dKDM5/LID regulates H3K4me3 dynamics at the transcription-start site (TSS) of actively transcribed developmental genes

H3K4me3 is a histone modification that accumulates at the transcription-start site (TSS) of active genes and is known to be important for transcription activation. The way in which H3K4me3 is regulated at TSS and the actual molecular basis of its contribution to transcription remain largely unanswered. To address these questions, we have analyzed the contribution of dKDM5/LID, the main H3K4me3 demethylase in Drosophila, to the regulation of the pattern of H3K4me3. ChIP-seq results show that, at developmental genes, dKDM5/LID localizes at TSS and regulates H3K4me3. dKDM5/LID target genes are highly transcribed and enriched in active RNApol II and H3K36me3, suggesting a positive contribution to transcription. Expression-profiling show that, though weakly, dKDM5/LID target genes are significantly downregulated upon dKDM5/LID depletion. Furthermore, dKDM5/LID depletion results in decreased RNApol II occupancy, particularly by the promoter-proximal Pol lloser5 form. Our results also show that ASH2, an evolutionarily conserved factor that locates at TSS and is required for H3K4me3, binds and positively regulates dKDM5/LID target genes. However, dKDM5/LID and ASH2 do not bind simultaneously and recognize different chromatin states, enriched in H3K4me3 and not, respectively. These results indicate that, at developmental genes, dKDM5/LID and ASH2 coordinately regulate H3K4me3 at TSS and that this dynamic regulation contributes to transcription.

PAX5 activates the transcription of the human telomerase reverse transcriptase gene in B cells.

Telomerase is an RNA-dependent DNA polymerase that synthesizes telomeric DNA. Its activity is not detectable in most somatic cells but it is reactivated during tumorigenesis. In most cancers, the combination of hTERT hypermethylation and hypomethylation of a short promoter region is permissive for low-level hTERT transcription. Activated and malignant lymphocytes express high telomerase activity, through a mechanism that seems methylation-independent. The aim of this study was to determine which mechanism is involved in the enhanced expression of hTERT in lymphoid cells. Our data confirm that in B cells, some T cell lymphomas and non-neoplastic lymph nodes, the hTERT promoter is unmethylated. Binding sites for the B cell-specific transcription factor PAX5 were identified downstream of the ATG translational start site through EMSA and ChIP experiments. ChIP assays indicated that the transcriptional activation of hTERT by PAX5 does not involve repression of CTCF binding. In a B cell lymphoma cell line, siRNA-induced knockdown of PAX5 expression repressed hTERT transcription. Moreover, ectopic expression of PAX5 in a telomerase-negative normal fibroblast cell line was found to be sufficient to activate hTERT expression. These data show that activation of hTERT in telomerase-positive B cells is due to a methylation-independent mechanism in which PAX5 plays an important role.

Growth and functionalization of carbon nanotubes on quartz filter for environmental applications

Background: Air pollution has become an important issue worldwide due to its adverse health effects. Among the different air contaminants, volatile organic compounds (VOCs) are liquids or solids with a high vapor pressure at room temperature that are extremely dangerous for human health. Removal of these compounds can be achieved using nanomaterials with tailored properties such as carbon nanotubes. Methods: Vertically-aligned multiwall carbon nanotubes (CNTs) were successfully grown on quartz filters by means of plasma enhanced chemical vapor deposition (PECVD). Furthermore, a plasma treatment was performed in order to modify the surface properties of the CNTs. The adsorption/desorption processes of three chlorinated compounds (trichloroethylene, 1,2-dichlorobenzene and chloroform) on the CNTs were studied using mass spectrometry measurements with a residual gas analyzer. Results: The adsorption capability of the CNTs increased after functionalization of their surface with a water plasma treatment. In addition, it was found that the presence of aromatic rings, water solubility and polarity of the VOCs play an important role on the adsorption/desorption kinetics at the CNTs surface. Conclusions: This study demonstrates the applicability of CNTs deposited on quartz filters for the removal or selective detection of volatile organic compounds (VOCs). The presence of aromatic rings in VOCs results in π -stacking interactions with a significant increase of their adsorption. On the other hand, it was found that CNTs surface interactions increase with water solubility and polarity of the VOC.

Indol-butyric acid levels on cashew cloning by air-layering process

A study was conducted to determine the possibility of cashew (Anacardium occidentale) cloning by air-layering and influence of IBA (indol-butyric acid) on this process. It was adopted a completely randomized design with 4 treatments, 10 air layers each and 4 replications, reaching 160 air layers. The IBA levels on the treatments were, as follow: 0, 1000, 3000 and 5000 mg.kg-1. It was evaluated: survival, callus and rooting percentage, average number and length of roots. The highest survival rate (67.5%) was registered with no growth regulator and IBA at 1000 mg.kg-1, while the best rooting percentage (82%) referred to 1000 mg.kg-1. In spite of average number and length of roots, the highest results were observed with IBA at 5000 mg.kg-1. IBA concentrations had no influence on cashew air-layering formation.

Physical and chemical characterization of yellow mangosteen fruits

The work had as objective the physico-chemical characterization of yellow mangosteen fruits. Six samples of 25 fruits were harvested in yellow mangosteen plants of the Active Germoplasm Bank of São Paulo State University and characterized by evaluation of length and width, weight, percentage and number of seeds per fruit, peel and pulp percentage, soluble solid (SS), titratable acidity (TA), vitamin C and SS/TA rate. Yellow mangosteen fruit is an intermediate vitamin C source with an average content 120.33 mg/100g of fresh fruit and has good technological quality.

Armazenamento de sementes de doviális (Dovyalis caffra)

O trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar os efeitos do tempo e ambiente de armazenamento na emergência de plântulas de doviális (Dovyalis caffra), espécie frutífera arbustiva de sementes recalcitrantes. Foi adotado o delineamento experimental inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3 x 5, correspondendo às condições ambientais de armazenamento: câmara seca (18±2ºC e 60% de UR), em condição ambiente (sem controle) e em câmara fria (10±2ºC e 70% de UR); e aos períodos de armazenamento 0; 7; 14; 21 e 28 dias. Esses efeitos foram avaliados para o cálculo da percentagem de emergência (%E) e índice de velocidade de emergência (IVE). Os ambientes de armazenamento não exerceram efeito estatístico significativo nas variáveis estudadas, diferentemente dos períodos de armazenamento, onde as mais altas %E e IVE foram observadas ao 14º dia de armazenamento. A partir do 14º dia de armazenamento, ocorreu uma redução na %E e IVE.

Estaquia como processo de clonagem do bacuripari (Redhia gardneriana Miers ex Planch e Triana)

No Brasil, existem diversas fruteiras nativas com potencial de exploração comercial, especialmente na Amazônia, local de origem do bacuripari. Neste sentido, realizou-se um trabalho com o objetivo de avaliar a clonagem dessa espécie pelo processo da estaquia, mediante uso de ácido indolil-3-butírico (AIB), em condições de nebulização intermitente. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, com 5 tratamentos, caracterizados pelas concentrações de AIB (0; 1.000; 3.000; 5.000 e 7.000 mg.L-1), com 4 repetições e 10 estacas por parcela. Foram avaliados na porcentagem de estacas enraizadas, o número médio de folhas e o comprimento de raízes. O uso de AIB não influenciou na porcentagem de enraizamento.

Clonagem do abacateiro variedade "Duke 7" (Persea americana Mill.) por alporquia

Foram conduzidos dois experimentos com a finalidade de determinar a possibilidade de clonagem da variedade de abacateiro "Duke 7", por alporquia e a influência do AIB (ácido indol-3-butírico) no processo. Experimento 1 - Alporque em plantas - O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2L x 4N x 2E, correspondendo à manutenção ou não das plantas à ausência de luz (L), níveis de AIB (N) e tipo de estrutura (E). Nos quatro dias antecedentes à realização da alporquia, 50% das plantas permaneceram na ausência total de luz (L1), e as demais, em condições normais de ripado, 50% de luminosidade (L2). No local anelado, foram aplicadas as concentrações (N) de AIB (ácido indolbutírico): 0; 1.000, 3.000 e 5.000 mg kg-1. O experimento foi realizado em duas estruturas diferenciadas pelo tipo de cobertura: a estrutura um (E1) e a estrutura dois (E2), diferenciadas pela temperatura e intensidade luminosa. Experimento 2- Alporque em plantas adultas após poda drástica - Os alporques foram realizados cinco meses após a poda drástica, quando os ramos possuíam entre 1,5 e 2,0 cm de diâmetro. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado em esquema fatorial, com 4 tratamentos, caracterizados pelas concentrações de AIB (0; 1.000; 3.000 e 5.000 mg kg-1), com quatro repetições, e cada parcela composta por 10 alporques. Em nenhum dos experimentos, houve enraizamento dos alporques, consequentemente há necessidade de maiores estudos, quanto à clonagem da variedade "Duke 7" para viabilizá-la como porta-enxerto.

Influência da época do ano no sucesso da enxertia nas variedades de abacateiro Hass e Fortuna

O objetivo do trabalho foi avaliar a influência da época no pegamento da enxertia em abacateiro das variedades Hass e Fortuna, mensalmente, no período de doze meses. As plantas utilizadas pertencem ao Banco de Germoplasma do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias - UNESP, Câmpus de Jaboticabal-SP. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2 x 12 ('Hass' e 'Fortuna' e os períodos de enxertia), no intervalo de março de 2005 a fevereiro de 2006, com 10 unidades por parcela, repetidas por quatro vezes. O método utilizado foi a enxertia por garfagem de topo em fenda cheia. As avaliações, 90 dias após a instalação do experimento, foram quanto à porcentagem de pegamento, desenvolvimento total das combinações (porta-enxerto/ enxerto), número de brotações do enxerto, diâmetros acima, abaixo e no local de união do enxerto. O período mais indicado para o sucesso da enxertia está compreendido entre os meses de novembro e dezembro para ambas as variedades de abacateiro.

Adubação orgânica e intensidade luminosa no crescimento e desenvolvimento inicial da Pitaya em Bom Jesus-PI

A pitaya é uma cactácea de sub-bosque, originária de florestas tropicais do México e das Américas Central e do Sul, pouco estudada no Brasil, principalmente quanto à sua resposta à intensidade luminosa e adubação. Nesse sentido, realizou-se um experimento objetivando avaliar crescimento e desenvolvimento inicial da pitaya em função da intensidade luminosa e adubação orgânica. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, com tratamentos distribuídos em esquema fatorial 5 x 3, referentes, respectivamente, aos níveis de adubação orgânica (0; 5; 10; 20 e 30 L de esterco bovino cova-1) e aos percentuais de luz (0; 50 e 75% de sombreamento), com quatro repetições. Foram avaliados semanalmente diâmetro do cladódio (mm), altura de estacas (cm) e comprimento do ramo secundário (cm); ao final do experimento, massa fresca da parte aérea e massas secas de raiz e parte aérea (g), sendo que para as variáveis mensuradas, semanalmente, foram calculados os respectivos incrementos percentuais semanais. Segundo os resultados do presente trabalho, no cultivo da pitaya, é necessário o uso de cobertura contra a incidência direta dos raios solares, onde as estruturas com 50% ou 75% de luminosidade podem ser usadas. O fornecimento de 20 L cova-1 de esterco bovino pode ser adotado como quantitativo no preparo de covas de pitaya, nas condições de clima e solo de Bom Jesus-PI.