientation and its antigen binding efficiency at interface are of particular interest in many immunoassays and biosensor applications. In this paper, spectroscopic ellipsometry (SE), neutron reflection (NR), and dual polarization interferometry (DPI) have been used to investigate interfacial assembly of the antibody [mouse monoclonal anti-human prostate-specific antigen (anti-hPSA)] at the silicon oxide/water interface and subsequent antigen binding. It was found that the mass density of antibody adsorbed at the interface increased with solution concentration and adsorption time while the antigen binding efficiency showed a steady decline with increasing antibody amount at the interface over the concentration range studied. The amount of antigen bound to the interfacial immobilized antibody reached a maximum when the surface-adsorbed amount of antibody was around 1.5 mg/m(2). This phenomenon is well interpreted by the interfacial structural packing or crowding. NR revealed that the Y-shaped antibody laid flat on the interface at low surface mass density with a thickness around 40 Å, equivalent to the short axial length of the antibody molecule. The loose packing of the antibody within this range resulted in better antigen binding efficiency, while the subsequent increase of surface-adsorbed amount led to the crowding or overlapping of antibody fragments, hence reducing the antigen binding due to the steric hindrance. In situ studies of antigen binding by both NR and DPI demonstrated that the antigen inserted into the antibody layer rather than forming an additional layer on the top. Stability assaying revealed that the antibody immobilized at the silica surface remained stable and active over the monitoring period of 4 months. These results are useful in forming a general understanding of antibody interfacial behavior and particularly relevant to the control of their activity and stability in biosensor development.