Mapping changes in coastline geomorphic features using Landsat TM and ETM+ imagery: examples in southeastern Brazil

Multitemporal Landsat Thematic Mapper (TM) and Enhanced Thematic Mapper Plus (ETM+) imagery was used to assess coastline morphological changes in southeastern Brazil. A spectral linear mixing approach (SLMA) was used to estimate fraction imagery representing amounts of vegetation, clean water (a proxy for shade) and soil. Fraction abundances were related to erosive and depositional features. Shoreline, sandy banks (including emerged and submerged banks) and sand spits were highlighted mainly by clean water and soil fraction imagery. To evaluate changes in the coastline geomorphic features, the fraction imagery generated for each data set was classified in a contextual approach using a segmentation technique and ISOSEG, an unsupervised classification. Evaluation of the classifications was performed visually and by an error matrix relating ground-truth data to classification results. Comparison of the classification results revealed an intense transformation in the coastline, and that erosive and depositional features are extremely dynamic and subject to change in short periods of time.

Twelve-month Outcomes After Coronary Stenting With the Genous (TM) Bio-Engineered R Stent (TM) in Diabetic Patients from the e-HEALING Registry

Objectives: We compared 12-month outcomes, regarding ischemic events, repeat intervention, and ST, between diabetic and nondiabetic patients treated with the Genous (TM) EPC capturing R stent (TM) during routine nonurgent percutaneous coronary intervention (PCI) using data from the multicenter, prospective worldwide e-HEALING registry. Background: Diabetic patients have an increased risk for restenosis and stent thrombosis (ST). Methods: In the 4,996 patient e-HEALING registry, 273 were insulin requiring diabetics (IRD), 963 were non-IRD (NIRD), and 3,703 were nondiabetics. The 12-month primary outcome was target vessel failure (TVF), defined as target vessel-related cardiac death or myocardial infarction (MI) and target vessel revascularization. Secondary outcomes were the composite of cardiac death, MI or target lesion revascularization (TLR), and individual outcomes including ST. Cumulative event rates were estimated with the Kaplan-Meier method and compared with a log-rank test. Results: TVF rates were respectively 13.4% in IRD, 9.0% in NIRD, and 7.9% in nondiabetics (P < 0.01). This was mainly driven by a higher mortality hazard in IRD (P < 0.001) and NIRD (P = 0.07), compared with nondiabetics. TLR rates were comparable in NIRD and nondiabetics, but significantly higher in IRD (P = 0.04). No difference was observed in ST. Conclusion: The 1-year results of the Genous stent in a real-world population of diabetics show higher TVF rates in diabetics compared with nondiabetics, mainly driven by a higher mortality hazard. IRD is associated with a significant higher TLR hazard. Definite or probable ST in all diabetic patients was comparable with nondiabetics. (J Interven Cardiol 2011;24:285-294)

Clinical results after coronary stenting with the Genous (TM) Bio-engineered R stent (TM): 12-month outcomes of the e-HEALING (Healthy Endothelial Accelerated Lining Inhibits Neointimal Growth) worldwide registry

Aims: e-HEALING is a worldwide, internet-based registry designed to capture post marketing clinical data on the use of the Genous (TM) EPC capturing R stent (TM). Rapid restoration of a healthy endothelial layer after stent placement by capturing circulating endothelial progenitor cells may reduce both stent thrombosis (ST) and in-stent-restenosis. Methods and results: We planned a 5,000 patient registry with >= 1 lesion suitable for stenting. The 12-month primary outcome was target vessel failure (TVF), defined as target vessel-related cardiac death or myocardial infarction (MI) and target vessel revascularisation. Secondary outcomes were the composite of cardiac death, MI or target lesion revascularisation (TLR), and individual outcomes including ST. A total of 4,939 patients received >= 1 Genous stent between 2005 and 2007. Baseline characteristics showed a median age of 63 years, 79% males, 25% diabetics, and 37% with prior MI. A total of 49% of lesions treated were ACC/AHA type B2 or C; 1.1 stents per lesion were used. At 12 months, TVF occurred in 8.4% and the composite of cardiac death, MI or TLR in 7.9%. Twelve-month TLR and ST were 5.7% and 1.1%, respectively. Conclusions: Coronary stenting with the Genous results in good clinical outcomes, and low incidences of repeat revascularisation and ST.

Functional association of human Ki-1/57 with pre-mRNA splicing events

The cytoplasmic and nuclear protein Ki- 1 / 57 was first identified in malignant cells from Hodgkin`s lymphoma. Despite studies showing its phosphorylation, arginine methylation, and interaction with several regulatory proteins, the functional role of Ki- 1 / 57 in human cells remains to be determined. Here, we investigated the relationship of Ki- 1 / 57 with RNA functions. Through immunoprecipitation assays, we verified the association of Ki- 1 / 57 with the endogenous splicing proteins hnRNPQ and SFRS9 in HeLa cell extracts. We also found that recombinant Ki- 1 / 57 was able to bind to a poly- U RNA probe in electrophoretic mobility shift assays. In a classic splicing test, we showed that Ki- 1 / 57 can modify the splicing site selection of the adenoviral E1A minigene in a dose- dependent manner. Further confocal and. uorescence microscopy analysis revealed the localization of enhanced green. uorescent protein - Ki- 1 / 57 to nuclear bodies involved in RNA processing and or small nuclear ribonucleoprotein assembly, depending on the cellular methylation status and its N- terminal region. In summary, our findings suggest that Ki- 1 / 57 is probably involved in cellular events related to RNA functions, such as pre- mRNA splicing.

Essential role of TM V and VI for binding the C-terminal sequences of Des-Arg-kinins

In the kallikrein-kinin and renin-angiotensin systems the main receptors, B-1 and B-2 (kinin receptors) and AT(1) and AT(2) (angiotensin receptors) respectively, are seven-transmembrane domain G-protein-coupled receptors. Considering that the B, agonists Des-Arg(9)-BK (Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro-Phe), Lys-desArg(9)-BK or Des-Arg(10)-KD (Lys-Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro-Phe) and the AT, agonist (Asp-Arg-Val-Tyr-lle-His-Pro-Phe) have the same two residues at the C-terminal region (i.e. Pro-Phe), we hypothesized that TM V and TM VI of the B-1 receptor could play an essential role in agonist binding and activity, being these regions receptor sites for binding the C-terminal sequences of Des-Arg-kinins similarly to that observed to AT, receptor. To investigate this hypothesis, we replaced Arg(212) for Ala at the top of the TM V and the sequence 274-282 (CPYHFFAFL) in TM VI of the rat kinin B, receptor by the 32 receptor homologous sequence, 289-297 (FPFQISTFL) and subsequently analyzed the consequences of these mutations by competition binding and functional assays. Despite correct expression, observed at the mRNA and protein level by RT-PCR and confocal microscopy, respectively, no agonist binding and function was verified for the mutated receptors. Therefore, our results suggest an important role for Arg(212) in the TM V and a region of TM VI of rat B, receptor in the interaction with the C-terminal residues of Des-Arg-kinins, similar to that observed with AngII. (c) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Canine visceral leishmaniasis: Performance of a rapid diagnostic test (Kalazar Detect (TM)) in dogs with and without signs of the disease

Current visceral leishmaniasis (VL) control programs in Brazil include the infected dog elimination but, despite this strategy, the incidence of human VL is still increasing. One of the reasons is the long delay between sample collection, analysis, control implementation and the low sensitivity of diagnostic tests. Due to the high prevalence of asymptomatic dogs, the diagnosis of these animals is important considering their vector infection capacity. Hence, a rapid and accurate diagnosis of canine visceral leishmaniasis is essential for an efficient surveillance program. In this study we evaluated the performance of rK39 antigen in an immunochromatographic format to detect symptomatic and asymptomatic Leishmania chagasi infection in dogs and compared the results with those using a crude antigen ELISA. The sensitivity of rK39 dipstick and ELISA were 83% vs. 95%, respectively, while the specificity was both 100%. Our results also demonstrated that the dipstick test was able to detect infected dogs presenting different clinical forms. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

Bond strength of Epiphany (TM) Sealer combined with different adhesive systems photo-activated with LED and QTH

The Epiphany (TM) Sealer is a new dual-curing resin-based sealer and has been introduced as an alternative to gutta-percha and traditional root canal sealers. The canal filling is claimed to create a seal with the dentinal tubules within the root canal system producing a `monoblock` effect between the sealer and dentinal tubules. Therefore, considering the possibility to incorporate the others adhesive systems, it is important to study the bond strength of the resulting cement. Forty-eight root mandibular canines were sectioned 8-mm below CEJ. The dentine discs were prepared using a tapered diamond bur and irrigated with 1% NaOCl and 17% EDTA. Previous the application Epiphany (TM) Sealer, the Epiphany (TM) Primer, AdheSE, and One Up Bond F were applied to the root canal walls. The LED and QTH (Quartz Tungsten Halogen) were used to photo-activation during 45 s with power density of 400 and 720 mW/cm(2), respectively. The specimens were performed on a universal testing machine at a cross-head speed of 1 mm/min until bond failure occurred. The force was recorded and the debonding values were used to calculate Push-out bond strength. The analysis of variance (ANOVA) and Tukey`s post-hoc tests showed significant statistical differences (P < 0.05) to Epiphany (TM) Sealer/Epiphany (TM) Primer/QTH and EpiphanyTM Sealer/AdheSE/QTH, which had the highest mean values of bond strength. The efficiency of resin-based filling materials are dependent the type of light curing unit used including the power density, the polymerization characteristics of these resin-based filling materials, depending on the primer/adhesive used.

A cassette ligation strategy with thioether replacement of three Gly-Gly peptide bonds: Total chemical synthesis of the 101 residue protein early pregnancy factor [psi(CH2S)(28-29,56-57,76-77)]

The 101 residue protein early pregnancy factor (EPF), also known as human chaperonin 10, was synthesized from four functionalized, but unprotected, peptide segments by a sequential thioether ligation strategy. The approach exploits the differential reactivity of a peptide-NHCH2CH2SH thiolate with XCH2CO-peptides, where X = Cl or I/Br. Initial model studies with short functionalized (but unprotected) peptides showed a significantly faster reaction of a peptide-NHCH2CH2SH thiolate with a BrCH2CO-peptide than with a CICH2CO-peptide, where thiolate displacement of the halide leads to chemoselective formation of a thioether surrogate for the Gly-Gly peptide bond. This rate difference was used as the basis of a novel sequential ligation approach to the synthesis of large polypeptide chains. Thus, ligation of a model bifunctional N-alpha-chloroacetyl, C-terminal thiolated peptide with a second N-alpha-bromoacetyl peptide demonstrated chemoselective bromide displacement by the thiol group. Further investigations showed that the relatively unreactive N-alpha-chloroacetyl peptides could be activated by halide exchange using saturated KI solutions to yield the highly reactive No-iodoacetyl peptides. These findings were used to formulate a sequential thioether ligation strategy for the synthesis of EPF, a 101 amino acid protein containing three Gly-Gly sites approximately equidistantly spaced within the peptide chain. Four peptide segments or cassettes comprising the EPF protein sequence (BrAc-[EPF 78-101] 12, ClAc-[EPF 58-75]-[NHCH2CH2SH] 13, ClAc-[EPF 30-55]-[NHCH2CH2SH] 14, and Ac-[EPF 1-27]-[NHCH2CH2SH] 15) of EPF were synthesized in high yield and purity using Boc SPPS chemistry. In the stepwise sequential ligation strategy, reaction of peptides 12 and 13 was followed by conversion of the N-terminal chloroacetyl functional group to an iodoacetyl, thus activating the product peptide for further ligation with peptide 14. The process of ligation followed by iodoacetyl activation was repeated to yield an analogue of EPF (EPF psi(CH2S)(28-29,56-57,76-77)) 19 in 19% overall yield.

Fatores intervenientes na implementação de ações estratégicas para a promoção do selo de indicação geográfica das panelas de barro de goiabeiras

Visando a proteção da propriedade industrial advinda de uma região demarcada, surgiu a Indicação Geográfica (IG). O registro da IG é conferido aos produtos ou serviços característicos de seu local de origem, apresentando qualidades únicas em função dos recursos naturais. Além disso, a IG é responsável por distinguir estes produtos em relação aos disponíveis no mercado. Neste contexto, entidades como Sebrae, MAPA e INPI, têm promovido ações estratégicas com o objetivo de apoiar a proteção do saber fazer e consequentemente, os produtos tradicionais das regiões. Tais entidades são responsáveis por promover a sustentabilidade do processo juntos aos produtores, assim como disseminar o selo para os consumidores. Assim, iniciativas como esta precisam ser apoiadas a fim de entregar resultados significativos para o desenvolvimento das regiões e seus respectivos produtos com o selo de IG. O Plano de Apoio à Gestão da Indicação Geográfica desenvolvido pelo Sebrae/ES tem três pilares: melhoria do processo de produção, promoção do produto e a sustentabilidade do processo. A presente pesquisa, baseando-se nas teorias sobre estratégia e implementação de estratégias, analisa os fatores intervenientes que contribuem para o sucesso da implementação do Plano de Apoio à Gestão da indicação geográfica das Panelas de Barro de Goiabeiras, bairro do município de Vitória, capital do Espírito Santo. A pesquisa é um estudo de caso de natureza qualitativa, exploratória e descritiva ex-post-facto. Os dados foram coletados nos documentos (plano de ação do Sebrae/ES, Livro dos Saberes e relatórios desenvolvidos por consultores especializados) e por meio de entrevistas com seis agentes de políticas públicas e cinco paneleiras, envolvidos na elaboração e implementação do plano de ação. Para a análise dos dados, adotou-se a metodologia de análise de conteúdo com index definido a posteriori. Do Plano de Apoio à Gestão da IG das Paneleiras de Goiabeiras, foram agrupadas três ações estratégicas buscando identificar em que medida os fatores intervenientes afetaram a implementação de cada ação estudada: Ação1: fortalecimento dos aspectos culturais do produto, Ação 2: fortalecimento dos aspectos sociais do produto e Ação 3: fortalecimento dos aspectos econômicos associados à diferenciação por IG. Os resultados mostraram que na Ação 1 o fator interveniente liderança superou as expectativas na implementação das estratégias. Já os aspectos políticos, o acompanhamento de resultados e a estrutura organizacional desenvolveram as ações conforme o planejado, enquanto os fatores intervenientes cultura e clareza nas estratégias apresentaram oportunidades de melhorias. Na Ação 2 somente os fatores intervenientes recursos, cultura e clareza nas estratégias apresentaram-se de acordo com o proposto, enquanto a liderança e a estrutura organizacional mostraram-se como pontos de oportunidades de melhoria. Por fim, na Ação 3 nenhum fator interveniente foi destaque como uma oportunidade de melhoria. A estrutura organizacional e os aspectos políticos apresentaram-se de acordo, enquanto os recursos e a liderança superaram as expectativas.

Abordagens metodológicas para avaliar risco de extinção de espécies de Brachyteles (Primates : Atelidae)

A distribuição geográfica de um táxon é limitada por aspectos ecológicos e históricos. Muitas atividades humanas têm causado modificações na cobertura vegetal, o que leva à fragmentação e perda do habitat. Isso tem levado à extinção local de populações de várias espécies, alterando sua distribuição geográfica. Entre elas estão as duas espécies do gênero Brachyteles (os muriquis), que são primatas endêmicos de um dos biomas mais afetados por esses processos, a Mata Atlântica. A União Internacional para a Conservação da Natureza (UICN) é uma organização que busca conservar a biodiversidade. Entre outros critérios, utiliza o conhecimento sobre as distribuições geográficas restritas das espécies para classificá-las em categorias de ameaça de extinção, nas chamadas listas vermelhas. Para isso, utiliza parâmetros espaciais, cujos resultados indicam o risco de extinção de determinado táxon em relação à sua distribuição geográfica. Muitas vezes os cálculos desses parâmetros são realizados de maneira subjetiva, de maneira que é importante a busca de métodos que tornem as classificações mais objetivas, precisas e replicáveis. Nesse contexto, o presente trabalho testou diferentes métodos de cálculos de três parâmetros relacionados à distribuição geográfica de B. hypoxanthus e B. arachnoides. Tratam-se de espécies ameaçadas de extinção, com localidades de ocorrência bem conhecidas, que foram profundamente afetadas pela degradação da Mata Atlântica. Assim, podem ser consideradas bons modelos para essas análises. Foi construído um banco de dados de localidades de ocorrência atuais das duas espécies. Por meio de abordagens de Sistemas de Informação Geográfica (SIG), foram estimadas a Extensão de Ocorrência (EOO) através de Mínimo Polígono Convexo e α-hull e Área de Ocupação (AOO) e Subpopulações por meio de métodos de grids, buffers circulares e α-hull, em diferentes escalas espaciais. Os resultados dos cálculos desses parâmetros foram comparados para identificar as abordagens e escalas mais adequadas para a avaliação de risco de extinção. Esses resultados indicam que as listas de localidades e os mapas de distribuição disponibilizados pela UICN precisam ser atualizados. Além disso, sugerem que α-hull é uma abordagem vantajosa para EOO e o método de buffers é mais adequado para os parâmetros de AOO e Subpopulações, quando utiliza escalas espaciais menores. Também foi utilizada a ferramenta GeoCAT, para as duas espécies. Essa ferramenta, por realizar análises de EOO e AOO instantâneas e por seus resultados serem semelhantes aos de outras análises, serve como uma abordagem preliminar de risco de extinção baseado no critério de distribuição geográfica.

Modelagem da distribuição geográfica atual e futura de Guerlinguetus (Rodentia, Sciuridae) no Brasil

O gênero Guerlinguetus, pertencente à família Sciuridae, possui sete espécies existentes no Brasil. Essas espécies têm sido tratadas como sinônimos de Sciurus aestuans, mas foram distinguidas em um gênero próprio com base nas revisões taxonômicas mais abrangentes disponíveis até recentemente. Apesar disso, pouco há na literatura sobre a distribuição das espécies desse gênero no Brasil e nenhuma pesquisa visando o conhecimento de sua distribuição futura havia sido realizada. A modelagem de distribuição potencial de espécies tem se tornado um componente importante dos planos de conservação e uma grande quantidade de técnicas têm sido desenvolvidas com esta finalidade. Ela pode ser uma ferramenta importante para determinar o grau de ameaça principalmente em espécies ou grupos com poucas informações disponíveis sobre sua distribuição. Com isso, o objetivo do presente trabalho foi verificar a influência das possíveis mudanças climáticas na distribuição das espécies de Guerlinguetus no Brasil, através da modelagem potencial das distribuições atual e futura dessas espécies. Para isso foram utilizados dados climáticos e topográficos e o cenário pessimista de emissão de CO2 (A2) para o ano 2070, do Modelo de Circulação Geral CSIRO, com base no quarto relatório do Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas. Os modelos gerados apresentaram perda significativa de áreas consideradas ambientalmente adequadas, do modelo de distribuição atual para o modelo de distribuição futura para as espécies de Guerlinguetus, com exceção de G. aestuans. Apesar da expansão da região potencial de distribuição de G. aestuans para o ano de 2070, a média dos valores de adequabilidade ambiental diminuiu em relação ao modelo de distribuição atual. A localização dessas espécies de hábito arborícola em áreas geograficamente espalhadas dentro da Amazônia, Cerrado e Mata Atlântica é preocupante, devido a grande perda de área original desses biomas, tornando possível a hipótese de ameaça à sobrevivência das espécies devido a mudanças ambientais futuras.