A imunologia da infecção pelo HIV em pacientes com idade avançada: caracterização fenotípica e funcional da resposta imune mediada pela célula T CD4+

A proporção de idosos portadores da síndrome da imunodeficiência adquirida (aids) tem aumentado de maneira importante nos últimos anos e, até a presente data, existem poucos estudos que abordam a infecção nessa população especial. As particularidades imunológicas decorrentes do fenômeno da imunossenescência podem acarretar mudanças significativas na evolução da infecção pelo HIV, bem como na resposta ao tratamento. O objetivo maior desta Tese foi avaliar o impacto da idade na recuperação funcional do sistema imune de pacientes com aids acima de 55 anos, quando tratados adequadamente com terapia anti-retroviral, caracterizando a resultante imunológica da idade avançada e da infecção pelo HIV. Para tanto, foram estudados quatro grupos experimentais: indivíduos jovens saudáveis ou com aids, e indivíduos acima de 55 anos saudáveis ou com aids. Todos os pacientes com aids estavam recebendo terapia anti-retroviral, em sucesso terapêutico. No primeiro artigo apresentado, avaliamos resposta linfoproliferativa e produção de citocinas in vitro e resposta humoral in vivo mediante desafio antigênico com toxóide tetânico (TT) em indivíduos previamente vacinados contra o tétano. Os resultados mostraram deficiências imunológicas significativas relacionadas à idade avançada no que diz respeito a produção de IgG anti-TT, resposta linfoproliferativa e produção de IFN-. Em contrapartida, a produção de IL-10 foi significativamente maior nos indivíduos acima de 55 anos, infectados ou não pelo HIV. No segundo artigo, foram caracterizadas as subpopulações de células T mediante estímulo policlonal ou específico com antígenos do envelope do HIV (Env). Em culturas não-estimuladas de PBMC do grupo com aids e idade avançada, observamos frequência reduzida de células T naive e de memória central, associada a aumento de células T efetoras. Quando estimuladas policlonalmente, essas culturas apresentaram deficiência na produção de IFN- e hiperprodução de IL-10, como na resposta ao TT. Mediante estímulo específico com Env, a citometria de fluxo revelou frequência elevada de células T CD4+FoxP3-CD152+ com forte marcação intracelular para IL-10, indicando predomínio do fenótipo Tr-1, e não das células Treg clássicas. Interessantemente, em ambos os artigos, a replicação viral in vitro foi significativamente menor nos pacientes com aids acima de 55 anos, condizendo com a excelente resposta virológica desses pacientes ao tratamento antirretroviral. A neutralização da IL-10 com anticorpo anti-IL-10 nas culturas ativadas pelos peptídeos Env aumentou de forma significativa a replicação viral no sobrenadante. Tanto na resposta ao TT quanto aos peptídeos Env, o bloqueio da IL-10 aumentou os níveis de citocinas pró-inflamatórias, mas não melhorou a produção de IFN- dos pacientes acima de 55 anos com aids. Coletivamente, os achados dessa Tese revelam distúrbios em vários segmentos da resposta imune, particularmente no compartimento Th1, de pacientes acima 55 anos com aids e adequadamente tratados, sugerindo que, para esses pacientes, a reconstituição imune pós-tratamento não ocorre com a mesma eficácia que no jovem. Apesar do aumento da produção de IL-10 provavelmente contribuir, ao menos em parte, para o controle virológico, pode comprometer a resposta tanto ao próprio HIV, quanto a outros desafios antigênicos, a exemplo do toxóide tetânico. Sugere-se, portanto, a necessidade de recomendações específicas de manejo clínico para esse grupo de pacientes

Towards Application of One-Class Classification Methods to Medical Data

In the problem of one-class classification (OCC) one of the classes, the target class, has to be distinguished from all other possible objects, considered as nontargets. In many biomedical problems this situation arises, for example, in diagnosis, image based tumor recognition or analysis of electrocardiogram data. In this paper an approach to OCC based on a typicality test is experimentally compared with reference state-of-the-art OCC techniques-Gaussian, mixture of Gaussians, naive Parzen, Parzen, and support vector data description-using biomedical data sets. We evaluate the ability of the procedures using twelve experimental data sets with not necessarily continuous data. As there are few benchmark data sets for one-class classification, all data sets considered in the evaluation have multiple classes. Each class in turn is considered as the target class and the units in the other classes are considered as new units to be classified. The results of the comparison show the good performance of the typicality approach, which is available for high dimensional data; it is worth mentioning that it can be used for any kind of data (continuous, discrete, or nominal), whereas state-of-the-art approaches application is not straightforward when nominal variables are present.

Population parameters of Penaeus californiensis in the Gulf of Guayaquil, Ecuador

The growth, mortality, and recruitment pattern of Penaeus californiensis were investigated using tail length (TL)-frequency data obtained from the Gulf of Guayaquil shrimp population. Computer-based methods of tail-frequency analysis Compleat ELEFAN software were used. Results obtained gave relatively high growth and mortality estimates for both males and females. The recruitment pattern indicated two pulses annually, one significantly larger than the other.

VPA estimates of fishing mortality and exploited biomass from Sardinella aurita catch-at-length data in eastern Venezuela

In this study, length-frequency data on Spanish sardine (Sardinella aurita) from northeastern Venezuela were analyzed for the period 1967-1989. Average growth parameters for the von Bertalanffy equation were established as L sub( infinity )= 26.6 cm (TL) and K = 1.26 year super(-1). The number of recruits to the fishing area, estimated from length-structured Virtual Population Analysis, varied from <10 super(8) in the late 1960s to >10 super(9) at the end of the 1980s. Exploited biomass estimates for the same period varied from less than 20,000 t in the first year to more than 100,000 in 1989. Both recruitment and exploited biomass showed different seasonal patterns between 1976-1983 and 1984-1988. Despite some uncertainty regarding these estimates, it is considered that major population tendencies are adequately represented by this analysis

Evolução Quaternária da Baixada de Jacarepaguá a partir de perfis GPR

O trabalho presente tem como enfoque o estudo da evolução quaternária da Baixada de Jacarepaguá situada no estado do Rio de Janeiro através do uso do método GPR (Ground Penetrating Radar). Os numerosos estudos feitos na Baixada de Jacarepaguá, baseados nas curvas de variação do nível do mar em diferentes setores da costa Brasileira (MARTIN et al. 1985) e datações ao radiocarbono contribuíram na elaboração de um modelo evolutivo no Pleistoceno e no Holoceno. Esse modelo mostra em primeiro lugar episódios transgressivos em 7000-5100 anos BP, 3900-3600 anos BP e 2700-2500 anos BP e episódios regressivos a 5100-3900 anos BP, 3600-2700 anos BP e depois de 2500 anos BP. Esses episódios de variações do nível relativo do mar tiveram por consequência a constante evolução da Baixada de Jacarepaguá do estado de ilha-barreira com uma e depois duas barreiras (interna e externa), fruto da inundação da planície por invasão marinha em episódios transgressivos, a um estado de planície costeira emersa em episódios regressivos com barreira progradante direção ao mar e processos erosivos associados. Esse modelo evolutivo não inclui dados processados obtidos com o GPR, método que permite por impulsos eletromagnéticos de alta freqüência gerar um perfil de refletores baseado nas descontinuidades elétricas na subsuperficie. Os perfis levantados e processados nesse trabalho permitiram confirmar esse modelo evolutivo, mostrando uma sucessão de migração do perfil de praia e geometria sedimentar associada em resposta as numerosas variações eustática local.

Estrutura temática do gênero reportagem na revista Veja e no jornal A Nova Democracia: o caso Santiago

A presente pesquisa investiga as escolhas temáticas de textos jornalísticos, especificamente de reportagens, que partem do mesmo evento, mas que são produzidos e publicados em linhas editoriais distintas. Nosso objetivo geral, com este estudo, é proporcionar subsídios para que sejam superados paradigmas ainda baseados na dicotomia texto e gramática na Escola Básica, como também colaborar para a promoção de um ensino mais crítico e reflexivo, a fim de que os estudantes possam atuar em sociedade com autonomia. Para isso, elegemos como corpus duas reportagens de veículos ideologicamente antagônicos: o jornal A Nova Democracia e a revista Veja. Considerando que o contexto de cultura e o contexto de situação são determinantes para as escolhas linguísticas dos textos, examinamos a organização temática dos períodos que compõem as reportagens. Como referencial teórico, elegemos a Gramática Sistêmico-Funcional (GSF) de Halliday (1978; 1994; 2004), centrando-se especificamente na função Tema, pertencente à Estrutura Temática na Metafunção Textual, um dos níveis de análise da GSF, que organiza a oração como mensagem e sistematiza os significados ideacionais. O objetivo específico deste trabalho é, portanto, analisar até que ponto as diferenças ideológicas afetam as escolhas temáticas dos textos. Com essa finalidade, dedicamo-nos à análise dos Temas Ideacionais e seus significados, pois são eles os responsáveis por indicar de que maneira os autores priorizaram as informações nos períodos que compõem e organizam as mensagens contidas nos textos. Como método de pesquisa, anotamos e classificamos manualmente cada um dos dados quantitativos e, em seguida, passamos a uma análise qualitativa dos Temas assinalados. Os resultados apontam que ambos os textos apresentam uma alta frequência de Temas Ideacionais Participantes, mas semanticamente distintos. Quanto aos Temas Ideacionais Processos e Circunstâncias, eles evidenciam discrepâncias sintáticas e semânticas significativas, que revelam representações diferentes dos narradores frente ao mesmo evento.

Perfil genético por sequenciamento e genotipagem de cepas multirresistentes do Mycobacterium tuberculosis provenientes de diversos estados brasileiros

A tuberculose multirresistente (MR) a drogas é uma séria ameaça à saúde pública devido à maiores complexidade, custo e efeitos colaterais do tratamento. Poucos estudos descreveram a epidemiologia molecular de isolados de Mycobacterium tuberculosis MR no Brasil. Neste trabalho foi investigada a diversidade genética e mutações associadas à resistência a drogas de 99 isolados MR e 7 não MR coletados em um período de 8 anos e provenientes de 12 estados brasileiros. Esta investigação foi feita através da análise do polimorfismo de fragmentos de restrição do elemento de inserção IS6110 (IS6110-RFLP), spoligotyping e sequenciamento de regiões dos genes rpoB e katG que conferem resistência aos antibióticos rifampicina e isoniazida, respectivamente. Mutações nos genes katG e rpoB foram encontradas em 90,9% e 93% dos isolados MR analisados, respectivamente. Para o gene rpoB, 91,9% das mutações estavam contidas na região RRDR de 81-pb. Um total de 51 (51.5%), 23 (23.3%) e 11 (11.1%) isolados MR apresentaram mutações nos códons 531, 526 e 516, respectivamente. Com relação ao gene katG, foram encontradas mutações em 93% dos isolados MR analisados, sendo que 7 apresentaram mutações apenas na primeira região analisada (katG1). O codon 315 da segunda região analisada do gene katG (katG2) apresentou mutações em 82.8% dos isolados MR, sendo a maioria Ser315Thr. A região katG1 apresentou mutações em 30.3% dos isolados MR sendo a maioria deleção do códon 4. Pelo spoligotyping foi possível determinar que os isolados MR deste estudo pertencem a 5 diferentes famílias (com suas subfamílias) de M. tuberculosis circulantes no Brasil, onde as mais frequentemente encontradas foram: LAM (46%), T (17%) e H (12%). Nós observamos que uma das famílias, a EAI5, carrega mutações no códon 463 do gene katG, o que não ocorre para as demais. Além disso, entre nossos isolados foi identificada um isolado pertencente à cepa Beijing (extremamente virulenta), mas este fato não é alarmante já que se tratou de apenas um caso. Através de nossos dados foram descritos novos alelos mutados para os genes rpoB e katG. Com exceção da família X2, foi identificada uma região inicial do gene katG com alta frequência de mutações nos isolados MR. A análise por IS6110-RFLP revelou que 25 isolados formaram 11 grupos genotípicos enquanto 74 mostraram um padrão único de bandas. Esta alta taxa de polimorfismo indica aquisição independente de resistência entre nossos isolados. Para a família H, foi identificada uma inversão na freqüência de ocorrência de mutações no gene rpoB, sendo o códon 516 o mais mutado, seguido pelo 526 e 531. Os resultados deste estudo fornecem informações úteis para um melhor entendimento do espectro de mutações dos isolados MR de pacientes no Brasil. Nossos resultados também se tornam úteis no desenvolvimento de testes diagnósticos de tuberculose MR e para auxiliar no rastreamento da transmissão global desta doença.

Effect of sampling interval on estimates of larval supply

Estimates of larval supply can provide information on year-class strength that is useful for fisheries management. However, larval supply is difficult to monitor because long-term, high-frequency sampling is needed. The purpose of this study was to subsample an 11-year record of daily larval supply of blue crab (Callinectes sapidus) to determine the effect of sampling interval on variability in estimates of supply. The coefficient of variation in estimates of supply varied by 0.39 among years at a 2-day sampling interval and 0.84 at a 7-day sampling interval. For 8 of the 11 years, there was a significant correlation between mean daily larval supply and lagged fishery catch per trip (coefficient of correlation [r]=0.88). When these 8 years were subsampled, a 2-day sampling interval yielded a significant correlation with fishery data only 64.5% of the time and a 3-day sampling interval never yielded a significant correlation. Therefore, high-frequency sampling (daily or every other day) may be needed to characterize interannual variability in larval supply.

High bandwidth multimode fiber links using subcarrier multiplexing in vertical-cavity surface-emitting lasers

The usage of subcarrier multiplexing (SCM) techniques to allow link transmission in excess of the specified fiber bandwidth is described. A series of 200-Mbit/s channels with carrier frequencies of up to more than twenty times the 3-dB fiber bandwidth have been successfully used, the maximum being limited by the available electronics. To assess the transmission of the fiber, digitally modulated channels are placed on high frequency carrier signals and then used to modulate a vertical-cavity surface-emitting lasers (VCSEL).

Ultrafast sputtered ZnO thin films with high kT for acousticwave device applications

The fabrication of high frequency acoustic wave devices requires thedevelopment of thin films of piezoelectric materials with improved morphologicaland electro-acoustical properties. In particular, the crystalline orientationof the films, surface morphology, film stress and electrical resistivity are keyissues for the piezoelectric response. In the work reported here, ZnO thinfilms were deposited at high rates (>50 nm/min) using a novel process knownas the High Target Utilisation Sputtering (HiTUS). The films deposited possessexcellent crystallographic orientation, high resistivity (>109ωm), and exhibit surface roughness and film stress one order of magnitudelower than films grown with standard magnetron sputtering. The electromechanicalcoupling coefficient of the films, kT, was precisely calculated byimplementing the resonant spectrum method, and was found to be at least 6%higher than any previously reported kT of magnetron sputtered filmsto the Authors' knowledge. The low film stress of the film is deemed as one ofthe most important factors responsible for the high k T valueobtained. © 2010 IEEE.

A 660MHz ZVS DC-DC converter using gate-driver charge-recycling in 0.18μm CMOS with an integrated output filter

The design and manufacture of a prototype chip level power supply is described, with both simulated and experimental results. Of particular interest is the inclusion of a fully integrated on-chip LC filter. A high switching frequency of 660MHz and the design of a device drive circuit reduce losses by supply stacking, low-swing signaling and charge recycling. The paper demonstrates that a chip level converter operating at high frequency can be built and shows how this can be achieved, using zero voltage switching techniques similar to those commonly used in larger converters. Both simulations and experimental data from a fabricated circuit in 0.18μm CMOS are included. The circuit converts 2.2V to 0.75∼1.0V at ∼55mA. ©2008 IEEE.

Wide Area Passive UHF RFID System using Antenna Diversity Combined with Phase and Frequency Hopping

This paper presents a long range and effectively error-free ultra high frequency (UHF) radio frequency identification (RFID) interrogation system. The system is based on a novel technique whereby two or more spatially separated transmit and receive antennas are used to enable greatly enhanced tag detection performance over longer distances using antenna diversity combined with frequency and phase hopping. The novel technique is first theoretically modelled using a Rician fading channel. It is shown that conventional RFID systems suffer from multi-path fading resulting in nulls in radio environments. We, for the first time, demonstrate that the nulls can be moved around by varying the phase and frequency of the interrogation signals in a multi-antenna system. As a result, much enhanced coverage can be achieved. A proof of principle prototype RFID system is built based on an Impinj R2000 transceiver. The demonstrator system shows that the new approach improves the tag detection accuracy from <50% to 100% and the tag backscatter signal strength by 10dB over a 20 m x 9 m area, compared with a conventional switched multi-antenna RFID system.

Estimation of the detection probability for Yangtze finless porpoises (Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis) with a passive acoustic method

Yangtze finless porpoises were surveyed by using simultaneous visual and acoustical methods from 6 November to 13 December 2006. Two research vessels towed stereo acoustic data loggers, which were used to store the intensity and sound source direction of the high frequency sonar signals produced by finless porpoises at detection ranges up to 300 m on each side of the vessel. Simple stereo beam forming allowed the separation of distinct biosonar sound source, which enabled us to count the number of vocalizing porpoises. Acoustically, 204 porpoises were detected from one vessel and 199 from the other vessel in the same section of the Yangtze River. Visually, 163 and 162 porpoises were detected from two vessels within 300 m of the vessel track. The calculated detection probability using acoustic method was approximately twice that for visual detection for each vessel. The difference in detection probabilities between the two methods was caused by the large number of single individuals that were missed by visual observers. However, the sizes of large groups were underestimated by using the acoustic methods. Acoustic and visual observations complemented each other in the accurate detection of porpoises. The use of simple, relatively inexpensive acoustic monitoring systems should enhance population surveys of free-ranging, echolocating odontocetes. (C) 2008 Acoustical Society of America.

Whistles of boto, Inia geoffrensis, and tucuxi, Sotalia fluviatilis

Whistles were recorded and analyzed from free-ranging single or mixed species groups of boto and tucuxi in the Peruvian Amazon, with sonograms presented. Analysis revealed whistles recorded falling into two discrete groups: a low-frequency group with maximum frequency below 5 kHz, and a high-frequency group with maximum frequencies above 8 kHz and usually above 10 kHz. Whistles in the two groups differed significantly in all five measured variables (beginning frequency, end frequency, minimum frequency, maximum frequency, and duration). Comparisons with Published details of whistles by other platanistoid river dolphins and by oceanic dolphins suggest that the low-frequency whistles were produced by boto, the high-frequency whistles by tucuxi. Tape recordings obtained on three occasions when only one species was present tentatively support this conclusion, but it is emphasized that this is based on few data. (C) 2001 Acoustical Society of America.

Elasticity, band structure, and piezoelectricity of BexZn1-xO alloys

Lattice constants, elasticity, band structure and piezoelectricity of hexagonal wideband gap BexZn1-xO ternary alloys are calculatedusing firstprinciples methods. The alloys' lattice constants obey Vegard's law well. As Be concentration increases, the bulk modulus and Young's modulus of the alloys increase, whereas the piezoelectricity decreases. We predict that BexZn1-xO/GaN/substrate (x = 0.022) multilayer structure can be suitable for high-frequency surface acoustic wave device applications. Our calculated results are in good agreement with experimental data and other theoretical calculations. (c) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.