Configurações magnéticas colineares e não-colineares em currais de Fe, Cr e Mn sobre a Pt (111)

Neste trabalho investigamos as propriedades magnéticas de currais de Fe, Cr e Mn adsorvidos sobre a superfície de Pt(111) utilizando o método RS-LMTO-ASA (Real Space Linear Muffin Tin Orbital - Atomic Sphere Approximation), o qual é um método de primeiros princípios baseado na Teoria do Funcional da Densidade (DFT-Density Functional Theory), que permite o cálculo de estruturas magnéticas não-colineares. Obtivemos que os átomos de Fe apresentam momentos magnéticos elevados, da ordem de 3.5µB /átomo, e têm uma interação de troca entre primeiros vizinhos forte e ferro-magnética. Isto leva a um arranjo magnético colinear no curral. Para os currais de Mn e Cr encontramos que estes possuem elevado momento magnético, da ordem de 4.51µB /átomo e 4.15µB /átomo, respectivamente, e interações de troca entre primeiros vizinhos antiferro-magnéticas. Isto conduz a arranjos magnéticos colineares em currais simples, assim como interessantes ordenamentos não-colineares, tais como estruturas tipo vértice (skyrmions), para os currais com uma geometria particular onde o antiferromagnetismo se apresenta frustado.

Propriedades magnéticas de nanoestruturas de metais de transição 3d adsorvidas na superfície de Pt(111)

Neste trabalho, utilizamos o método de primeiros princípios, RS-LMTO-ASA (“Real Space - Linear Muffin-Tin Orbital - Atomic Sphere Approximation”), baseado na Teoria do Funcional da Densidade (DFT) e implementado para o cálculo de estruturas magnéticas não-colineares, para investigar as propriedades magnéticas de nanoestruturas de metais de transição 3d (Cr, Mn, Fe, Co e Ni) adsorvidas na superfície de Pt(111). Diferentes geometrias como adátomos, dímeros, trímeros, fios lineares e zig-zag foram consideradas e, o tamanho dos aglomerados foi variado de 2 a 7 átomos. Mostramos que os aglomerados de Fe, Co e Ni sobre a superfície de Pt(111), para todas as geometrias simuladas, apresentam um ordenamento ferromagnético. Devido à redução do número de coordenação presente na superfície, os momentos de spin e orbital nos sítios de Fe, Co e Ni, para as diferentes geometrias, mostram-se elevados comparados com os respectivos valores dos momentos destes metais como bulk. Para os glomerados de Cr e Mn mostramos que a interação de troca antiferromagnética entre primeiros vizinhos leva a um ordenamento antiferromagnético colinear no caso de geometrias lineares. No entanto, se o antiferromagnetismo é frustrado por restrição geométrica imposta aos aglomerados pela superfície triangular do substrato, obtém-se um comportamento magnético não-colinear para aglomerados de Cr e Mn sobre a Pt(111). Nossos resultados estão em boa concordância com os resultados experimentais da literatura e com os resultados teóricos obtidos por outros métodos, quando existentes.

Efeito da monocultura de dendezeiro (Elaeis guineensis JACQ.) na integridade física e nas assembleias de peixes de igarapés da Amazônia Oriental

O objetivo da presente dissertação é avaliar o efeito do cultivo de dendezeiro Elaeis guineenses JACQ. na integridade física e nas assembleias de peixes de igarapés de terra firme da Amazônia Oriental. Os sítios de amostragem foram estabelecidos em trechos (150 m) de 23 igarapés da bacia do rio Acará-Mirim, Nordeste do Estado do Pará distribuídos em áreas de drenagem com floresta primária até áres de plantio de dendezeiro. De acordo com os resultados do índice de integridade física (IIF), dos 23 igarapés amostrados, todos que drenam áreas de fragmentos florestais foram classificados como íntegros (IIF = 5,00 – 4,00), enquanto que os 15 igarapés que drenam plantações de dendezeiro foram classificados como alterados (IIF = 3,67 – 2,67). Foram coligidos 9.734 espécimes de peixes pertencentes a seis ordens, 24 famílias, distribuídos em 64 espécies. As espécies mais abundantes durante o estudo foram Microcharacidium weitzmani, Apistogramma gr. regani, Trichomycterus hasemani, Hyphessobrycon heterorhabdus e Copella arnoldi. A riqueza observada em igarapés que drenam plantações foi superior (S = 61) a encontrada em igarapés que drenam fragmentos florestais (S = 42). Os resultados da PERMANOVA evidenciam que existe diferença entre os ambientes amostrados (G.L. = 22; pseudo-F = 2,44; P = 0,01), no entanto, o ordenamento produzido pelo NMDS demonstra que essa diferença é sutil (stress = 0,19), pois apenas três espécies são exclusivas de florestas e 22 exclusivas de áreas de palmeiras de dendezeiro. Resultado semelhante foi obtido utilizando-se a abundância dos grupos tróficos funcionais (GTF) (stress = 0,18). Os resultados do TITAN indicam que algumas espécies apresentam adaptações para persistir em determinadas situações ambientais, como por exemplo, Aequidens tetramrus, Apistogramma agassizii e Microcharacidium weitzmani que estão associadas a igarapés que drenam plantações de dendezeiro e são boas indicadoras de locais com menor integridade do hábitat físico (P < 0,05; pureza > 0,95; confiabilidade > 0,95), enquanto que as espécies Hyphessobrycon heterorhabdus e Helogenes marmoratus demonstaram ser indicadoras de hábitats mais íntegros (P < 0,05; pureza > 0,95; confiabilidade > 0,95). Não houve correlação entre a riqueza de espécies de peixes e o índice de integridade física, enquanto que os únicos grupos tróficos funcionais que apresentaram correlação com o índice de integridade física foram os escavadores e coletores navegadores. Esses grupos são compostos por peixes da família Cichlidae que apresentam comportamentos tolerantes e generalistas que podem ter explicado sua grande contribuição na assembleia de peixes mesmo em locais onde a sedimentação foi alta comparada aos locais com a configuração mais próxima do natural. Isso evidencia que mesmo a riqueza de espécies sendo maior em igarapés alterados há fortes indícios de perda de qualidade ambiental nos igarapés que drenam plantações gerada pelo cultivo de dendezeiro.

Mapeamento dos parâmetros florísticos e estruturais de floresta de mangue com dados LIDAR e SRTM

Este estudo apresenta a estimativa dos parâmetros florísticos e estruturais (determinação da espécie, altura, diâmetro a altura do Peito - DAP e biomassa) do mangue a partir de informações da superfície adquiridas remotamente com os sensores Laser Detection and Range (LIDAR), Shuttle Radar Topography Mission (SRTM) e ortofotos na Ilha dos Guarás, conjunto de arquipélagos localizado a 30 km da desembocadura do rio amazonas. Para esse trabalho foram utilizadas informações do SRTM, LIDAR e fotografias aéreas processadas e ortorretificadas durante dois sobrevôos realizados entre o mês de julho e agosto de 2011. Com a ortofoto foi feito o mapa do reconhecimento de unidades geobotânicas que delimitou apenas a classe mangue. Em seguida, foi realizada a correção da altura elipsoidal para a altura ortométrica, onde a nuvem de pontos foi interpolada pelo método vizinho mais próximo, gerando Modelo Digital de Elevação (MDE) LIDAR (full points) com RMSE de 0,88 cm e por meio de uma linguagem macro foi estatisticamente separadas as informações do último pulso da superfície, conhecido também por ground points. Em seguida, os dados foram interpolados pelo método de krigeagem que gerou o valor de Modelo Digital de Superfície (MDS), o qual foi subtraído do MDE. Com base no Modelo Digital de Vegetação (MDV) foram definidos os sítios de coleta e selecionadas as árvores ascendentes, intermediárias e emergentes, porte no qual foi medido o DAP e altura. No total foram coletadas 212 amostras individuais de mangue e para assegurar o nível de acurácia do conjunto coletado, foi realizado o cálculo de RMSE entre as alturas do LIDAR e Campo, que resultou em RMSE= 1,10 m. Os modelos escolhidos para calibração LIDAR e altura de campo foi do tipo linear, com R² = 91% e RMSE= 0,98 cm e para calibração da DAP e altura de campo foi escolhido o modelo Logarítmico R² = 74,1%. Nos resultados da calibração do SRTM o modelo logarítmico também foi o mais adequado para a relação entre altura média e SRTM com R² = 91% e RMSE de 2,2 m e DAP Médio e SRTM, com R² = 88% e RMSE 2,2 cm. A partir de um inventário foi realizada a estimativa da biomassa por espécie por meio das equações alométricas de Fromard e posteriormente os resultados foram espacializados em forma de mapas com alto nível de detalhamento oriundo das informações LIDAR e SRTM corrigido e ortofotos.

Dinâmica populacional, forrageamento e exposição de operárias de Ectatomma opaciventre (Hymenoptera : Formicidae) a iscas formicidas contendo sulfluramida, fipronil e clorpirifós

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Variabilidade genética de Colletotrichum gloeosporioides e Colletotrichum acutatum em seringueira (Hevea brasiliensis) no Brasil

Pós-graduação em Agronomia (Irrigação e Drenagem) - FCA

Classificador Fisherface Fuzzy para o reconhecimento de faces

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Changes in plant species composition and functional traits along the successional trajectory of a restored patch of Atlantic Forest

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Polydomy in the ant Ectatomma opaciventre

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Novel estimation of the humification degree of soil organic matter by laser-induced breakdown spectroscopy

Soil organic matter (SOM) constitutes an important reservoir of terrestrial carbon and can be considered an alternative for atmospheric carbon storage, contributing to global warming mitigation. Soil management can favor atmospheric carbon incorporation into SUM or its release from SOM to atmosphere. Thus, the evaluation of the humification degree (HD), which is an indication of the recalcitrance of SOM, can provide an estimation of the capacity of carbon sequestration by soils under various managements. The HD of SOM can be estimated by using various analytical techniques including fluorescence spectroscopy. In the present work, the potential of laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) to estimate the HD of SUM was evaluated for the first time. Intensities of emission lines of Al, Mg and Ca from LIBS spectra showing correlation with fluorescence emissions determined by laser-induced fluorescence spectroscopy (LIFS) reference technique were used to obtain a multivaried calibration model based on the k-nearest neighbor (k-NN) method. The values predicted by the proposed model (A-LIBS) showed strong correlation with LIFS results with a Pearson's coefficient of 0.87. The HD of SUM obtained after normalizing A-LIBS by total carbon in the sample showed a strong correlation to that determined by LIFS (0.94), thus suggesting the great potential of LIBS for this novel application. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

Long-term dynamics of Methone, Anthe and Pallene

We numerically investigate the long-term dynamics of the Saturn's small satellites Methone (S/2004 S1), Anthe (S/2007 S4) and Pallene (S/2004 S2). In our numerical integrations, these satellites are disturbed by non-spherical shape of Saturn and the six nearest regular satellites. The stability of the small bodies is studied here by analyzing long-term evolution of their orbital elements.We show that long-term evolution of Pallene is dictated by a quasi secular resonance involving the ascending nodes (12) and longitudes of pericentric distances (pi) of Mimas (subscript 1) and Pallene (subscript 2), which critical argument is pi(2) - pi(1) - Omega(1) + Omega(2) Long-term orbital evolution of Methone and Anthe are probably chaotic since: i) their orbits randomly cross the orbit of Mimas in time scales of thousands years); ii) long-term numerical simulations involving both small satellites are strongly affected by small changes in the initial conditions.

Wickerhamiella kiyanii f.a., sp nov and Wickerhamiella fructicola f.a., sp nov., two yeasts isolated from native plants of Atlantic rainforest in Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Next-generation sequencing reveals large connected networks of intra-host HCV variants

Background: Next-generation sequencing (NGS) allows for sampling numerous viral variants from infected patients. This provides a novel opportunity to represent and study the mutational landscape of Hepatitis C Virus (HCV) within a single host.Results: Intra-host variants of the HCV E1/E2 region were extensively sampled from 58 chronically infected patients. After NGS error correction, the average number of reads and variants obtained from each sample were 3202 and 464, respectively. The distance between each pair of variants was calculated and networks were created for each patient, where each node is a variant and two nodes are connected by a link if the nucleotide distance between them is 1. The work focused on large components having > 5% of all reads, which in average account for 93.7% of all reads found in a patient. The distance between any two variants calculated over the component correlated strongly with nucleotide distances (r = 0.9499; p = 0.0001), a better correlation than the one obtained with Neighbour-Joining trees (r = 0.7624; p = 0.0001). In each patient, components were well separated, with the average distance between (6.53%) being 10 times greater than within each component (0.68%). The ratio of nonsynonymous to synonymous changes was calculated and some patients (6.9%) showed a mixture of networks under strong negative and positive selection. All components were robust to in silico stochastic sampling; even after randomly removing 85% of all reads, the largest connected component in the new subsample still involved 82.4% of remaining nodes. In vitro sampling showed that 93.02% of components present in the original sample were also found in experimental replicas, with 81.6% of reads found in both. When syringe-sharing transmission events were simulated, 91.2% of all simulated transmission events seeded all components present in the source.Conclusions: Most intra-host variants are organized into distinct single-mutation components that are: well separated from each other, represent genetic distances between viral variants, robust to sampling, reproducible and likely seeded during transmission events. Facilitated by NGS, large components offer a novel evolutionary framework for genetic analysis of intra-host viral populations and understanding transmission, immune escape and drug resistance.

Mapeamento geoestatístico da permeabilidade superficial no entorno do Ribeirão Claro: e simulação da possibilidade de sua contaminação

The evaluation of soil permeability throughout the weathering profile is one of the most important features to be considered in environmental studies. This study, developed from field testing and analysis of data obtained by geostatistical methods, aims at mapping the permeability around the Ribeirão Claro river. The intent is to simulate an accident with toxic liquids where soil permeability is of fundamental importance. Another purpose of the research was to determine the minimum time that, in the event of an accident, a possible contaminant to reach the water table level and be routed to the nearest drain, in this case, the Ribeirao V Claro river constitutes fundamental information. The studied area of approximately 4 km² is located within the UNESP-Rio Claro campus, consisting of colluvial soil from Fm. Rio Claro superimposed on residual soil of Fm. Corumbataí. The method used to determine the permeability is the concentric cylinders performed on a sampling grid with 64 points containing spacing of 5 meters EW and 10 meters NS. In the places of permeability tests were collected samples for laboratory determination of the percentage of fines. From particle size analysis was performed and analysis statistical and geostatistical on this data. The histogram was based on the statistical studies, and the semivariograms were based on geostatistical estimation methods. Based on the comparison between the maps and the data obtained, it was determined that the percentage of fines in colluvial surface soil has little influence on permeability, which the proximity to the Ribeirao Claro river, the eastern portion, a factor that influences the distribution of permeability values

Explorando abordagens de múltiplos rótulos por floresta de caminhos ótimos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)