An interplay between TATA box-binding protein and transcription factors IIE and IIA modulates DNA binding and transcription

The basal transcription factor IIE (TFIIE) is thought to be one of the last factors to be assembled into a preinitiation complex (PIC) at eukaryotic promoters after RNA polymerase II and TFIIF have been incorporated. It was shown that a primary function of TFIIE is to recruit and cooperate with TFIIH in promoter melting. Here, we show that the large subunit of TFIIE (E56) can directly stimulate TBP binding to the promoter in the absence of other basal factors. The zinc-finger domain of E56, required for transcriptional activity, is critical for this function. In addition, the small subunit of TFIIE (E34) directly contacts DNA and TFIIA and thus providing a second mechanism for TFIIE to help binding of a TBP/IIA complex to the promoter, the first critical step in the PIC assembly. These studies suggest an alternative PIC assembly pathway in which TFIIE affects both TBP and TFIIH functions during initiation of RNA synthesis.

The barrier-to-autointegration protein is a host factor for HIV type 1 integration

In vivo, retroviral integration is mediated by a large nucleoprotein complex, termed the preintegration complex (PIC). PICs isolated from infected cells display in vitro integration activity. Here, we analyze the roles of different host cell factors in the structure and function of HIV type 1 (HIV-1) PICs. PICs purified by size exclusion after treatment with high salt lost their integration activity, and adding back an extract from uninfected cells restored this activity. In parallel, the native protein–DNA intasome structure detected at the ends of HIV-1 by Mu-mediated PCR footprinting was abolished by high salt and restored by the crude cell extract. Various purified proteins previously implicated in retroviral PIC function then were analyzed for their effects on the structure and function of salt-treated HIV-1 PICs. Whereas relatively low amounts (5–20 nM) of human barrier-to-autointegration factor (BAF) protein restored integration activity, substantially more (5–10 μM) human host factor HMG I(Y) was required. Similarly high levels (3–8 μM) of bovine RNase A, a DNA-binding protein used as a nonspecific control, also restored activity. Mu-mediated PCR footprinting revealed that of these three purified proteins, only BAF restored the native structure of the HIV-1 protein–DNA intasome. We suggest that BAF is a natural host cofactor for HIV-1 integration.

Differential inhibition of HIV-1 preintegration complexes and purified integrase protein by small molecules.

To replicate, HIV-1 must integrate a cDNA copy of the viral RNA genome into a chromosome of the host. The integration system is a promising target for antiretroviral agents, but to date no clinically useful integration inhibitors have been identified. Previous screens for integrase inhibitors have assayed inhibition of reactions containing HIV-1 integrase purified from an Escherichia coli expression system. Here we compare action of inhibitors in vitro on purified integrase and on subviral preintegration complexes (PICs) isolated from lymphoid cells infected with HIV-1. We find that many inhibitors active against purified integrase are inactive against PICs. Using PIC assays as a primary screen, we have identified three new anthraquinone inhibitors active against PICs and also against purified integrase. We propose that PIC assays are the closest in vitro match to integration in vivo and, as such, are particularly appropriate for identifying promising integration inhibitors.

DNA loops induced by cooperative binding of transcriptional activator proteins and preinitiation complexes.

DNA conformational changes are essential for the assembly of multiprotein complexes that contact several DNA sequence elements. An approach based on atomic force microscopy was chosen to visualize specific protein-DNA interactions occurring on eukaryotic class II nuclear gene promoters. Here we report that binding of the transcription regulatory protein Jun to linearized plasmid DNA containing the consensus AP-1 binding site upstream of a class II gene promoter leads to bending of the DNA template. This binding of Jun was found to be essential for the formation of preinitiation complexes (PICs). The cooperative binding of Jun and PIC led to looping of DNA at the protein binding sites. These loops were not seen in the absence of either PICs, Jun, or the AP-1 binding site, suggesting a direct interaction between DNA-bound Jun homodimers and proteins bound to the core promoter. This direct visualization of functional transcriptional complexes confirms the theoretical predictions for the mode of gene regulation by trans-activating proteins.

Promoção, comunicação e educação em saúde: a prática da acupuntura e da fitoterapia

Esta pesquisa discute a Comunicação em Saúde no contexto das Práticas Integrativas e Complementares (PIC) no Sistema Único de Saúde (SUS), no que concerne ao tratamento do câncer realizado num hospital público de Campinas. O arcabouço teórico se debruça sobre as diretrizes do ideário da Promoção da Saúde e sobre as discussões da Educação em Saúde, por serem premissas fundamentais para que a Comunicação em Saúde seja participativa e democrática, e que a Comunicação das PIC conquiste maior espaço na Saúde Pública. O objetivo geral foi investigar o processo de comunicação entre profissionais de saúde e usuários do SUS participantes do Projeto de Construção do Cuidado Integrativo (PCCI). A metodologia utilizada foi a qualitativa tendo como instrumentos pesquisa documental e entrevistas semi-estruturadas para a coleta dos dados. Os participantes do estudo foram usuários que fizeram parte do grupo de Acupuntura e de Fitoterapia e usaram práticas complementares ao tratamento convencional do câncer, e também os profissionais de saúde envolvidos no PCCI realizado no Hospital de Clínicas da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)/SP. Os dados foram analisados por meio da análise temática de conteúdo de Bardin, que permitiu identificar as seguintes categorias: Medo da intervenção, Analgesia como resultado, Continuidade do tratamento, Falta de informação e Divulgação das práticas. Os resultados mostraram que houve dificuldades de comunicação, indicando lacunas importantes em relação à infraestrutura, à falta de divulgação e continuidade do tratamento complementar com as PIC, a falta de valorização da participação popular e estímulo à autonomia como preconiza o ideário da Promoção da Saúde. Concluiu-se que o modelo de saúde vigente, de base biomédica, não tem permitido a participação dos usuários, e, mais ainda, tem dificultado o desenvolvimento da comunicação democrática, humanizada e solidária. O Projeto (PCCI) foi importante em sua execução, uma vez que trouxe resultados positivos com o uso das PIC por melhorar as condições da qualidade de vida dos usuários e ter promovido analgesia, conferido maior disposição e recuperação dos movimentos. Entretanto, o Projeto (PCCI) não teve potencial o suficiente para provocar uma mudança na lógica do tratamento convencional que está hegemonicamente imerso no modelo biomédico, com isso limitando a inserção e a comunicação das PIC na Saúde Pública e dificultando a abertura para o diálogo entre os diferentes saberes. Entende-se que este é um dos principais desafios da Medicina Tradicional e Complementar (MTC).

Efeito da substituição de plasma sanguíneo por levedura hidrolisada sobre rendimento e imunidade de leitões desmamados

O Experimento foi realizado com o objetivo de avaliar a substituição parcial e total de plasma bovino por levedura hidrolisada na dieta de leitões desmamados no período de 21 a 47 dias de idade. Foram utilizados 1600 leitões da linhagem PIC, distribuídos em blocos ao acaso, com quatro tratamentos. As dietas foram divididas em quatro fases (pré-inicial I 22 a 28 dias; pré-inicial II 29 a 35 dias; inicial I - 36 a 47 dias e inicial II 48 a 63 dias). A inclusão percentual, Plasma: Levedura, nas dietas foi: T1 (6:0; 4:0; 2:0 e 0:0); T2 (3: 4; 2: 3; 1: 2 e 0: 0); T3 (1,5: 6; 1: 4,5; 0,5: 3 e 0: 0) e T4 (0: 8; 0: 6; 0: 4 e 0: 0). Cada tratamento teve 10 repetições (cinco de machos e cinco de fêmeas) totalizando 40 unidades experimentais com 40 animais cada. As variáveis zootécnicas avaliadas durante o período experimental foram: consumo de ração, ganho de peso, e conversão alimentar. Foram tomadas amostras de sangue de 5 animais por tratamento no dia de início do experimento, e de 10 animais por tratamento 25 dias depois. Foram quantificadas a IgA e a IgG. Os dados obtidos foram submetidos a análise de variância ANOVA, utilizando-se o teste Tukey para comparação das médias ao nível de significância de 5% utilizando o pacote estatístico SAS. Não houve diferença estatística nas quantidades de Ig A e Ig G circulante, nem na variação destas imunoglobulinas no tempo, entre os tratamentos. Considerando a análise dos dados conclui-se que nas condições estudadas, a utilização da relação percentual de (1,5: 6; 1: 4,5; 0,5: 3 e 0: 0) de plasma: levedura hidrolisada resultou um maior consumo de ração e ganho de peso dos animais, em comparação às outras proporções, e consequentemente podendo trazer um maior lucro para o produtor

Post T Tauri stars in the solar neighborhood: isolated or members of young associations and moving groups

Post T Tauri stars (PTTS) are late-type stars in the age range between 10 and 100 Myr filling the gap between T Tauri (TTs) and zero-age: main sequence phases. This period of evolution remains ambiguous and until now different studies of young stars have failed to find the numbers of PTTS that are expected. In the last years, some PTTS have been identified among the X-ray detected pre-main sequence stars in some star-forming regions. More recently, additional PTTS have been identified in young associations and moving groups (β Pic, TW Hya, Tucana/Horologium, and the AB Dor). However, many isolated PTTS still remain undiscovered. In this contribution, we compiled the PTTS previously identified in the literature, and identified new candidates using the information provided by the high resolution spectra obtained during our surveys of late-type stars possible members to young moving groups, FGK stars in the solar neighborhood, and RasTyc sample. To identify PTTS we applied an age-oriented definition using relative age indicators (Li abundance, chromospheric and coronal emission and the kinematics) as well as color-magnitude diagrams and pre-main sequence isochrones.

Política de información y comunicación de la Unión Europea: una estrategia insuficiente para cerrar la brecha entre la ciudadanía y la UE

La presente investigación parte de la hipótesis de que la política de Información y Comunicación es una estrategia insuficiente para cerrar la brecha que hay entre la UE y sus ciudadanos. El distanciamiento entre las instituciones europeas y la ciudadanía, reconocido desde los años 70, ha sido atribuido a una brecha de comunicación, es decir, a la forma en que los asuntos de la UE se reflejan en los medios de comunicación, y a la aparente falta de intereses de las élites nacionales para transmitir la importancia de Europa. Así cada vez que ha habido una baja participación en los comicios europeos o en los distintos referenda, la Comisión Europea ha respondido con nuevos enfoques de las Políticas de Información y Comunicación de la UE para cubrir ese hueco. El desarrollo de nuestra hipótesis principal pasa por el análisis de toda la Política de Información y Comunicación (PIC) de la UE, haciendo hincapié en el período 2001 a 2006, que es cuando se institucionaliza y da un importante salto cualitativo. La PIC evolucionará en paralelo a la construcción europea que se debate entre lo intergubernamental y lo comunitario. El peso de una u otra tendencia influirá en el desarrollo de esa política. El trabajo se desarrolla en tres partes. Primero, se analiza el nacimiento y desarrollo de las estrategias de información y comunicación de la UE hasta 2005. Tras el fracaso constitucional, se incide en la institucionalización de la PIC, durante esta última década y, por último, se detectan los problemas y se buscan las soluciones para cerrar la brecha entre ciudadanía e instituciones...

Hand gesture recognition based on morphologic features

Comunicación presentada en el IX Simposium Nacional de Reconocimiento de Formas y Análisis de Imágenes, Benicàssim, Mayo, 2001.

Influencia de un plan de educación sanitaria en alimentación y nutrición para pacientes/familiares en dos unidades de hemodiálisis

Objetivos. Aumentar los conocimientos de los pacientes en hemodiálisis sobre su alimentación y nutrición para mejorar su estado nutricional.

Valoración del estado nutricional por parámetros antropométricos en dos unidades de hemodiálisis

Objetivos. Conocer el estado nutricional de los pacientes en nuestra unidad que nos sirva de guía para preparar la metodología de intervención.

Estudio descriptivo del insomnio en dos unidades de hemodiálisis. Aplicación de un programa educacional sobre higiene del sueño

Objetivos. Conocer la prevalencia del insomnio, así como las variables y factores desencadenantes en nuestros pacientes de hemodiálisis, para que conociendo el problema, estemos en condiciones de poder ayudarles mediante un programa educacional a adquirir hábitos saludables que favorezcan el sueño.

Analysis of pollutants evolved from combustion and pyrolysis of flexible polyurethane foam in a laboratory furnace

Resumen del póster presentado en PIC2015 – the 14th International Congress on Combustion By-Products and Their Health Effects, Umeå, Sweden, 14-17 June 2015.

Emissions of polybrominated dibenzo-p-dioxins and dibenzofurans (PBDD/Fs) and polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) from a cement kiln using a continuous monitoring system

Resumen de la comunicación presentada en PIC2015 – the 14th International Congress on Combustion By-Products and Their Health Effects, Umeå, Sweden, 14-17 June 2015.

An Electronic Reconfigurable Neural Architecture for Intrusion Detection

The explosive growth of the traffic in computer systems has made it clear that traditional control techniques are not adequate to provide the system users fast access to network resources and prevent unfair uses. In this paper, we present a reconfigurable digital hardware implementation of a specific neural model for intrusion detection. It uses a specific vector of characterization of the network packages (intrusion vector) which is starting from information obtained during the access intent. This vector will be treated by the system. Our approach is adaptative and to detecting these intrusions by using a complex artificial intelligence method known as multilayer perceptron. The implementation have been developed and tested into a reconfigurable hardware (FPGA) for embedded systems. Finally, the Intrusion detection system was tested in a real-world simulation to gauge its effectiveness and real-time response.