Characterization of 12 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in Pacific abalone, Haliotis discus hannai

We report here for the first time 12 polymorphic single nucleotide polymorphisms (SNPs) in a commercially important gastropod, Pacific abalone (Haliotis discus hannai) that were identified by searching expressed sequence tag database. These SNP loci (seven nuclear and five mitochondrial SNPs) were polymorphic among 37 wild abalone individuals, based on a four-primer allele-specific polymerase chain reaction analysis. All loci had two alleles and the minor allele frequency ranged from 0.027 to 0.473. For the seven nuclear SNPs, the expected and observed heterozygosities ranged from 0.053 to 0.499 and from 0.054 to 0.811, respectively.

Mancha foliar bacteriana em plantios de eucalipto na região Sul do Brasil.

2011

MB 03: clone de batata resistente à murcha bacteriana.

2004

Avaliação de produtos alternativos para o controle da mancha-bacteriana em tomateiro para processamento industrial.

O pôrometro de pós-colheita é um instrumento para medir transpiração, resistência difusiva e déficit de pressão de vapor por manometria a volume constante e por volumetria a pressão constante. É constituído de uma câmara de transpiração com fechamento hermético contendo um suporte de amostras sobre um ventilador e externamente um manômetro de coluna de água com pipeta graduada móvel. Sob temperatura constante, o déficit de pressão de vapor (.P), e o volume de vapor de água (.V) foram proporcionais aos volumes de água vaporizados. Com o uso de um excesso de água este aumento da pressão de vapor iguala-se, em módulo, ao déficit de pressão de vapor do ar na câmara de transpiração. Para amostras do ar atmosférico no laboratório, o déficit de pressão de vapor foi calculado a partir das temperaturas de bulbo seco e úmido em um psicrômetro ventilado e por manometria. A correlação entre estes dois métodos foi de 0,976. A acurácia das medidas de transpiração é tal que o produto do volume morto da câmara (V) pela declividade (.P/ .V) determinada pelo vapor de água liberado no processo iguala-se à pressão barométrica, com erro inferior a 1%. Um exemplo experimental do uso do porômetro de pós-colheita em cenoura é apresentado juntamente e os detalhes para obter a resistência difusiva e espessura da camada laminar. O porômetro de pós-colheita é um porômetro de difusão simples, robusto, que poderá ser usado em estudos de efeito de cêras, na seleção de cultivares e em variados outros estudos de fisiologia de pós-colheita.

Moko ou murcha bacteriana da bananeira.

Informacoes sobre a murcha bacteriana da bananeira, ocorrencia, sintomas, medidas preventivas e de controle para o Estado do Amazonas.

A murcha-bacteriana (Ralstonia solanacearum) em pimenta longa (Piper hispidinervium).

A murcha-bacteriana é a principal doença vascular de plantas em todo o mundo. É causada pela bactéria Ralstonia solanacearum e ocorre em todas as regiões do Brasil, principalmente nas regiões Norte, Nordeste e Centro-Oeste em que predominam temperaturas e umidades elevadas

Detecção e identificação molecular de Xanthomonas spp. causadoras da mancha bacteriana do tomateiro.

Neste comunicado são relatados os procedimentos para a identificação molecular das quatro espécies de Xanthomonas associadas à mancha bacteriana do tomateiro.

Enxertia em tomateiro para o controle da murcha-bacteriana.

Esta circular técnica tem por objetivo mostrar a realização da enxertia como opção para o controle de murcha bacteriana no tomateiro.

A population-based association study of SNPs of GSTP1, MnSOD, GPX2 and Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma

Oxidative stress appears to be important in the pathogenesis of Barrett's esophagus (BE) and esophageal adenocarcinoma (EAC). Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of antioxidant enzyme genes may play a part in determining individual susceptibility to these diseases. The Factors Influencing the Barrett's Adenocarcinoma Relationship (FINBAR) study is a population-based, case-control study of BE and EAC in Ireland. DNA from EAC (n = 207), BE (> or =3 cm BE at endoscopy with specialized intestinal metaplasia on biopsy, n = 189) and normal population controls (n = 223) were analyzed. Several SNPs spanning the genes for glutathione S-transferase P1 (GSTP1), manganese superoxide dismutase (MnSOD) and glutathione peroxidase 2 (GPX2) were genotyped using multiplex polymerase chain reaction and SNaPshottrade mark. The chi(2) test was used to compare genotype and allele frequencies between case and control subjects. Linkage disequilibrium between SNPs was quantified using Lewontin's D' value and haplotype frequency estimates obtained using Haploview. Eleven SNPs were genotyped (six for GSTP1, three for MnSOD and two for GPX2); all were in Hardy-Weinberg equilibrium. None was significantly associated with EAC or BE even before Bonferroni correction. Odds ratios for EAC for individual SNPs ranged from 0.68 [95% confidence interval (CI) 0.43-1.08] to 1.25 (95% CI 0.73-2.16), and for BE from 0.84 (95% CI 0.52-1.30) to 1.30 (95% CI 0.85-1.97). SNPs in all three genes were in strong linkage disequilibrium (D' > 0.887) but haplotype analysis did not show any significant association with EAC or BE. SNPs involving the GSTP1, MnSOD and GPX2 genes were not associated with BE or EAC. Further studies aimed at identifying susceptibility genes should focus on different antioxidant genes or different pathways.