Consumo alimentar e estilo de vida: um estudo longitudinal com estudantes universitários

A universidade é um local de aprendizagem no qual conhecimento acadêmico, social e cultural permeia a relação entre os estudantes, onde estes terão a oportunidade de vivenciar diferentes situações durante o curso. A maior preocupação é como esta experiência influenciará o estado nutricional com a possível mudança dos hábitos cotidianos, como abuso de bebidas alcoólicas, uso irrestrito de suplementos vitamínicos e alimentares e a alimentação inadequada. O consumo alimentar de universitários foi o foco desta pesquisa que teve como objetivo geral identificar as principais mudanças do consumo de alimentos/ bebidas e estilos de vida por meio de estudo de coorte, envolvendo estudantes ingressantes nos cursos de graduação da Escola Superior de Agricultura \"Luiz de Queiroz\" - ESALQ/USP, e como objetivos específicos desenvolver, validar e aplicar um instrumento com a finalidade de identificar medidas comportamentais relacionadas aos hábitos de consumo alimentar, atividade física, situação socioeconômica e relacionar as informações obtidas ao estado nutricional do estudante; descrever o consumo dentro e fora do domicílio. Participaram da pesquisa estudantes com idade entre 18 e 30 anos. Um questionário foi aplicado juntamente com a avaliação antropométrica para mensuração do peso, altura e classificação do estado nutricional por meio do Índice de Massa Corporal (IMC). Este protocolo foi repetido após 8 meses de curso para que fosse identificada a situação do estado nutricional de cada indivíduo relacionada às mudanças do comportamento alimentar. Os dados coletados foram armazenados em base de dados no Microsoft Excel, sendo analisados por meio do Statistical Analysis System. Os dados quantitativos foram expressos em média e desvio-padrão (DP) com cálculos de intervalos de confiança de 95%. O teste do qui-quadrado foi utilizado para comparar a distribuição da prevalência de sobrepeso e obesidade quanto à variável sexo, associando-se ao IMC. Foi utilizado o coeficiente de correlação intraclasse de Pearson para verificação de concordância entre peso e altura aferidos e referidos. Foi realizada análise de regressão múltipla para identificação da mudança de consumo entre as fases, assim como para peso corporal. Utilizou-se o nível de significância de 5%. Observaram-se entre as duas fases quantidades preocupantes de nutrientes ingeridos aquém ou além dos limites preconizados para ambos os sexos; destaque para o elevado consumo de sódio, e insatisfatório de carotenóides. No caso dos carotenóides, houve crescimento significativo da contribuição da categoria 3 para as alunas. O consumo de cafeína na segunda fase foi maior, predominando o fornecimento pelos alimentos ultraprocessados. De forma geral houve aumento do consumo de alimentos processados e ultraprocessados. Observou-se aumento (significativo a 5%) no consumo de lipídios. Constatou-se diminuição na prática de exercícios físicos e aumento na ingestão de bebidas alcoólicas, e destas com energéticos e no tabagismo. Concluiu-se que o ingresso na universidade contribui para a mudança nos hábitos alimentares e estilos de vida de maneira negativa, sendo necessária intervenção adequada visando a promoção da saúde dos estudantes.

Disponibilidade de níquel no sistema solo-planta: efeito de doses e saturações por bases

Por se tratar de um elemento essencial às plantas e um metal pesado ao mesmo tempo, o níquel requer atenção quanto aos aspectos da fisiologia de plantas e ambiental. Além disso, existe um intervalo estreito entre as exigências nutricionais e os teores tóxicos às plantas. Neste contexto, objetivou-se avaliar o efeito do Ni no sistema solo-planta, com foco no ciclo do N e a disponibilidade do elemento no solo, por meio de experimento em condições controladas, utilizando vasos distribuídos inteiramente ao acaso, utilizando-se esquema fatorial 2 x 5, com sete repetições cada tratamento. O primeiro fator foi constituído de duas saturações por base (50 e 70%) e o segundo de cinco doses de Ni (0; 0,1; 0,5; 1,0 e 10,0 mg dm-3 de solo). Os vasos foram preenchidos com 8 dm3 de terra e cultivados com soja [Glycine max (L.) Merrill] sucedida por girassol (Helianthus annuus L.). Os parâmetros qualitativos e quantitativos: altura de plantas (AP), diâmetro do caule (DC), número de nós (NN), estádio fenológico (EF), índice SPAD e, diâmetro do capítulo (DCap) (para girassol) foram avaliadas aos 30 e 60 dias após a emergência (d.a.e.) de cada cultivo. Plantas inteiras de soja, amostradas em quatro vasos de cada tratamento, foram coletadas no estádio R1. Na mesma ocasião foram coletadas amostras de solo da rizosfera. Em seguida, as plantas coletadas foram divididas em: folhas; raízes (nódulos na soja) e parte aérea. Foram determinados nas folhas utilizadas para diagnose em soja e girassol: os teores de macro e micronutrientes, as atividades da redutase do nitrato e da urease e as concentrações dos ácidos orgânicos: oxálico, malônico, succínico, málico, tartárico, fumárico, oxaloacético, cítrico e lático. Os mesmos ácidos orgânicos foram determinados em raízes secundárias de girassol e nódulos de soja. Foram realizadas avaliações ultraestruturais por meio de microscopia eletrônica de transmissão (MET) em raízes de girassol, e estruturais e de tonalidade em nódulos de soja, por meio de microscopia de luz. No solo, foram determinadas: atividade urease, desidrogenase, Ni total e fitodisponível pelos métodos: Mehlich-1, Mehlich-3 e DTPA. No período de maturidade fisiológica de cada cultura foi realizada a colheita das plantas dos vasos restantes para determinação de produção de grãos, teores de Ni na planta inteira e Ni e N nos grãos. Ao final dos dois experimentos foi realizada nova coleta de solo para extração sequencial de Ni. O índice SPAD em soja aos 60 d.a.e., a produção de massa seca da parte aérea da soja e da raiz de girassol foram influenciados pela saturação por bases, doses de níquel e pela a interação destes. Foram influenciados pelas saturações por base e doses de níquel (fatores isolados): para soja: AP aos 60 d.a.e., NN aos 30 e 60 d.a.e., SPAD aos 30 d.a.e.; para girassol: AP e NN aos 30 e 60 d.a.e., DC e SPAD aos 30 d.a.e. As demais variáveis avaliadas aos 30 e 60 d.a.e. foram influenciadas apenas pela saturação por bases, ou doses de Ni separadamente. As plantas de soja e girassol apresentaram maiores teores de Ni nos diferentes tecidos avaliados (exceto grãos) quando cultivadas sob V50%. A produção de grãos de soja e girassol não foi influenciada pelos tratamentos, porém o teor de N dos grãos de soja influenciado pelas doses de Ni na V70%. A atividade da enzima urease nas folhas de soja e girassol foi responsiva positivamente ao aumento das doses de Ni. Quatro dos ácidos orgânicos avaliados e o teor de N nas folhas e nos grãos foram maiores nas plantas cultivadas sob V70% com a dose de 0,5 mg dm-3 de Ni. As doses de Ni bem com as saturações por bases influenciaram diretamente o balanço de nutrientes das plantas. Os extratores Mehlich-1, Mehlich-3 e DTPA apresentaram elevado coefienciente de correlação entre a fração de Ni disponível no solo e a concentração do elemento nas plantas de soja e girassol, sendo o extrator DTPA o que apresentou maior coeficiente de correlação. O Ni apresentou distribuição variável entre as diferentes frações do solo em função dos tratamentos. Os solos dos tratamentos com saturação por bases de 70% apresentaram maior concentração de Ni ligado a carbonato, comparado aos tratamentos sob saturação por bases de 50%. A distribuição do Ni entre as frações do solo seguiu a seguinte orgem: ligado a carbonato < trocável < ligado a óxidos < matéria orgânica < residual. A saturação por bases exerceu efeito diferenciado para a atividade da urease no solo em função da cultura avaliada. Por sua vez, o Ni exerceu efeito diferenciado sobre a atividade de desidrogenase em função da cultura estudada

Aplicação de uma rede neural artificial para a avaliação da rugosidade e soprosidade vocal

A avaliação perceptivo-auditiva tem papel fundamental no estudo e na avaliação da voz, no entanto, por ser subjetiva está sujeita a imprecisões e variações. Por outro lado, a análise acústica permite a reprodutibilidade de resultados, porém precisa ser aprimorada, pois não analisa com precisão vozes com disfonias mais intensas e com ondas caóticas. Assim, elaborar medidas que proporcionem conhecimentos confiáveis em relação à função vocal resulta de uma necessidade antiga dentro desta linha de pesquisa e atuação clínica. Neste contexto, o uso da inteligência artificial, como as redes neurais artificiais, indica ser uma abordagem promissora. Objetivo: Validar um sistema automático utilizando redes neurais artificiais para a avaliação de vozes rugosas e soprosas. Materiais e métodos: Foram selecionadas 150 vozes, desde neutras até com presença em grau intenso de rugosidade e/ou soprosidade, do banco de dados da Clínica de Fonoaudiologia da Faculdade de Odontologia de Bauru (FOB/USP). Dessas vozes, 23 foram excluídas por não responderem aos critérios de inclusão na amostra, assim utilizaram-se 123 vozes. Procedimentos: avaliação perceptivo-auditiva pela escala visual analógica de 100 mm e pela escala numérica de quatro pontos; extração de características do sinal de voz por meio da Transformada Wavelet Packet e dos parâmetros acústicos: jitter, shimmer, amplitude da derivada e amplitude do pitch; e validação do classificador por meio da parametrização, treino, teste e avaliação das redes neurais artificiais. Resultados: Na avaliação perceptivo-auditiva encontrou-se, por meio do teste Coeficiente de Correlação Intraclasse (CCI), concordâncias inter e intrajuiz excelentes, com p = 0,85 na concordância interjuízes e p variando de 0,87 a 0,93 nas concordâncias intrajuiz. Em relação ao desempenho da rede neural artificial, na discriminação da soprosidade e da rugosidade e dos seus respectivos graus, encontrou-se o melhor desempenho para a soprosidade no subconjunto composto pelo jitter, amplitude do pitch e frequência fundamental, no qual obteve-se taxa de acerto de 74%, concordância excelente com a avaliação perceptivo-auditiva da escala visual analógica (0,80 no CCI) e erro médio de 9 mm. Para a rugosidade, o melhor subconjunto foi composto pela Transformada Wavelet Packet com 1 nível de decomposição, jitter, shimmer, amplitude do pitch e frequência fundamental, no qual obteve-se 73% de acerto, concordância excelente (0,84 no CCI), e erro médio de 10 mm. Conclusão: O uso da inteligência artificial baseado em redes neurais artificiais na identificação, e graduação da rugosidade e da soprosidade, apresentou confiabilidade excelente (CCI > 0,80), com resultados semelhantes a concordância interjuízes. Dessa forma, a rede neural artificial revela-se como uma metodologia promissora de avaliação vocal, tendo sua maior vantagem a objetividade na avaliação.

Qualidade de interação entre familiar/cuidador e adulto ou idoso pós-acidente vascular cerebral (AVC)

Considerando a família como instituição primária a qual se tem acesso, e a sua relevância nos diversos processos os quais o ser humano passa durante a vida, um resultado desse movimento são as mudanças na dinâmica familiar, quando há, por exemplo, o adoecimento de algum dos membros e um familiar torna-se cuidador. , atentando-se para as necessidades de cada sistema familiar. O objetivo deste estudo foi descrever a qualidade da relação entre o cuidador familiar e adulto ou idoso pós-Acidente Vascular Cerebral, que se encontram no processo de reabilitação. Participaram deste estudo, familiares de 11 pacientes que se encontram em atendimento na Clínica de Fonoaudiologia da Faculdade de Odontologia de Bauru FOB/USP. Para a coleta de dados foram agendadas entrevistas com a aplicação de questionários para caracterizar os aspectos interacionais entre o cuidador familiar e a pessoa cuidada, avaliar o nível de dependência na realização de atividades básicas e instrumentais diárias e como esses fatores podem influenciar na sobrecarga do cuidador, considerando o tempo do Acidente Vascular Cerebral (tAVC) e tempo de convivência diária (tCD) e, consequentemente, oferecer uma qualidade da relação insatisfatória. A média de idade dos participantes foi de 49 anos, houve predominância do sexo feminino (63,6%), a média de tAVC de 44 meses e a média de tCD foi de 19 horas. Para a análise dos dados optou-se por uma análise descritiva e abordagem quantitativa para a apresentação dos dados, para determinar a correlação entre as variáveis foi utilizado o Coeficiente de Correlação de Spearman e adotado nível de significância de 5% (p<0,05). Os resultados oferecem subsídios para estudos complementares direcionados ao desenvolvimento de intervenções no âmbito familiar. A psicologia pode auxiliar nessa tarefa de observar os comportamentos e as interações dos indivíduos, além de avaliar o contexto desse paciente, em especial, na descrição da qualidade da relação entre paciente-familiar, partindo da atual situação vivenciada.

Determination of cyclic and linear siloxanes in wastewater samples by ultrasound-assisted dispersive liquid-liquid microextraction followed by gas chromatography-mass spectrometry

A fast, simple and environmentally friendly ultrasound-assisted dispersive liquid-liquid microextraction (USA-DLLME) procedure has been developed to preconcentrate eight cyclic and linear siloxanes from wastewater samples prior to quantification by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). A two-stage multivariate optimization approach has been developed employing a Plackett-Burman design for screening and selecting the significant factors involved in the USA-DLLME procedure, which was later optimized by means of a circumscribed central composite design. The optimum conditions were: extractant solvent volume, 13 µL; solvent type, chlorobenzene; sample volume, 13 mL; centrifugation speed, 2300 rpm; centrifugation time, 5 min; and sonication time, 2 min. Under the optimized experimental conditions the method gave levels of repeatability with coefficients of variation between 10 and 24% (n=7). Limits of detection were between 0.002 and 1.4 µg L−1. Calculated calibration curves gave high levels of linearity with correlation coefficient values between 0.991 and 0.9997. Finally, the proposed method was applied for the analysis of wastewater samples. Relative recovery values ranged between 71–116% showing that the matrix had a negligible effect upon extraction. To our knowledge, this is the first time that combines LLME and GC-MS for the analysis of methylsiloxanes in wastewater samples.

Intrasubject repeatability in keratoconus-eye measurements obtained with a new Scheimpflug photography–based system

Purpose: To evaluate in keratoconus eyes the intrasubject repeatability of anterior and posterior corneal curvature and of other anterior segment anatomic measurements obtained with a new topography system combining Scheimpflug-photography and Placido-disk technology. Setting: Vissum Corporation, Alicante, Spain. Design: Evaluation of technology. Methods: All keratoconus eyes had a comprehensive ophthalmologic examination including analysis with the Sirius system. Three consecutive measurements were obtained to assess the intrasubject repeatability of the following parameters: anterior and posterior corneal curvature and shape factor, white-to-white (WTW) corneal diameter, central and minimum corneal thickness, and anterior chamber depth (ACD). The within-subject standard deviation (Sw) and intraclass correlation coefficient (ICC) were calculated. Results: This study comprised 61 eyes of 61 patients ranging in age from 14 to 64 years. For anterior and posterior corneal curvatures and power vector components, the Sw was 0.29 mm or less in all cases. The ICC was above 0.990 in all cases except the flattest curvature of the posterior corneal surface at 3.0 mm, which was 0.840 (moderate agreement), and the posterior power vector J0, which was 0.665 (poor agreement), 0.752, and 0.758 (moderate agreement) for 3.0 mm, 5.0 mm, and 7.0 mm, respectively. In shape factor measurements, the Sw was 0.12 or less in all cases and the ICC ranged between 0.989 and 0.999. Pachymetry, ACD, and WTW had ICC values very close to 1. Conclusion: The new topography system provided repeatable measurements of corneal shape and other anatomic parameters in eyes with keratoconus.

Power line interference filtering on surface electromyography based on the stationary wavelet packet transform

Power line interference is one of the main problems in surface electromyogram signals (EMG) analysis. In this work, a new method based on the stationary wavelet packet transform is proposed to estimate and remove this kind of noise from EMG data records. The performance has been quantitatively evaluated with synthetic noisy signals, obtaining good results independently from the signal to noise ratio (SNR). For the analyzed cases, the obtained results show that the correlation coefficient is around 0.99, the energy respecting to the pure EMG signal is 98–104%, the SNR is between 16.64 and 20.40 dB and the mean absolute error (MAE) is in the range of −69.02 and −65.31 dB. It has been also applied on 18 real EMG signals, evaluating the percentage of energy respecting to the noisy signals. The proposed method adjusts the reduction level to the amplitude of each harmonic present in the analyzed noisy signals (synthetic and real), reducing the harmonics with no alteration of the desired signal.

Repeatability and reproducibility of corneal thickness using SOCT Copernicus HR

Purpose: The aim of this study is to determine the reliability of corneal thickness measurements derived from SOCT Copernicus HR (Fourier domain OCT). Methods: Thirty healthy eyes of 30 subjects were evaluated. One eye of each patient was chosen randomly. Images were obtained of the central (up to 2.0 mm from the corneal apex) and paracentral (2.0 to 4.0 mm) cornea. We assessed corneal thickness (central and paracentral) and epithelium thickness. The intra-observer repeatability data were analysed using the intra-class correlation coefficient (ICC) for a range of 95 per cent within-subject standard deviation (SW) and the within-subject coefficient of variation (CW). The level of agreement by Bland–Altman analysis was also represented for the study of the reproducibility between observers and agreement between methods of measurement (automatic versus manual). Results: The mean value of the central corneal thickness (CCT) was 542.4 ± 30.1 μm (SD). There was a high intra-observer agreement, finding the best result in the central sector with an intra-class correlation coefficient of 0.99, 95 per cent CI (0.989 to 0.997) and the worst, in the minimum corneal thickness, with an intra-class correlation coefficient of 0.672, 95 per cent CI (0.417 to 0.829). Reproducibility between observers was very high. The best result was found in the central sector thickness obtained both manually and automatically with an intra-class correlation coefficient of 0.990 in both cases and the worst result in the maximum corneal thickness with an intra-class correlation coefficient of 0.827. The agreement between measurement methods was also very high with intra-class correlation coefficient greater than 0.91. On the other hand the repeatability and reproducibility for epithelial measurements was poor. Conclusion: Pachymetric mapping with SOCT Copernicus HR was found to be highly repeatable and reproducible. We found that the device lacks an appropriate ergonomic design as proper focusing of the laser beam onto the cornea for anterior segment scanning required that patients were positioned slightly farther away from the machine head-rest than in the setup for retinal imaging.

A quasi-elastic aquifer deformational behavior: Madrid aquifer case study

The purpose of this paper is to analyze the quasi-elastic deformational behavior that has been induced by groundwater withdrawal of the Tertiary detrital aquifer of Madrid (Spain). The spatial and temporal evolution of ground surface displacement was estimated by processing two datasets of radar satellite images (SAR) using Persistent Scatterer Interferometry (PSI). The first SAR dataset was acquired between April 1992 and November 2000 by ERS-1 and ERS-2 satellites, and the second one by the ENVISAT satellite between August 2002 and September 2010. The spatial distribution of PSI measurements reveals that the magnitude of the displacement increases gradually towards the center of the well field area, where approximately 80 mm of maximum cumulated displacement is registered. The correlation analysis made between displacement and piezometric time series provides a correlation coefficient greater than 85% for all the wells. The elastic and inelastic components of measured displacements were separated, observing that the elastic component is, on average, more than 4 times the inelastic component for the studied period. Moreover, the hysteresis loops on the stress–strain plots indicate that the response is in the elastic range. These results demonstrate the quasi-elastic behavior of the aquifer. During the aquifer recovery phase ground surface uplift almost recovers from the subsidence experienced during the preceding extraction phase. Taking into account this unique aquifer system, a one dimensional elastic model was calibrated in the period 1997–2000. Subsequently, the model was used to predict the ground surface movements during the period 1992–2010. Modeled displacements were validated with PSI displacement measurements, exhibiting an error of 13% on average, related with the inelastic component of deformation occurring as a long-term trend in low permeability fine-grained units. This result further demonstrates the quasi-elastic deformational behavior of this unique aquifer system.

A reliable and valid questionnaire was developed to measure computer vision syndrome at the workplace

Objectives: To design and validate a questionnaire to measure visual symptoms related to exposure to computers in the workplace. Study Design and Setting: Our computer vision syndrome questionnaire (CVS-Q) was based on a literature review and validated through discussion with experts and performance of a pretest, pilot test, and retest. Content validity was evaluated by occupational health, optometry, and ophthalmology experts. Rasch analysis was used in the psychometric evaluation of the questionnaire. Criterion validity was determined by calculating the sensitivity and specificity, receiver operator characteristic curve, and cutoff point. Testeretest repeatability was tested using the intraclass correlation coefficient (ICC) and concordance by Cohen’s kappa (k). Results: The CVS-Q was developed with wide consensus among experts and was well accepted by the target group. It assesses the frequency and intensity of 16 symptoms using a single rating scale (symptom severity) that fits the Rasch rating scale model well. The questionnaire has sensitivity and specificity over 70% and achieved good testeretest repeatability both for the scores obtained [ICC 5 0.802; 95% confidence interval (CI): 0.673, 0.884] and CVS classification (k 5 0.612; 95% CI: 0.384, 0.839). Conclusion: The CVS-Q has acceptable psychometric properties, making it a valid and reliable tool to control the visual health of computer workers, and can potentially be used in clinical trials and outcome research.

Screening for Language Disorders in Stroke: German Validation of the Language Screening Test (LAST)

BACKGROUND Screening of aphasia in acute stroke is crucial for directing patients to early language therapy. The Language Screening Test (LAST), originally developed in French, is a validated language screening test that allows detection of a language deficit within a few minutes. The aim of the present study was to develop and validate two parallel German versions of the LAST. METHODS The LAST includes subtests for naming, repetition, automatic speech, and comprehension. For the translation into German, task constructs and psycholinguistic criteria for item selection were identical to the French LAST. A cohort of 101 stroke patients were tested, all of whom were native German speakers. Validation of the LAST was based on (1) analysis of equivalence of the German versions, which was established by administering both versions successively in a subset of patients, (2) internal validity by means of internal consistency analysis, and (3) external validity by comparison with the short version of the Token Test in another subset of patients. RESULTS The two German versions were equivalent as demonstrated by a high intraclass correlation coefficient of 0.91. Furthermore, an acceptable internal structure of the LAST was found (Cronbach's α = 0.74). A highly significant correlation (r = 0.74, p < 0.0001) between the LAST and the short version of the Token Test indicated good external validity of the scale. CONCLUSION The German version of the LAST, available in two parallel versions, is a new and valid language screening test in stroke.

Evaluation of the Relationship Between Saturated Hydraulic Conductivity and Grain-Size Distribution of Fluvio-Glacial Deposits, Puget Lowland, Washington

The relationship between saturated hydraulic conductivity (Ks) and grain-size distribution was evaluated for 49 sites underlain by either glacially over consolidated or normally consolidated fluvio-glacial deposits in the Puget Lowland. A linear regression comprising pairs of grain-size analyses and pilot infiltration tests predicts Ks with a 1 sigma uncertainty of a factor of about 3.5 with 70% of the population variance accounted for. The correlation coefficient R^2 of about 0.90 shows that there is a strong correlation between the grain-size distribution and Ks. In contrast, a widely applied analysis proposed by Massmann (2003) explains only 20% of the population variance for normally consolidated materials with an R^2 of only 0.15. That analysis entirely fails to explain the population variance for over consolidated materials. The method developed in this study is recommended for determination of Ks for fluvio-glacial deposits of the Puget Lowland.

Advantage of single-trial models for response to selection in wheat breeding multi-environment trials

An investigation was conducted to evaluate the impact of experimental designs and spatial analyses (single-trial models) of the response to selection for grain yield in the northern grains region of Australia (Queensland and northern New South Wales). Two sets of multi-environment experiments were considered. One set, based on 33 trials conducted from 1994 to 1996, was used to represent the testing system of the wheat breeding program and is referred to as the multi-environment trial (MET). The second set, based on 47 trials conducted from 1986 to 1993, sampled a more diverse set of years and management regimes and was used to represent the target population of environments (TPE). There were 18 genotypes in common between the MET and TPE sets of trials. From indirect selection theory, the phenotypic correlation coefficient between the MET and TPE single-trial adjusted genotype means [r(p(MT))] was used to determine the effect of the single-trial model on the expected indirect response to selection for grain yield in the TPE based on selection in the MET. Five single-trial models were considered: randomised complete block (RCB), incomplete block (IB), spatial analysis (SS), spatial analysis with a measurement error (SSM) and a combination of spatial analysis and experimental design information to identify the preferred (PF) model. Bootstrap-resampling methodology was used to construct multiple MET data sets, ranging in size from 2 to 20 environments per MET sample. The size and environmental composition of the MET and the single-trial model influenced the r(p(MT)). On average, the PF model resulted in a higher r(p(MT)) than the IB, SS and SSM models, which were in turn superior to the RCB model for MET sizes based on fewer than ten environments. For METs based on ten or more environments, the r(p(MT)) was similar for all single-trial models.

Prediction of protein B-factor profiles

The polypeptide backbones and side chains of proteins are constantly moving due to thermal motion and the kinetic energy of the atoms. The B-factors of protein crystal structures reflect the fluctuation of atoms about their average positions and provide important information about protein dynamics. Computational approaches to predict thermal motion are useful for analyzing the dynamic properties of proteins with unknown structures. In this article, we utilize a novel support vector regression (SVR) approach to predict the B-factor distribution (B-factor profile) of a protein from its sequence. We explore schemes for encoding sequences and various settings for the parameters used in SVR. Based on a large dataset of high-resolution proteins, our method predicts the B-factor distribution with a Pearson correlation coefficient (CC) of 0.53. In addition, our method predicts the B-factor profile with a CC of at least 0.56 for more than half of the proteins. Our method also performs well for classifying residues (rigid vs. flexible). For almost all predicted B-factor thresholds, prediction accuracies (percent of correctly predicted residues) are greater than 70%. These results exceed the best results of other sequence-based prediction methods. (C) 2005 Wiley-Liss, Inc.

Reply to "Comment on 'Signal correlation between two normal-mode helical antennas for diversity reception in a multipath environment'"

This comment points out an inaccurate formula relating the signal correlation coefficient to the mutual impedance and corrects it. © 2005 IEEE.