Direct evidence for a predominantly exolytic processive mechanism for depolymerization of heparin-like glycosaminoglycans by heparinase I

Heparinase I from Flavobacterium heparinum has important uses for elucidating the complex sequence heterogeneity of heparin-like glycosaminoglycans (HLGAGs). Understanding the biological function of HLGAGs has been impaired by the limited methods for analysis of pure or mixed oligosaccharide fragments. Here, we use methodologies involving MS and capillary electrophoresis to investigate the sequence of events during heparinase I depolymerization of HLGAGs. In an initial step, heparinase I preferentially cleaves exolytically at the nonreducing terminal linkage of the HLGAG chain, although it also cleaves internal linkages at a detectable rate. In a second step, heparinase I has a strong preference for cleaving the same substrate molecule processively, i.e., to cleave the next site toward the reducing end of the HLGAG chain. Computer simulation showed that the experimental results presented here from analysis of oligosaccharide degradation were consistent with literature data for degradation of polymeric HLGAG by heparinase I. This study presents direct evidence for a predominantly exolytic and processive mechanism of depolymerization of HLGAG by heparinase I.

Computer-modeling origin of a simple genetic apparatus

This computer simulation is based on a model of the origin of life proposed by H. Kuhn and J. Waser, where the evolution of short molecular strands is assumed to take place in a distinct spatiotemporal structured environment. In their model, the prebiotic situation is strongly simplified to grasp essential features of the evolution of the genetic apparatus without attempts to trace the historic path. With the tool of computer implementation confining to principle aspects and focused on critical features of the model, a deeper understanding of the model's premises is achieved. Each generation consists of three steps: (i) construction of devices (entities exposed to selection) presently available; (ii) selection; and (iii) multiplication of the isolated strands (R oligomers) by complementary copying with occasional variation by copying mismatch. In the beginning, the devices are single strands with random sequences; later, increasingly complex aggregates of strands form devices such as a hairpin-assembler device which develop in favorable cases. A monomers interlink by binding to the hairpin-assembler device, and a translation machinery, called the hairpin-assembler-enzyme device, emerges, which translates the sequence of R1 and R2 monomers in the assembler strand to the sequence of A1 and A2 monomers in the A oligomer, working as an enzyme.

Objetos de aprendizagem: limitações funcionais no ensino médio e aplicabilidade no ensino de física sob uma perpectiva vigostkiana

Neste trabalho fazemos uma revisão das novas tecnologias da informação e comunicação (TIC), definindo o que são Objetos de Aprendizagem (OA) e como eles têm sido utilizados no ensino de Física. Revisamos ainda o trabalho de Vigotski buscando indicações de sua teoria educacional para investigar a aplicabilidade de atividades didáticas em ensino de Física que lancem mão de OA no ensino médio. Elaboramos um instrumento de pesquisa voltado para professores do ensino médio para avaliar seu efetivo uso nas escolas públicas e privadas brasileiras e as limitações funcionais por eles identificadas ao utilizarem esses recursos computacionais. Com base na literatura, e sob uma ótica vigotskiana, aplicamos algumas atividades com OA pré-selecionados e avaliamos com outro instrumento de pesquisa a opinião dos alunos quanto ao seu uso para o ensino de Física. Nosso trabalho pôde corroborar a boa aceitação por parte dos alunos com relação ao seu uso, já divulgada na literatura e também por parte dos professores, mas mostrou que para além das limitações de uso dos OA, especialmente das simulações computacionais, destacadas na literatura e relacionadas às limitações cognitivas que elas podem trazer quando utilizadas de maneira indiscriminada, existem problemas mais profundos de natureza funcional que têm limitado a disseminação de seu uso efetivo pelo corpo docente.

O efeito da estimulação top-down e bottom-up no potencial evocado auditivo de tronco encefálico com estímulo complexo

Introdução: Crianças com transtorno fonológico (TF) apresentam dificuldade na percepção de fala, em processar estímulos acústicos quando apresentados de forma rápida e em sequência. A percepção dos sons complexos da fala, dependem da integridade no processo de codificação analisado pelo Sistema Nervoso Auditivo. Por meio do Potencial Evocado Auditivo de Tronco Encefálico com estímulo complexo (PEATEc) é possível investigar a representação neural dos sons em níveis corticais e obter informações diretas sobre como a estrutura do som da sílaba falada é codificada no sistema auditivo. Porém, acredita-se que esse potencial sofre interferências tanto de processos bottom-up quanto top-down, o que não se sabe é quanto e como cada um desses processos modifica as respostas do PEATEc. Uma das formas de investigar a real influência dos aspectos top-down e bottom-up nos resultados do PEATEc é estimulando separadamente esses dois processos por meio do treinamento auditivo e da terapia fonoaudiológica. Objetivo: Verificar o impacto da estimulação sensorial (processamento bottom-up) e cognitiva (processamento top-down), separadamente, nos diferentes domínios da resposta eletrofisiológica do PEATEc. Método: Participaram deste estudo 11 crianças diagnosticadas com TF, com idades entre 7 e 10:11, submetidas a avaliação comportamental e eletrofisiológica e então dividas nos grupos Bottom-up (B-U) (N=6) e Top-down T-D (N=5). A estimulação bottom-up foi voltada ao treinamento das habilidades sensoriais, através de softwares de computador. A estimulação top-down foi realizada por meio de tarefas para estimular as habilidades cognitiva por meio do Programa de Estimulação Fonoaudiológica (PEF). Ambas as estimulações foram aplicadas uma vez por semana, num período de aproximadamente 45 minutos por 12 semanas. Resultados: O grupo B-U apresentou melhoras em relação aos domínios onset e harmônicos e no valor da pontuação do escore após ser submetido à estimulação bottom-up. Por sua vez, após serem submetidos à estimulação top-down, o grupo T-D apresentou melhoras em relação aos domínios onset, espectro-temporal, fronteiras do envelope e harmônicos e para os valores da pontuação do escore. Conclusão: Diante dos resultados obtidos neste estudo, foi possível observar que a estimulação sensorial (processamento bottom-up) e a estimulação cognitiva (processamento top-down) mostraram impactar de forma diferente a resposta eletrofisiológica do PEATEc

Graphical remote-access simulation system (GRASS), the communication and monitor components (GASP/GLASP).

"Supported in part by contract U.S. AEC AT(11-1)1469."

A universal language for continuous network simulation /

Typescript.

A multiprocessor for simulation applications.

Vita.

Scheduling and simulation of computation graphs for multiple resource computers /

"UILU Eng 79 1709."

A GPSS simulation of the 360/75 under HASP and O.S. 360.

Mode of access: Internet.

The pattern articulation unit of Illiac III: simulation,

"COO-1018-1154."

Simulation analysis of a pay-for-priority scheme for the IBM 360/75 /

Thesis (M.S.) - University of Illinois at Urbana-Champaign.

Simulation system programming design manual /

"Contract no. N61339-1089."

Demand bibliography : simulation /

"Results from a search of the technical report database ... references cover only unclassified, unlimited document references with abstracts."

Computer model documentation guide /

Item 247.

Hormone replacement therapy and everyday memory in mid-aged New Zealand women

While empirical research to date has generally supported positive effects of estrogen on verbal memory performance in women, the literature examining specific effects of Hormone Replacement Therapy (HRT) on cognitive functioning in mid-life women is more equivocal. The Rivermead Behavioural Memory Test-Extended Version (RBMT-E), a measure of everyday memory functioning in adults within an average range of cognitive functioning, was administered to a sample of 104 New Zealand women aged 40 to 60 years who had self-selected to either use or not use HRT (53 HRT users and 51 non-users). Self-report. measures of mood, stress, general health and menopausal symptoms were also administered. These variables, along with age and education level, were used in analyses of group differences on the everyday memory measures. Results showed significant differences between the groups for three sub-tests of the RBMT-E:'Story Immediate', 'Story Delayed', and 'Message Delayed'. Women who use HRT scored higher on these subtests than those who do not use HRT. After calculation of a total profile score (adjusting for age and IQ), HRT users score higher than HRT non-users on the RBMT-E overall measure of Everyday Memory. These pilot results suggest that HRT use in this sample-is related to enhanced verbal memory in everyday memory tasks and that the RBMT-E may be a useful tool for further work in this area of research.