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The objective of the work was to evaluate the in vitro mycelial growth of five A. blazei strains (ABL-05/53, ABL-04/49, ABL-03/44, ABL-99/30 and ABL-02/51) when submitted to the temperatures of 20 and 25 ºC. In a laminar flow chamber, discs of the strains were inoculated in the middle of Petri’s plates containing CA (compost-agar) medium and incubated in BOD. After 48 hours, measurements of the mycelial growth began, with the help of a ruler with scale in millimeters, by means of four equidistant measurements, until the moment when the fungal colony reached near the edges of the Petri’s plate in one of the treatments. The experimental design was totally randomized, in 5 x 2 factorial design. Each treatment consisted of seven repetitions, corresponding to one Petri’s plate, totalizing seventy experimental units. We verified that A. blazei growth is influenced by incubation temperature, being that the temperature of 25 ºC was more favorable for the mycelial growth of all A. blazei strains tested, with attention for ABL-04/49 and ABL-03/44 strains, which obtained the highest averages for mycelial growth under this temperature condition at the end of the cultivation cycle.

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The objective of this work was to evaluate the mycelial growth of 2 edible fungi (Pleurotus ostreatus and Lentinula edodes) in 6 culture media [(malt-agar, sawdustdextrose-agar-marupá (SDA-MA), sawdust-dextrose-agar-cajuí (SDA-CA), sawdust-dextrose-agaraçaí (SDA-AÇA), sawdust-dextrose-agar-banana 50% (BAN 50%) and sawdust-dextrose-agar-banana 100% (BAN 100%)], in Petri dishes. The experimental design was totally randomized, in a 6x2 factorial scheme. Each treatment consisted of six repetitions in 1 Petri dish, totaling 72 experimental units. It was verified that P. ostreatus presented better mycelial development (81.00; 64.66; 81.00; 50.16 and 33.33mm for SDA-MA, SDA-CA, SDA-AÇA, BAN 50% and BAN 100%, respectively) than L. edodes (32.00; 31.66; 27.66; 37.33 and 21.83mm for SDA-MA, SDA-CA, SDA-AÇA, BAN 50% and BAN 100%, respectively). It was also verified that there was no advantage for L. edodes in relation to mycelial growth, when media based on residues were used, compared to malt-agar medium (control), which obtained the best performance (62.17mm). As for P. ostreatus, SDA-MA and SDA-AÇA medium presented the highest growth averages (81 mm), representing a growth increase of 34% in relation to the control medium (malt-agar), whose growth average was 60.33mm. Thus, the residues tested present potential to be used in fungiculture, especially for the cultivation of P. ostreatus.

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Pós-graduação em Odontologia Restauradora - ICT

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Black fungi are able to adapt to extreme environmental conditions, such as: high temperatures, the presence of toxic chemical substances and lack of nutrients. Besides, they are also potential pathogens to humans. The natural environment of many black fungi is still unknown and some studies are being conducted to evaluate the biodiversity of this group and their different habitats. This study aimed to isolate black fungi in domestic environments and facilities, such as toothbrushes, fridge sealing rubbers, bathroom strainers and divisions, windows, wall tiles and bath sponge. For the collection, material surfaces were scratched with a scalpel and the resulting fragments were sewed in Mycosel agar (DifcoTM), supplemented with actidione to inhibit the growth of highly-sporulating fungi. Plates were incubated at 25ºC for three weeks. The 46 isolated fungi were maintained on MA2% slants at 8ºC and cryopreserved at -80ºC. Fungal identification was performed through the analysis of macro and microscopic features and ITS rDNA sequencing. The following black fungi taxa were found: Ascomycota sp., Cladosporium spp., Dothideomycete sp., Exophiala alcalophila, Ochroconis mirabilis and Rhinocladiella atrovirens. Non-melanized fungi were also found, such as Geosmithia sp., Penicillium sp. and Rhodotorula mucilaginosa. The temperature tests showed that isolated black fungi were not able to grow at 37°C, however, this temperature proved to be fungistatic to 43% of them. According to literature, all black fungi isolated in this study are opportunistic pathogens and additional studies are necessary to evaluate the risk that these micro-organisms offer to health, once they were isolated from domestic environments

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Black fungi are able to adapt to extreme environmental conditions, such as: high temperatures, the presence of toxic chemical substances and lack of nutrients. Besides, they are also potential pathogens to humans. The natural environment of many black fungi is still unknown and some studies are being conducted to evaluate the biodiversity of this group and their different habitats. This study aimed to isolate black fungi in domestic environments and facilities, such as toothbrushes, fridge sealing rubbers, bathroom strainers and divisions, windows, wall tiles and bath sponge. For the collection, material surfaces were scratched with a scalpel and the resulting fragments were sewed in Mycosel agar (DifcoTM), supplemented with actidione to inhibit the growth of highly-sporulating fungi. Plates were incubated at 25ºC for three weeks. The 46 isolated fungi were maintained on MA2% slants at 8ºC and cryopreserved at -80ºC. Fungal identification was performed through the analysis of macro and microscopic features and ITS rDNA sequencing. The following black fungi taxa were found: Ascomycota sp., Cladosporium spp., Dothideomycete sp., Exophiala alcalophila, Ochroconis mirabilis and Rhinocladiella atrovirens. Non-melanized fungi were also found, such as Geosmithia sp., Penicillium sp. and Rhodotorula mucilaginosa. The temperature tests showed that isolated black fungi were not able to grow at 37°C, however, this temperature proved to be fungistatic to 43% of them. According to literature, all black fungi isolated in this study are opportunistic pathogens and additional studies are necessary to evaluate the risk that these micro-organisms offer to health, once they were isolated from domestic environments

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We studied the eutrophication history of a tropical shallow reservoir in the So Paulo metropolitan region, southeast Brazil. We analyzed grain size, geochemistry, diatom assemblages, and land-use records in a sediment core from the reservoir to infer its trophic state history during the last similar to 110 years (1894-2005). Eighty diatom species were observed in the core and shifts in the relative abundances of planktonic and benthic taxa indicate major limnological changes associated with complex interactions between hydrologic factors and eutrophication. Discostella stelligera was associated with deforestation and water physical changes whereas Aulacoseira granulata, a species abundant throughout the core, was mostly associated with high flux conditions and erosion events, regardless of trophic state. Eutrophication was triggered by construction of the city zoo (1958) and installation of the So Paulo State Department of Agriculture (1975) within the Gar double dagger as watershed, and increasing loads of untreated sewage from these institutions. The data suggest that deterioration in water quality began after similar to 1975 and markedly accelerated after similar to 1990. The reservoir has been hypereutrophic since 1999. Steady increases in geochemical proxies for trophic state, along with a decrease in C/N ratios, indicated higher nutrient concentrations and the prevalence of autochthonous production towards the core top. Appearance of Achnanthidium catenatum similar to 1993 highlighted the onset of a marked eutrophication phase. The subsequent dominance of Planothidium rostratum and Cyclotella meneghiniana suggested a sharp shift to a hypereutrophic state since 1999. Land-use history proved valuable for validating the chronology and interpreting anthropogenic impacts. Multi-proxy analysis of the sediment record provided an effective tool for tracking ecological shifts in the reservoir ecosystem. This study provides the first reconstruction of lake eutrophication history in Brazil and highlights the importance of hydrological/physical changes as drivers of diatom assemblage shifts in reservoirs, which may confound trophic state inferences based on shifts in the planktonic/benthic diatom ratio.

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Ilustración portada: Feliciano Tavío. Prólogo: Domingo Garí

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Zusammenfassung der DoktorarbeitDie MALDI-TOF-Massenspektrometrie (Matrix Assisted Laser Desorption and Ionisation–Time Of Flight) ist in der Lage, Moleküle mit einem Molekulargewicht bis zu mehreren Hunderttausend Da intakt in die Gasphase zu überführen. Dabei wird die Fragmentierung des Analyten stark eingeschränkt bzw. gänzlich vermieden. Diese Methode findet daher zunehmend Verwendung für die Charakterisierung von Biopolymeren und synthetischen Polymeren. Ziel dieser Arbeit war, die MALDI-TOF-Massenspektrometrie zur Charakterisierung von Makromolekülen einzusetzen, bei denen die konventionellen polymeranalytischen Methoden nur unzureichende Informationen oder gar falsche bzw. gar keine Ergebnisse liefern. Mittels einer methodischen Entwicklung der MALDI-TOF-Massenspektrometrie gelang es, die bisherigen Grenzen der Methode zu erweitern und neue Anwendungsbereiche der Polymeranalytik aufzuzeigen. Anhand der erzielten Ergebnisse wurden darüber hinaus neue Erklärungsansätze formuliert, die zu einem besseren Verständnis des noch immer ungeklärten MALDI-Prozesses beitragen können. Besonders vielversprechend sind zum einen die Ergebnisse der Fragmentionenanalyse synthetischer Polymere und zum anderen die Charakterisierung von unlöslichen PAHs (Polycyclic Aromatic Hydrocarbons). Die Möglichkeiten und Aussagekraft der Fragmentionenanalyse wurde an synthetischen Polymeren getestet. Mit Hilfe dieser neuen Technik konnte die komplizierte Endgruppenverteilung einer Polycarbonat-Probe sowie die Zusammensetzung eines Poly-para-phenylenethynylen-b-Polyethylenoxid-Diblock-Copolymers eindeutig bestimmen werden, während die konventionellen MALDI-Massenspektren nur über einen wesentlich geringeren Informationsgehalt verfügten. Auf dem Gebiet der Analytik von unlöslichen PAHs wurde mit der Entwicklung einer neuen MALDI-Probenvorbereitung eine Methode gefunden, die über die PAH Analytik hinaus von großem Nutzen ist. Diese erstmalig angewendete Probenvorbereitung unterscheidet sich von den üblichen MALDI-Probenpräparationen, indem sie auf die Beteiligung eines Lösungsmittels vollkommen verzichtet. Damit konnte speziell ein unlöslicher, zuvor nicht nachweisbarer PAH von ca. 2700 Da mit MALDI eindeutig charakterisiert werden.

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Im Rahmen dieser Dissertation wurden die Synthese und die Charakterisierung verschiedener, zum Teil neuartiger Blockcopolymere beschrieben, wobei die Einbeziehung radikalischer Polymeri-sationsmechanismen den konzeptionellen Kern ausmachte. Mit einer auf die jeweilige Kombination von Monomeren zugeschnittenen Syntheseroute gelang die Verknüpfung von Segmenten, die allein mittels der herkömmlich zur Synthese von Blockcopolymeren genutzten, ionischen Mechanismen nur mit hohem Aufwand oder gar nicht zu verbinden sind. Auf materieller Seite stand die Herstellung amphiphiler Strukturen im Vordergrund. Diese wurden entweder direkt beim Aufbau der Blockcopo-lymere oder nach anschließender polymeranaloger Umsetzung eines ihrer Segmente erhalten. Solche amphiphilen Substanzen besitzen aufgrund ihrer Grenzflächenaktivität Anwendungspotential z. B. als Stabilisatoren in der Dispersionspolymerisation oder als Flokkulantien. Es wurden drei Verfahren zum Aufbau von Blockcopolymeren untersucht:1. Die Transformation von anionischer zu freier radikalischer Polymerisation für die Synthese von Polystyrol-b-poly(N-vinylformamid) (PS-b-P(VFA)).2. Die Transformation von anionischer zu kontrollierter radikalischer Polymerisation (ATRP) für den Aufbau von Blockcopolymeren aus Poly(dimethylsiloxan) PDMS und Segmenten von t-Butylacrylat (t-BuA) bzw. (2-(Trimethylsiloxy)ethyl)methacrylat (TMS-HEMA).3. Die kontrollierte radikalische Polymerisation unter Einsatz von Triazolinyl als Gegenradikal zur Synthese von Poly[(2-(trimethylsiloxy)ethyl)methacrylat]-b-polystyrol (P(TMS-HEMA)-b-PS) als alternative Route zur anionischen Polymerisation.

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Bei Nierenzellkarzinomen (NZK), wie auch bei vielen anderen Tumoren konnte eine reduzierte Expression der Klasse I Haupthistokompatibilitäts-Komplexe (MHC Klasse I) nachgewiesen werden, die assoziiert sein kann mit der gestörten Expression oder Funktion von Komponenten der Antigenprozessierung. Eine verminderte Erkennung solcher Tumore durch zytotoxische T-Lymphozyten und ein Zusammenhang mit einem Fortschreiten der Erkrankung führte zu der Annahme, daß es sich bei diesen Störungen um "immune escape"-Mechanismen handelt. Um die Bedeutung des heterodimeren Peptidtransporters TAP ("transporter associated with antigen processing") für die Immunogenität von Nierenzellkarzinomen zu untersuchen, wurde im Rahmen dieser Arbeit erstmals der stabile Gentransfer des humanen TAP1A-Gens in Nierenzellkarzinom-Zellen erfolgreich durchgeführt.
Dies konnte durch die Optimierung der Transfektionsmethode und des verwendeten Plasmid-Vektors erreicht werden. Die Transfektionen wurden mit Hilfe der Rechteck-Impuls-Elektroporation unter spezifischen, in der Arbeit etablierten Bedingungen durchgeführt. Der CMV-regulierte TAP-Expressions-Vektor wurde dahingehend verbessert, daß durch die Einführung einer IRES ("internal ribosomal entry site") Sequenz eine bicistronische m-RNS transkribiert wird, die sowohl das TAP1-Transgen als auch den Neomycin-Selektionsmarker enthält.
Es konnte nach klonaler Selektion eine stabile, aber unter den sieben getesteten Klonen heterogene Transkription der transgenen TAP1-mRNS nachgewiesen werden. In der Protein-Expression zeigten 5/7 der TAP1A-positive Klone eine mindestens zweifache Induktion der TAP1-Expression. In 2/7 dieser TAP1A-positive Klone war die TAP1-Überexpression mit einer Erhöhung der MHC Klasse I-Expression und selektiver Induktion des HLA-A2-Moleküls in der Durchflußzytometrie verbunden. Eine Quantifizierung des Peptidtransportes ergab je nach verwendetem Modellpeptid eine geringe oder gar keine Erhöhung der Transportrate in den TAP1-Transfektanden gegenüber Kontrollzellen. Ebenfalls konnte in Zytotoxizitäts-Analysen mit einer autologen T-Zellinie eine Erhöhung der spezifischen Lyse nicht gezeigt werden. Jedoch wurden im Zellkultur-Überstand dieser Zytotoxizitäts-Analysen bei einigen TAP1A-positive Transfektanden gegenüber mock transfizierten-Kontrollzellen deutlich erhöhte Werte des Tumornekrose-Faktor-alpha (TNF-alpha) gemessen, was als Maß einer T-Zell-Aktivierung gilt. Diese Ergebnisse sind konsistent mit einer ebenfalls deutlich gesteigerten T-Zell-Proliferation in Anwesenheit von TAP1A-positive Transfektanden.
Die alleinige stabile Überexpression von TAP1 in Nierenzellkarzinomzellen kann somit zu einer Modulation der MHC Klasse I-Expression und der T-Zell-Reaktivität führen. Das weist darauf hin, daß eine starke, konstitutive TAP1-Expression eine grundlegende Voraussetzung für eine effiziente Antigenprozessierung und Immunantwort darstellt und die Immuntoleranz gegenüber NZK durch stabilen TAP1-Gentransfer beinflußbar ist. Eine denkbare klinische Anwendung dieser Technik ist die Herstellung einer Tumorantigen-präsentierenden Zellvakzine, die eine T-Zell-Anergie gegenüber NZK durchbrechen könnte.
Schlüsselwörter: TAP, MHC, Antigenprozessierung, Tumorimmunologie, Gentransfer