Resolution and Absolute Configuration Assignment of a Natural Racemic Chromane from Peperomia obtusifolia (Piperaceae)

The resolution of the natural racemic chromane 3,4-dihydro-5-hydroxy-2,7-dimethyl-8-(3 ''-methyl-2 ''-butenyl)-2-(4'-methyl-1',3'-pentadienyl)-2H-1-benzopyran-6-carboxylic acid (1) isolated from the leaves of Peperomia obtusifolia has been accomplished using stereoselective HPLC. The absolute coil figuration of the resolved enantiomers was determined by the analysis of optical rotations and CD spectra. The finding of a racemic mixture instead of an enantiomerically pure metabolite raises questions about the final steps in the biosynthesis of this class of natural products, suggesting that the intramolecular chromane ring formation step may not be enzymatically controlled at all in P. obtusifolia. Chirality 21:799-801, 2009. (C) 2008 Wiley-Liss, Inc.

Aproveitamento de um fosfato natural parcialmente solubilizado pelas culturas do arroz, milho e soja: I. Resultados preliminares

Em solos pouco ácidos, pobres em P disponível, dois dos quais anteriormente com vegetação de cerrado, foram conduzidos ensaios destinados a comparar a eficiência de um fosfato natural parcialmente acidulado com ácido sulfúrico (FAPS) com a do super simples (SS) e a do fosfato de Araxá original. Usaram-se as culturas de arroz de sequeiro, milho e soja. Verificou-se que: (1) o FAPS deu produções que não diferiram estatísticamente das obtidas com o SS sendo maiores que as conseguidas com o FA; (2) os resultados das análises de solos e da diagnose foliar indicam que o FAPS funcionou como fonte de P, Ca e S.

Identification of Mycobacteria by Thin Layer Chromatographic Analysis of Mycolic Acids and Conventional Biochemical Method: Four Years of Experience

Mycolic acids analysis by thin-layer chromatography (TLC) has been employed by several laboratories worldwide as a method for fast identification of mycobacteria. This method was introduced in Brazil by our laboratory in 1992 as a routine identification technique. Up to the present, 861 strains isolated were identified by mycolic acids TLC and by standard biochemical tests; 61% out of these strains came as clinical samples, 4% isolated from frogs and 35% as environmental samples. Mycobacterium tuberculosis strains identified by classical methods were confirmed by their mycolic acids contents (I, III and IV). The method allowed earlier differentiation of M. avium complex - MAC (mycolic acids I, IV and VI) from M. simiae (acids I, II and IV), both with similar biochemical properties. The method also permitted to distinguish M. fortuitum (acids I and V) from M. chelonae (acids I and II) , and to detect mixed mycobacterial infections cases as M. tuberculosis with MAC and M. fortuitum with MAC. Concluding, four years experience shows that mycolic acids TLC is an easy, reliable, fast and inexpensive method, an important tool to put together conventional mycobacteria identification methods.

Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD

O objetivo deste trabalho foi comparar diferentes técnicas multivariadas na caracterização de 35 genótipos de gergelim mediante 769 marcadores RAPD. As distâncias genéticas foram obtidas pelo complemento aritmético do coeficiente de Jaccard e agrupadas pelos métodos hierárquicos do vizinho mais próximo, do vizinho mais distante, das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA), do método de otimização de Tocher e análises de coordenadas principais. O agrupamento dos genótipos foi alterado em função dos diferentes métodos usados. Adotando-se a mesma distância genética (0,36) como valor de corte, diferenciaram-se quatro grupos no método do vizinho mais próximo, 13 para o vizinho mais distante, 11 no UPGMA e quatro no Tocher. Entre os métodos hierárquicos, o UPGMA apresentou o melhor ajuste das distâncias originais e estimadas (CCC = 0,89). As análises das coordenadas principais confirmaram a baixa diversidade existente entre os genótipos. A maior divergência ocorreu entre as cultivares Seridó 1 e Arawaca 4, e a menor, entre os genótipos VCR-101 e GP-3314. As três primeiras coordenadas principais contabilizaram 35,13% do total da variabilidade, e 18 autovalores foram necessários para explicar 81% da variação genética. Os métodos UPGMA, de otimização de Tocher, e as análises de coordenadas principais são complementares na formação dos grupos.

Inheritance of resistance to powdery mildew in pea and pathogenesis-related aspects

A herança da resistência ao oídio na cultivar de ervilha MK-10 e alguns aspectos histológicos da infecção foram estudados. Para o estudo da herança, as gerações F1, F2, retrocuzamentos e geração F3 de MK-10 com duas populações suscetíveis foram avaliadas. Nas avaliações histológicas observou-se a porcentagem de conídios germinados, porcentagem de conídios que formaram apressório, porcentagem de conídios que estabeleceram colônia e número de haustórios por colônia. Para comparar as razões de segregação obtidas no estudo da herança da resistência, adotou-se o teste do Qui-quadrado (X²) e para os dados das análises histológicas, utilizou-se o teste Tukey a 5% de probabilidade. Concluiu-se que a resistência de MK-10 ao oídio é devida a um par de alelos recessivos e que a resistência é expressa na fase de pré-penetração, completada por uma morte celular localizada pós-penetração, característica da presença do par de alelos recessivos er1er1.

Ciclo reprodutivo do caranguejo violinista Uca rapax (Smith) (Crustacea, Brachyura, Ocypodidae) habitante de um estuário degradado em Paraty, Rio de Janeiro, Brasil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Resistência de genótipos de batata ao pulgão

Avaliou-se a resistência (e antibiose) de genótipos de batata, comerciais e em fase de melhoramento, ao pulgão Myzus persicae, em ensaios efetuados com plantas em vasos, sem chance de escolha, em Jaboticabal (SP). Foram efetuados seis experimentos, utilizando-se um total de 16 genótipos, a saber: 'Achat', 'Apuã', 'Aracy', 'Aracy Ruiva', 'Bintje', 'Ibitu Açu', 'Itararé', 'N 140-201', 'NYL 235-4', '288.719-13', '288.764-26', '288.776-3', '288.776-6', '288.794-19', '288.801-6' e '288.814-7'. em cada experimento foram utilizadas combinações variadas dos mesmos. Nos dois primeiros experimentos as plantas foram infestadas com 30 pulgões adultos por planta, distribuídos em três folhas, com três avaliações realizadas em semanas subseqüentes à infestação, contando-se o número de indivíduos por planta. O terceiro experimento foi conduzido aprisionando-se duas fêmeas adultas no interior de pequenas gaiolas fixadas na face abaxial dos folíolos, em número de dez por planta, avaliando-se a reprodução do pulgão após sete dias, em dois plantios. No quarto experimento efetuou-se a infestação da planta com 15 pulgões, avaliando-se o crescimento da população na planta toda durante três semanas consecutivas. No quinto experimento foi avaliada a descendência de uma única fêmea adulta por folíolo e no sexto experimento avaliou-se o peso dos pulgões aos sete dias de vida. Os tricomas glandulares presentes nos folíolos e a funcionalidade dos mesmos também foram avaliados. A cultivar 'Ibitu Açu' apresentou elevado grau de antibiose a M. persicae; os genótipos '288.776-3' e '288.794-19' também apresentaram esse tipo de resistência, em grau moderado; '288.719-13' e '288.764-26' foram resistentes ao pulgão, provavelmente devido à presença de tricomas glandulares funcionais, dos tipos A e B, em seus folíolos (antixenose); entre os mais suscetíveis destacaram-se 'Bintje' e '288.801-6'.

A criança disfônica: diagnóstico, tratamento e evolução clínica

Os nódulos vocais são causas freqüentes de disfonias infantis, porém, através das vídeoendoscopias, outras lesões têm sido diagnosticadas na laringe infantil, como os cistos, sulcos, pontes e micromembranas, denominadas de lesões estruturais mínimas. OBJETIVO: Avaliar, em 71 crianças com disfonia agendadas nos ambulatórios de Foniatria da Faculdade de Medicina de Botucatu (Unesp) nos últimos cinco anos: sexo, idade, diagnósticos, tratamentos e evolução clínica. FORMA DE ESTUDO: Clínico retrospectivo. CASUÍSTICA E MÉTODO: Realizou-se estudo retrospectivo das avaliações otorrinolaringológicas e endoscópicas de 71 crianças com queixas de disfonia e idade entre 3 a 13 anos (45 meninos e 26 meninas). As crianças haviam sido submetidas a exame endoscópico com telescópio rígido ou nasofibroscópio flexível. Foram excluídas as crianças com disfonias funcionais ou com queixas de obstrução respiratória. RESULTADOS: Os principais diagnósticos foram: nódulo vocal (47 casos; 66,2%), cisto epidérmico (7 casos; 9,9%), cisto aberto fistulizado (6 casos; 8,4%), sulco vocal (5 casos; 7,1%), ponte + cisto (2 casos; 2,8%), micromembrana anterior (2 casos; 2,8%) e pólipo vocal (2 casos; 2,8%). As disfonias foram mais freqüentes entre os meninos (63,3%). A fonoterapia isolada foi o tratamento de escolha nos casos de nódulo vocal (evolução favorável), sulco vocal (evolução desfavorável) e micro-membrana (evolução desfavorável). Nas demais lesões (cistos, pontes e pólipos) o tratamento de escolha foi a cirurgia associada à fonoterapia, com resultados satisfatórios, exceto nos casos que recusaram a cirurgia. CONCLUSÃO: Os nódulos vocais são as principais causas de disfonias em crianças, porém as lesões estruturais mínimas mostraram-se também freqüentes, exigindo exame minucioso para o diagnóstico.

Identificação de marcas moleculares associadas à ausência de sementes em videira

A ausência de sementes tem sido uma característica bastante exigida pelos consumidores de uvas de mesa. O objetivo deste trabalho foi identificar marcas moleculares associadas à ausência de sementes, utilizando as técnicas RAPD e fAFLP. Foram utilizadas folhas jovens de 19 cultivares. Na análise RAPD 30, iniciadores possibilitaram amplificação de todas as amostras, produzindo 392 bandas polimórficas. Foi possível encontrar uma marca específica para a ausência de sementes, utilizando o iniciador UBC 443, que poderá futuramente ser utilizado para o desenvolvimento de marcadores SCAR, possibilitando a criação de um teste de identificação rápida e precoce de apirenia em videira. A análise fAFLP proporcionou a visualização de um dendrograma com grupos específicos de cultivares com sementes, sem sementes e porta enxertos.

An analysis of the floristic composition and diversity of Amazonian forests including those of the Guiana Shield

A large number of newly published and unpublished hectare plots in Amazonia and the Guiana Shield area allow an analysis of family composition and testing of hypotheses concerning alpha-diversity in the south American rain forest. Using data from 94 plots the family-level floristic patterns in wet tropical South America are described. To test diversity patterns, 268 plots are used in this large area. Contrary to a widely held belief, western Amazonian plots are not necessarily the most diverse. Several central Amazonian plots have equal or even higher tree diversity. Annual rainfall is not a good estimator for tree diversity in the Amazonia area and Guiana shield. Plots in the Guiana Shield area (and eastern Amazonia) usually have lower diversity than those in central or western Amazonia. It is argued that this is not because of low rainfall or low nutrient status of the soil but because of the small area of the relatively isolated rain forest area in eastern Amazonia and the Guiana Shield. The low diversity on nutrient-poor white sand soils in the Amazon basin is not necessarily due to their Low nutrient status but is, at least partly, caused by their small extent and fragmented nature.

Thermogravimetric investigations during the synthesis of silica-based MCM-41

MCM-41 material was synthesized starting from hydrogel containing colloidal fumed silica, sodium silicate, cetyltetramethylammonium bromide (CTMABr) as surfactant, and distilled water as solvent. These reactants were mixed to obtain a gel with the following composition: 4SiO(2):1Na(2)O:1CTMABr:200H(2)O. The hydrogel with pH=14 was hydrothermally treated at 100 degreesC, for 4 days. Each day, the pH was measured, and then adjusted to 9.5-10 by using 30% acetic acid solution. Thermogravimetry was the main technique, which was used to monitor the participation of the surfactant on the MCM-41 nanophase, being possible to determine the temperature ranges relative to water desorption as well as the surfactant decomposition and silanol condensation.

Whydration effects on DNA double helix stability modulates ligand binding to natural DNA in response to changes in water activity

In this work we present evidence that water molecules are actively involved on the control of binding affinity and binding site discrimination of a drug to natural DNA. In a previous study, the effect of water activity (a(w)) on the energetic parameters of actinomycin-D intercalation to natural DNA was determined using the osmotic stress method (39). This earlier study has shown evidence that water molecules act as an allosteric regulator of ligand binding to DNA via the effect of water activity on the long-range stability of the DNA secondary structure. In this work we have carried out DNA circularization experiments using the plasmid pUC18 in the absence of drugs and in the presence of different neutral solutes to evaluate the contribution of water activity to the energetics of DNA helix unwinding. The contribution of water to these independent reactions were made explicit by the description of how the changes in the free energy of ligand binding to DNA and in the free energy associated with DNA helix torsional deformation are linked to a(w) via changes in structural hydration. Taken together, the results of these studies reveal an extensive linkage between ligand binding affinity and site binding discrimination, and long range helix conformational changes and DNA hydration, This is strong evidence that water molecules work as a classical allosteric regulator of ligand binding to the DNA via its contribution to the stability of the double helix secondary structure, suggesting a possible mechanism by which the biochemical machinery of DNA processing takes advantage of the low activity of water into the cellular milieu.