882 resultados para G-protein coupled receptor


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Computer-aided drug design becomes an important part of G-protein coupled receptors (GPCR) drug discovery process that is applied for improving the efficiency of derivation and optimization of novel ligands. It represents the combination of methods that-use-structural information of a receptor binding site of known ligands to design new ligands. In this report, we give a brief description of ligand binding sites in cholecystokinin and gastrin receptors (CK1R and CCK2R) which were delineated using experimental and computational methods, and then, we show how the validated ligand binding sites can be used to design and improve novel ligands. The translation of the knowledge of ligand-binding sites of different GPCRs to computer-aided design of novel ligands is summarized.

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The regulator of the G-protein signaling 4 (RGS4) gene was shown to have a different expression pattern in schizophrenia patients in a microarray study. A family-based study subsequently implicated the association of this gene with schizophrenia. We replicated the study with our sample from the Irish Study of High Density Schizophrenia Families (ISHDSF). Single marker transmission disequilibrium tests (TDT) for the four core SNPs showed modest association for SNP 18 (using a narrow diagnostic approach with FBAT P = 0.044; with PDT P = 0.0073) and a trend for SNP 4 (with FBAT P = 0.1098; with PDT P = 0.0249). For SNP 1 and 7, alleles overtransmitted to affected subjects were the same as previously reported. Haplotype analyses suggested that haplotype G-G-G for SNP1-4-18, which is the most abundant haplotype (42.3%) in the Irish families, was associated with the disease (narrow diagnosis, FBAT P = 0.0061, PDT P = 0.0498). This was the same haplotype implicated in the original study. While P values were not corrected for multiple testing because of the clear prior hypothesis, these results could be interpreted as supporting evidence for the association between RGS4 and schizophrenia.

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The community-wide GPCR Dock assessment is conducted to evaluate the status of molecular modeling and ligand docking for human G protein-coupled receptors. The present round of the assessment was based on the recent structures of dopamine D3 and CXCR4 chemokine receptors bound to small molecule antagonists and CXCR4 with a synthetic cyclopeptide. Thirty-five groups submitted their receptor-ligand complex structure predictions prior to the release of the crystallographic coordinates. With closely related homology modeling templates, as for dopamine D3 receptor, and with incorporation of biochemical and QSAR data, modern computational techniques predicted complex details with accuracy approaching experimental. In contrast, CXCR4 complexes that had less-characterized interactions and only distant homology to the known GPCR structures still remained very challenging. The assessment results provide guidance for modeling and crystallographic communities in method development and target selection for further expansion of the structural coverage of the GPCR universe.

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It is well established that chronic inflammation underpins the development of a number of human cancers, with pro-inflammatory signaling within the tumor microenvironment contributing to tumor progression and metastasis. CXCL8 is an ELR+ pro-inflammatory CXC-chemokine which mediates its effects via signaling through two G protein-coupled receptors, CXCR1 and CXCR2. Elevated CXCL8-CXCR1/2 signaling within the tumor microenvironment of numerous cancers is known to enhance tumor progression via activation of signaling pathways promoting proliferation, angiogenesis, migration, invasion and cell survival. This review provides an overview of established roles of CXCL8-CXCR1/2 signaling in cancer and subsequently, discusses the possible strategies of targeting CXCL8-CXCR1/2 signaling in cancer, covering indirect strategies (e.g., anti-inflammatories, NFκB inhibitors) and direct CXCL8 or CXCR1/2 inhibition (e.g., neutralizing antibodies, small molecule receptor antagonists, pepducin inhibitors and siRNA strategies). Reports of pre-clinical cancer studies and clinical trials using CXCL8-CXCR1/2-targeting strategies for the treatment of inflammatory diseases will be discussed. The future translational opportunities for use of such agents in oncology will be discussed, with emphasis on exploitation in stratified populations.

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Many sequelae associated with endotoxaemic-induced shock result from excessive production of the cytokine mediators, tumour necrosis factor alpha (TNF-alpha), interleukin 1 (IL-1) and IL-6 from lipopolysaccharide (LPS)-activated monocytes. Protein C (PC)/activated protein C (APC) has potent cytokine-modifying properties and is protective in animal models and human clinical trials of sepsis. The precise mechanism by which this anti-inflammatory response is achieved remains unknown; however, the recently described endothelial protein C receptor (EPCR) appears to be essential for this function. The pivotal role that monocytes play in the pathophysiology of septic shock led us to investigate the possible expression of a protein C receptor on the monocyte membrane. We used similarity algorithms to screen human sequence databases for paralogues of the EPCR but found none. However, using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), we detected an mRNA transcribed in primary human monocytes and THP1 cells that was identical to human EPCR mRNA. We also used immunocytochemical analysis to demonstrate the expression of a protein C receptor on the surface of monocytes encoded by the same gene as EPCR. These results confirm a new member of the protein C pathway involving primary monocytes. Further characterization will be necessary to compare and contrast its biological properties with those of EPCR.

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BACKGROUND: The free fatty acid receptors (FFAs), including FFA1 (orphan name: GPR40), FFA2 (GPR43) and FFA3 (GPR41) are G protein-coupled receptors (GPCRs) involved in energy and metabolic homeostasis. Understanding the structural basis of ligand binding at FFAs is an essential step toward designing potent and selective small molecule modulators.

RESULTS: We analyse earlier homology models of FFAs in light of the newly published FFA1 crystal structure co-crystallized with TAK-875, an ago-allosteric ligand, focusing on the architecture of the extracellular binding cavity and agonist-receptor interactions. The previous low-resolution homology models of FFAs were helpful in highlighting the location of the ligand binding site and the key residues for ligand anchoring. However, homology models were not accurate in establishing the nature of all ligand-receptor contacts and the precise ligand-binding mode. From analysis of structural models and mutagenesis, it appears that the position of helices 3, 4 and 5 is crucial in ligand docking. The FFA1-based homology models of FFA2 and FFA3 were constructed and used to compare the FFA subtypes. From docking studies we propose an alternative binding mode for orthosteric agonists at FFA1 and FFA2, involving the interhelical space between helices 4 and 5. This binding mode can explain mutagenesis results for residues at positions 4.56 and 5.42. The novel FFAs structural models highlight higher aromaticity of the FFA2 binding cavity and higher hydrophilicity of the FFA3 binding cavity. The role of the residues at the second extracellular loop used in mutagenesis is reanalysed. The third positively-charged residue in the binding cavity of FFAs, located in helix 2, is identified and predicted to coordinate allosteric modulators.

CONCLUSIONS: The novel structural models of FFAs provide information on specific modes of ligand binding at FFA subtypes and new suggestions for mutagenesis and ligand modification, guiding the development of novel orthosteric and allosteric chemical probes to validate the importance of FFAs in metabolic and inflammatory conditions. Using our FFA homology modelling experience, a strategy to model a GPCR, which is phylogenetically distant from GPCRs with the available crystal structures, is discussed.

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FMRFamide-like peptide (FLP) receptors are appealing as putative anthelmintic targets. To date, 31 flp-encoding genes have been identified in Caenorhabditis elegans and thirteen FLP-activated G-protein coupled receptors (FLP-GPCRs) have been reported. The lack of knowledge on FLPs and FLP-GPCRs in parasites impedes their functional characterisation and chemotherapeutic exploitation. Using homology-based BLAST searches and phylogenetic analyses this study describes the identification of putative flp and flp-GPCR gene homologues in 17 nematode parasites providing the first pan-phylum genome-based overview of the FLPergic complement. These data will facilitate FLP-receptor deorphanisation efforts in the quest for novel control targets for nematode parasites.

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Background: Protease activated receptors (PAR) belong to a subfamily of G protein coupled receptors. They consist of seven transmembrane domains but are not classical receptors as their agonist is a circulating serine proteinase. This proteinase cleaves an N-terminal extracellular domain of the receptor to reveal a new N-terminal tethered ligand which binds intramolecularly, thus converting an extracellular proteolytic event into a transmembrane signal. Therefore, the cleavage and activation of PARs provide a mechanism whereby proteinases can directly influence the inflammatory response. Gingival hyperplasia or gingival enlargement is a side effect of some drugs such as cyclosporine, a potent immunosuppressant. To date, the potential role of PAR in the inflammation associated with the pathogenesis of gingival overgrowth has not been studied. Objectives: The present study was designed to determine whether proteinases derived from extracts of cyclosporine induced hyperplasia were capable of activating PAR in vitro. Methods: Cell lysates were derived from tissue obtained from gingival overgrowth of patients requiring surgical excision. Cell lines over-expressing PARs were maintained in Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM), containing 10% foetal calf serum (FCS) in 5% CO2. The cells were treated with gingival overgrowth lysates and agonist stimulated calcium release from the cells was recorded using the Fluo-4-Direct™ Calcium Assay Kit from Invitrogen, according to manufacturer's instructions. Results: Calcium release by activated PAR on tumour cells was detected in those treated with gingival hyperplasia lysates. Samples from healthy gingival fibroblasts did not elicit this response. Conclusions: The identification of mediators of the molecular events central to the inflammatory phenotype elicited by gingival hyperplasia is important. To this end, our experiments show that in vitro, enzymes derived from overgrown gingival tissue are capable of activating PAR and thereby provide evidence for the potential role of PAR in sustaining gingival hyperplasia.

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Dissertação de Mestrado, Biotecnologia, Faculdade de Engenharia de Recursos Naturais, Universidade do Algarve, 2009

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GABA (y-amino butyric acid) is a non-protein amino acid synthesized through the a-decarboxylation of L-glutamate. This reaction is catalyzed by L-glutamate decarboxylase (EC 4.1.1.15), a cytosolic Ca2+/calmodulin-stimulated enzyme. The purpose of this study is to determine whether or not GABA accumulation is associated with the hypersensitive response of isolated Asparagus sprengeri mesophyll cells. The addition of 25 J.lM mastoparan, a G protein activator, to suspensions of isolated asparagus mesophyll cells significantly increased GABA synthesis and cell death. Cell death was assessed using Evan's blue dye and fluorescein diacetate tests for cell viability. In addition, mastoparan stimulated pH-dependent alkalinization of the external medium, and a rapid and large 02 consumption followed by a loss of photosynthetic activity. The rate of 02 consumption and the net decrease in 02 in the dark was enhanced by light. The inactive mastoparan analogue Mas17 was ineffective in stimulating GABA accumulation, medium alkalinization, 02 uptake and cell death. Accumulation of H202 in response tomastoparan was not detected, however, mastoparan caused the cell-dependent degradation of added H202. The pH dependence of mastoparan-stimulated alkalinization suggests cellular electrolyte leakage, while the consumption of 02 corresponds to the oxidative burst in which 02 at the cell surface is reduced to form various active oxygen species. The results are indicative of the "hypersensitive response" of plants to pathogen attack, namely, the death of cells in the locality of pathogen invasion. The data are compatible with a model in which mastoparan triggers G protein activity, subsequent intracellular signal transduction pathway/s, and the hypersensitive response. It is postulated that the physiological elicitation of the hypersensitive response involves G protein signal transduction. The synthesis of GABA during the hypersensitive response has not been documented previously; however the role/s of GABA synthesis in the hypersensitive response, if any, remain unclear.

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L’approche Module X a été créée dans le but de concevoir de petits peptides modulateurs ayant des propriétés allostériques. Module X reproduit de petites parties des portions extracellulaires flexibles des récepteurs. Ces petits peptides vont interagir en s’interposant entre deux sous unités ou entre deux régions de la même sous-unité qui interagissent par des liens hydrogènes, des ponts salins ou des liens disulfure. Ces régions sont spécialement choisies à l’extérieur du domaine de liaison du ligand orthostérique et sont situées dans les régions inter domaines, la portion juxta membranaire ou dans les boucles. Étant donné que les boucles sont exposées durant les changements de conformation, une séquence peptidique reproduisant certaines régions de ces boucles pourrait s’insérer à un endroit approprié dans la structure où se lier à son partenaire de signalisation dans le complexe protéique, ce qui aurait comme effet de déplacer l’équilibre de l’ensemble vers un état particulier et modulerait ainsi la signalisation. De cette façon, certaines voies de signalisation pourraient être partiellement inhibées tandis que d’autres voies ne seraient pas touchées puisque le ligand orthostérique pourrait toujours se lier au récepteur. Dans une première étude, nous avons conçu des peptides inhibiteurs du récepteur de l’interleukine 1 (IL-1R/IL-1RAcP) plus précisément en reproduisant des régions flexibles de la protéine accessoire, sous-unité signalisatrice du récepteur. IL-1 est un médiateur majeur de l’inflammation, mais le seul antagoniste disponible est l’analogue naturel de IL-1, IL-1Ra qui compétitionne avec IL-1 pour le site de liaison sur le récepteur. Nous avons conçu plusieurs peptides à partir des boucles de la protéine accessoire. Un de ces peptides, rytvela (101.10) a démontré des propriétés de non-compétitivité et de sélectivité fonctionnelle caractéristiques des modulateurs allostériques. 101.10 bloque la prolifération des thymocytes et la synthèse de PGE2 avec un IC50 de 1 nM mais une efficacité de 100 % et 45 % respectivement et ne déplace pas IL-1 radioactif dans des essais de radioliaisons. De plus, 101.10 n’a qu’un effet minime sur l’affinité de IL-1 pour son récepteur. 101.10 démontre, de plus, une activité inhibitrice in vivo dans des modèles d’inflammation de l’intestin chez le rat (efficacité supérieure aux corticostéroïdes et à IL-1Ra) et de dermatite chez la souris de même que dans un modèle d’hyperthermie induite par IL-1. La deuxième étude démontre que Module X peut être utilisé pour concevoir des inhibiteurs pour une autre grande famille de récepteurs : les récepteurs couplés aux protéines G. La vasopressine joue un rôle important dans l’équilibre hydro-osmotique et un moindre rôle dans la vasomotricité. Six peptides ont été conçus à partir de régions juxta membranaires du récepteur de la vasopressine V2R. Le peptide le plus actif, VRQ397 (IC50 = 0,69 nM dans un modèle de vasorelaxation du crémastère), a démontré de la sélectivité fonctionnelle en inhibant la synthèse de prostacycline mais sans inhiber l’activation de la protéine Gs et la génération d’ AMP cyclique. Le peptide VRQ397 ne pouvait déplacer le ligand naturel AVP marqué radioactivement; de même VRQ397 radioactif ne se liait que sur V2R et non pas sur d’autres récepteurs de la même famille tel que V1R (récepteur de la vasopressine de type I). Ces études décrivent la caractérisation de petits peptides modulateurs de la signalisation de IL-1R et V2R et présentant des propriétés de modulateurs allostériques.

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Le récepteur de la vasopressine de type 2 (V2R) joue un rôle crucial dans l’homéostasie hydrique. Exprimé principalement au niveau du rein, son activation par l’hormone antidiurétique arginine-vasopressine (AVP) favorise la réabsorption d’eau, participant ainsi à diminuer la diurèse. Plus de 200 mutations dans le gène du V2R ont été associées au diabète néphrogénique insipide congénital (DINc), une maladie causée par une perte de fonction du récepteur. À l’opposé, trois mutations découvertes récemment induisent un gain de fonction du V2R, et sont la cause du syndrome néphrogénique de l’anti-diurèse inappropriée (NSIAD). Les travaux de cette thèse visent à mieux comprendre les bases moléculaires responsables de la perte ou du gain de fonction des récepteurs mutants associés à ces deux maladies. Dans plus de 50% des cas, les mutations faux-sens affectent négativement l’adoption d’une conformation native par le V2R, provoquant la reconnaissance et la rétention intracellulaire des mutants par le système de contrôle de qualité du réticulum endoplasmique. Nos résultats ont démontré que l’interaction entre les récepteurs mutants et le chaperon moléculaire calnexine est dépendante de N-glycosylation et que sa durée varie en fonction de la mutation. De plus, l’importance de cette modification co-traductionnelle et des interactions lectines-sucres dans le processus de maturation d’un mutant donné s’est avérée une caractéristique intrinsèque, puisque l’absence de N-glycosylation n’a pas affecté le mutant Y128S (phénotype léger) tandis que la maturation du mutant W164S (phénotype sévère) a été totalement abolie. Nos résultats suggèrent aussi que l’action des chaperons pharmacologiques (CP), molécules favorisant la maturation des mutants du V2R, peut survenir à différentes étapes au cours du processus de maturation, selon le mutant réchappé. Ces différences entre muta nts suggèrent des processus biosynthétiques ‘personnalisés’ dictés par la nature de la mutation impliquée et pourraient expliquer la différence de sévérité des manifestations cliniques chez les patients porteurs de ces mutations. Bien qu’une récupération de fonction ait été obtenue pour les mutants Y128S et W164S par un traitement au CP, il n’en est pas de même pour toutes les mutations occasionnant un défaut conformationnel. C’est ce que nous avons démontré pour le mutant V88M, affligé de deux défauts, soit une faible efficacité de maturation combinée à une basse affinité pour l’AVP. Dans ce cas, et malgré une augmentation du nombre de récepteurs mutants la surface cellulaire, la diminution de l’affinité apparente du récepteur mutant pour l’AVP a été exacerbée par la présence résiduelle de CP à son site de liaison, rendant impossible l’activation du récepteur aux concentrations physiologiques d’AVP. Les mutants R137C et R137L ont une activité constitutive élevée et mènent au NSIAD tandis que la substitution de cette même arginine par une histidine (R137H) mène au DINc. Ces trois mutants se sont avéré partager plusieurs caractéristiques, dont une efficacité de maturation réduite et une désensibilisation spontanée élevée. La seule différence iden tifiée entre ces mutants est leur niveau d’activité constitutive. Le CP utilisé dans nos études possède aussi la propriété d’agoniste inverse, mais n’a pourtant pas diminué l’activité constitutive des mutants R137C/L, suggérant une conformation active ‘figée’. Seul l’effet chaperon a été observé, entraînant la hausse de récepteurs à la surface cellulaire, qui se traduit par une augmentation de la production de second messager. Nous avons par contre suggéré l’utilisation d’AVP puisqu’il favorise l’endocytose des récepteurs R137/L sans promouvoir leur activation, diminuant ainsi le nombre de récepteurs actifs à la surface cellulaire. Nous avons identifié la première mutation occasionnant un gain de fonction du V2R qui n’implique pas l’arginine 137. Le mutant F229V a une activité constitutive élevée et, contrairement aux R137C et R137L, il n’est pas sujet à une désensibilisation spontanée accrue. L’observation que des agonistes inverses sont aptes à inhiber l’activité constitutive de ce nouveau mutant est une découverte importante puisque l’insuccès obtenu avec les mutations précédentes suggérait que ces molécules n’étaient pas utiles pour le traitement du NSIAD. Considérés globalement, ces travaux illustrent le caractère particulier des formes mutantes du V2R et l’importance de bien cerner les conséquences fonctionnelles des mutations afin d’apporter aux patients atteints de DINc ou NSIAD une thérapie personnalisée, et de développer de nouveaux agents thérapeutiques adaptés aux besoins.

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Les kinines agissent sur deux types de récepteurs couplés aux protéines G, nommés B1 et B2, lesquels jouent un rôle important dans le contrôle cardiovasculaire, la nociception et l’inflammation. Nous considérons l’hypothèse que le récepteur B1 des kinines est induit et contribue aux complications diabétiques, incluant l’hypertension artérielle, les polyneuropathies sensorielles, l’augmentation du stress oxydatif vasculaire, l’inflammation vasculaire et l’obésité chez le rat traité au D-glucose (10% dans l’eau de boisson) pendant 8 ou 12 semaines. Dans ce modèle de résistance à l’insuline, nous avons évalué les effets d’un traitement pharmacologique d’une semaine avec un antagoniste du récepteur B1 des kinines, le SSR240612 (10 mg/kg/jr). Les résultats montrent que le SSR240612 renverse l’hypertension, l’allodynie tactile et au froid, la production de l’anion superoxyde et la surexpression de plusieurs marqueurs inflammatoires dans l’aorte (iNOS, IL-1β, macrophage (CD68, CD11), ICAM-1, E-selectine, MIF ainsi que le B1R) et dans les adipocytes (iNOS, IL-1β, TNF-α et macrophage CD68). De plus, le SSR240612 corrige la résistance à l’insuline, les anomalies du profil lipidique plasmatique et le gain de poids et de masse adipeuse. Ces données supportent l’implication des kinines dans les complications diabétiques dans un modèle animal de résistance à l’insuline et suggèrent que le récepteur B1 est une cible thérapeutique potentielle dans le diabète et l’obésité.

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Les kinines sont des peptides neuro- et vaso- actifs impliqués dans les processus hémodynamiques, inflammatoires et douloureux. Leurs effets biologiques sont produits par l’entremise de deux types de récepteurs couplés aux protéines G, soit B1 (B1R) et B2 (B2R). Le B1R est inductible, son expression est augmentée à la suite d’un dommage tissulaire ou de l’exposition à des endotoxines bactériennes (lipopolysaccharide bactérien (LPS)), à des cytokines pro-inflammatoires (interleukine-1β (IL-1β), facteur de nécrose tumorale-α (TNF-α)) ou à des espèces réactives oxygénées (ROS). Les travaux présentés dans cette thèse avaient pour objectif d’élucider et/ou de raffiner les connaissances sur 1) la localisation, 2) le mécanisme d’induction et 3) le rôle physiopathologique du B1R dans des modèles expérimentaux de douleur chez le rat. Nos données ont permis de démontrer pour la première fois que le B1R est augmenté de façon significative dans la moelle épinière du rat diabétique de type 1 où il est localisé sur les fibres sensorielles de type C, les astrocytes et les cellules de la microglie (1er article). Également, l’inhibition de l’activation des cellules de la microglie supprime les neuropathies diabétiques, l’expression de médiateurs pro-inflammatoires ainsi que l’activité pro-nociceptive du B1R (2e et 3e articles). Finalement, nous avons démontré que la stimulation systémique du TRPV1 par la capsaïcine induit une surexpression du B1R au niveau microgliale, via un mécanisme impliquant l’augmentation de la production de ROS et possiblement de cytokines (4e article). Ces données nous permettent de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’expression et l’activité du B1R. Aussi, elles nous permettent d’imaginer de nouvelles stratégies pour prévenir l’induction du B1R (inhibition du TRPV1) ou son activité délétère (inhibition de l’activation des cellules de la microglie) dans la douleur inflammatoire et neuropathique. 

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Au cours des dernières années, un intérêt grandissant concernant les rôles physiologiques des endocannabinoïdes (eCBs) a été observé. Le système eCB est une cible attrayante pour la modulation du système immunitaire et de la douleur périphérique. Bien que le récepteur CB1 soit distribué dans le système nerveux, le récepteur CB2 est traditionnellement associé au système immunitaire. Ce dogme fait maintenant l’objet d’un débat depuis la découverte de l’expression du récepteur CB2 dans certains neurones. La rétine est un modèle important pour l’étude de processus neuronaux. La présence du récepteur CB1 y a été démontrée. Des études fonctionnelles rapportent que l’activation des récepteurs cannabinoïdes affecte le fonctionnement de plusieurs cellules rétiniennes. À ce jour, aucune étude ne s’est intéressée au rôle global des récepteurs CB1 et CB2 dans la rétine. Nous avons investigué les conséquences de l’élimination du récepteur CB1 (cnr1-/-) ou du récepteur CB2 (cnr2-/-) sur la fonction rétinienne mesurée par électrorétinographie. Nous avons également caractérisé la distribution du récepteur CB2 dans la rétine. Pour ce faire, nous avons comparé la spécificité de plusieurs anticorps dirigés contre le récepteur CB2. Seulement l’un des anticorps testés a montré une spécificité satisfaisante. Il a permis de détecter la présence du récepteur CB2 dans les cônes, les bâtonnets, les cellules horizontales, amacrines, bipolaires et ganglionnaires. Nos résultats d’électrorétinographie indiquent que seules les souris cnr2-/- présentent une amplitude accrue de l’onde a des ERG, en conditions scotopiques. En conditions photopiques, l’amplitude de l’onde b des souris cnr2-/- montre un schéma d’adaptation à la lumière différent des autres groupes. Aucun effet significatif n’a été observé chez les animaux cnr1-/-. Ces résultats permettent de conclure que les récepteurs CB1 et CB2 jouent des rôles différents dans le traitement visuel et que le récepteur CB2 semble être impliqué dans l’établissement des réponses rétiniennes.