Estimativas de parâmetros genéticos para pesos do nascimento aos dois anos de idade para bovinos da raça Brahman utilizando modelos de regressão aleatória

Pós-graduação em Zootecnia - FCAV

Estimativas de parâmetros genéticos para produção de leite em búfalas por modelos de repetibilidade, multi-característica e de regressão aleatória

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estimativas de parâmetros genéticos para escores de avaliação visual, peso e perímetro escrotal à desmama de bovinos da raça Canchim

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A comunidade zooplanctônica em um canal de maré no estuário do rio Caeté, Bragança (Pará, Brasil)

Poucos são os estudos realizados sobre zooplâncton em estuários na região Bragantina do Estado do Pará. Este trabalho foi realizado em um canal de maré, denominado de Furo do Chato, próximo a localidade de Ajuruteua. Município de Bragança, no litoral do Estado do Pará, e teve por objetivo estudar a composição qualitativa e quantitativa do zooplâncton, bem como as variações sazonais em função das variáveis ambientais, Durante o período de agosto/96 a janeiro/97 foram feitas oito campanhas a cada três semanas, com obtenção de amostras a cada duas horas, durante 24 horas. O Furo do Chato é um canal de maré com forte influência costeira. Assim, a maior parte dos representantes do zooplâncton encontrados são de origem costeira. Além de componentes holoplanctônicos e meroplanctônicos, as amostras de zooplâncton no Furo do Chato apresentaram representantes da fauna bentônica. Dez filos foram identificados: Protozoa, Mollusca, Chordata, Annelida, Cnidaria, Arthropoda, Urochordata, Chaetognatha, Nematoda e Bryozoa. A classe Copepoda teve maior representatividade, tanto pela densidade, pela biomassa como Oela freqüência de ocorrência nas amostras. As categorias mais abundantes e frequentes (>40%) foram Pseudodiaptomus marshi, Acartia iilljeborgi, A. tonsa, Harpacticoida, Sagitta sp., Oiko pleura dioica, Cnidaria, lsopoda, zoeas de caranguejo, pós-larvas de camarão e alevinos de peixes. A abundâncias médias foram baixas (1,07 indiv./m³e 16,43 mg/m³). A comunidade do zooplâncton é mais abundante nos meses de transição do que no período seco A maiores abundâncias ocorreram em geral à noite e durante as marés de sizígia. Contudo, o ciclo diário de marés, a salinidade e as fases lunares não influenciaram a variabilidade do zooplâncton como um todo, mas apenas em algumas categorias isoladamente.

Uso de modelo de regressão aleatória na análise de produção de leite em bubalinos

Dados referentes a 1.719 controles de produção de leite de 357 fêmeas predominantemente da raça Murrah, filhas de 110 reprodutores, com partos distribuídos entre os anos de 1974 e 2004, obtidos do Programa de Melhoramento Genético de Bubalinos (PROMEBUL) com adição de registros do rebanho pertencente à EMBRAPA Amazônia Oriental - EAO, localizada em Belém, Pará. Os registros foram usados para comparar modelos de regressão aleatória na estimação de componentes de variância e predição de valores genéticos dos reprodutores utilizando a. função polinomial de Legendre, variando de segunda à quarta ordem. O modelo de regressão aleatória incluiu os efeitos de rebanho-ano, mês de parto, coeficientes de regressão para idade da fêmea (para descrever a parte fixa da curva de lactação) e coeficientes de regressão relacionados ao efeito genético direto e de ambiente permanente. A comparação entre modelos foram realizadas por meio do Critério de Informação de Akaike. O modelo de regressão aleatória que utilizou a terceira ordem de polinômio de Legendre, com quatro classes de resíduo para o ambiente temporário, foi o que melhor descreveu a variação genética aditiva da produção de leite. A herdabilidade estimada variou entre 0,08 a 0,40. A correlação genética entre produções mais próximas foram próximas da unidade, mas em idades mais distantes a correlação foi baixa. A correlação de Spearman e de Pearson entre os valores genéticos preditos em todas as situações foram próximas da unidade.

Efeito da interação genótipo ambiente, sob a forma de heterogeneidade de variâncias entre rebanhos

Foram simuladas estruturas de dados em modelos mistos representando o teste de 100 reprodutores, sendo cada reprodutor acasalado com 10 matrizes (total de 1000 matrizes), originando em cada acasalamento 2 proles, totalizando 2000 proles (vinte proles por reprodutor). De cada combinação reprodutor e matriz, dez proles tiveram seu fenótipo expresso no ambiente de baixa produção (Estrato 1) e, a outra metade, no ambiente de alta produção (Estrato 2). A simulação foi realizada de forma a representar diferentes situações de presença de heterogeneidade de variâncias, combinando-se as origens da heterogeneidade, de natureza genética e ambiental. Na presença de heterogeneidade residual, o valor estimado para o componente de variância residual, considerando homogeneidade de variâncias se aproximou do valor médio das variâncias entre os estratos. Houve superestimação, também, do componente de variância genético aditivo. Ao simular heterogeneidade de variância de origem genética, observou-se que a estimação desse componente situou-se em valor intermediário aos simulados. Nessa situação, o componente de variância residual estimado foi próximo do valor simulado, indicando que a heterogeneidade de variâncias quando proveniente de fatores genéticos, não interfere, substancialmente, sobre e estimação do componente de variância residual. Na simulação de dados com presença de heterogeneidade tanto de origem genética quanto ambiental (estrutura de dados 4), conduziu a estimação de componentes de variâncias intermediários aos valores simulados em cada estrato. Assim, observa-se que, mesmo quando os reprodutores apresentam proles bem distribuídas em ambos os estratos, a heterogeneidade de variância proveniente de fatores não genético provoca distorções sobre a estimação da variância genética aditiva. Mas por outro lado, quando a heterogeneidade de variância é decorrente de fatores genéticos, não há grande interferência sobre a estimativa da variância residual, tal comportamento pode ser explicado pela incorporação da matriz de parentesco na estimação do componente de variância genético aditivo, possibilitando discriminar melhor a origem da diferenças entre variâncias. Na estrutura onde a variância residual foi heterogênea a estimativa de herdabilidade foi menor em relação à estrutura de homogeneidade de variâncias. Por outro lado, quando somente a variância genética aditiva foi heterogênea, a estimativa de herdabilidade, considerando-se apenas o estrato de alta variabilidade genética, foi inflacionada pela superestimação da variância genética aditiva. No entanto, a estimativa de herdabilidade obtida, desconsiderando essa fonte de heterogeneidade de variância, foi próxima à situação de homogeneidade de variância, indicando que, quando os reprodutores possuem boa distribuição de proles em diferentes ambientes, as estimativas relacionadas ao efeito genético são ponderadas pelo desempenho dos animais em cada ambiente. As correlações de Spearman e de Pearson entre os valores genéticos preditos dos reprodutores, para todas as situações, foram maiores que 0,90. O resultado indica que, mesmo havendo presença de heterogeneidade de variância genética e/ou ambiental, se os reprodutores possuem proles bem distribuídas entre os ambientes (estratos heterogêneos) a classificação do mérito genético não se altera, o que era esperado, pois em análises unicarácter, quando ocorre uma fonte de viés na avaliação genética, ela é comum a todos os indivíduos. Na situação em que foi imposta a estrutura de dados à presença de heterogeneidade de variância residual com número de número desigual de proles por reprodutor nos estratos, provocou superestimação dos componentes de variância. Porém mesmo havendo alteração na magnitude dos valores genéticos preditos para os reprodutores, a heterogeneidade de variância não alterou a classificação entre os reprodutores todas as correlações de ordem foram próximas à unidade. O efeito da heterogeneidade de variância, oriunda de fatores ambientais, ocasiona em maiores distorções sobre a avaliação genética animal, em relação, quando a mesma é proveniente de causas genéticas. A conexidade genética entre diferentes ambientes, dilui o efeito da heterogeneidade de variância, tanto de origem genética, quanto ambiental, na predição de valores genéticos dos reprodutores.

Persistência da lactação e Influência da estrutura de dados sobre a estimação de parâmetros genéticos para a produção de leite de bovinos da raça Holandesa

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Genetic Parameters for Growth Traits of Mediterranean Buffaloes from Brazil, Estimated By Bayesian Inference

Quantitative analysis of growth genetic parameters is not available for many breeds of buffaloes making selection and breeding decisions an empirical process that lacks robustness. The objective of this study was to estimate heritability for birth weight (BW), weight at 205 days (W205) and 365 days (W365) of age using Bayesian inference. The Brazilian Program for Genetic Improvement of Buffaloes provided the data. For the traits BW, W205 and W365 of Brazilian Mediterranean buffaloes 5169, 3792 and 3883 observations have been employed for the analysis, respectively. In order to obtain the estimates of variance, univariate analyses were conducted using the Gibbs sampler included in the MTGSAM software. The model for BW, W205 and W365 included additive direct and maternal genetic random effects, random maternal permanent environmental effect and contemporary group that was treated as a fixed effect. The convergence diagnosis was performed employing Geweke, a method that uses an algorithm from the Bayesian Output Analysis package that was implemented using R software environment. The average values for weight traits were 37.6 +/- 4.7 kg for BW, 192.7 +/- 40.3 kg for W205 and 298.6 +/- 67.4 kg for W365. The heritability posterior distributions for direct and maternal effects were symmetric and close to those expected in a normal distribution. Direct heritability estimates obtained using the modes were 0.30 (BW), 0.52 (W205) and 0.54 (W365). The maternal heritability coefficient estimates were 0.31, 0.19 and 0.21 for BW, W205 and W365, respectively. Our data suggests that all growth traits and mainly W205 and W365, have clear potential for yield improvement through direct genetic selection.

Estimates of genetic parameters for total milk yield over multiple ages in Brazilian Murrah buffaloes using different models

The objective of this study was to estimate variance components and genetic parameters for accumulated 305-day milk yield (MY305) over multiple ages, from 24 to 120 months of age, applying random regression (RRM), repeatability (REP) and multi-trait (MT) models. A total of 4472 lactation records from 1882 buffaloes of the Murrah breed were utilized. The contemporary group (herd-year-calving season) and number of milkings (two levels) were considered as fixed effects in all models. For REP and RRM, additive genetic, permanent environmental and residual effects were included as random effects. MT considered the same random effects as did REP and RRM with the exception of permanent environmental effect. Residual variances were modeled by a step function with 1, 4, and 6 classes. The heritabilities estimated with RRM increased with age, ranging from 0.19 to 0.34, and were slightly higher than that obtained with the REP model. For the MT model, heritability estimates ranged from 0.20 (37 months of age) to 0.32 (94 months of age). The genetic correlation estimates for MY305 obtained by RRM (L23.res4) and MT models were very similar, and varied from 0.77 to 0.99 and from 0.77 to 0.99, respectively. The rank correlation between breeding values for MY305 at different ages predicted by REP, MT, and RRM were high. It seems that a linear and quadratic Legendre polynomial to model the additive genetic and animal permanent environmental effects, respectively, may be sufficient to explain more parsimoniously the changes in MY305 genetic variation with age.

Random regression models to estimate genetic parameters for milk production of Guzerat cows using orthogonal Legendre polynomials

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

An unequivocal normalization-based paradigm to solve dynamic economic and emission active-reactive OPF (optimal power flow)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Cerne e alburno em eucaliptos: influência da espécie e da idade nas propriedades tecnológicas

Pós-graduação em Ciência Florestal - FCA

Estimation methods of non-additive effects for characteristics of weight and scrotal circumference in crossbred beef cattle

The objective of this study was to investigate, in a population of crossbred cattle, the obtainment of the non-additive genetic effects for the characteristics weight at 205 and 390 days and scrotal circumference, and to evaluate the consideration of these effects in the prediction of breeding values of sires using different estimation methodologies. In method 1, the data were pre-adjusted for the non-additive effects obtained by least squares means method in a model that considered the direct additive, maternal and non-additive fixed genetic effects, the direct and total maternal heterozygosities, and epistasis. In method 2, the non-additive effects were considered covariates in genetic model. Genetic values for adjusted and non-adjusted data were predicted considering additive direct and maternal effects, and for weight at 205 days, also the permanent environmental effect, as random effects in the model. The breeding values of the categories of sires considered for the weight characteristic at 205 days were organized in files, in order to verify alterations in the magnitude of the predictions and ranking of animals in the two methods of correction data for the non-additives effects. The non-additive effects were not similar in magnitude and direction in the two estimation methods used, nor for the characteristics evaluated. Pearson and Spearman correlations between breeding values were higher than 0.94, and the use of different methods does not imply changes in the selection of animals.

Genotype x location x feeding interactions in Nellore cattle calculated through three-mode principal component analysis

The main objective of this study was to apply three-mode principal component analysis to assess the triple interaction (genotype x location x feeding) on direct genetic value for weight at 205 days of age. We used 60 sires with offspring in three regions of northeastern Brazil (Maranhao, Mata and Agreste, and Reconcavo Baiano) and raised on a pasture regime or with supplementation. There was no interaction between genotype and location, but there was a correlation between genotype and direct effect of feeding. The use of sires should be dictated according to the system of rearing of their offspring.

Star formation in H I tails: HCG 92, HCG 100 and six interacting systems

We present new Gemini spectra of 14 new objects found within the H?i tails of Hickson Compact Groups (HCGs) 92 and 100. Nine of them are Galaxy Evolution Explorer (GALEX) far-ultraviolet (FUV) and near-ultraviolet (NUV) sources. The spectra confirm that these objects are members of the compact groups and have metallicities close to solar, with an average value of 12+log(O/H) similar to 8.5. They have average FUV luminosities 7 x 10(40)?erg?s-1 and very young ages (<100?Myr), and two of them resemble tidal dwarf galaxy (TDG) candidates. We suggest that they were created within gas clouds that were ejected during galaxygalaxy interactions into the intergalactic medium, which would explain the high metallicities of the objects, inherited from the parent galaxies from which the gas originated. We conduct a search for similar objects in six interacting systems with extended H?i tails: NGC 2623, NGC 3079, NGC 3359, NGC 3627, NGC 3718 and NGC 4656. We found 35 ultraviolet (UV) sources with ages < 100?Myr; however, most of them are on average less luminous/massive than the UV sources found around HCG 92 and HCG 100. We speculate that this might be an environmental effect and that compact groups of galaxies are more favourable to TDG formation than other interacting systems.