Coalescent analysis of mtDNA indicates Pleistocene divergence among three species of howler monkey (Alouatta spp.) and population subdivision within the Atlantic Coastal Forest species, A. guariba

We have used coalescent analysis of mtDNA cytochrome b (cyt b) sequences to estimate times of divergence of three species of Alouatta-A. caraya, A. belzebul, and A. guariba-which are in close geographic proximity. A. caraya is inferred to have diverged from the A. guariba/A. belzebul clade approximately 3.83 million years ago (MYA), with the later pair diverging approximately 1.55 MYA. These dates are much more recent than previous dates based on molecular-clock methods. In addition, analyses of new sequences from the Atlantic Coastal Forest species A. guariba indicate the presence of two distinct haplogroups corresponding to northern and southern populations with both haplogroups occurring in sympatry within Sao Paulo state. The time of divergence of these two haplogroups is estimated to be 1.2 MYA and so follows quite closely after the divergence of A. guariba and A. belzebul. These more recent dates point to the importance of Pleistocene environmental events as important factors in the diversification of A. belzebul and A. guariba. We discuss the diversification of the three Alouatta species in the context of recent models of climatic change and with regard to recent molecular phylogeographic analyses of other animal groups distributed in Brazil.

Functional Characterization of LcpA, a Surface-Exposed Protein of Leptospira spp. That Binds the Human Complement Regulator C4BP

We have previously shown that pathogenic leptospiral strains are able to bind C4b binding protein (C4BP). Surface-bound C4BP retains its cofactor activity, indicating that acquisition of this complement regulator may contribute to leptospiral serum resistance. In the present study, the abilities of seven recombinant putative leptospiral outer membrane proteins to interact with C4BP were evaluated. The protein encoded by LIC11947 interacted with this human complement regulator in a dose-dependent manner. The cofactor activity of C4BP bound to immobilized recombinant LIC11947 (rLIC11947) was confirmed by detecting factor I-mediated cleavage of C4b. rLIC11947 was therefore named LcpA (for leptospiral complement regulator-acquiring protein A). LcpA was shown to be an outer membrane protein by using immunoelectron microscopy, cell surface proteolysis, and Triton X-114 fractionation. The gene coding for LcpA is conserved among pathogenic leptospiral strains. This is the first characterization of a Leptospira surface protein that binds to the human complement regulator C4BP in a manner that allows this important regulator to control complement system activation mediated either by the classical pathway or by the lectin pathway. This newly identified protein may play a role in immune evasion by Leptospira spp. and may therefore represent a target for the development of a human vaccine against leptospirosis.

Seroprevalence of anti-Leishmania spp. antibodies in rural dogs from the city of Monte Negro, State of Rondonia, Brazil

The present study assessed the prevalence of anti-Leishmania spp antibodies in dogs from the city of Monte Negro, State of Rondonia, Brazil ELISA (NE >= 3) and IFAT (>= 1 40) were used to evaluate 161 serum samples collected from rural dogs from Monte Negro Forty-five (27 9%) dogs were positive by ELISA tests and five (3 1%) were positive by IFAT The present study showed for the first time the frequency of exposure to Leishmania spp in dogs in the State of Rondonia, Amazon Region

Trypanosoma cruzi in Brazilian Amazonia: Lineages TCI and TCIIa in wild primates, Rhodnius spp. and in humans with Chagas disease associated with oral transmission

In this study, we provide phylogenetic and biogeographic evidence that the Trypanosomo cruzi lineages T. cruzi I (TCI) and T. cruzi IIa (TCIIa) circulate amongst non-human primates in Brazilian Amazonia, and are transmitted by Rhodnius species in overlapping arboreal transmission cycles, sporadically infecting humans. TO presented higher prevalence rates, and no lineages other than TCI and TCIIa were found in this study in wild monkeys and Rhodnius from the Amazonian region. We characterised TO and TCIIa from wild primates (16 TO and five TCIIa), Rhodnius spp, (13 TCI and nine TCIIa), and humans with Chagas disease associated with oral transmission (14 TO and five TCIIa) in Brazilian Amazonia. To our knowledge, TCIIa had not been associated with wild monkeys until now. Polymorphisms of ssrDNA, cytochrome b gene sequences and randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) patterns clearly separated TCIIa from TCIIb-e and TCI lineages, and disclosed small intra-lineage polymorphisms amongst isolates from Amazonia. These data are important in understanding the complexity of the transmission cycles, genetic structure, and evolutionary history of T cruzi populations circulating in Amazonia, and they contribute to both the unravelling of human infection routes and the pathological peculiarities of Chagas disease in this region. (C) 2008 Australian Society for Parasitology Inc. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

Malassezia spp. in acoustic meatus of bats (Molossus molossus) of the Amazon region, Brazil

The yeasts of the Malassezia genus are opportunistic microorganisms and can cause human and animal infections. They are commonly isolated from the skin and auricular canal of mammalians, mainly dogs and cats. The present study was aimed to isolate Malassezia spp. from the acoustic meatus of bats (Molossus molossus) in the Montenegro region, `` Rondonia ``, Brazil. From a total of 30 bats studied Malassezia spp. were isolated in 24 (80%) animals, the breakdown by species being as follows (one Malassezia sp. per bat, N=24): 15 (62.5%) M. pachydermatis, 5 (20.8%) M. furfur, 3 (12.5%) M. globosa and 1 (4.2%) M. sympodialis. This study establishes a new host and anatomic place for Malassezia spp., as it presents the first report ever of the isolation of this genus of yeasts in the acoustic meatus of bats.

Search for Salmonella spp. in ostrich productive chain of Brazilian southeast region

We analyzed ostriches from an equipped farm located in the Brazilian southeast region for the presence of Salmonella spp. This bacterium was investigated in 80 samples of ostrich droppings, 90 eggs, 30 samples of feed and 30 samples of droppings from rodents. Additionally, at slaughter-house this bacterium was investigated in droppings, caecal content, spleen, liver and carcasses from 90 slaughtered ostriches from the studied farm. Also, blood serum of those animals were harvested and submitted to serum plate agglutination using commercial Salmonella Pullorum antigen. No Salmonella spp. was detected in any eggs, caecal content, liver, spleen, carcass and droppings from ostriches and rodents. However, Salmonella Javiana and Salmonella enterica subsp. enterica 4, 12: i:- were isolated from some samples of feed. The serologic test was negative for all samples. Good sanitary farming management and the application of HACCP principles and GMP during the slaughtering process could explain the absence of Salmonella spp. in the tested samples.

Anti-Toxocara spp. antibodies in sheep from southeastern Brazil

The purpose of this study was to evaluate the frequency of anti-Toxocara antibodies in sheep from Presidente Prudente, southeastern Brazil. Serum samples were obtained from 365 sheep of diverse breeds and different ages. Samples were collected at a slaughterhouse and at farms located in Presidente Prudente. Three groups of animal of different ages were evaluated according to age: Group I: between 1 and 6 months old; Group II: between 7 and 10 months old; and Group III: between 11 and 15 months old. An ELISA test was carried out to detect anti-Toxocara antibodies (IgG) using the excretory-secretory antigens of Toxocara canis (TES) larvae. In total, 183 out of 365 animals (50.1%) were positive for anti-Toxocara antibodies. The frequency of antibody detection was directly proportional to the age of the animals (p<0.0001). indicating a relationship between infection and aging. In Group III, there was a higher prevalence in females (p = 0.0041). The relevance of these animals to the epidemiology of toxocariasis in pets and human should be considered. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Metabolomic assessment with CE-MS of the nutraceutical effect of Cystoseira spp extracts in an animal model

There is a need of scientific evidence of claimed nutraceutical effects, but also there is a social movement towards the use of natural products and among them algae are seen as rich resources. Within this scenario, the development of methodology for rapid and reliable assessment of markers of efficiency and security of these extracts is necessary. The rat treated with streptozotocin has been proposed as the most appropriate model of systemic oxidative stress for studying antioxidant therapies. Cystoseira is a brown alga containing fucoxanthin and other carothenes whose pressure-assisted extracts were assayed to discover a possible beneficial effect on complications related to diabetes evolution in an acute but short-term model. Urine was selected as the sample and CE-TOF-MS as the analytical technique to obtain the fingerprints in a non-target metabolomic approach. Multivariate data analysis revealed a good clustering of the groups and permitted the putative assignment of compounds statistically significant in the classification. Interestingly a group of compounds associated to lysine glycation and cleavage from proteins was found to be increased in diabetic animals receiving vehicle as compared to control animals receiving vehicle (N6, N6, N6-trimethyl-L-lysine, N-methylnicotinamide, galactosylhydroxylysine, L-carnitine, N6-acetyl-N6-hydroxylysine, fructose-lysine, pipecolic acid, urocanic acid, amino-isobutanoate, formylisoglutamine. Fructoselysine significantly decreased after the treatment changing from a 24% increase to a 19% decrease. CE-MS fingerprinting of urine has provided a group of compounds different to those detected with other techniques and therefore proves the necessity of a cross-platform analysis to obtain a broad view of biological samples.

Epidemiologia das infecções por Candida spp. na corrente sanguínea : coorte retrospectiva em hospital terciário brasileiro

Objetivos: definir os dados demográficos, as doenças de base e os fatores de risco associados aos episódios de candidemia ocorridos na Santa Casa Complexo Hospitalar entre 17/02/1995 e 31/12/2003; identificar as espécies envolvidas nestes episódios de candidemia e determinar a mortalidade global entre estes pacientes. Métodos: estudo de coorte retrospectivo não-controlado com inclusão de todos os casos consecutivos de candidemia diagnosticados na instituição entre 17/02/1995 e 31/12/2003. Como critério de inclusão no estudo, foi exigida a presença de sinais ou sintomas temporalmente relacionados ao isolamento de Candida em hemocultivo coletado de veia periférica. Resultados: 210 pacientes com candidemia foram incluídos (infecção nosocomial em 91,0%). O sexo feminino foi mais prevalente (51,4%) e a idade mediana foi de 41,0 anos. A doença de base mais prevalente foi câncer (neoplasias sólidas 30,5% e hematológicas 9,0%). Candida albicans foi a espécie mais freqüente (38,1%), seguida de Candida parapsilosis (27,6%) e Candida tropicalis (15,7%); candidemia por Candida glabrata ocorreu em 3,8%, e por Candida krusei, em 2,4%. Procedimentos cirúrgicos foram realizados em 43,8%, cateter venoso central estava presente em 74,8%, cateter urinário em 57,1%, ventilação mecânica em 48,6% e nutrição parenteral em 33,8%; o número mediano de antimicrobianos foi 4,0 por paciente (glicopeptídeos 54,3%, carbapenêmicos 25,7%). A maioria dos pacientes com candidemia comunitária (52,6%) havia sido hospitalizada nos 60 dias anteriores à candidemia; em 21,1%, Candida foi isolada de cateter; insuficiência renal crônica (p<0,001) e hemodiálise (p=0,027) foram mais freqüentes no grupo de candidemia comunitária do que no nosocomial; a distribuição das espécies de Candida foi semelhante entre os grupos. Comparadas aos adultos, as crianças com candidemia nosocomial foram mais expostas a antimicrobianos de amplo espectro (p<0,001), ventilação mecânica invasiva (p=0,002) e nutrição parenteral (p<0,001). Candidemia nosocomial por Candida parapsilosis foi mais freqüente em crianças (p=0,002), bem como o isolamento de Candida de cateteres (p=0,019); crianças foram mais freqüentemente tratadas com anfotericina B do que adultos (p<0,001), os quais receberam mais fluconazol (p=0,013). Entre os pacientes com câncer e candidemia nosocomial, tratamento prévio com corticosteróides (p=0,004), quimioterapia (p<0,001) e cefepima (p=0,004) foram mais comuns naqueles com malignidades hematológicas; cirurgias foram mais comuns em pacientes com tumores sólidos (p<0,001), principalmente do trato gastrointestinal (p=0,016); a distribuição das espécies de Candida foi semelhante entre os grupos. Candidemia breakthrough (“de escape”) ocorreu em 10,5% dos pacientes com candidemia nosocomial; a maioria destes vinha em uso de anfotericina B em doses terapêuticas, por período mediano de 6,5 dias; o isolamento de Candida de sítios outros que o sangue foi mais freqüente nestes pacientes (p=0,028). A mortalidade dos pacientes com candidemia foi 50,5%, sem diferenças estatisticamente significativas entre pacientes com candidemia comunitária ou nosocomial, com câncer ou outros diagnósticos e com infecção breakthrough ou não-breakthrough; a mortalidade foi maior em adultos do que em crianças (p=0,005). Conclusões: espécies não-Candida albicans foram os principais agentes de candidemia; assim como em outros estudos brasileiros, a prevalência de espécies como Candida glabrata e Candida krusei foi baixa. Fatores de risco já descritos na literatura foram freqüentemente encontrados, e a distribuição dos mesmos variou de acordo com as diferentes características dos pacientes estudados. A mortalidade em pacientes com candidemia foi semelhante \à descrita na literatura.

Tipificação molecular de amostras de Brucella spp. utilização a técnica de BOX-PCR

O gênero Brucella é formado por coco-bacilos Gram negativos patogênicos ao homem e animais, sendo classificado como patógeno de grupo de risco III. A identificação dessas bactérias apresenta várias limitações como: exigência de inoculação em vários meios, tempo de incubação longo e necessidade de soros imunes e bacteriófagos. Devido à sua alta patogenicidade e ao longo tempo de exposição dos laboratoristas à bactéria, a brucelose é uma das infecções mais freqüentemente adquiridas em laboratório. Além da contaminação em laboratório, a transmissão ao homem pode ocorrer através de animais infectados e ingestão de produtos derivados, como o leite cru. A procura de métodos rápidos de identificação das espécies e biovares pode ser útil para diminuir os riscos do manuseio desta bactéria e na tomada de medidas de controle epidemiológico. O principal objetivo deste trabalho foi facilitar a classificação de cepas de referência de Brucella spp. e isoladas no Brasil utilizando a técnica de rep-PCR com oligonucleotídeos do elemento BOX, uma seqüência repetida presente no genoma de várias bactérias. Foram analisados 38 isolados representando diferentes espécies e biovares de Brucella sp. e 13 isolados de gêneros relacionados como controle da especificidade da reação. Foi realizada uma confirmação prévia dos isolados de brucela por testes bioquímicos e PCR gênero-específica. A técnica de BOX-PCR agrupou todas as espécies e biovares de Brucella em um único grupo com nível de similaridade entre 100 e 74%. Diferenças entre os isolados, quanto a presença ou ausência de bandas, puderam ser observadas. Entretanto, essas divergências não caracterizam uma espécie ou biovar. Bandas comuns a todos os isolados de Brucella sp. podem caracterizar o gênero.

Seleção de isolados de Paenibacillus spp com atividade enzimática e antimicrobiana

As bactérias do gênero Paenibacillus são isolados de uma grande variedade de ambientes e tem como característica a produção e secreção de enzimas extracelulares, antimicrobianos e compostos antifúngicos inibidores de vários patógenos animais e vegetais. Os 55 isolados de 15 espécies de Paenibacillus foram testados frente a diversos substratos a fim de verificar a produção de enzimas extracelulares. Foram também testados frente a uma variedade de bactérias e fungos fitopatógenos, humanos e animais para a produção de antibióticos. Nessa triagem, P. validus, P. chibensis, P. koreensis e P. peoriae se destacaram inibindo a maioria das bactérias indicadoras. As espécies P. validus, P. chibensis e P. peoriae foram bons produtores de substancias que inibiram o crescimento de fungos, demonstrando que o gênero possui um amplo espectro de atuação. O tradicional procedimento de triagem para obterem-se novos microrganismos produtores de enzimas para fins biotecnológicos foi executado neste trabalho. As 55 linhagens foram avaliadas na sua capacidade de produzir amilase, proteases (caseinase), celulase, xantanase, xilanase, pectinase, quitinase e lipase. Os isolados se mostraram bons produtores de enzimas hidrolíticas, já que 26 apresentaram atividade xilanolítica, 17 atividade pectinolítica, 49 atividade proteolítica, 43 atividade xantanolítica, 40 atividade celulolítica, 17 atividade lipolítica, 39 atividade amilolítica em condições neutras (pH 7) e 26 atividade amilolítica em condições alcalinas (pH 10), e apenas 4 apresentaram atividade quitinolítica. Sendo assim, esses isolados são candidatos a serem utilizados como agentes biocontroladores ou podem ser explorados como produtores de antimicrobianos e de enzimas hidrolíticas de interesse.

Enterococcus SPP resistente à vancomicina : tipagem molecular, caracterização clínica e associação com mortalidade

Resumo não disponível

Monitoramento de Anastrepha spp. (Diptera: Tephritidae) e identificação de seus parasitóides em Citrus sinensis Var. Céu, sob manejo orgânico, em Maratá, RS

A citricultura no Rio Grande do Sul tem sua produção limitada devido a doenças e pragas. Entre as pragas estão as moscas-das-frutas do gênero Anastrepha. As fêmeas ovipositam nos frutos e, após a eclosão, as larvas consomem a polpa, depreciando e causando a queda destes. Atualmente, tem-se procurado viabilizar o controle biológico das populações de moscas-das-frutas, principalmente com a utilização de himenópteros parasitóides. No Rio Grande do Sul não existem registros de espécies de parasitóides associados à Anastrepha spp. em pomares de citros. Assim, o objetivo deste trabalho foi o de conhecer e identificar estas espécies de parasitóides e registrar a flutuação de Anastrepha spp. durante o período de desenvolvimento dos frutos em um pomar de Citrus sinensis var. Céu sob o manejo orgânico localizado no município de Maratá, RS. Para isto, entre 21 de janeiro e 20 de maio de 2003, foram coletados frutos da copa e caídos no solo, bem como capturados adultos de Anastrepha spp., com armadilhas McPhail, em intervalos semanais. Em condição de laboratório, os frutos da copa e do solo foram colocados em potes plásticos e caixas de papelão, respectivamente, sobre uma camada de areia. Semanalmente, a areia era peneirada e os pupários obtidos, colocados em placas de Petri. Obtiveram-se cinco espécies de parasitóides pertencentes a três famílias, Braconidae, Diapriidae e Pteromalidae. O índice de parasitismo total foi de 6,23% e o braconídeo Doryctobracon areolatus foi mais freqüente (38,70%). Observaram-se dois patamares no número médio de adultos de Anastrepha spp. capturados. A viabilidade pupal foi 37,01%, enquanto que a razão sexual das moscas-das-frutas obtidas nas armadilhas foi de 0,53.

Ecologia parasitária de isópodos e biologia reprodutiva em tibiro, Oligoplites spp (OSTEICHTHYES: CARANGIDAE) das águas costeiras de Natal, Rio Grande do norte

Oligoplites palometa (Cuvier) and Oligoplites saurus (Bloch & Schneider) (Osteichthyes: Carangidae) are coastal pelagic fish species. The objective of this study was to investigate the effect of parasitism by isopods and the reproductive biology of the leather jack, Oligoplites spp. A total of 113 individuals of Oligoplites spp (35 of O. saurus and 78 of O. palometa) were captured during the period between January, 2005 and July, 2007 from the coastal waters of Natal, RN. The morphometric and meristic characters were registered; macroscopic analyses were done to collect the isopod parasites and the gonads were observed to verify the reproductive aspects. The crustacean isopod parasite, Cymothoa spinipalpa (Isopoda: Cymothidae) was encountered on the tongue in the oral cavity in both fish hosts. The parasitic indices of C. spinipalpa showed high values of prevalance of 51,4% for O. saurus and 64,1% for O. palometa. The host presented significant correlations between body mass and body length of O. palometa and the number of parasites. Body lengths of female C. spinipalpa were small due to the limited space available in the oral cavity of the host. There was a significant difference in the sex ratio of O. palometa, males outnumbered the females. The isopod parasites showed specificity to the oral cavity of hosts. Macroscopic analyses of gonads showed four stages of gonadal development for both sex of O. palometa: immature, maturing, mature and spent

Antimicrobial resistance and species composition of Enterococcus spp. isolated from waters and sands of marine recreational beaches in Southeastern Brazil

Density, species composition and antimicrobial resistance in bacteria of the Enterococcus genus were evaluated in seawater and sands from 2 marine recreational beaches with different levels of pollution. The 2 beaches showed predominance of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium, in the water and the sand. Dry sand presented higher densities of Enterococcus sp. and higher frequency of resistant strains than wet sand and seawater. The beach with a higher degree of pollution presented higher percentages of resistant strains (66.7% and 61.5%, in sand and in water, respectively) and resistance to a larger number of antimicrobials compared with the less polluted beach, Ilha Porchat (35.7% and 31.25% of resistant strains in sand and water, respectively). in water samples, the highest frequencies of resistance were obtained against streptomycin (38.5%) and erythromycin (25%), whilst in sand, the highest frequencies were observed in relation to erythromycin and tetracycline (38.1% and 14.3%, respectively). These results show that water and sands from beaches with high indexes of faecal contamination of human origin may be potential sources of contamination by pathogens and contribute to the dissemination of bacterial resistance. (C) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.