Composition and interrelationships of a large Neotropical freshwater fish group, the subfamily Cheirodontinae (Characiformes: Characidae): A case study based on mitochondrial and nuclear DNA sequences

•Relationships of Cheirodontinae based on a broad taxonomic sample.•Results reject the monophyly of Cheirodontinae as previously conceived.•Exclusion of Amazonspinther and Spintherobolus from the subfamily Cheirodontinae.•The removal of Leptagoniates pi of the genus Leptagoniates and inclusion in Cheirodontinae.•Division of Cheirodontinae in three newly defined monophyletic tribes. Characidae is the most species-rich family of freshwater fishes in the order Characiformes, with more than 1000 valid species that correspond to approximately 55% of the order. Few hypotheses about the composition and internal relationships within this family are available and most fail to reach an agreement. Among Characidae, Cheirodontinae is an emblematic group that includes 18 genera (1 fossil) and approximately 60 described species distributed throughout the Neotropical region. The taxonomic and systematic history of Cheirodontinae is complex, and only two hypotheses about the internal relationships in this subfamily have been reported to date. In the present study, we test the composition and relationships of fishes assigned to Cheirodontinae based on a broad taxonomic sample that also includes some characid incertae sedis taxa that were previously considered to be part of Cheirodontinae. We present phylogenetic analyses of a large molecular dataset of mitochondrial and nuclear DNA sequences. Our results reject the monophyly of Cheirodontinae as previously conceived, as well as the tribes Cheirodontini and Compsurini, and the genera Cheirodon, Compsura, Leptagoniates, Macropsobrycon, Odontostilbe, and Serrapinnus. On the basis of these results we propose: (1) the exclusion of Amazonspinther and Spintherobolus from the subfamily Cheirodontinae since they are the sister-group of all remaining Characidae; (2) the removal of Macropsobrycon xinguensis of the genus Macropsobrycon; (3) the removal of Leptagoniates pi of the genus Leptagoniates; (4) the inclusion of Leptagoniates pi in the subfamily Cheirodontinae; (5) the removal of Cheirodon stenodon of the genus Cheirodon and its inclusion in the subfamily Cheirodontinae under a new genus name; (6) the need to revise the polyphyletic genera Compsura, Odontostilbe, and Serrapinnus; and (7) the division of Cheirodontinae in three newly defined monophyletic tribes: Cheirodontini, Compsurini, and Pseudocheirodontini. Our results suggest that our knowledge about the largest Neotropical fish family, Characidae, still is incipient. © 2013 Elsevier Inc..

Estudos sobre a síntese de piperidinas funcionalizadas através de reações pentacomponentes, utilizando compostos de nióbio como catalisadores

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Influência do vírus da hepatite B na infecção crônica pelo vírus da hepatite C: perfil das séricas e histopatologia hepática

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A contagem de plaquetas pré-operatória é fator de risco em pacientes cirróticos com hepatocarcinoma submetidos a hepatectomia?: revisão sistemática e metanálise de estudos coorte

Pós-graduação em Bases Gerais da Cirurgia - FMB

Investigando possíveis relações entre alcoolismo, sofrimento psíquico e violência intrafamiliar na perpectiva de mulheres atendidas pela Saúde da Família

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Carcinoma hepatocelular e as infecções pelos vírus das hepatites B e C na Amazônia Oriental: estudo clínico-sorológico e de biologia molecular

Com o objetivo de contribuir para um melhor conhecimento do eventual envolvimento das infecções pelos vírus das hepatites B e C, na etiopatogenia do carcinoma hapatocelular (CHC) na Amazônia Oriental, estudaram-se 36 pacientes internados em três hospitais públicos em Belém (PA), de janeiro de 1992 a março de 1999. Os critérios de inclusão adotados foram: o clínico, associado à imagenologia compatível, níveis séricos de alfafetoproteína (AFP) acima de 400ng/ml e/ou histopatologia compatível. Foram avaliados os aspectos clínicos, exames bioquímicos e hematológicos, imagenologia, histopatologia, níveis séricos de AFP e exames sorológicos das hepatites B e C. A presença dos ácidos nucléicos virais, o HBV-DNA e o HCV-RNA, foi avaliada a partir da detecção no soro pela reação em cadeia da polimerase. Observou-se um predomínio do sexo masculino (p<0.01), com reação M/F de 6,2: 1. Média e medianas gerais de idade foram, respectivamente, 50,8 e 53,0 anos, com amplitude de 6-81 anos. A maioria dos pacientes (52,7%) era procedente da zona rural, sendo a profissão de lavrador a mais freqüente (p<0,01). Etilismo foi encontrado em 33,3% dos casos. Dor abdominal e hepatomegalia, presentes em 94,4% dos casos, foram os sintomas e sinais mais freqüentes. Observou-se a presença de cirrose em 83,3% dos casos, sendo 80% enquadrados nas classes B e C (child-pugh). Cinqüenta por cento apresentaram complicações durante o diagnóstico, sendo as mais freqüentes a encefalopatia hepática e a hemorragia digestiva alta, relacionadas à doença hepática crônica de base. Marcadores sorológicos de infecção pelo HBV e pelo HCV foram encontrados em, respectivamente, 88,9% e 8,3% da casuística. Em 11,1% não se encontrou marcador sorológico. O HbsAg foi encontrado em 58, 3%. Anti-HBc foi encontrado em 86%, estando associado ao anti- HBs em 25%. Entre os HbsAg positivos: o anti- Hbe foi encontrado em 85%; o antiHBc IgM em 57,1%; e o anti-HD não foi detectado. O HBV- DNA foi encontrado em 37,7% do total de casos e em 65% dos HbsAG positivos. O HCV-RNA foi encontrado em 8,5% da amostra estudada e em 100% dos casos anti-HCV positivos. Não foi observada positividade para o HBV-DNA e para o HCV-RNA em soros de pacientes HbsAG ou anti- HCV negativos. A AFP esteve acima da normalidade em 88,9% dos casos, estando acima de 400 ng/ml em 75% e em 27,8% a titulações foi superior a 70.000 ng/ml. A ultrassonografia abdominal mostrou tumores com múltiplos nódulos em 63,9% e, nódulo único em 36,1% dos casos. O tipo histológico predominante foi carcinoma bem diferenciado do tipo trabecular (p<0,05). Os casos HbsAg positivos apresentaram menor média de idade e níveis de AFP mais elevados (p<0,01). A maioria dos pacientes se encontravam em fase avançada de doenças com uma taxa de óbito durante o diagnóstico de 38,9%. Conclui-se que, na Amazônia Oriental, a infecção pelo HBV parece exercer importância na etiologia do CHC, ressaltando-se a necessidade de incrementação de medidas preventivas, como vacinação e programa de detecção precoce do tumor em populações de risco. São necessários estudos adicionais controlados ou direcionados, para os possíveis co-fatores de importância na região, o que pode contribuir para um melhor entendimento dos mecanismos envolvidos na hepatocarcinogênese.

Infecções pelos vírus das hepatites B e C e o carcinoma hepatocelular na Amazônia oriental

Com o objetivo de contribuir para um melhor conhecimento do envolvimento das infecções pelos vírus das hepatites B e C, na etioepidemiologia do CHC na Amazônia Oriental, estudou-se 36 pacientes em Belém-PA. Foram avaliados marcadores sorológicos e a pesquisa do HBV-DNA e HCV-RNA pela reação em cadeia da polimerase. Observou-se etilismo em 33,3% e cirrose em 83,3%. Marcadores sorológicos das infecções pelo HBV e HCV foram encontrados respectivamente em 88,9% e 8,3%. O HBsAg foi encontrado em 58,3%; anti-HBc em 86%; anti-HBe em 85,7; HBeAg em 9,5%; anti-HBc IgM em 57,1%. O HBV-DNA foi detectado em 37,7% e em 65% dos HBsAg positivos; o HCV-RNA em 8,5% e em 100% dos anti-HCV positivos. AFP esteve alterada em 88,9% e acima de 400ng/ml em 75% dos casos. Conclui-se que a infecção pelo HBV parece ter importância na etiologia do CHC e ressalta-se a importância de implementar programas de vacinação e detecção precoce do tumor.

Inibição do vírus da hepatite C utilizando siRNAs direcionados para o genoma viral e proteínas celulares Hsps

Pós-graduação em Microbiologia - IBILCE

Efeito da suplementação de vitamina D no desenvolvimento de lesões pré-neoplásicas quimicamente induzidas em ratos Wistar macho

Pós-graduação em Biologia Geral e Aplicada - IBB

Wavelets based Algorithm for the Evaluation of Enhanced Liver Areas

Hepatocellular carcinoma (HCC) is a primary tumor of the liver. After local therapies, the tumor evaluation is based on the mRECIST criteria, which involves the measurement of the maximum diameter of the viable lesion. This paper describes a computed methodology to measure through the contrasted area of the lesions the maximum diameter of the tumor by a computational algorithm 63 computed tomography (CT) slices from 23 patients were assessed. Non-contrasted liver and HCC typical nodules were evaluated, and a virtual phantom was developed for this purpose. Optimization of the algorithm detection and quantification was made using the virtual phantom. After that, we compared the algorithm findings of maximum diameter of the target lesions against radiologist measures. Computed results of the maximum diameter are in good agreement with the results obtained by radiologist evaluation, indicating that the algorithm was able to detect properly the tumor limits A comparison of the estimated maximum diameter by radiologist versus the algorithm revealed differences on the order of 0.25 cm for large-sized tumors (diameter > 5 cm), whereas agreement lesser than 1.0cm was found for small-sized tumors. Differences between algorithm and radiologist measures were accurate for small-sized tumors with a trend to a small increase for tumors greater than 5 cm. Therefore, traditional methods for measuring lesion diameter should be complemented with non-subjective measurement methods, which would allow a more correct evaluation of the contrast-enhanced areas of HCC according to the mRECIST criteria.

Wavelet-based algorithm to the evaluation of contrasted hepatocellular carcinoma in CT-images after transarterial chemoembolization

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudo da contribuição do espalhamento nuclear não elástico na trajetória mais provável de prótons em alvo homogêneo composto de água

The Therapy with proton beam has shown more e ective than Radiotherapy for oncology treatment. However, to its planning use photon beam Computing Tomography that not considers the fundamentals di erences the interaction with the matter between X-rays and Protons. Nowadays, there is a great e ort to develop Tomography with proton beam. In this way it is necessary to know the most likely trajectory of proton beam to image reconstruction. In this work was realized calculus of the most likely trajectory of proton beam in homogeneous target compound with water that was considered the inelastic nuclear interaction. Other calculus was the analytical calculation of lateral de ection of proton beam. In the calculation were utilized programs that use Monte Carlo Method: SRIM 2006 (Stopping and Range of Ions in Matter ), MCNPX (Monte Carlo N-Particle eXtended) v2.50. And to analytical calculation was employed the software Wolfram Mathematica v7.0. We obtained how di erent nuclear reaction models modify the trajectory of proton beam and the comparative between analytical and Monte Carlo method

Anéis de inteiros de corpos de números e aplicações

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação dos efeitos antitumorais de extratos brutos produzidos por fungos endofíticos isolados de Eugenia jambolana em células de hepatocarcinoma murino (Hepa-1c1c7)

Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia - FCFAR

Sorafenib after arterial chemoembolization in child-pugh A and B cirrhotic patients with intermediate hepatocellular carcinoma: a retrospective analysis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)