Effects of the administration of pentoxifylline and prednisolone on the evolution of portal fibrogenesis secondary to biliary obstruction in growing animals: immunohistochemical analysis of the expression of TGF-BETA; and VEGF

OBJECTIVE: During the neonatal and infancy periods, some chronic liver diseases may lead to progressive hepatic fibrosis, which is a condition that can ultimately result in the loss of organ function and severe portal hypertension necessitating hepatic transplantation. In a previous report, pharmacological interventions were demonstrated to modulate hepatic fibrosis induced by bile duct ligation in young rats. The administration of pentoxifylline or prednisolone, or the combination of both, resulted in reduced fibrogenesis in portal spaces. The objectives of the present study were to evaluate the expression of transforming growth factor beta and vascular endothelial growth factor after bile duct ligation in young rats and to assess the effect of those same drugs on cytokine expression. METHODS: In this experimental study, 80 young rats (21 or 22 days old) were submitted either to laparotomy and common bile duct ligation or to sham surgery. The animals were allocated into four groups according to surgical procedure, and the following treatments were administered: (1) common bile duct ligation + distilled water, (2) sham surgery + distilled water, (3) common bile duct ligation + pentoxifylline, or (4) common bile duct ligation + prednisolone. After 30 days, a hepatic fragment was collected from each animal for immunohistochemical analysis using monoclonal antibodies against transforming growth factor beta and vascular endothelial growth factor. Digital morphometric and statistical analyses were performed. RESULTS: The administration of pentoxifylline reduced the transforming growth factor beta-marked area and the amount of transforming growth factor beta expressed in liver tissue. This effect was not observed after the administration of prednisolone. There was a significant reduction in vascular endothelial growth factor expression after the administration of either drug compared with the non-treatment group. CONCLUSIONS: The administration of pentoxifylline to cholestatic young rats resulted in the diminished expression of transforming growth factor beta and vascular endothelial growth factor in liver tissue. The administration of steroids resulted in the diminished expression of vascular endothelial growth factor only. These pathways may be involved in hepatic fibrogenesis in young rats submitted to bile duct ligation and exposed to pentoxifylline or prednisolone.

A new portal for the analysis of human splicing variants

Understanding alternative splicing is crucial to elucidate the mechanisms behind several biological phenomena, including diseases. The huge amount of expressed sequences available nowadays represents an opportunity and a challenge to catalog and display alternative splicing events (ASEs). Although several groups have faced this challenge with relative success, we still lack a computational tool that uses a simple and straightforward method to retrieve, name and present ASEs. Here we present SPLOOCE, a portal for the analysis of human splicing variants. SPLOOCE uses a method based on regular expressions for retrieval of ASEs. We propose a simple syntax that is able to capture the complexity of ASEs.

Portal de Busca Integrada

O SIBiUSP lançou em março de 2012 uma nova ferramenta de busca de conteúdos acadêmicos/científicos, o nome dado foi Portal de Busca Integrada. Esta ferramenta pertence à uma categoria de softwares intitulada de “Web Scale Discovery”, que permitem a integração de diversas e dispersas fontes de dados em uma única interface de busca e entrega de resultados. Dessa forma, apresentam-se aqui os processos de seleção e implantação desta solução.

Effects of the administration of pentoxifylline and prednisolone on the evolution of portal fibrogenesis secondary to biliary obstruction in growing animals: immunohistochemical analysis of the expression of TGF-β and VEGF

OBJECTIVE: During the neonatal and infancy periods, some chronic liver diseases may lead to progressive hepatic fibrosis, which is a condition that can ultimately result in the loss of organ function and severe portal hypertension necessitating hepatic transplantation. In a previous report, pharmacological interventions were demonstrated to modulate hepatic fibrosis induced by bile duct ligation in young rats. The administration of pentoxifylline or prednisolone, or the combination of both, resulted in reduced fibrogenesis in portal spaces. The objectives of the present study were to evaluate the expression of transforming growth factor β and vascular endothelial growth factor after bile duct ligation in young rats and to assess the effect of those same drugs on cytokine expression. METHODS: In this experimental study, 80 young rats (21 or 22 days old) were submitted either to laparotomy and common bile duct ligation or to sham surgery. The animals were allocated into four groups according to surgical procedure, and the following treatments were administered: (1) common bile duct ligation + distilled water, (2) sham surgery + distilled water, (3) common bile duct ligation + pentoxifylline, or (4) common bile duct ligation + prednisolone. After 30 days, a hepatic fragment was collected from each animal for immunohistochemical analysis using monoclonal antibodies against transforming growth factor β and vascular endothelial growth factor. Digital morphometric and statistical analyses were performed. RESULTS: The administration of pentoxifylline reduced the transforming growth factor β-marked area and the amount of transforming growth factor β expressed in liver tissue. This effect was not observed after the administration of prednisolone. There was a significant reduction in vascular endothelial growth factor expression after the administration of either drug compared with the non-treatment group. CONCLUSIONS: The administration of pentoxifylline to cholestatic young rats resulted in the diminished expression of transforming growth factor β and vascular endothelial growth factor in liver tissue. The administration of steroids resulted in the diminished expression of vascular endothelial growth factor only. These pathways may be involved in hepatic fibrogenesis in young rats submitted to bile duct ligation and exposed to pentoxifylline or prednisolone.

El Open Journal Systems en la Universidade de São Paulo: la experiencia de gestión del Portal de Revistas da USP

El objeto de este poster es presentar la experiencia de manejamiento de un portal de revistas científicas de acceso abierto, en una universidad pública y que integra los editores científicos, profesores y bibliotecarios. Iniciativas de esta naturaleza tienen importancia estratégica para la consolidación y el fortalecimiento del Movimiento de Acceso Abierto en los países en desarrollo, puesto que ofrecen la oportunidad de se vivir plenamente una cultura de acceso abierto en todas las etapas de certificación del conocimiento. La experiencia de la Universidade de São Paulo, se convierte en relevante, ya que promueve la integración de los diversos actores involucrados en la producción de revistas científicas. El Portal de Revistas da USP (http://www.revistas.usp.br), lanzado en 2008, es una iniciativa del Departamento Técnico do Sistema Integrado de Bibliotecas de USP que tiene el Programa de Apoio às Publicações Científicas Periódicas da USP. Esta iniciativa, basada en los principios del Movimiento de Acceso Abierto, tiene como objetivo promover la visibilidad y la accesibilidad de las revistas científicas publicadas oficialmente por la USP. Considerase que las revistas cumplen con un doble papel, como objeto y también vehículo de comunicación. Con esto las inversiones para calificación de las revistas incluyen recursos informáticos para garantizar la interoperabilidad entre distintos sistemas de información (bases de datos, catálogos, repositorios etc.), sistemas de gestión editorial en línea (para agilizar la tramitación de los manuscritos y la disminución de la publicación); la formación de los equipos (técnicos y bibliotecarios), atribuición de nomes DOI (digital object identifier), software de verificación de plágio. En 2012 se cambió el software de gestión del Portal para Open Journal Systems - OJS por lo cual se reunió por la primera vez, en um mismo dominio web las revistas científicas editadas en USP. De las más de 100 revistas publicadas en el Portal 29 están en DOAJ, 27 en SciELO Brasil, 20 en Scopus, 11 en JCR entre outros. En el Portal hay revistas con distintos perfiles, unas más institucionales y otras de calidad internacional. Algunas revistas más antíguas y consolidadas se utilizan de distintos sistemas de gestión de los manuscriptos y en el Portal es como un espejo para garantizar la presencia en la Universidad. Con tantas y tan distintas publicaciones el OJS se presenta como una promisora herramienta para la gestión del Portal de Revistas. El OJS surge como un sistema para la gestión individual de revistas científicos y con los avances de las tecnologías y principalmente del uso por la comunidad se conviertió en herramienta de gestión de Portal. Para una mejor gestión del Portal se presenta algunas recomendaciones, basadas en la experiencia, y que podrán mejorar el trabajo de gestión del conjunto de las revistas: en la pantalla de creación de revistas se deberá incluir todos los datos del registro oficial en ISSN, sin posibilidad de edición por los editores-gerentes; en el listado general de revistas se podría incluir una indicación de las revistas que están en línea y las que están aún en configuración; clara identificación de las revistas vigentes y no-vigentes, una vinculación mas clara de las revistas que cambiaran su título y que están vigentes; una tabla para selección de fuentes de indización; edición de contenidos ya publicados solamente por el administrador del sistema; gestión centralizada del DOI y de la preservación digital en LOCKSS y un painel con los datos estadísticos (total de revistas, ediciones, estatísticas Counter, autores etc). Además el fortalecimiento y creación de centros de desarrollo de OJS en las Universidades Latinoamericanas podría impulsionar el uso del sistema en su totalidad por los editores de la región.

Portal de Busca Integrada do SIBiUSP: metodologia de implantação

Relata o estudo, a instalação e implantação de ferramenta de descoberta e entrega do Portal de Busca Integrada, para o Sistema Integrado de Bibliotecas da Universidade de São Paulo (SIBiUSP). Esta nova interface denominada Portal de Busca Integrada possibilita uma nova experiência de pesquisa científica ao usuário final pela recuperação de literatura em diferentes fontes de informação.

Portal de revistas da USP

O Portal de Revistas da USP apresenta-se como uma estratégia do Sistema Integrado de Bibliotecas, por meio de seu Programa de Apoio às Publicações Científicas Periódicas, para aumentar a visibilidade e acessibilidade das revistas científicas da Universidade de São Paulo. Para fazer parte deste Programa as revistas devem cumprir com critérios de qualidade, definidos por uma Comissão de Credenciamento, formada por professores e bibliotecários, e pautados em padrões internacionais. Atualmente 62 publicações estão credenciadas neste Programa.

Estudo das complicações do cateter totalmente implantável em oncologia pediátrica: Comparação entre a punção da veia jugular interna e da veia subclávia no implante do cateter

Objetivo: Avaliar, por estudo prospectivo, a incidência de complicações relacionadas ao implante e uso de cateteres de longa permanência totalmente implantáveis (CLP) em crianças com câncer, comparando o implante por punção em veia subclávia (SCL) com o implante por punção em veia jugular interna (J). Método: estudo prospectivo com randomização da escolha da punção em veia subclávia ou veia jugular interna para o implante do cateter. Foram considerados como desfechos as complicações que levaram a retirada ou revisão do cateter. Resultados: 83 implantes foram randomizados no período de janeiro de 2004 a abril de 2006 e acompanhados até março de 2008. Dos 83 implantes selecionados 6 foram excluídos, permanecendo 43 pacientes no grupo SCL e 34 no grupo J. Não houve diferença estatística entre os dois grupos em relação à: distribuição por idade, sexo, número de leucócitos no implante, número de plaquetas, tipo de internação para cirurgia (ambulatorial ou não), se houve quimioterapia prévia ao implante e quanto ao tipo de cateter. Na avaliação das complicações se observou, incidência de infecção de 20% no grupo SCL e 11% no grupo J (p: 0,44), incidência de embolia de 23% no grupo SCL e 8% no grupo J (p: 0,11), e incidência de complicações total de 51% no grupo SCL e 23% no grupo J (p 0,02). A média do tempo de permanência do cateter foi de 12,6 meses para o grupo SCL e 14,8 para o grupo J (p: 0,38). A análise por regressão logística mostrou que o peso (p: 0,001) é um fator de risco envolvido com a infecção; e o peso (p: 0,020) e a marca do cateter (p: 0,03) são fatores de risco para embolia. Conclusões: há maior incidência de complicações tardias no grupo SCL. Os pacientes com menor peso tiveram risco maior de desenvolver infecção. Pacientes com menor peso e a marca do cateter são fatores de risco para a ocorrência de embolia do cateter

Efeitos da oxigenoterapia hiperbárica em lesões actícas da veia cava e aorta infra-renal. Estudo experimental em ratos

Objetivos: Estudar o efeito da Oxigenoterapia Hiperbárica sobre as lesões causadas pela radiação ionizante na veia cava e aorta. Método: Foram utilizados 32 ratos adultos distribuídos aleatoriamente em 4 grupos: 3 no grupo controle; 10 no grupo oxigenoterapia hiperbárica (5 sessões e 3 ATA e após 3 dias, operados), 9 no grupo radioterapia (8 sessões de 5Gy, atingindo 54Gy, sendo operados após 7 dias), 10 no grupo radioterapia e oxigenoterapia hiperbárica (procedimento radioterapia, observação por 7 dias, submetidos a 5 sessões de oxigenoterapia hiperbárica e após 3 dias, são operados. Ressecamos a veia cava e aorta infrarenal para estudo morfológico (integridade endotelial, infiltrado inflamatório e integridade da vasa-vasorum), avaliação do ciclo celular pelo método do AgNOR e índice de apoptose nas distintas camadas dos vasos, através da Caspase-3 (imuno-histoquímica). Resultados: O grupo radioterapia – oxigenoterapia hiperbárica apresentou diminuição estatisticamente significativa das alterações morfológicas em vasa-vasorum, aumento da atividade celular na camada média e também diminuição do índice de apoptose nas camadas íntima e média da aorta infra-renal quando comparados ao grupo apenas submetidos à radiação ionizante. A lesões rádio induzidas na veia cava não apresentaram melhora significativa com a oxigenoterapia hiperbárica Conclusão: A oxigenoterapia hiperbárica é capaz de minimizar as lesões radio-induzidas em fase aguda em aorta.

Portal de Accesibilidad y Comunicación

[ES]La educación inclusiva surge del convencimiento de que el derecho a la educación es un derecho universal que está en la base de una sociedad más justa. Uno de los ejes de este tipo de educación, entre otros, es la creación de entornos universales adaptados, e implica el acceso en condiciones de igualdad a una educación de calidad. En un campus inclusivo la herramienta on-line: PORTAL DE ACCESIBILIDAD Y COMUNICACIÓN (PAC) es una estrategia para la participación de la comunidad universitaria en donde cualquiera de sus miembros puede valorar la aplicación de las normas vigentes en materia de accesibilidad universal y proponer mejoras. La Universidad está llamada a ser un referente en la asunción de los derechos humanos, promoción del voluntariado y la no discriminación.

Portal hypertension: a comparison between portal-venous pressure measurement and ARFI measurement of liver and spleen stiffness

PURPOSE. Portal pressure is measured invasively as Hepatic Venous Pressure Gradient (HVPG) in the angiography room. Liver stiffness measured by Fibroscan was shown to correlate with HVPG values below 12 mmHg. This is not surprising, since in cirrhosis the increase of portal pressure is not directly linked with liver fibrosis and consequently to liver stiffness. We hypothesized that, given the spleen’s privileged location upstream to the whole portal system, splenic stiffness could provide relevant information about portal pressure. Aim of the study was to assess the relationship between liver and spleen stiffness measured by Virtual Touch™ (ARFI) and HVPG in cirrhotic patients. METHODS. 40 consecutive patients (30 males, mean age 62y, mean BMI=26, mean Child-Pugh A6, mean platelet count=92.000/mmc, 19 HCV+, 7 with ascites) underwent to ARFI stiffness measurement (10 valid measurements in right liver lobe both surface and centre, left lobe and 20 in the spleen) and HPVG, blindly to each other. Median ARFI values of 10 samplings on every liver area and of 20 samplings on spleen were calculated. RESULTS. Stiffness could be easily measured in all patients with ARFI, resulting a mean of 2,61±0,76, 2,5±0,62 and 2,55±0,66 m/sec in the liver areas and 3.3±0,5 m/s in the spleen. Median HPVG was 14 mmHg (range 5-27); 28 patients showed values ≥10 mmHg. A positive significant correlation was found between spleen stiffness and HPVG values (r=0.744, p<0.001). No significant correlation was found between all liver stiffness and HVPG (p>0,05). AUROC was calculated to test spleen stiffness ability in discriminating patients with HVPG ≥10. AUROC = 0.911 was obtained, with sensitivity of 69% and specificity of 91% at a cut-off of 3.26 m/s. CONCLUSION. Spleen stiffness measurement with ARFI correlates with HVPG in patients with cirrhosis, with a potential of identifying patients with clinically significant portal hypertension.

Evoluzione tecnologica in ambito End User Computing: un caso d'uso basato su Horizon Workspace Portal

L'obbiettivo del progetto di cui tratta questa tesi è costituire un ambiente intuitivo e facilmente utilizzabile dall'utente finale che permetta di accedere sia alle applicazioni aziendali sia ai desktop virtuali da qualsiasi dispositivo effettui l'accesso. Grazie alle recenti tecnologie di End User Computing messe a disposizione da VMware è possibile virtualizzare qualsiasi applicazione Windows e renderla disponibile tramite Internet a qualsiasi utente la richieda, indifferentemente dal sistema operativo o dal luogo in cui si trova. Il progetto descritto nella tesi spiega come implementare tale ambiente tramite il prodotto Horizon Workspace Portal integrato nella suite Horizon 6.

NCX-1000, a nitric oxide-releasing derivative of UDCA, does not decrease portal pressure in patients with cirrhosis: results of a randomized, double-blind, dose-escalating study

NCX-1000 (2(acetyloxy) benzoic acid-3(nitrooxymethyl)phenyl ester) is an nitric oxide (NO)-releasing derivative of ursodeoxycholic acid (UDCA), which showed selective vasodilatory effect on intrahepatic circulation in animal models of cirrhosis. This study was aimed at testing the efficacy and tolerability of this compound in patients with cirrhosis and portal hypertension.

Hepatic-portal vein infusions of glucagon-like peptide-1 reduce meal size and increase c-Fos expression in the nucleus tractus solitarii, area postrema and central nucleus of the amygdala in rats

We recently reported that brief, remotely controlled intrameal hepatic-portal vein infusions of glucagon-like peptide-1 (GLP-1) reduced spontaneous meal size in rats. To investigate the neurobehavioural correlates of this effect, we equipped male Sprague-Dawley rats with hepatic-portal vein catheters and assessed (i) the effect on eating of remotely triggered infusions of GLP-1 (1 nmol/kg, 5 min) or vehicle during the first nocturnal meal after 3 h of food deprivation and (ii) the effect of identical infusions performed at dark onset on c-Fos expression in several brain areas involved in the control of eating. GLP-1 reduced (P < 0.05) the size of the first nocturnal meal and increased its satiety ratio. Also, GLP-1 increased (P < 0.05) the number of c-Fos-expressing cells in the nucleus tractus solitarii, the area postrema and the central nucleus of the amygdala, but not in the arcuate or paraventricular hypothalamic nuclei. These data suggest that the nucleus tractus solitarii, the area postrema and the central nucleus of the amygdala play a role in the eating-inhibitory actions of GLP-1 infused into the hepatic-portal vein; it remains to be established whether activation of these brain nuclei reflect satiation, aversion, or both.