Distribution of vitamin B-12 in some fishes and marine invertebrates

Distribution of vitamin B-12 in the skeletal muscle of several marine and fresh water fish and marine invertebrates are reported. The vitamin B-12 content of white muscle of various fish ranges between 0.05 and 1.5 micrograms. The elasmobranch fish, such as sharks and rays, has a lower levels of vitamin B-12. The distribution of vitamin B-12 in the red muscle, heart, brain and liver of various fish is also shown. Content in red muscle varies between 3 and 22 micrograms, averaging 8 micrograms. The values show that the heart is a rich source of vitamin B-12. Internal organs are also rich in vitamin B

B itte r an d Sw e e t /Um am i Ta s te Re c ep to rs w ith D iffe ren tly Evo lu tio n a ry Pa thw ays

通过生物信息学和系统发育学分析,研究了苦味受体和甜味/鲜味受体的进化途径。结果显示,苦味受体 和甜味/鲜味受体在进化上具有远相关,并且具有不同的进化途径,提示这可能是导致这些受体具有不同功能,传 导不同味觉的原因。

大银鱼和小齿日本银鱼线粒体细胞色素b 和16S rRNA基因部分序列分析

　对大银鱼和小齿日本银鱼的线粒体细胞色素b 和16S rRNA 基因片段进行了扩增和序列测定,分析比较了2 种 间的序列差异。大银鱼2 个个体间细胞色素b 基因序列无差异,小齿日本银鱼3 个个体的序列出现了2 种单倍型;大银鱼 同小齿日本银鱼细胞色素b 序列(单倍型SB21) 之间存在86 个碱基差异(差异率21 %) ,变异较大。大银鱼、小齿日本银鱼 的16S rRNA 基因片段种内个体间无序列差异,两种间存在21 个碱基的差异(差异率5 %) ,有1 个碱基的插入/ 缺失。由 此可见,2 种银鱼间线粒体细胞色素b 基因的进化速率较快,约为16S rRNA 基因片段的4 倍。根据细胞色素b 序列数据, 推算出2 种银鱼大概在中新世晚期发生分化。

养殖褐牙鲆细胞色素b 基因序列的初步研究

对养殖褐牙鲆( Paralichthys olivaceus) 的线粒体DNA Cytb 基因的部分序列进行测定,测得的目的DNA 片段的长 度为410 bp ,其A(104 bp) 、T(119 bp) 、C(117 bp) 、G(70 bp) 4 种碱基平均含量分别为25. 4 %、29. 0 %、28. 5 %、17. 1 %。 在28 个褐牙鲆个体中共出现了3 种单倍型。白化褐牙鲆出现的第1 种和第3 种单倍型个体数分别为10 尾(占白 化褐牙鲆样本数的90. 91 %) 和1 尾(9. 09 %) ;6 尾黑化褐牙鲆均出现第1 种单倍型(100 %) ;正常褐牙鲆出现的3 种 单倍型尾数分别为7 尾(占正常褐牙鲆样本数的55. 56 %) 、2 尾(22. 22 %) 和2 尾(22. 22 %) ;测得的序列与既知序列 间在第6 bp 、第19 bp 和第402 bp 碱基处出现差异。由于褐牙鲆Cytb 基因的高度同源性,研究其白化、黑化和正常 状态时出现的序列差异,对于寻找褐牙鲆白化机理研究的分子标记意义重大。

六种鱼巴亚科鱼类线粒体细胞色素b 基因序列分析

测定了鱼巴亚科云南光唇鱼( Acrossocheilus yunnanensis) 、宽头四须鱼巴( Barbodes laticeps) 、抚仙金线鱼巴 ( Sinocyclocheilus tingi) 和滇池金线鱼巴( Sinocyclocheilus grahami) 4 种鱼类线粒体细胞色素b 基因DNA 序列402 bp ,结合已知的云南倒刺鱼巴( S pinibarb denticulatus yunnanensis) 和细尾长臀鱼巴( Mystacoleucus lepturus) 的同源 序列,组成1 个6 种代表鱼巴亚科5 属鱼类的数据集. 选用已知的云南鲴( Xenocypris yunnanensis) 作为外群,采用 邻接法、最大简约法和最大似然法构建了分子系统树. 结果显示: 倒刺鱼巴属( S pinibarbus) 和光唇鱼属 ( Acrossocheilus) 有较近的亲缘关系,四须鱼巴属( Barbodes) 和长臀鱼巴属( Mystacoleucus) 有较近的亲缘关系,而金 线鱼巴属( Sinocyclocheilus) 和它们的关系不能确定. 上述结果与它们的地理分布基本吻合.

Study on Mitochondrial DNA Cytochrome b Gene of Chinese sea bass, Lateolabrax sp.

参考鳗鲡等鱼类线粒体 DNA序列进行了中国花鲈线粒体 DNA细胞色素 b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为 4 10 bp,其 A、T、G、C含量分别为 10 1bp(2 4 .6 3% )、112 bp(2 7.32 % )、72 bp(17.56 % )、12 5bp(30 .4 9% ) ,与鳗鲡等其他鱼类相同基因片断序列碱基含量相似。

日本花鲈细胞色素b基因部分序列的研究

首次报道日本花鲈线粒体DNA细胞色素b基因片段的PCR扩增及其序列测 定。得到410bp的碱基序列，其A、T、G、C含量分别为99bp(24．15哟、113bp(27．56旧、 72bp(17．56嗡、126bp(30．73哟，与其他鱼类相同基因片段碱基序列含量相似。

从线粒体细胞色素b探讨长臀ba属三个种分类与进化的关系

细尾长臀ba与月斑长臀ba、长臀ba间存在遗传分化,分化程度与鲤科其它鱼类相似;而月斑长臀ba和长臀ba却无法分开。结果提示,月斑长臀ba和长臀ba很可能为同一个种。此外,长臀ba属与云南倒刺ba的亲缘关系较近,表明有争议的长臀ba属归入ba亚科是合理的。

犬科的线粒体细胞色素b DNA序列及其分子系统学研究

通过对犬科的赤狐、蓝狐、貉和狼4种的线粒体细胞色素b约372bp DNA片段序列分析,结合GenBank中狗、西门豺和非洲野犬3种的该区段DNA序列的比较,共发现113个核苷酸位点存在变异(约30%)。NJ法构建的分子系统树显示,非洲野犬最先从犬科动物中分化出来;犬属的狼、狗和西门豺等3种为系统树上独立的一支,且其分歧的时间较赤狐、蓝狐和貉早;赤狐和蓝狐具有较近的亲缘关系。

蜂猴线粒体细胞色素b基因变异特点及系统发育分析

在所研究的个体中,2个蜂猴物种碱基组成具有哺乳动物的共同特点,它们之间转换比(特别是密码子第3位)是颠换比的6倍多,大于其他种间比较;低的Ka/Ks值(<0.1)说明懒猴科cyt-b基因的异义突变位点受到强的选择压力作用。由cyt-b基因构建的系统发育树符合懒猴科化石记录和形态学分类观点。根据化石记录和分化时间有一定线性关系的第3位颠换和同义突变速率,估算蜂猴与倭蜂猴种间、蜂猴与瘠蜂猴属间可能的分化时间分别为300和600万年。

蝮亚科蛇线粒体细胞色素b基因序列分析及其系统发育

竹叶青蛇在全部受试物种中处于原始地位,分布于东北地区的蛇岛蝮、乌苏里蝮、黑眉蝮与浙江和陕西产的短尾蝮所组成的分枝与横断山区的高原蝮、雪山蝮聚集形成的分枝组成姐妹群,支持分布于中国境内的亚洲蝮属蛇种的两个起源及分化地的假说,同时探讨了蝮蛇的分类地位问题。

中国花鲈细胞色素b基因片断的序列研究

参考鳗鲡等鱼类线粒体DNA序列进行了中国花鲈线粒体DNA细胞色素b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为410bp，其A、T、G、C含量分别为101bp（24.63%）、112bp（27.32%）、72bp（17.56%）、125bp（30.49%），与鳗鲡等其他鱼类相同基因片断序列碱基含量相似。

细胞色素b基因序列与11种熊蜂的系统进化

通过比较一段357bp的细胞色素b的序列,分析了熊蜂属5亚属11种熊蜂系统发育关系。5亚属包括Bombus(5种)、Thoracobombus(3种)、Mendacibombus(1种)、Fervidobombus(1种)和Pyrobombus(1种)。该序列有65个单变异多态位点和71个简约信息多态位点,翻译成119个氨基酸序列后有45个氨基酸变异位点。根据P-距离构建的邻接树(NJ tree)和最大简约树(MP tree)都显示同样的结果:Mendacibombus(B. avinovielllus)分化最早;Fervidobombus(B. pensylvanicus)次之;Pyrobombus(B. impatiens)和Bombus形成姊妹群;Bombus亚属是单系群,其中B. ignitus在所研究的5个种中分化最早。

zhao科鱼类细胞色素b基因片段的序列测定及其系统发育的初步研究

从9种zhao科鱼类的福尔马林标本中获得了333bp的细胞色素b基因片段的序列。经MUST软件排序后,有101个变异位点,其中有39个信息位点。序列在成对物种间的距离为8-48。平均遗传距离为2.4%-14.4%。简约分析产生了最大简约系统树,Bagarius是最原始的属,并与所有其他的物种形成姊妹群。其余8个属形成一个单系类群并分为二个姊妹群,而鳗zhao鱼类并未形成一个单系类群。