Filogeografia do tubarão mako Isurus oxyrinchus utilizando marcadores moleculares do DNA mitocondrial

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Genotipagem por Spoligotyping e MIRU de Mycobacterium tuberculosis provenientes de pacientes com tuberculose pulmonar

Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia - FCFAR

Acidovorax citruli: genetic analyses and protocol for its detection in seeds

Bacterial fruit blotch of cucurbits (BFB), caused by the seed borne Gramnegative bacterium Acidovorax citrulli is a serious threat to cucurbit industry worldwide. Since late 1980`s after devastating outbreaks in watermelon fields in southern United States, BFB has spread worldwide and has been reported in other cucurbit crops such as melon, pumpkin, cucumber and squash. To date, there is evidence for the existence of at least two genetically and pathogenically distinct populations of A. citrulli. In Brazil, the first report of BFB was in 1991, in a watermelon field in São Paulo. Although widespread in the country, BFB has been a major problem to melon production. More precisely, BFB has caused significant yield losses to melon production in northeastern Brazil, which concentrates > 90% of the country`s melon production. Despite the management efforts and the recent advances in A. citrulli research, BFB is still a continuous threat to the cucurbit industry, including seed producers, growers and transplant nurseries. To better understand the population structure of A. citrulli strains in Brazil, and to provide a basis for the integrated management of BFB, we used pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence analysis (MLSA) of housekeeping and virulence-associated genes and pathogenicity tests on different cucurbit seedlings to characterize a Brazilian population of A. citrulli strains from different hosts and regions. Additionally, we conducted for the first time a comparative analysis of the A. citrulli group I and II population at genomic level and showed that these two groups differ on their genome sizes due to the presence of eight DNA segments, which are present in group II and absent in group I genomes. We also provide the first evidence to suggest that temperature might be a driver in the ecological adaptation of A. citrulli populations under nutrient-rich or -depleted conditions. Finally, in order to improve the routine detection of A. citrulli on melon seedlots, we designed a new primer set that is able to detect the different Brazilian haplotypes, thus minimizing the risk of false-negatives on PCR-based seed health testing.

Distribuição espaço-temporal e estrutura populacional do camarão Artemesia longinaris Bate, 1988 (Crustacea: Decapoda: Penaeidae) no litoral de Macaé, RJ

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Zoologia) - IBB

Filogeografia das espécies de tainha, Mugil liza e M. platanus (Teleostei: Mugiliformes)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Distribuição espaço-temporal, estrutura populacional e biologia reprodutiva de Callinectes Ornatus Ordway, 1863 na enseada da Fortaleza, Ubatuba (SP), Brasil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Uso de aeradores e substratos no cultivo semi-intensivo do camarão-da-amazônia Macrobrachium amazonicum: análise técnica, econômica e emissão de gases do efeito estufa

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Ictiofauna do Córrego Rico, bacia do rio Mogi Guaçu, alto Paraná

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estrutura populacional de Anopheles darlingi em diferentes localidades de Rondônia ao longo do Rio Madeira através da genotipagem de microssatélites

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Genotipagem de leveduras presentes no processo industrial de produção de álcool combustível e estudo do polimorfismo de genes envolvidos no processo fermentativo em Saccharomyces cerevisiae

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Avaliação da organização da variabilidade genética em populações de anfíbios de hábitats antropizados por meio marcadores microssatélites

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estrutura genética de populações de Crinipellis perniciosa e Moniliophthora roreri utilizando marcadores RAPD e SSR

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Caracterização da diversidade genética de Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville por marcador molecular AFLP e transferência de microssatélites

Pós-graduação em Agronomia (Horticultura) - FCA

Estrutura populacional, uso de ambientes e crescimento corporal de Rhinoclemmys punctularia punctularia (DAUDIN, 1801), na Ilha de Algodoal/Maiandeua, Maracanã, Pará, Brasil

Para Rhinoclemmys punctularia punctularia (DAUDIN, 1801), até o presente trabalho, não existiam estudos mais aprofundados que abordassem sua ecologia em ambiente natural. Em geral, os trabalhos existentes são baseados em poucos registros em diferentes locais de abrangência da espécie e dados de animais em de cativeiro, tais trabalhos descrevem a espécie como generalista em relação à sua alimentação e ao uso de ambientes. Este estudo teve como objetivo avaliar o uso de ambientes, a estrutura populacional e estimar as constantes de crescimento de Rhinoclemmys punctularia punctularia na Ilha de Algodoal/Maiandeua. Como metodologia foram realizadas pescarias experimentais em diferentes ambientes da APA de Algodoal/Maiandeua, entre os anos de 2008 e 2009. Dos ambientes amostrados foram capturados espécimes somente ambientes sem influência de águas marinhas e com abundantes recursos alimentares, tais como frutos de Annona sp. e Chysobalanus sp.. Dos ambientes utilizados por R. p. punctularia (igapó, poças temporárias e lagoas de região de planície), os maiores rendimentos foram encontrados nos lagoas de região de planície, onde há uma maior disponibilidade de frutos de Annona sp. e Chysobalanus sp nos corpos d’água que a espécie ocupa. A população de R. p. punctularia em Algodoal/Maiandeua é composta principalmente por indivíduos adultos e é levemente desviada para fêmeas (0.43 machos). O comprimento médio das fêmeas é de 195.42±18 mm (amplitude de 43-226 mm) (n=68) enquanto os machos é de 167±12.7 mm (amplitude de 133-197mm) (n=64), sendo as fêmeas estatisticamente maiores que os machos (U=454.02; GL= 132; p=0.0001; n=132). Em ambos os sexos houve uma relação significativamente negativa entre a taxa de crescimento e comprimento da carapaça. Através do modelo de von Bertallanfy foi estimado um valor de k=0.19 ano-1 para os machos e de k=0.16 ano-1 para as fêmeas, já os valores de L∞ foram de 207.36 mm e 237.89 mm para os machos e para as fêmeas, respectivamente. Ao alcançarem o CRC de 237 mm para as fêmeas e de 207 mm para os machos, a espécie atinge a idade de aproximadamente 33 anos em ambos os sexos.

Ecologia, pesca e dinâmica populacional do camarão-da-Amazônia - Macrobrachium amazonicum (Heller, 1862) (Decapoda:Palaemonidae) – capturado na região das ilhas de Belém - Pará - Brasil

A partir de coletas biológicas mensais na Baía do Guajará e Ilha do Mosqueiro, foram obtidas amostragens de Macrobrachium amazonicum para estudos de reprodução, densidade, relações morfométricas e dinâmica de populações. Adicionalmente, dois outros desenhos amostrais foram utilizados para estudo da capturabilidade da espécie sobre influência de dois tipos de iscas e três tamanhos de armadilhas e de sua distribuição espacial em dois canais perenes do mesmo estuário. Os resultados apontam para diferença na captura de M. amazonicum quando se utiliza isca de farelo de babaçu, porém a diferença é unicamente na abundância sendo que a estrutura populacional não é modificada. A espécie é mais abundante no período seco, corroborando a idéia de maior capturabilidade dos recursos pesqueiros. A ilha do Combu é o local onde os espécimes são mais encontrados e ainda com maiores tamanhos. As fêmeas são significativamente maiores e mais pesadas que os machos, denotando a diferenciação no metabolismo devido à reprodução. A proporção de machos é maior nas menores classes de comprimento, o que pode indicar um aumento na predação de machos de menores tamanhos devido ao seu comportamento mais agressivo que o das fêmeas ou simplesmente por que os machos que atingem comprimentos maiores que as fêmeas sejam mais intensamente predados pela pesca, havendo o recrutamento apenas dos machos menores. O tamanho de primeira maturação (comprimento da carapaça) para ambos os sexos resultou em 11,5mm (11,5 mm nos machos e 11,2mm nas fêmeas). A reprodução em M. amazonicum é do tipo contínua ou periódica com um aumento gradativo entre os meses de outubro a março. Os locais mais abrigados, como regiões mais internas de canais de maré ou furos (comuns no estuário amazônico) são locais preferencialmente procurados por fêmeas maduras para a desova e crescimento dos juvenis. Os parâmetros de crescimento da curva de von Bertalanffy obtidos, foram bastante similares entre os sexos, sendo L∞ = 44,8mm e K = 0,35 para os machos e L∞ = 46,5 e K = 0,31 para as fêmeas. As taxas de mortalidade e explotação obtidas apontam para um estado limítrofe de explotação do recurso, neste sentido, o manejo deverá ser tratado com bastante cuidado. A taxa atual de explotação encontra-se no seu limite máximo de sustentabilidade. Nesta situação, qualquer aumento do esforço poderá ocasionar um estado de sobre-explotação de crescimento. Aliado ao estado de quase comprometimento dos estoques de M. amazonicum, a situação sócio econômica dos pescadores também não é diferente dos demais sistemas pesqueiros do litoral do Pará: baixa escolaridade, atuação deficiente das entidades de classe, cadeia produtiva complexa e que desprivilegia os seus principais atores. Sugere-se o monitoramento estatístico da produção; a delimitação do tamanho mínimo de captura em 4,5cm de comprimeto total; a proibição da pesca com matapis em áreas de cabeceira de furos e canais de maré; um censo de usuários e a utilização de modelos bioeconômicos que contemplem os principais aspectos de sua cadeia biológica e produtiva.