Variabilité spatiale et temporelle des flux de carbone organique et des formes d'azote dissous dans le bassin versant de l'Hermine

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Décomposition automatique de signaux EMG intramusculaires

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Gain bandwidth optimisation and enhancement in ultra-long Raman fibre laser based amplifiers

We show experimentally a 57nm gain bandwidth for an ultra-long Raman fiber laser based amplification technique using only a single pump wavelength. The enhanced gain bandwidth and gain flatness is investigated for single and multi-cavity designs. ©2010 IEEE.

Development and optimisation of photonic crystal based nanosensors

This thesis involved the development of two Biosensors and their associated assays for the detection of diseases, namely IBR and BVD for veterinary use and C1q protein as a biomarker to pancreatic cancer for medical application, using Surface Plasmon Resonance (SPR) and nanoplasmonics. SPR techniques have been used by a number of groups, both in research [1-3] and commercially [4, 5] , as a diagnostic tool for the detection of various biomolecules, especially antibodies [6-8]. The biosensor market is an ever expanding field, with new technology and new companies rapidly emerging on the market, for both human [8] and veterinary applications [9, 10]. In Chapter 2, we discuss the development of a simultaneous IBR and BVD virus assay for the detection of antibodies in bovine serum on an SPR-2 platform. Pancreatic cancer is the most lethal cancer by organ site, partially due to the lack of a reliable molecular signature for diagnostic testing. C1q protein has been recently proposed as a biomarker within a panel for the detection of pancreatic cancer. The third chapter discusses the fabrication, assays and characterisation of nanoplasmonic arrays. We will talk about developing C1q scFv antibody assays, clone screening of the antibodies and subsequently moving the assays onto the nanoplasmonic array platform for static assays, as well as a custom hybrid benchtop system as a diagnostic method for the detection of pancreatic cancer. Finally, in chapter 4, we move on to Guided Mode Resonance (GMR) sensors, as a low-cost option for potential use in Point-of Care diagnostics. C1q and BVD assays used in the prior formats are transferred to this platform, to ascertain its usability as a cost effective, reliable sensor for diagnostic testing. We discuss the fabrication, characterisation and assay development, as well as their use in the benchtop hybrid system.

Valeur pronostique de CD73 et des lymphocytes T CD8 et optimisation de la vaccination de type GVAX dans le cancer de la prostate

CD73 est un ecto-enzyme qui a été associé à la suppression de l'immunité anti-tumorale. Ses valeurs pronostiques et thérapeutiques ont été mises de l'avant dans plusieurs types de cancer. La première hypothèse du projet est que l'expression de CD73 dans la tumeur prédit le pronostic des patients atteints du cancer de la prostate. L'expression de CD73 a été étudiée par immunofluorescence dans des échantillons de tumeur. Puis, des analyses univariées et multivariées ont été conduites pour déterminer si l'expression de CD73 permet de prédire la récidive biochimique des patients. Nous avons déterminé que CD73 prédit indépendamment le pronostic des patients atteints du cancer de la prostate. De plus, nous avons déterminé que son expression dans le tissu normal adjacent ou dans la tumeur prédit différemment la survenue de la récidive biochimique. La deuxième hypothèse est que l'inhibition de CD73 permet d'améliorer l'efficacité d'un vaccin thérapeutique contre le cancer de la prostate. L'effet d'un vaccin de type GVAX a été étudié dans des souris CD73KO ou en combinaison avec un anticorps ciblant CD73. Nous avons observé que l'efficacité du vaccin était augmentée dans les souris où CD73 était absent. Cependant, la combinaison avec l'anti-CD73 n'a pas permis d'améliorer l'efficacité.

Analyse simultanée des hormones stéroïdiennes et leurs formes chimiques dans les matrices d'eau et d'urine par SPE-LC-MS/MS en ligne.

Dans les dernières années, les perturbateurs endocriniens ont été observés dans les rivières qui reçoivent des entrées importantes d’eaux usées. Parmi les perturbateurs endocriniens, les hormones stéroïdiennes naturelles et synthétiques sont des composés dont le potentiel d'imiter ou d'interférer avec les fonctions hormonales normales (développement, croissance et reproduction), est reconnu même au niveau ultra-traces (ng L-1). Bien que les hormones conjuguées soient moins actives que les hormones libres, elles peuvent être clivées et redevenir libres une fois exposées aux processus microbiens avant ou pendant le traitement des eaux usées. En raison de la nécessité d'identifier et de quantifier ces composés dans l'eau, une nouvelle méthode, entièrement automatisée, a été développée pour la détermination simultanée des deux formes de plusieurs hormones stéroïdiennes (conjuguées et libres) dans les matrices d'eau et dans l’urine des femmes. La méthode est basée sur l'extraction en phase solide couplée en ligne à la chromatographie liquide et la spectrométrie de masse en tandem (SPE-LC-MS/MS). Plusieurs paramètres ont été évalués dans le but d'optimiser l'efficacité de la méthode, tels que le type et le débit de la phase mobile, des différentes colonnes de SPE et de chromatographie, ainsi que différentes sources et modes d'ionisation des échantillons pour la MS. La méthode démontre une bonne linéarité (R2 > 0.993), ainsi qu'une précision avec un coefficient de variance inférieure à 10%. Les limites de quantification varient d’un minimum de 3 à 15 ng L-1 pour un volume d'injection entre 1 mL et 5 mL et le recouvrement des composés varie de 72 % à 117 %.

Symétrie : réflexions sur les formes naturelles

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Étude de l'enseignement et de l'apprentissage des formes indéterminées

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Variabilité spatiale et temporelle des flux de carbone organique et des formes d'azote dissous dans le bassin versant de l'Hermine

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Décomposition automatique de signaux EMG intramusculaires

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Optimisation of a droplet digital PCR assay for the diagnosis of Schistosoma japonicum infection: A duplex approach with DNA binding dye chemistry

Schistosomiasis is a chronically debilitating helminth infection with a significant socio-economic and public health impact. Accurate diagnostics play a pivotal role in achieving current schistosomiasis control and elimination goals. However, many of the current diagnostic procedures, which rely on detection of schistosome eggs, have major limitations including lack of accuracy and the inability to detect pre-patent infections. DNA-based detection methods provide a viable alternative to the current tests commonly used for schistosomiasis diagnosis. Here we describe the optimisation of a novel droplet digital PCR (ddPCR) duplex assay for the diagnosis of Schistosoma japonicum infection which provides improved detection sensitivity and specificity. The assay involves the amplification of two specific and abundant target gene sequences in S. japonicum; a retrotransposon (SjR2) and a portion of a mitochondrial gene (nad1). The assay detected target sequences in different sources of schistosome DNA isolated from adult worms, schistosomules and eggs, and exhibits a high level of specificity, thereby representing an ideal tool for the detection of low levels of parasite DNA in different clinical samples including parasite cell free DNA in the host circulation and other bodily fluids. Moreover, being quantitative, the assay can be used to determine parasite infection intensity and, could provide an important tool for the detection of low intensity infections in low prevalence schistosomiasis-endemic areas.

Physical model parameter optimisation for calibrated emulation of the Dallas Rangemaster Treble Booster guitar pedal

In this work we explore optimising parameters of a physical circuit model relative to input/output measurements, using the Dallas Rangemaster Treble Booster as a case study. A hybrid metaheuristic/gradient descent algorithm is implemented, where the initial parameter sets for the optimisation are informed by nominal values from schematics and datasheets. Sensitivity analysis is used to screen parameters, which informs a study of the optimisation algorithm against model complexity by fixing parameters. The results of the optimisation show a significant increase in the accuracy of model behaviour, but also highlight several key issues regarding the recovery of parameters.