Biblioteca de escalonamento de tarefas em grid computacional - LIBTS

The use of computational grid simulators is particularly important for studying the algorithms of task scheduling. Through the simulators it’s possible to assess and compare the performance of different algorithms in various scenarios. Despite the simulation tools provide basic features for simulation in distributed environments, they don’t offer internal policies of task scheduling, so that the implementation of the algorithms must be realized by the user himself. Therefore, this study aims to present the library of task scheduling LIBTS (LIBrary Tasks Scheduling) which is developed and adapted to the SimGrid simulator to provide the users with a tool to analyze the algorithms of task scheduling in the computational grid.

Using Threads to Overcome Synchronization Delays in Parallel Multiple Progressive Alignment Algorithms

Sao Paulo State Research Foundation-FAPESP

Otimização e escalonamento da produção de Xilanases por Candida davisiana L101 isolada de amostra da Antártica visando a aplicação na produção de biocombustível

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Consumo de energia em escalonadores de transações em sistemas de memória transacional em software

Pós-graduação em Ciência da Computação - IBILCE

Consumo de energia em escalonadores de transações em sistemas de memória transacional em software

Pós-graduação em Ciência da Computação - IBILCE

Concurrency in prolog using threads and a shared database

Concurrency in Logic Programming has received much attention in the past. One problem with many proposals, when applied to Prolog, is that they involve large modifications to the standard implementations, and/or the communication and synchronization facilities provided do not fit as naturally within the language model as we feel is possible. In this paper we propose a new mechanism for implementing synchronization and communication for concurrency, based on atomic accesses to designated facts in the (shared) datábase. We argüe that this model is comparatively easy to implement and harmonizes better than previous proposals within the Prolog control model and standard set of built-ins. We show how in the proposed model it is easy to express classical concurrency algorithms and to subsume other mechanisms such as Linda, variable-based communication, or classical parallelism-oriented primitives. We also report on an implementation of the model and provide performance and resource consumption data.

The Threads of Biosystems Engineering

The core concepts, or threads, of Biosystems Engineering (BSEN) are variously understood by those within the discipline, but have never been unequivocally defined due to its early stage of development. This makes communication and teaching difficult compared to other well established engineering subjects. Biosystems Engineering is a field of Engineering which int egrates engineering science and design with applied biological, environmental and agricultural sciences. It represents an evolution of the Agricultural Engineering discipline applied to all living organisms not including biomedical applications. The basic key element for the emerging EU Biosystems Engineering program of studies is to ensure that it offers essential minimum fundamental engine ering knowledge and competences . A core curriculum developed by Erasmus Thematic Networks is used as benchmark for Agr icultural and Biosystems Engineering studies in Europe. The common basis of the core curriculum for the discipline across the Atlantic , including a minimum of competences comprising the Biosystems Engineering core competencies, has been defined by an Atlan tis project , but this needs to be taken further by defining the threads linking courses together. This paper presents a structured approach to define the Threads of BSEN . The definition of the mid-level competences and the associated learning outcomes has been one of the objectives of the Atlantis programme TABE.NET. The mid-level competences and learning outcomes for each of six specializations of BSEN are defined while the domain-specific knowledge to be acquired for each outcome is proposed. Once the proposed definitions are adopted, these threads will be available for global development of the BSEN.

A potential mediator of collagenous block copolymer gradients in mussel byssal threads

Mussel byssal threads contain unusual block copolymer-like proteins that combine collagen with flanking domains that resemble silk-fibroin (preCol-D) or elastin (preCol-P). These are distributed in complementary gradients along the length of the threads and as precursors in the mussel foot. We discuss a 76-kDa precursor, preCol-NG, from a cDNA library of the foot where it has no gradient but rather is distributed evenly along the distal to proximal axis. A pepsin-resistant fragment of preCol-NG has been confirmed in byssal threads. Like preCol-D and -P, this protein has a central collagenous domain, flanking domains, an acidic patch, and histidine-rich termini. The flanking domains of preCol-NG resemble the glycine-rich proteins of plant cell walls with tandem XGlyn repeats where X denotes alanine, leucine, or asparagine but not proline. Similarity with the (glycine–alanine) repeats and poly(alanine) runs of arthropod silks also exists. Based on available evidence, a model of preCol axial assembly is proposed in which preCol-NG functions as a mediator between preCol-D/-P molecules. This is consistent with the observed progression of mechanical properties in byssal threads.

Informações de suporte ao escalonamento de workflows científicos para a execução em plataformas de computação em nuvem

A ciência tem feito uso frequente de recursos computacionais para execução de experimentos e processos científicos, que podem ser modelados como workflows que manipulam grandes volumes de dados e executam ações como seleção, análise e visualização desses dados segundo um procedimento determinado. Workflows científicos têm sido usados por cientistas de várias áreas, como astronomia e bioinformática, e tendem a ser computacionalmente intensivos e fortemente voltados à manipulação de grandes volumes de dados, o que requer o uso de plataformas de execução de alto desempenho como grades ou nuvens de computadores. Para execução dos workflows nesse tipo de plataforma é necessário o mapeamento dos recursos computacionais disponíveis para as atividades do workflow, processo conhecido como escalonamento. Plataformas de computação em nuvem têm se mostrado um alternativa viável para a execução de workflows científicos, mas o escalonamento nesse tipo de plataforma geralmente deve considerar restrições específicas como orçamento limitado ou o tipo de recurso computacional a ser utilizado na execução. Nesse contexto, informações como a duração estimada da execução ou limites de tempo e de custo (chamadas aqui de informações de suporte ao escalonamento) são importantes para garantir que o escalonamento seja eficiente e a execução ocorra de forma a atingir os resultados esperados. Este trabalho identifica as informações de suporte que podem ser adicionadas aos modelos de workflows científicos para amparar o escalonamento e a execução eficiente em plataformas de computação em nuvem. É proposta uma classificação dessas informações, e seu uso nos principais Sistemas Gerenciadores de Workflows Científicos (SGWC) é analisado. Para avaliar o impacto do uso das informações no escalonamento foram realizados experimentos utilizando modelos de workflows científicos com diferentes informações de suporte, escalonados com algoritmos que foram adaptados para considerar as informações inseridas. Nos experimentos realizados, observou-se uma redução no custo financeiro de execução do workflow em nuvem de até 59% e redução no makespan chegando a 8,6% se comparados à execução dos mesmos workflows sendo escalonados sem nenhuma informação de suporte disponível.

Um método de otimização da relação desempenho/consumo de energia para arquiteturas multi-cores heterogêneas em FPGA

Devido às tendências de crescimento da quantidade de dados processados e a crescente necessidade por computação de alto desempenho, mudanças significativas estão acontecendo no projeto de arquiteturas de computadores. Com isso, tem-se migrado do paradigma sequencial para o paralelo, com centenas ou milhares de núcleos de processamento em um mesmo chip. Dentro desse contexto, o gerenciamento de energia torna-se cada vez mais importante, principalmente em sistemas embarcados, que geralmente são alimentados por baterias. De acordo com a Lei de Moore, o desempenho de um processador dobra a cada 18 meses, porém a capacidade das baterias dobra somente a cada 10 anos. Esta situação provoca uma enorme lacuna, que pode ser amenizada com a utilização de arquiteturas multi-cores heterogêneas. Um desafio fundamental que permanece em aberto para estas arquiteturas é realizar a integração entre desenvolvimento de código embarcado, escalonamento e hardware para gerenciamento de energia. O objetivo geral deste trabalho de doutorado é investigar técnicas para otimização da relação desempenho/consumo de energia em arquiteturas multi-cores heterogêneas single-ISA implementadas em FPGA. Nesse sentido, buscou-se por soluções que obtivessem o melhor desempenho possível a um consumo de energia ótimo. Isto foi feito por meio da combinação de mineração de dados para a análise de softwares baseados em threads aliadas às técnicas tradicionais para gerenciamento de energia, como way-shutdown dinâmico, e uma nova política de escalonamento heterogeneity-aware. Como principais contribuições pode-se citar a combinação de técnicas de gerenciamento de energia em diversos níveis como o nível do hardware, do escalonamento e da compilação; e uma política de escalonamento integrada com uma arquitetura multi-core heterogênea em relação ao tamanho da memória cache L1.

Summarizing threads in blogs using opinion polarity

The huge amount of data available on the Web needs to be organized in order to be accessible to users in real time. This paper presents a method for summarizing subjective texts based on the strength of the opinion expressed in them. We used a corpus of blog posts and their corresponding comments (blog threads) in English, structured around five topics and we divided them according to their polarity and subsequently summarized. Despite the difficulties of real Web data, the results obtained are encouraging; an average of 79% of the summaries is considered to be comprehensible. Our work allows the user to obtain a summary of the most relevant opinions contained in the blog. This allows them to save time and be able to look for information easily, allowing more effective searches on the Web.

Riparian management : common threads and shared interests : a western regional conference on river management strategies : February 4-6, 1993, Albuquerque, New Mexico /

Includes bibliographical references.

Silver threads.

Added t.-p., illus.