A novel assay for drug-DNA binding mode, affinity, and exclusion number: scanning force microscopy.

Determining the mode-of-binding of a DNA ligand is not always straightforward. Here, we establish a scanning force microscopic assay for mode-of-binding that is (i) direct: lengths of individual DNA-ligand complexes are directly measured; (ii) rapid: there are no requirements for staining or elaborate sample preparation; and (iii) unambiguous: an observed increase in DNA length upon addition of a ligand is definitive evidence for an intercalative mode-of-binding. Mode-of-binding, binding affinity, and site-exclusion number are readily determined from scanning force microscopy measurements of the changes in length of individual drug-DNA complexes as a function of drug concentration. With this assay, we resolve the ambiguity surrounding the mode of binding of 2,5-bis(4-amidinophenyl) furan (APF) to DNA and show that it binds to DNA by nonintercalative modes. APF is a member of an important class of aromatic dicationic drugs that show significant activity in the treatment of Pneumocystis carinii pneumonia, an opportunistic infection that is the leading cause of death in AIDS patients.

Cryo-electron microscopy studies of empty capsids of human parvovirus B19 complexed with its cellular receptor.

The three-dimensional structures of human parvovirus B19 VP2 capsids, alone and complexed with its cellular receptor, globoside, have been determined to 26 resolution. The B19 capsid structure, reconstructed from cryo-electron micrographs of vitrified specimens, has depressions on the icosahedral 2-fold and 3-fold axes, as well as a canyon-like region around the 5-fold axes. Similar results had previously been found in an 8 angstrom resolution map derived from x-ray diffraction data. Other parvoviral structures have a cylindrical channel along the 5-fold icosahedral axes, whereas density covers the 5-fold axes in B19. The glycolipid receptor molecules bind into the depressions on the 3-fold axes of the B19:globoside complex. A model of the tetrasaccharide component of globoside, organized as a trimeric fiber, fits well into the difference density representing the globoside receptor. Escape mutations to neutralizing antibodies map onto th capsid surface at regions immediately surrounding the globoside attachment sites. The proximity of the antigenic epitopes to the receptor site suggests that neutralization of virus infectivity is caused by preventing attachment of viruses to cells.

Large secretory structures at the cell surface imaged with scanning force microscopy.

Scanning force microscopy was used to image rat basophilic leukemia (RBL-2H3) cell surfaces under different stimulation conditions that either permit or inhibit secretion. Cross-linking the surface IgE receptors with dinitrophenol-conjugated bovine serum albumin initiates secretion in RBL cells with concomitant spreading of the cell body. Structures at the cell surface approximately 1.5 microns in diameter relate to secretion both spatially and temporally. The position of these surface pits and their sizes suggest that they may be related to the dense-core granules positioned along the cytoskeletal filaments in detergent-extracted, unactivated RBL cell processes. Topographic scanning force microscopy images of RBL cell surfaces at 2, 5, and 35 min after activation show that these structures persist and change in cross-sectional profile with time after activation. These structures may be related to the membrane retrieval mechanism of cells after intense stimulation.

Anatomia ecológica do lenho de espécies arbustivas e arbóreas que ocorrem naturalmente em bosques com drástico gradiente de precipitação ao Noroeste da Patagônia, Argentina

A utilização de gradientes ambientais no estudo de comunidades vegetais possibilita a eleição de sítios onde há a predominância de um fator abiótico que determina o sucesso ou o fracasso de espécies ao longo de sua extensão. Entre as inúmeras ferramentas utilizadas no estudo de gradientes climáticos, se destaca a anatomia do lenho, pois, é um ramo da ciência que permite analisar, além dos aspectos espaciais, os aspectos temporais dos sítios por meio dos anéis de crescimento. Além disso, a ampla distribuição das plantas lenhosas ao longo do globo possibilita análises em praticamente todos os tipos de biomas e ecossistemas terrestres. Dentro desse contexto estão os bosques andino-patagônicos de Araucaria araucana (Pehuén) ao norte de sua distribuição na Argentina. Esses bosques ocupam territórios caracterizados por um acentuado gradiente de precipitação, que vai de cerca de 3000 a 100 milímetros anuais, entre a cordilheira do Andes e a estepe patagônica, que os define como bosques mésicos e xéricos, com diferenças ecológicas que condicionam a formação vegetal, dinâmica, estrutura, relações com o clima e vulnerabilidade em cenários de mudanças ambientais. O objetivo do projeto foi descrever e analisar comparativamente a estrutura anatômica do lenho de 33 espécies arbóreas e arbustivas ocorrentes ao longo de um gradiente de precipitação, entre a encosta da cordilheira dos Andes e a estepe Patagônica, para verificar possíveis alterações anatômicas que permitam a determinação de tendências e elucidem os limites de distribuição das espécies. Foram coletadas amostras não destrutivas de lenho durante três expedições para a Patagônia entre 2012 e 2014, seguidas de procedimentos laboratoriais de confeccção de lâminas histológicas, preparo de amostras para análises dendrocronológicas, captura de imagens com câmeras acopladas a microscópios óptico e eletrônico de varredura, mensurações, descrições e análises comparativas com o auxílio de softwares. Foram identificados caracteres anatômicos exclusivos de sítios secos e úmidos que permitiram a caracterização, posicionamento ao longo do gradiente de precipitação e grupamento de espécies xerófitas e mesófitas; A ultra-estrutura das pontoações de traqueídeos de Araucaria araucana apresentou diferenças marcantes na frequência e porosidade de suas membranas, sendo maior e menos porosas em sítios xéricos, e menor e mais porosas nos mésicos; a chave dicotômica microscópica permitiu a identificação das 32 espécies arbustivas, as espécies Chuquiraga oppositifolia e Nothofagus antarctica apresentaram potencial dendrocronológico, e foram identificadas tendências anatômicas latitudinais influenciadas pelo clima nos extremos da América do Sul. A anatomia do lenho se mostrou uma ferramenta confiável no estudo de um gradiente de precipitação na Patagônia argentina, e os resultados apontam para riscos de embolismos e morte induzida por falha no sistema hidráulico de Araucaria araucana ao longo de todo o gradiente, em função do atual cenário climático, e suas projeções em médio e longo prazos.

Desenvolvimento de matrizes poliméricas como veículo de ácido ascórbico: caracterização e avaliação da estabilidade

A administração de princípios ativos pela mucosa oral é uma forma eficiente para a distribuição de fármacos e nutrientes, oferecendo diversas vantagens como uma fácil aplicação, evitando o metabolismo de primeira passagem hepática e potencialmente melhorando a biodisponibilidade dessas substâncias. A acerola e o camu-camu apresentam uma alta concentração de vitamina C e são consideradas fontes de diferentes compostos ativos, porém a vitamina C presente nas frutas é facilmente oxidada pelos fatores ambientais, e essas frutas são pouco acessíveis ao consumo populacional. Filmes de desintegração oral (FDO) podem apresentar rápido tempo de desintegração e fácil administração, o que os torna um material interessante para a veiculação de compostos com atividades farmacêuticas ou nutricionais. Assim, este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento e caracterização de filmes de desintegração oral à base de amido e gelatina com adição de extrato seco de acerola e camu-camu produzidos por \"spray dryer\" como uma alternativa para a administração de vitamina C. Os FDOs foram produzidos pela técnica de casting, variando-se a proporção de amido e gelatina. Como plastificante foi utilizado o sorbitol (20 g / 100 g de polímero), mantendo-se constante a concentração de polímeros (2 g /100 g de solução filmogênica) e de extrato seco de acerola (4 g /100 g de solução filmogênica) e camu-camu (4 g / 100 g de solução filmogênica). Os extratos secos de acerola e camu-camu foram caracterizados com relação à concentração da vitamina C e da estabilidade desses extratos nessas condições (30 °C, UR 75 % e 40 °C, UR 75%). Os FDOs foram caracterizados em relação a espessura, propriedades mecânicas, ângulo de contato, FT-IR, microscopia electrônica de varredura, concentração de vitamina C, atividade antioxidante, atividade antimicrobiana, estabilidade da vitamina C, tempo de desintegração, estabilidade da atividade de eliminação de radicais de DPPH•, avaliação sensorial. Os extratos secos apresentaram uma boa estabilidade em relação à vitamina C e aos compostos antioxidantes (sequestro do radical DPPH•). Os FDOs sem adição de extrato, independente da formulação, mostraram-se homogêneos, com ausência de partículas insolúveis e alta capacidade de formação de filme. Para os FDOs com maior concentração de amido foi observado reduzido tempo de desintegração e pH próximo ao bucal. Após a adição dos extratos, os FDOs apresentaram redução do tempo de desintegração, boa aceitação sensorial, propriedades antioxidantes e estabilidade pelo sequestro do radical DPPH•. O pH de superfície dos filmes com adição de extrato seco de acerola foi mais próximo ao bucal quando comparado com os filmes com camu-camu. No entanto, os FDOs com acerola apresentaram reduzida estabilidade da vitamina C em relação ao tempo de armazenamento, enquanto que os filmes com camu-camu apresentaram melhor estabilidade. De modo geral, na formulação produzida apenas com amido (100 g de amido / 100 g de polímeros) observou-se uma maior concentração da vitamina C no final da estabilidade realizada à 30 °C e umidade relativa de 75 %, elevada estabilidade dos compostos ativos (DPPH) e alta taxa de uniformidade na distribuição da vitamina C no filme de desintegração oral. Dessa forma, os FDOs podem ser considerados uma boa alternativa para a suplementação de vitamina C.