Precursor of C4 antisense RNA of bacteriophages P1 and P7 is a substrate for RNase P of Escherichia coli.

The C4 repressor of the temperate bacteriophages P1 and P7 inhibits antirepressor (Ant) synthesis and is essential for establishment and maintenance of lysogeny. C4 is an antisense RNA acting on a target, Ant mRNA, which is transcribed from the same promoter. The antisense-target RNA interaction requires processing of C4 RNA from a precursor RNA. Here we show that 5' maturation of C4 RNA in vivo depends on RNase P. In vitro, Escherichia coli RNase P and its catalytic RNA subunit (M1 RNA) can generate the mature 5' end of C4 RNA from P1 by a single endonucleolytic cut, whereas RNase P from the E. coli rnpA49 mutant, carrying a missense mutation in the RNase P protein subunit, is defective in the 5' maturation of C4 RNA. Primer extension analysis of RNA transcribed in vivo from a plasmid carrying the P1 c4 gene revealed that 5'-mature C4 RNA was the predominant species in rnpA+ bacteria, whereas virtually no mature C4 RNA was found in the temperature-sensitive rnpA49 strain at the restrictive temperature. Instead, C4 RNA molecules carrying up to five extra nucleotides beyond the 5' end accumulated. The same phenotype was observed in rnpA+ bacteria which harbored a plasmid carrying a P7 c4 mutant gene with a single C-->G base substitution in the structural homologue to the CCA 3' end of tRNAs. Implications of C4 RNA processing for the lysis/lysogeny decision process of bacteriophages P1 and P7 are discussed.

Análisis de la distribución geográfica de especies con fotosíntesis C4 en un área mediterránea (este de la Península Ibérica): estudio del caso de Atriplex halimus L.

Se aborda el análisis del área de distribución de una especie con fotosíntesis C4, Atriplex halimus L., a partir de la información corológica existente en el área de Cataluña, Comunidad Valenciana e Islas Baleares, y con la utilización de herramienta SIG, que incluye los factores ambientales considerados como más importantes en la distribución de este tipo de plantas. Este procedimiento representa una alternativa a las investigaciones pasadas en distribución de plantas C4, en este caso se analiza el número de especies C4 en áreas geográficas concretas, a lo largo de gradientes, y es el inicio de una vía más inductiva que puede ser prometedora para entender mejor los factores que afectan a la distribución de estas plantas. Se ha podido obtener un modelo de distribución de A. halimus en base a los factores ambientales actuales que tiene interés porque, aunque el uso de estos métodos predictivos está ya muy extendido, en este caso se aplica por primera vez a una especie que posee una vía de fotosíntesis que ha sido descrita como una adaptación a determinados tipos de clima. En esta especie, la altitud y la precipitación anual, con coeficientes negativos, son las dos variables que al introducirlas, más contribuyen a reducir la desvianza. De las temperaturas consideradas, solo la de enero interviene en el modelo y con un comportamiento diferente por debajo o por encima de los 400 m de altitud. La salinidad del suelo resulta también seleccionada, pero no de forma significativa. La coincidencia entre la distribución real y la resultante de la aplicación del modelo es otro indicador que nos muestra que el modelo es próximo a la realidad, salvo, acaso, en el medio insular. Los resultados son muy coherentes con la información existente sobre los factores que determinan la distribución de las plantas C4 en general, y de las Quenopodiáceas en concreto, que son las temperaturas y el coeficiente de aridez.

Zooplankton biomass from METEOR cruise M87/1 in April 2012

Zooplankton samples were taken in five depth strata using a Multinet type Midi, with 50 µm nets. The samples were taken during the second leg only, three times at station 1, two times at station 2 and once at station 3. Zooplankton were identified to species / genus and life-stage, and at least 300 individuals were counted per sample. 10 individuals of each stage / species were measured and the numbers of eggs counted.

Abundance and biomass of mesozooplankton collected in front of the Danube Delta in May and October 1978

The Gurile Dunarii 1978 dataset contains zooplankton data collected in May and October 1978 in 14 station allong 3 transect in front of the Danube Delta (45°05' - 44°45'N, 30°02'- 29°27'E). Zooplankton sampling was undertaken at 14 stations where samples were collected using a Juday closing net in the 0-10, 10-20, 20-30, 30-40 and 40-50m layer (depending also on the water masses). The dataset includes samples analysed for mesozooplankton species composition and abundance. Sampling volume was estimated by multiplying the mouth area with the wire length. Taxon-specific mesozooplankton abundance was count under microscope. Total abundance is the sum of the counted individuals. Total biomass Fodder, Rotifera , Ctenophora and Noctiluca was estimated using a tabel with wet weight for each species an stage.