SMART, a simple modular architecture research tool: Identification of signaling domains

Accurate multiple alignments of 86 domains that occur in signaling proteins have been constructed and used to provide a Web-based tool (SMART: simple modular architecture research tool) that allows rapid identification and annotation of signaling domain sequences. The majority of signaling proteins are multidomain in character with a considerable variety of domain combinations known. Comparison with established databases showed that 25% of our domain set could not be deduced from SwissProt and 41% could not be annotated by Pfam. SMART is able to determine the modular architectures of single sequences or genomes; application to the entire yeast genome revealed that at least 6.7% of its genes contain one or more signaling domains, approximately 350 greater than previously annotated. The process of constructing SMART predicted (i) novel domain homologues in unexpected locations such as band 4.1-homologous domains in focal adhesion kinases; (ii) previously unknown domain families, including a citron-homology domain; (iii) putative functions of domain families after identification of additional family members, for example, a ubiquitin-binding role for ubiquitin-associated domains (UBA); (iv) cellular roles for proteins, such predicted DEATH domains in netrin receptors further implicating these molecules in axonal guidance; (v) signaling domains in known disease genes such as SPRY domains in both marenostrin/pyrin and Midline 1; (vi) domains in unexpected phylogenetic contexts such as diacylglycerol kinase homologues in yeast and bacteria; and (vii) likely protein misclassifications exemplified by a predicted pleckstrin homology domain in a Candida albicans protein, previously described as an integrin.

An Embryo-Defective Mutant of Arabidopsis Disrupted in the Final Step of Biotin Synthesis

Auxotrophic mutants have played an important role in the genetic dissection of biosynthetic pathways in microorganisms. Equivalent mutants have been more difficult to identify in plants. The bio1 auxotroph of Arabidopsis thaliana was shown previously to be defective in the synthesis of the biotin precursor 7,8-diaminopelargonic acid. A second biotin auxotroph of A. thaliana has now been identified. Arrested embryos from this bio2 mutant are defective in the final step of biotin synthesis, the conversion of dethiobiotin to biotin. This enzymatic reaction, catalyzed by the bioB product (biotin synthase) in Escherichia coli, has been studied extensively in plants and bacteria because it involves the unusual addition of sulfur to form a thiophene ring. Three lines of evidence indicate that bio2 is defective in biotin synthase production: mutant embryos are rescued by biotin but not dethiobiotin, the mutant allele maps to the same chromosomal location as the cloned biotin synthase gene, and gel-blot hybridizations and polymerase chain reaction amplifications revealed that homozygous mutant plants contain a deletion spanning the entire BIO2-coding region. Here we describe how the isolation and characterization of this null allele have provided valuable insights into biotin synthesis, auxotrophy, and gene redundancy in plants.

The N-end rule: functions, mysteries, uses.

The N-end rule relates the in vivo half-life of a protein to the identity of its N-terminal residue. Similar but distinct versions of the N-end rule operate in all organisms examined, from mammals to fungi and bacteria. In eukaryotes, the N-end rule pathway is a part of the ubiquitin system. I discuss the mechanisms and functions of this pathway, and consider its applications.

A psychrophilic crenarchaeon inhabits a marine sponge: Cenarchaeum symbiosum gen. nov., sp. nov.

Archaea, one of the three major domains of extant life, was thought to comprise predominantly microorganisms that inhabit extreme environments, inhospitable to most Eucarya and Bacteria. However, molecular phylogenetic surveys of native microbial assemblages are beginning to indicate that the evolutionary and physiological diversity of Archaea is far greater than previously supposed. We report here the discovery and preliminary characterization of a marine archaeon that inhabits the tissues of a temperate water sponge. The association was specific, with a single crenarchaeal phylotype inhabiting a single sponge host species. To our knowledge, this partnership represents the first described symbiosis involving Crenarchaeota. The symbiotic archaeon grows well at temperatures of 10 degrees C, over 60 degrees C below the growth temperature optimum of any cultivated species of Crenarchaeota. Archaea have been generally characterized as microorganisms that inhabit relatively circumscribed niches, largely high-temperature anaerobic environments. In contrast, data from molecular phylogenetic surveys, including this report, suggest that some crenarchaeotes have diversified considerably and are found in a wide variety of lifestyles and habitats. We present here the identification and initial description of Cenarchaeum symbiosum gen. nov., sp. nov., a symbiotic archaeon closely related to other nonthermophilic crenarchaeotes that inhabit diverse marine and terrestrial environments.

Trafficking of Plasmodium chabaudi adami-infected erythrocytes within the mouse spleen.

Plasmodium chabaudi adami causes a nonlethal infection in mice. We found that crisis, the time of rapidly dropping parasitemia, was abrogated by splenectomy, indicating the role of spleen in parasite killing. The factors that mediate spleen-dependent immunity are not known. An earlier study in Plasmodium berghei-infected rats showed an association between increased clearance of heat-treated erythrocytes and the onset of crisis [Wyler, D. J., Quinn, T. C. & Chen, L.-T. (1982) J. Clin. Invest. 67, 1400-1404]. To determine the potential effects of different vascular beds in parasite killing, we studied the distribution of parasitized erythrocytes and bacteria in the spleens of P. chabaudi adami-infected mice during precrisis (a period of rising parasitemia) and during crisis. After intravenous injection, bacteria were localized predominantly in the marginal zone. In contrast, parasitized erythrocytes were found in the red pulp. We also found that during precrisis, a time of no immunity, the uptake of radiolabeled infected erythrocytes by the spleen was increased, not decreased. These data imply that no change occurs in the flow of parasitized erythrocytes through the spleen during the transition to an immune state (crisis). Our observations suggest that immune effector mechanisms, not circulatory changes, account for spleen-dependent parasite killing during a P. chabaudi adami infection in mice.

Single-amino acid substitutions eliminate lysine inhibition of maize dihydrodipicolinate synthase.

Dihydrodipicolinate synthase (DHPS; EC 4.2.1.52) catalyzes the first step in biosynthesis of lysine in plants and bacteria. DHPS in plants is highly sensitive to end-product inhibition by lysine and, therefore, has an important role in regulating metabolite flux into lysine. To better understand the feedback inhibition properties of the plant enzyme, we transformed a maize cDNA for lysine-sensitive DHPS into an Escherichia coli strain lacking DHPS activity. Cells were mutagenized with ethylmethanesulfonate, and potential DHPS mutants were selected by growth on minimal medium containing the inhibitory lysine analogue S-2-aminoethyl-L-cysteine. DHPS assays identified surviving colonies expressing lysine-insensitive DHPS activity. Ten single-base-pair mutations were identified in the maize DHPS cDNA sequence; these mutations were specific to one of three amino acid residues (amino acids 157, 162, and 166) localized within a short region of the polypeptide. No other mutations were present in the remaining DHPS cDNA sequence, indicating that altering only one of the three residues suffices to eliminate lysine inhibition of maize DHPS. Identification of these specific mutations that change the highly sensitive maize DHPS to a lysine-insensitive isoform will help resolve the lysine-binding mechanism and the resultant conformational changes involved in inhibition of DHPS activity. The plant-derived mutant DHPS genes may also be used to improve nutritional quality of maize or other cereal grains that have inadequate lysine content when fed to animals such as poultry, swine, or humans.

Isolation of an ovine pulmonary surfactant-associated anionic peptide bactericidal for Pasteurella haemolytica.

Ovine pulmonary surfactant is bactericidal for Pasteurella haemolytica when surfactant and bacteria mixtures are incubated with normal ovine serum. To isolate this component, surfactant (1 mg/ml) was centrifuged at 100,000 x gav, and the supernatant was fractionated by HPLC. Fractions were eluted with acetonitrile (10-100%)/0.1% trifluoracetic acid and tested for bactericidal activity. Amino acid and sequence analysis of three bactericidal fractions showed that fraction 2 contained H-GDDDDDD-OH, fraction 3 contained H-DDDDDDD-OH, and fraction 6 contained H-GADDDDD-OH. Peptides in 0.14 M NaCl/10 microM ZnCl2 (zinc saline solution) induced killing of P. haemolytica and other bacteria comparable to defensins and beta-defensins [minimal bactericidal concentration (MBC)50 range, 0.01-0.06 mM] but not in 0.14 M NaCl/10 mM sodium phosphate buffer, pH 7.2/0.5 mM CaCl2/0.15 mM MgCl2 (MBC50 range, 2.8-11.5 mM). Bactericidal activity resided in the core aspartate hexapeptide homopolymeric region, and MBC50 values of aspartate dipeptide-to-heptapeptide homopolymers were inversely proportional to the number of aspartate residues in the peptide. P. haemolytica incubated with H-DDDDDD-OH in zinc saline solution was killed within 30 min. Ultrastructurally, cells contained flocculated intracellular constituents. In contrast to cationic defensins and beta-defensins, surfactant-associated anionic peptides are smaller in size, opposite in charge, and are bactericidal in zinc saline solution. They are members of another class of peptide antibiotics containing aspartate, which when present in pulmonary secretions may help clear bacteria as a part of the innate pulmonary defense system.

Molecular cloning of the transcription factor TFIIB homolog from Sulfolobus shibatae.

The Archaea (archaebacteria) constitute a group of prokaryotes that are phylogenetically distinct from Eucarya (eukaryotes) and Bacteria (eubacteria). Although Archaea possess only one RNA polymerase, evidence suggests that their transcriptional apparatus is similar to that of Eucarya. For example, Archaea contain a homolog of the TATA-binding protein which interacts with the TATA-box like A-box sequence upstream of many archaeal genes. Here, we report the cloning of a Sulfolobus shibatae gene that encodes a protein (transcription factor TFB) with striking homology to the eukaryotic basal transcription factor TFIIB. We show by primer extension analysis that transcription of the S. shibatae TFB gene initiates 27 bp downstream from a consensus A-box element. Significantly, S. shibatae TFB contains an N-terminal putative metal-binding region and two imperfect direct repeats--structural features that are well conserved in eukaryotic TFIIBs. This suggests that TFB may perform analogous functions in Archaea and Eucarya. Consistent with this, we demonstrate that S. shibatae TFB promotes the binding of S. shibatae TBP to the A-box element of the Sulfolobus 16S/23S rRNA gene. Finally, we show that S. shibatae TFB is significantly more related to TFB of the archaeon Pyrococcus woesei than it is to eukaryotic TFIIBs. These data suggest that TFB arose in the common archaeal/eukaryotic ancestor and that the lineages leading to P. woesei and S. shibatae separated after the divergence of the archaeal and eukaryotic lines of descent.

Symbiotic induction of a MADS-box gene during development of alfalfa root nodules.

In response to infection by Rhizobium, highly differentiated organs called nodules form on legume roots. Within these organs, the symbiotic association between the host plant and bacteria is established. A putative plant transcription factor, NMH7, has been identified in alfalfa root nodules. nmh7 contains a MADS-box DNA-binding region and shows homology to flower homeotic genes. This gene is a member of a multigene family in alfalfa and was identified on the basis of nucleic acid homology to plant regulatory protein genes (MADS-box-containing genes) from Antirrhinum and Arabidopsis. RNA analysis and in situ hybridization showed that expression of this class of regulatory genes is limited to the infected cells of alfalfa root nodules and is likely to be involved in the signal transduction pathway initiated by the bacterial symbiont, Rhizobium meliloti. The expression of nmh7 in a root-derived organ is unusual for this class of regulatory genes.

Caracterização anatomopatológica, microbiológica e parasitológica de ratos Wistar (Rattus norvegicus) em diferentes idades

Os ratos Wistar são amplamente empregados como modelo animal na pesquisa biomédica e o controle sanitário dos biotérios é essencial para garantir a qualidade dos experimentos. O objetivo do estudo foi a caracterização do estado sanitário da colônia de ratos Wistar em sistema de criação convencional e para tanto determinar as bactérias, fungos, virus e parasitos, bem como caracterizar as lesões anatomopatológicas do sistema respiratório. Foram utilizados 273 ratos (N), machos (M) e fêmeas (F), das faixas etárias 4, 8, 12, 16 a 20 semanas e entre 12 a 18 meses, para as determinações de peso e condição corpórea (N=273, 140M, 133F); avaliação bacteriológica de orofaringe, mucosa intestinal e lavado traqueobrônquico (N=40, 20M, 20F); determinação de anticorpos para vírus e bactérias (N=20, 10M, 10F); exame parasitológico (N=60, 30M, 30F); identificação molecular de Mycoplasma pulmonis em amostras de pulmão (N=25, 15M, 10F), e caracterização anatomopatológica da cavidade nasal, orofaringe, laringe, traqueia e pulmão (N=106, 53M, 53F). Foram realizadas ainda avaliações microbiológicas das salas dos ratos em três períodos com isolamento de Micrococcus spp., Staphylococcus spp., Bacillus spp., Aspergillus spp. e Penicillium spp. O peso se mostrou homogêneo dentro da faixa etária e gênero, com apenas sete animais magros (2,56%) e nove em sobrepeso (3,30%). Não foram isoladas bactérias patogênicas na orofaringe, mucosa intestinal e lavado traqueobrônquico por cultivo. Mycoplasma pulmonis foi determinado em 72% das amostras pulmonares e em 100% dos soros testados. Em 35% foram detectados anticorpos para Reovirus tipo III e em 100% para bacilos associados ao epitélio respiratório ciliado. Syphacia muris foi diagnosticada em 91,67%, Eimeria spp. em 3,33% e Entamoeba muris em 1,67%. Lesões relacionadas a infecção por agentes exógenos foram observadas em cavidade nasal e na orofaringe, laringe e traqueia a partir da 4 semanas de idade e, em pulmão desde as 12 semanas, com aumento de frequência de ocorrência e do grau de progressão, com o avançar da idade, nos vários segmentos estudados. Concluímos que a caracterização do estado sanitário dos ratos permite conhecer as particularidades do modelo biológico utilizado e compor base de dados para auxiliar no desenho e na interpretação experimental dos pesquisadores, além de garantir uma base para o programa de monitorização sanitária de biotérios em condições similares

Avaliação da contaminação conjunta de Dekkera bruxellensis e Lactobacillus fermentum sobre a fermentação alcoólica: efeito do substrato e formas de controle

As contaminações por leveduras selvagens e por bactérias no processo de produção de etanol combustível no Brasil causam prejuízos ao rendimento fermentativo e aumento de custos pelo uso de biocidas. No entanto, poucos estudos tem focado no efeito das contaminações conjuntas de leveduras selvagens e bactérias e as possíveis interações entre os micro-organismos, especialmente em função dos diferentes substratos de fermentação e das formas de controle. Este trabalho teve por objetivos verificar o efeito do substrato (caldo de cana e melaço) sobre o desenvolvimento das contaminações pela levedura da espécie Dekkera bruxellensis e pela bactéria Lactobacillus fermentum, em co-culturas com Saccharomyces cerevisiae (linhagem industrial PE-2) e possíveis formas de controle do crescimento dos contaminantes (pelo uso de metabissulfito de potássio e adição de etanol ao tratamento ácido) sem afetar a levedura do processo. Os testes foram realizados em condições de crescimento (substrato com 4 °Brix, culturas agitadas) e fermentação com reciclo celular (substrato com 16 °Brix, culturas estáticas). Houve interação entre as leveduras e a bactéria quando crescidas em caldo de cana 4 °Brix. A levedura industrial não foi afetada pela presença dos micro-organismos contaminantes, no entanto, para D. bruxellensis a presença de L. fermentum interferiu positivamente no crescimento, com aumento no número de UFC, e consequentemente inibição do crescimento da bactéria. Em melaço, houve um estímulo ao crescimento de L. fermentum quando em co-cultura com S. cerevisiae. Houve influência das contaminações sobre os parâmetros avaliados no experimento (pH, açúcar redutor total, etanol, glicerol e crescimento das células) e a contaminação conjunta de L. fermentum e D. bruxellensis potencializou o efeito das contaminações pelos micro-organismos isoladamente, tanto em caldo quanto em melaço. A adição de 13% de etanol à solução de ácido sulfúrico pH 2,0 no tratamento celular resultou em uma diminuição significativa no número de UFC de D. bruxellensis (entre 90-99%). A levedura PE-2 foi pouco afetada pelo tratamento proposto. A bactéria L. fermentum teve seu crescimento afetado em todas as combinações testadas. Como os experimentos foram feitos em co-culturas, verificouse que pode haver influência de um micro-organismo sobre a viabilidade do outro, dependendo da reação ao tratamento ácido-etanol. O metabissulfito de potássio (MBP), no intervalo entre 200-400 mg/L, foi eficaz para controlar o crescimento de D. bruxellensis dependendo do meio de cultura e linhagem. Quando adicionado (250 mg/L) à solução ácida (pH 2,0) no tratamento celular, um efeito significativo foi observado nas culturas mistas, pois ocorreu a inativação do SO2 pela S. cerevisiae e uma provável proteção das células de D. bruxellensis, não sendo essa levedura prejudicada pelo MBP. A resposta fisiológica de S. cerevisiae na presença de MBP pode explicar a diminuição significativa na produção de etanol. Quando o MBP foi adicionado ao meio de fermentação, resultou no controle da D. bruxellensis mas não em sua morte, com efeito menos intensivo sobre a eficiência fermentativa. Em cocultura com a adição de MBP, a eficiência fermentativa foi significativamente menor do que na ausência de MBP.

Efeito do substrato e das condições de tratamento do fermento sobre a fermentação etanólica contaminada com leveduras Saccharomyces cerevisiae selvagens e Lactobacillus fermentum

Pouco se sabe sobre o efeito do substrato e a interação entre as leveduras selvagens e bactérias do gênero Lactobacillus na fermentação alcoólica, pois os estudos tem se concentrado na avaliação dos efeitos da contaminação por um ou outro contaminante separadamente. Diante disso, este trabalho teve como objetivos estudar o efeito do substrato e das condições de tratamento do fermento sobre as fermentações contaminadas com ambos os micro-organismos, leveduras S. cerevisiae selvagens (três linhagens apresentando colônias rugosas e células dispostas em pseudohifas) e Lactobacillus fermentum, tendo a linhagem industrial de S. cerevisiae PE-2 como levedura do processo. Foram realizadas fermentações em batelada em mosto de caldo e de melaço, sem reciclo e com reciclo celular, utilizando tanto a cultura pura da linhagem PE-2 quanto as culturas mistas com as linhagens rugosas e ou L. fermentum. Foram avaliadas modificações no tratamento ácido do fermento, visando o controle do crescimento dos contaminantes sem afetar a levedura do processo. Em seguida, foram conduzidas fermentações contaminadas e não contaminadas submetidas ao tratamento ácido combinado com adição de etanol, tanto em caldo quanto em melaço, utilizando-se PE-2, uma das linhagens rugosas e L. fermentum. A atividade da invertase extracelular foi também avaliada em ambos os substratos para os micro-organismos estudados, em condições de crescimento. Concluiu-se que o tipo de substrato de fermentação, caldo de cana ou melaço, influenciou o desempenho da linhagem industrial PE-2 assim como afetou o desenvolvimento das contaminações com as leveduras rugosas S. cerevisiae na presença ou ausência da bactéria L. fermentum, em fermentações sem reciclo celular. O efeito da contaminação foi mais evidente quando se utilizou caldo de cana do que melaço como substrato, no caso da contaminação com leveduras rugosas, e o inverso no caso da contaminação com L. fermentum. O efeito da contaminação sobre a eficiência fermentativa foi maior na presença da levedura rugosa do que com a bactéria, e a contaminação dupla (tanto com a levedura rugosa quanto com a bactéria) não teve efeito maior sobre a eficiência fermentativa do que a contaminação simples, por um ou por outro micro-organismo isoladamente, especialmente na fermentação em batelada com reciclo celular, independentemente do substrato. Nas fermentações com reciclo de células, o efeito do substrato foi menos evidente. O controle do crescimento das linhagens rugosas pode ser realizado modificando o tratamento ácido normalmente realizado na indústria, seja pela adição de etanol à solução ácida ou pelo abaixamento do pH, dependendo da linhagem rugosa. O tratamento combinado baixo pH (2,0) + 13% etanol afetou a fisiologia da linhagem industrial, trazendo prejuízos à fermentação com reciclo celular, com pequeno controle sobre o crescimento da levedura rugosa e causando morte celular à L. fermentum. A diferença na atividade invertásica entre as linhagens rugosas e industrial de S. cerevisiae pode ser a responsável pela fermentação lenta apresentada pelas linhagens rugosas quando presentes na fermentação, sendo não significativa a influência do substrato sobre a atividade dessa enzima.

Estudo da viabilidade para introduzir na rotina testes de diagnóstico para infecção respiratória aguda

Para avaliar os benefícios da comunicação rápida ao clínico do diagnóstico de vírus respiratórios, foi analisado a viabilidade econômica de 2 testes, com o tempo de entrega de resultado em 2 horas para teste rápido e 48 horas para Biologia Molecular. As amostras coletadas foram processadas utilizando técnicas convencionais e os testes disponíveis no mercado local. Foram escolhidos dois testes rápidos pelo método de imunocromatografia para quatro parâmetros analíticos: Influenza A, Influenza H1N1, Influenza B e Vírus Sincicial Respiratório (RSV) e em Biologia Molecular um teste de RT-PCR multiplex com 25 patógenos entre vírus e bactérias. O tipo de amostra utilizada foi swab e lavado de nasofaringe. A população escolhida para o estudo foi paciente adulto, em tratamento de câncer, que necessita de uma resposta rápida já que a maioria se encontra com comprometimento do sistema imune por doença ou por tratamento. O estudo foi transversal, realizado entre os anos de 2012 e 2013, para avaliar a viabilidade econômica da introdução de testes de diagnóstico da infecção respiratória aguda de etiologia viral a partir de amostras de nasofaringe em pacientes com câncer atendidos no Centro de Atendimento de Oncologia Intercorrência (CAIO ), do Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (ICESP), hospital público que atende exclusivamente Sistema Único de Saúde (SUS) e Hospital A.C. Camargo, que atende tanto a pacientes do SUS como da rede privada. O estudo incluiu 152 pacientes em tratamento para qualquer tipo de câncer, predominantemente do sexo feminino (81 mulheres e 70 homens) com idades entre 18-86 anos. Para participar do estudo o paciente era consultado e o critério para escolha do paciente foi ser portador de câncer, com história de febre (ainda que referida) acompanhada de tosse ou dor de garganta, tosse e sintomas respiratórios agudos, atendidos por protocolo padronizado que inclui avaliação na admissão, seguimento e manejo antimicrobiano. Para a avaliação econômica os pacientes foram classificados de acordo com o estado geral de saúde, se apresentavam bom estado de estado de saúde poderiam receber alta e faziam uso da medicação em casa evitando 5 dias de internação se recebessem algum resultado para Influenza ou RSV, no entanto os pacientes que apresentavam outro vírus, resultado negativo ou o estado geral era ruim permaneciam internados por 7 dias em observação e cuidados com medicação adequada. Foram realizadas análises econômicas em dois âmbitos: o sistema de saúde publico e o privado considerando o fator diminuição de dias de internação. A analise de Custo-benefício foi eficiente no Sistema privado mas inadequada para o SUS assim como, qualquer outra medida monetária já que os valores de reembolso do SUS estão defasados do custo de qualquer internação. A análise de Custo-efetividade que olha para outros fatores além do monetário foi efetiva nos dois sistemas que enfrentam falta de leitos além da condição de saúde do paciente de evitar a ingestão desnecessária de antibióticos, evitar os gastos do acompanhante, perda de dias de trabalho e estudo. Não houve correspondência de resultados dos testes rápidos com o multiplex de Biologia Molecular

Monitoramento da interação entre rizobactéria RZ2MS16 (Burkholderia ambifaria) promotora de crescimento e bioinoculantes comerciais aplicados nas culturas de soja e milho

As culturas da soja e milho são de grande importância econômica mundial e também para o Brasil, onde a área cultivada com essas duas culturas está estimada em 45.855.900 mil hectares, distribuídas em todos estados produtores conforme suas características. A estimativa da safra mundial de soja em 2015/16 apresentou uma redução na produção global da oleaginosa para 319,0 milhões de ton, volume 1,1 milhão de ton inferior ao levantamento de dezembro de 2015. Ainda assim, trata-se de um volume recorde. Para o milho, a produção global foi de 967,9 milhões de ton, com uma redução no volume de 5,9 milhões de ton em relação ao levantamento realizado em dezembro de 2015. Nessas duas culturas são comumente utilizadas bactérias fixadoras de nitrogênio (BFN), reduzindo ou até mesmo, eliminando a aplicação de adubos nitrogenados. Estudos apontam que a simbiose entre BFN e as culturas soja e milho pode ser otimizada mediante a coinoculação com rizobatérias promotoras de crescimento de plantas (RPCP). Apesar de promissora, o estudo da utilização de BFN em associação com RPCPs é incipiente no Brasil. Assim, o presente trabalho teve como objetivo monitorar, a partir da marcação bacteriana, a interação entre a linhagem de Burkholderia ambifaria (RZ2MS16), uma rizobactéria proveniente do guaranazeiro e previamente descrita como promotora de crescimento em soja e milho e linhagens das espécies Bradyrhizobium japonicum (SEMIA5079), Bradyrhizobium diazoefficiens (SEMIA5080) e Azospirillum brasilense (Ab-v5 e Ab-v6) que são comercialmente utilizadas como bioinoculantes nessas culturas respectivamente. Os efeitos sinergisticos da interação entre RZ2MS16 e bioinoculantes comercias foram avaliados em experimento de casa de vegetação. Também foi avaliado o efeito da coinoculação de bioinculantes com outra rizobactéria proveniente do guaranazeiro, Bacillus sp. (RZ2MS9). As linhagens foram inoculadas separadamente e coinoculadas, sendo melhores resultados observados com a coinoculação das linhagens. As linhagens marcadas com genes de fluorescência selecionadas para estudo de interação foram RZ2MS16, Ab-v5 e SEMIA5080, sendo essa interação observada por microscopia de fluorescência, com também pelo reisolamento das linhagens marcadas. As linhagens RZ2MS16:pNKGFP e Ab-v5: pWM1013 e SEMIA5080:pWM1013 colonizaram todos os nichos avaliados em milho e soja, respectivamente, sendo também caracterizadas como endofíticos. Assim se observa que estudos desta natureza são de grande importância para um melhor entendimento da interação entre bactéria planta e o efeito da coinoculação no melhor desenvolvimento de plantas comercialmente utilizadas.