Análise do perfil de expressão dos genes da cana-de-açúcar envolvidos na interação com Leifsonia xyli subsp: xyli

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Variabilidade genética de Sugarcane mosaic virus, causando mosaico em milho no Brasil

O objetivo deste trabalho foi caracterizar biológica e molecularmente três isolados de Sugarcane mosaic virus (SCMV) de lavouras de milho, analisá-los filogeneticamente e discriminar polimorfismos do genoma. Plantas com sintomas de mosaico e nanismo foram coletadas em lavouras de milho, no Estado de São Paulo e no Município de Rio Verde, GO, e seus extratos foliares foram inoculados em plantas indicadoras e submetidos à análise sorológica com antissoros contra o SCMV, contra o Maize dwarf mosaic virus (MDMV) e contra o Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Mudas de sorgo 'Rio' e 'TX 2786' apresentaram sintomas de mosaico após a inoculação dos três isolados, e o DAS-ELISA confirmou a infecção pelo SCMV. O RNA total foi extraído e usado para amplificação por transcriptase reversa seguida de reação em cadeia de polimerase (RT-PCR). Fragmentos específicos foram amplificados, submetidos à análise por polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) e sequenciados. Foi possível discriminar os genótipos de SCMV isolados de milho de outros isolados brasileiros do vírus. Alinhamentos múltiplos e análises dos perfis filogenéticos corroboram esses dados e mostram diversidade nas sequências de nucleotídeos que codificam para a proteína capsidial, o que explica o agrupamento separado desses isolados e sugere sua classificação como estirpes distintas, em lugar de simples isolados geográficos.

Infecção mista pelo Sugarcane mosaic virus e Maize rayado fino virus provoca danos na cultura do milho no estado de São Paulo

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Detection and partial characterization of a carlavirus causing stem necrosis of soybean in Brazil

No ano agrícola de 2000/2001, ocorreu um surto de nanismo e necrose da haste em soja (Glycine max) plantada em duas áreas do Brasil Central e na safra seguinte, esta anomalia foi constatada em outras regiões produtoras, mesmo distantes mais de 2.000 km de onde fora inicialmente constatada. Estudos envolvendo ensaios de transmissão (enxertia, mecânica e insetos vetores), microscopia eletrônica, purificação, sorologia e ensaios moleculares indicaram que a enfermidade foi causada por um carlavirus transmitido por mosca branca, possivelmente relacionado ao Cowpea mild mottle virus (CpMMV).

Nutrição mineral do mamoeiro (Carica papaya L.): II - deficiência de boro em condições de campo e casa de vegetação

Com o objetivo de caracterizar a deficiência de boro no mamoeiro (Carica papaya L.) em condições de casa de vegetação e correlacionar com o problema que ocorre em condições de campo, conhecido como careca do mamoeiro ou queda do chapéu, foram instalados dois ensaios. O primeiro foi conduzido em condições de campo no município de Botucatu, SP., em um solo pertencente ao grande grupo Terra Roxa Estruturada e de clima Cf.b.. O segundo ensaio foi conduzido em condições de casa de vegetação e soluções nutritivas. Os autores descrevem os sintomas de deficiência de boro em mamoeiro e correlacionam o problema conhecido como careca do mamoeiro, com a deficiência de boro.

Controle biológico da podridão radicular (Pythium aphanidermatum) e promoção de crescimento por Pseudomonas chlororaphis 63-28 e Bacillus subtilis GB03 em alface hidropônica

Podridões radiculares causadas por espécies de Pythium são um importante problema em cultivos hidropônicos. Sintomas de subdesenvolvimento são observados nas plantas parasitadas pelo patógeno, sendo muitas vezes não diagnosticados pelo produtor. O objetivo do trabalho foi avaliar o controle biológico da podridão radicular causada por Pythium aphanidermatum e a promoção de crescimento por Pseudomonas chlororaphis 63-28 e Bacillus subtilis GB03, reconhecidos agentes de controle biológico de doenças de plantas. A inoculação das plantas com P. aphanidermatum ocasionou o subdesenvolvimento, sendo essa diminuição de 20%. A adição dos agentes de biocontrole na solução nutritiva teve um efeito positivo no aumento da massa (6% a 13%), no número de folhas (4% a 7%) e no teor de clorofila (3%) das plantas de alface. Entretanto, maiores estudos devem ser realizados para melhorar a capacidade de controle da doença e de promoção de crescimento pelos agentes de biocontrole estudados no cultivo de alface hidropônica.

Breakdown of resistance in sweet pepper against Pepper yellow mosaic virus in Brazil

Plantas de Capsicum annuum cv. Magali R, resistentes ao Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), exibindo sintomas severos de mosaico amarelo, malformação foliar e subdesenvolvimento foram encontradas em plantios na região de Lins, SP, Brasil, em 2003/04. Partículas semelhantes àquelas do gênero Potyvirus foram observadas em extrato foliar de planta infectada examinado em microscópio eletrônico de transmissão. O extrato foliar também reagiu com anti-soro contra o PepYMV em PTA-ELISA. Além de C. annuum cv. Magali R, esse potyvirus também infectou sistemicamente C. annuum cv. Rubia R, que é resistente ao PepYMV. A seqüência de nucleotídeos de parte do gene da proteína capsidial (CP) desse potyvirus apresentou 96-98% de identidade com a de outros isolados do PepYMV. A seqüência parcial de nucleotídeos da região 3' não traduzida (3' NTR) apresentou 94-96% de identidade com a do PepYMV. Esses resultados são indicativos de que o potyvirus que quebrou a resistência em pimentão é um isolado do PepYMV.

Influência das condições socioeconômicas nas alterações nutricionais e na taxa de metabolismo de repouso em crianças escolares moradoras em favelas no município de São Paulo

OBJETIVOS: Realizou-se um estudo transversal para avaliar a taxa de metabolismo de repouso (TMR) e condições socioeconômicas em 15 crianças escolares do sexo feminino; eutróficas (EU= estatura/idade 3 95% e peso/idade entre 90-110%) e 15 com desnutrição pregressa (DP= estatura/idade < 95% e peso/estatura entre 90-110%) moradoras em favelas no município de São Paulo. MÉTODOS: Avaliou-se a TMR por calorimetria indireta, e a situação socioeconômica por entrevista domiciliar. RESULTADOS: O grupo DP apresentou TMR mais alta quando expressa por unidade de peso corpóreo (EU= 40,5 Kcal/kg/dia; DP=44,4 Kcal/kg/dia, p<0,05) e por quilograma de massa magra (EU= 49,2 Kcal/kg/dia; DP=52,5 Kcal/kg/dia, p<0,05); e diferenças significantes para renda per capita, analfabetismo materno, número de parasitas por criança, número de ordem entre os filhos e número de irmãos. em análise multivariada as variáveis associadas à desnutrição foram renda per capita e analfabetismo materno. CONCLUSÕES: Embora os dois grupos tenham peso/estatura normais, a presença de baixa estatura leve foi acompanhada por alterações metabólicas e socioeconômicas típicas de um quadro de desnutrição.

The genome sequence of the gram-positive sugarcane pathogen Leifsonia xyli subsp. xyli

The genome sequence of Leifsonia xyli subsp. xyli, which causes ratoon stunting disease and affects sugarcane worldwide, was determined. The single circular chromosome of Leifsonia xyli subsp. xyli CTCB07 was 2.6 Mb in length with a GC content of 68% and 2,044 predicted open reading frames. The analysis also revealed 307 predicted pseudogenes, which is more than any bacterial plant pathogen sequenced to date. Many of these pseudogenes, if functional, would likely be involved in the degradation of plant heteropolysaccharides, uptake of free sugars, and synthesis of amino acids. Although L. xyli subsp. xyli has only been identified colonizing the xylem vessels of sugarcane, the numbers of predicted regulatory genes and sugar transporters are similar to those in free-living organisms. Some of the predicted pathogenicity genes appear to have been acquired by lateral transfer and include genes for cellulase, pectinase, wilt-inducing protein, lysozyme, and desaturase. The presence of the latter may contribute to stunting, since it is likely involved in the synthesis of abscisic acid, a hormone that arrests growth. Our findings are consistent with the nutritionally fastidious behavior exhibited by L. xyli subsp. xyli and suggest an ongoing adaptation to the restricted ecological niche it inhabits.

Derrame Pleural Parapneumônico: perfil e evolução de crianças internadas no Hospital Universitário João de Barros Barreto

Introdução: A pneumonia é uma das infecções mais comuns em crianças, sendo o derrame pleural uma complicação potencial, principalmente nos países em desenvolvimento, onde existem sérias limitações de recursos diagnóstico-terapêuticos. Objetivos: Conhecer o perfil das crianças portadoras de derrame pleural parapneumônico, analisando sua evolução a partir da terapêutica clínica e cirúrgica que são submetidas. Método: Estudo descritivo, transversal, de coleta prospectiva, no qual foram estudadas todas as crianças internadas em um hospital de referência de doenças infecciosas na Região Norte-Brasil com diagnóstico de derrame pleural parapneumônico, submetidas a procedimento cirúrgico para abordagem do mesmo, no período de outubro de 2010 a outubro de 2011. Resultados: A amostra foi composta por 46 crianças, com distribuição igual entre os sexos, predominância de menores de 3 anos (74%) e procedentes do interior do estado (54,3%). Parcela considerável (28%) possuía algum grau de inadequação do estado nutricional. A média de tempo de doença até à admissão na referida instituição foi de 16,9 dias, e todos os indivíduos eram provenientes de outro hospital. A duração média da internação hospitalar foi de 26,0 dias, e a do estado febril, de 9,8 dias. Foram utilizados 2,2 esquemas antimicrobianos, em média, por paciente e o Ceftriaxone foi o antibiótico mais comum. Diagnóstico etiológico só foi alcançado em um único caso. Em 22 crianças, (47,8%), havia empiema pleural, e elas apresentaram maior tempo de drenagem. Foi encontrada associação entre crianças com nanismo e cirurgias múltiplas (Teste G = 8,40; p= 0,040). A grande maioria das criança foi operada uma única vez (80,4%), e a drenagem torácica fechada foi a cirurgia mais realizada. A drenagem torácica aberta foi instalada em 24,0% dos pacientes. A toracotomia com descorticação foi realizada em 2 pacientes (4,0%). Todas as crianças da amostra obtiveram recuperação clínica e radiológica em até quatro meses após a alta hospitalar, e não houve óbito na amostra. Conclusão: A população estudada possui doença em estágio avançado e distúrbios nutricionais prevalentes, que podem influenciar na evolução. É necessária padronização da antibioticoterapia, e reconsiderar a drenagem torácica aberta no empiema pleural, a partir de novos estudos sobre o tema, principalmente na indisponibilidade da videotoracoscopia.

Controle biológico da podridão radicular (Pythium aphanidermatum) em cultivos hidropônicos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Occurrence of Groundnut ringspot virus on Brazilian peanut crops

A high incidence of plants with mosaic, chlorotic spots, ringspots, necrosis, smaller leaves, and stunting was observed on peanut crops (Arachis hypogaea L.) in Itapolis, So Paulo State, Brazil. Transmission electron microscope examination of thin sections of infected leaves revealed the presence of spheroidal particles, ca. 80 nm in diameter, suggestive of Tospovirus. A DNA fragment of similar to 600 bp was amplified by RT-PCR from total RNA extracted from infected tissues using primers specific for the nucleocapsid gene of Groundnut ringspot virus (GRSV). Nucleotide and deduced amino acid sequences of the fragments showed high identities with known GRSV isolates.

Distribuição geográfica de agravos nutricionais entre escolares na cidade de Piracicaba-SP, Brasil

The objective was to map the prevalence of nutritional disorders in children attending the 1st to 4th grade of 12 public elementary schools located in the 5 administrative regions of Piracicaba, SP, each with its own socioeconomic profi le, from 2003 to 2006. A total of 16,068 children, divided into 8,133 (50.6%) girls and 7,935 (49.4%) boys, aged 7 to 11 years, were weighed and measured. Their nutritional status indicators heightfor-age (H/A), weight-for-age (W/A), and body mass index-for-age (BMI/A) were compared with those of the NCHS/CDC 2000 reference population and classifi ed according to the z-score cut-off points recommended by the World Health Organization. During that period, the Western Region, which has the lowest socioeconomic indicators, had the lowest z-score medians of the three anthropometric indicators assessed (p<0.0001) and was the only region to have a higher-than-expected stunting prevalence (3.0% with Z < -2). Excess weight prevalence was higher than expected in all regions. The Central Region, which has the highest socioeconomic indicators, had the highest excess weight prevalence (6.0% with Z > 2). Time had a positive effect on the stunted children, reducing the stunting rates in the regions with the lowest socioeconomic indicators. In conclusion, the three nutritional status indicators showed results suitable to the social and economic characteristics of each region. Although nutritional disorders have particular characteristics, they are a problem to the entire population.

Biological control of root rot caused by Pythium aphanidermatum and growth promotion in hydroponic cucumber with microorganisms from mangrove

The prospection of biological control agents in similar environments to the microbe application improves the chances of microorganisms establishment added to the environment. The low survival of these beneficial microorganisms added to hydroponic environment is a problem for the growth promotion and root rot biological control success in hydroponic crops. Because of the environmental similarity between hydroponic systems and mangrove ecosystems, the aim of this work was to evaluate the ability of mangrove microbes to control root rot caused by Pythium aphanidermatum and to improve plant growth in hydroponic cucumbers. Among the 28 strains evaluated for disease control in small-hydroponic system using cucumber seedlings, Gordonia rubripertincta SO-3B-2 alone or in combination with Pseudomonas stutzeri (MB-P3A- 49, MB-P3-C68 and SO-3L-3), and Bacillus cereus AVIC-3-6 increased the seedlings survival and were subsequently evaluated in hydroponic cucumbers in a greenhouse. Bacillus cereus AVIC-3-6 protected the plants from stunting caused by the pathogen and Gordonia rubripertincta SO-3B-2 and Pseudomonas stutzeri MB-P3A-49 increased the plant growth. We concluded that microorganisms from mangroves are useful as biocontrol agents and for improving plant growth in hydroponic crops.

Estimating total body fat using a skinfold prediction equation in Brazilian children

Background: The double burden of obesity and underweight is increasing in developing countries and simple methods for the assessment of fat mass in children are needed. Aim: To develop and validate a new anthropometric predication equation for assessment of fat mass in children. Subjects and methods: Body composition was assessed in 145 children aged 9.8 +/- 1.3 (SD) years from Sao Paulo, Brazil using dual energy X-ray absorptiometry (DEXA) and skinfold measurements. The study sample was divided into development and validation sub-sets to develop a new prediction equation for FM (PE). Results: Using multiple linear regression analyses, the best equation for predicting FM (R-2 - 0.77) included body weight, triceps skinfold, height, gender and age as independent variables. When cross-validated, the new PE was valid in this sample (R-2 = 0.80), while previously published equations were not. Conclusion: The PE was more valid for Brazilian children that existing equations, but further studies are needed to assess the validity of this PE in other populations.