Clonal propagation of Phyllanthus amarus: A hepatoprotector

Background: The micropropagation protocol for Phyllanthus amarus, an important medicinal herb used widely for the treatment of hepatitis in ethnomedicinal systems, was standardized with shoot tip and single node explants. Materials and Methods: The micropropagation was carried out for the hyperproducing ecotype (phyllanthin content 463.828 ppm; hypophyllanthin content: 75.469 ppm) collected from Aanaikatti, Coimbatore, and grown in mist chamber, CPMB, TNAU. For micropropagation studies, the leaves were trimmed off and the shoot tips (6 mm long) and nodal segments (single node) were used for initiation. Results: Shoot tips and single node explants gave a maximum of 6.00 and 7.00 multiple shoots per explant with Benzyl Amino Purine (BAP) (1.0mg/L mg/L). Upon subculturing, a shoot length of around 7 cm with an average of eight internodes per shoot was observed after 20 days in the elongation medium supplemented with BAP (0.2 mg/Lmg/L) and Indole Acetic Acid (IAA) (2.0 mg/L). Seven to ten adventitious roots developed when the elongated microshoots were cultured in half strength MS medium with Indole Butyric Acid (IBA) (2.0 mg/Lmg/L) and NAA (1.0 mg/L mg/L) in 15-20 days after transfer. The rooted shoots acclimatized successfully to field conditions. Conclusion: A method for successful micropropagation of the valuable medicinal plant was established which will provide a better source for continuous supply of plants for manufacturing drugs.

Clonal complexes and virulence factors of Staphylococcus aureus from several cities in India

Background: Diseases from Staphylococcus aureus are a major problem in Indian hospitals and recent studies point to infiltration of community associated methicillin resistant S. aureus (CA-MRSA) into hospitals. Although CA-MRSA are genetically different from nosocomial MRSA, the distinction between the two groups is blurring as CA-MRSA are showing multidrug resistance and are endemic in many hospitals. Our survey of samples collected from Indian hospitals between 2004 and 2006 had shown mainly hospital associated methicillin resistant Staphylococcus aureus (HA-MRSA) carrying staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) type III and IIIA. But S. aureus isolates collected from 2007 onwards from community and hospital settings in India have shown SCCmec type IV and V cassettes while several variations of type IV SCCmec cassettes from IVa to IVj have been found in other parts of the world. In the present study, we have collected nasal swabs from rural and urban healthy carriers and pus, blood etc from in patients from hospitals to study the distribution of SCCmec elements and sequence types (STs) in the community and hospital environment. We performed molecular characterization of all the isolates to determine their lineage and microarray of select isolates from each sequence type to analyze their toxins, virulence and immune-evasion factors. Results: Molecular analyses of 68 S. aureus isolates from in and around Bengaluru and three other Indian cities have been carried out. The chosen isolates fall into fifteen STs with all major clonal complexes (CC) present along with some minor ones. The dominant MRSA clones are ST22 and ST772 among healthy carriers and patients. We are reporting three novel clones, two methicillin sensitive S. aureus (MSSA) isolates belonging to ST291 (related to ST398 which is live stock associated), and two MRSA clones, ST1208 (CC8), and ST672 as emerging clones in this study for the first time. Sixty nine percent of isolates carry Panton-Valentine Leucocidin genes (PVL) along with many other toxins. There is more diversity of STs among methicillin sensitive S. aureus than resistant ones. Microarray analysis of isolates belonging to different STs gives an insight into major toxins, virulence factors, adhesion and immune evasion factors present among the isolates in various parts of India. Conclusions: S. aureus isolates reported in this study belong to a highly diverse group of STs and CC and we are reporting several new STs which have not been reported earlier along with factors influencing virulence and host pathogen interactions.

Sensory-organ-like response determines the magnetism of zigzag-edged honeycomb nanoribbons

We present an analytical effective theory for the magnetic phase diagram for zigzag-edge terminated honeycomb nanoribbons described by a Hubbard model with an interaction parameter U. We show that the edge magnetic moment varies as ln U and uncover its dependence on the width W of the ribbon. The physics of this owes its origin to the sensory-organ-like response of the nanoribbons, demonstrating that considerations beyond the usual Stoner-Landau theory are necessary to understand the magnetism of these systems. A first-order magnetic transition from an antiparallel orientation of the moments on opposite edges to a parallel orientation occurs upon doping with holes or electrons. The critical doping for this transition is shown to depend inversely on the width of the ribbon. Using variational Monte Carlo calculations, we show that magnetism is robust to fluctuations. Additionally, we show that the magnetic phase diagram is generic to zigzag-edge terminated nanostructures such as nanodots. Furthermore, we perform first-principles modeling to show how such magnetic transitions can be realized in substituted graphene nanoribbons. DOI: 10.1103/PhysRevB.87.085412

Development of an ex vivo organ culture model using human gastro-intestinal tissue and Campylobacter jejuni.

Campylobacter jejuni is an important food-borne pathogen. However, relatively little is understood regarding its pathogenesis, and research is hampered by the lack of a suitable model. Recently, a number of groups have developed assays to study the pathogenic mechanisms of C. jejuni using cell culture models. Here, we report the development of an ex vivo organ culture model, allowing for the maintenance of intestinal mucosal tissue, to permit more complex host-bacterium interactions to be studied. Ex vivo organ culture highlights the propensity for C. jejuni to adhere to mucosal tissue via the flagellum, either as discrete colonies or as multicellular units.

Desarrollo y optimización de herramientas biotecnológicas para la obtención de material clonal de "Pinus radiata" D. Don

224 p. : il. col.

Length-weight relationship and organ indices of pond raised and wild population of C. gariepinus (Burchell 1822) pisces-Claridae

Samples of C. gariepinus collected from the wild and cultured populations in Plateau and Niger States of Nigeria were analyzed for length-weight relationship and organ indices (Gonadosomatic index (GSI), hepatosomatic index (HSI), renalsomatic index (RSI) and somatic fat deposit index (PDI). High correlation and linear relationship between body length and body weight was observed in all sample population (P<0.05). A significant difference was observed between the GSI of males and females of both wild and cultured population and also between females of the wild and cultured population,(P < 0.05).There was no significant difference in HSI, CSI RSI and PDI of all the sample populations (P < 0.05).The importance of length-weight relationship and organ indices in fish production are discussed

Identificação, perfil fenotípico e disseminação clonal de cepas de Acinetobacter spp. em hospitais do estado do Rio de Janeiro

Espécies do gênero Acinetobacter são patógenos oportunistas que têm sido associados a várias infecções relacionadas à assistência em saúde acometendo principalmente, pacientes hospitalizados em centros de tratamento intensivo. A. baumannii , Acinetobacter genoespécie 3 e Acinetobacter genoespécie 13TU constituem o complexo A. baumannii e são consideradas as espécies de maior importância clínica. O objetivo deste trabalho foi identificar em nível de espécie, avaliar o perfil de resistência e analisar a diversidade genética de 102 amostras de Acinetobacter spp. isoladas de hemoculturas de pacientes internados em quatro hospitais do estado do Rio de Janeiro. Após a utilização de duas técnicas moleculares, 87 (85,3%) amostras foram identificadas como A. baumannii, sete (6,9%) como A. genoespécie 3, duas (1,9%) A. genoespécie 13TU e seis (5,9%) não foram identificadas em nível de espécie. A maioria das amostras de A. baumannii apresentou caráter multirresistente mostrando percentuais de resistência acima de 70% para ceftazidima, cefotaxima e ciprofloxacina. A resistência aos carbapenêmicos variou de 59% a 91%. Foi encontrada uma grande variedade de antibiotipos entre as amostras de A. baumannii, sendo prevalente dois multirresistentes. Um deles, caracterizado pela sensibilidade apenas aos aminoglicosídeos, ocorreu em 20,7% das amostras e o outro observado em 14,9% das amostras , foi caracterizado pela resistência a todos os antimicrobianos testados. Através da PCR, foi observado que 77% das amostras de A. baumannii apresentaram produto de amplificação compatível com gene blaOXA-23-like e destas, 64 mostraram-se resistentes tanto a imipenem quanto a meropenem. Em contrapartida, todas as amostras de A. baumannii OXA-23 negativas mostraram-se sensíveis aos carbapenens. Em relação às amostras de A. genoespécie 3 e 13TU, foram observados baixos percentuais de resistência frente aos antimicrobianos testados e apenas uma amostra de Acinetobacter genoespécie 3 apresentou produto de amplificação compatível com gene blaOXA-23-like, sendo esta sensível aos carbapenens. Não foram detectados os genes blaOXA-40-like e blaOXA-58-like nas 102 amostras de Acinetobacter spp.. A análise do polimorfismo genético das amostras de A. baumannii por PFGE mostrou a presença de 35 clones distribuídos entre os hospitais. Um clone (designado A), presente em 32 amostras (36,9%), foi encontrado nos quatro hospitais, sendo prevalente em três. Em 93,8% das amostras do clone A foi detectado o gene blaOXA-23-like. A disseminação de um clone de A. baumannii multirresistente produtor de OXA-23 entre os hospitais estudados evidencia a importância de medidas de controle de infecções mais eficazes, visando minimizar a morbidade e a mortalidade causadas por este importante patógeno. Além disso, como outras espécies também podem estar associadas a infecções, destacamos a importância da identificação correta das amostras em nível de espécie, visando o conhecimento da patogenicidade, do perfil de resistência e dados epidemiológicos des outras espécies, principalmente as pertencentes ao complexo A. baumannii

An epizootic of infectious hepatopancreatic and lymphoid organ necrosis disease in cultured Penaeus monodon: a case study

Shrimp disease of viral origin have caused large production losses worldwide. This paper presents a case study of shrimp (Penaeus monodon; Penaeus indicus) epizootic disease, covering an area of 1,050 ha in Andhra Pradesh, India. The disease struck shrimp farms in the area in July 1994. Samples from 26 shrimp farms were studied in the laboratory, and the pattern of the disease and of mortality recorded. The disease was classified as infectious hepatopancreatic and lymphoid organ necrosis disease (IHLN).

Achromobacter xylosoxidans na fibrose cística: infecção crônica e disseminação clonal

A mortalidade na Fibrose Cística (FC) é decorrente de infecções pulmonares causadas comumente por: Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus e espécies do Complexo Burkholderia cepacia (CBc). Mais recentemente, tem sido observada a emergência de BGN-NF raros, como Achromobacter xylosoxidans, porém, sua prevalência, potencial de transmissão e significado clínico são desconhecidos. O objetivo deste trabalho foi verificar a ocorrência de colonização crônica por A. xylosoxidans e avaliar a possibilidade de transmissão cruzada entre os pacientes acompanhados em dois centros de referência na cidade do Rio de Janeiro. Foram incluídos 39 pacientes com FC, com pelo menos uma cultura positiva para o gênero Achromobacter spp., em um total de 897 analisadas, do período de janeiro de 2003 a dezembro de 2008. A frequência de isolamento de Achromobacter spp. nas culturas analisadas foi de 14,5% (130 em 897 culturas). A maioria (n=122; 93,8%) foi identificada como A. xylosoxidans por testes fenotípicos e pelo sequenciamento do gene rrs que codifica o 16S rRNA. A análise do polimorfismo genético dos isolados de A. xylosoxidans pela técnica de PFGE, mostrou 22 grupos clonais. Destes, sete foram compartilhados entre pacientes distintos sugerindo transmissão cruzada. Apenas o clone G foi amplamente disseminado entre 56,4% dos pacientes estudados, sugerindo a possibilidade de um surto. Os 15 clones restantes constituíram-se em clones exclusivos por pacientes. Os cinco pacientes colonizados cronicamente por A. xylosoxidans mostraram a prevalência de clones únicos. Até o momento, este é o primeiro caso da ocorrência de surto por A. xylosoxidans em pacientes com Fibrose Cística. A. xylosoxidans é um microrganismo que vem se destacando em frequência e como um possível patógeno pulmonar nesses pacientes. Entretanto, até o momento os dados são insuficientes para avaliar a sua contribuição para a evolução da doença pulmonar. Estudos que busquem elucidar as características de A. xylosoxidans que o permitem colonizar persistentemente o pulmão dos pacientes com FC, bem como seu potencial de virulência, são necessários.