997 resultados para Efecto genotypic


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OBJECTIVES: To investigate mechanisms of reduced susceptibility to commonly used antibiotics in Prevotella cultured from patients with cystic fibrosis (CF), patients with invasive infection and healthy control subjects and to determine whether genotype can be used to predict phenotypic resistance.

METHODS: The susceptibility of 157 Prevotella isolates to seven antibiotics was compared, with detection of resistance genes (cfxA-type gene, ermF and tetQ), mutations within the CfxA-type β-lactamase and expression of efflux pumps.

RESULTS: Prevotella isolates positive for a cfxA-type gene had higher MICs of amoxicillin and ceftazidime compared with isolates negative for this gene (P < 0.001). A mutation within the CfxA-type β-lactamase (Y239D) was associated with ceftazidime resistance (P = 0.011). The UK CF isolates were 5.3-fold, 2.7-fold and 5.7-fold more likely to harbour ermF compared with the US CF, UK invasive and UK healthy control isolates, respectively. Higher concentrations of azithromycin (P < 0.001) and clindamycin (P < 0.001) were also required to inhibit the growth of the ermF-positive isolates compared with ermF-negative isolates. Furthermore, tetQ-positive Prevotella isolates had higher MICs of tetracycline (P = 0.001) and doxycycline (P < 0.001) compared with tetQ-negative isolates. Prevotella spp. were also shown, for the first time, to express resistance nodulation division (RND)-type efflux pumps.

CONCLUSIONS: This study has demonstrated that Prevotella isolated from various sources harbour a common pool of resistance genes and possess RND-type efflux pumps, which may contribute to tetracycline resistance. The findings indicate that antibiotic resistance is common in Prevotella spp., but the genotypic traits investigated do not reflect phenotypic antibiotic resistance in every instance.

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Nontypable Haemophilus influenzae (NTHi) has emerged as an important opportunistic pathogen causing infection in adults suffering obstructive lung diseases. Existing evidence associates chronic infection by NTHi to the progression of the chronic respiratory disease, but specific features of NTHi associated with persistence have not been comprehensively addressed. To provide clues about adaptive strategies adopted by NTHi during persistent infection, we compared sequential persistent isolates with newly acquired isolates in sputa from six patients with chronic obstructive lung disease. Pulse field gel electrophoresis (PFGE) identified three patients with consecutive persistent strains and three with new strains. Phenotypic characterisation included infection of respiratory epithelial cells, bacterial self-aggregation, biofilm formation and resistance to antimicrobial peptides (AMP). Persistent isolates differed from new strains in showing low epithelial adhesion and inability to form biofilms when grown under continuous-flow culture conditions in microfermenters. Self-aggregation clustered the strains by patient, not by persistence. Increasing resistance to AMPs was observed for each series of persistent isolates; this was not associated with lipooligosaccharide decoration with phosphorylcholine or with lipid A acylation. Variation was further analyzed for the series of three persistent isolates recovered from patient 1. These isolates displayed comparable growth rate, natural transformation frequency and murine pulmonary infection. Genome sequencing of these three isolates revealed sequential acquisition of single-nucleotide variants in the AMP permease sapC, the heme acquisition systems hgpB, hgpC, hup and hxuC, the 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase kdkA, the long-chain fatty acid transporter ompP1, and the phosphoribosylamine glycine ligase purD. Collectively, we frame a range of pathogenic traits and a repertoire of genetic variants in the context of persistent infection by NTHi.

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OBJECTIVE: To provide a detailed phenotype/genotype characterization of Bietti crystalline dystrophy (BCD). DESIGN: Observational case series. PARTICIPANTS: Twenty patients from 17 families recruited from a multiethnic British population. METHODS: Patients underwent color fundus photography, near-infrared (NIR) imaging, fundus autofluorescence (FAF) imaging, spectral domain optical coherence tomography (SD-OCT), and electroretinogram (ERG) assessment. The gene CYP4V2 was sequenced. MAIN OUTCOME MEASURES: Clinical, imaging, electrophysiologic, and molecular genetics findings. RESULTS: Patients ranged in age from 19 to 72 years (median, 40 years), with a visual acuity of 6/5 to perception of light (median, 6/12). There was wide intrafamilial and interfamilial variability in clinical severity. The FAF imaging showed well-defined areas of retinal pigment epithelium (RPE) loss that corresponded on SD-OCT to well-demarcated areas of outer retinal atrophy. Retinal crystals were not evident on FAF imaging and were best visualized with NIR imaging. Spectral domain OCT showed them to be principally located on or in the RPE/Bruch's membrane complex. Disappearance of the crystals, revealed by serial recording, was associated with severe disruption and thinning of the RPE/Bruch's membrane complex. Cases with extensive RPE degeneration (N = 5) had ERGs consistent with generalized rod and cone dysfunction, but those with more focal RPE atrophy showed amplitude reduction without delay (N = 3), consistent with restricted loss of function, or that was normal (N = 2). Likely disease-causing variants were identified in 34 chromosomes from 17 families. Seven were novel, including p.Met66Arg, found in all 11 patients from 8 families of South Asian descent. This mutation appears to be associated with earlier onset (median age, 30 years) compared with other substitutions (median age, 41 years). Deletions of exon 7 were associated with more severe disease. CONCLUSIONS: The phenotype is highly variable. Several novel variants are reported, including a highly prevalent substitution in patients of South Asian descent that is associated with earlier-onset disease. Autofluorescence showed sharply demarcated areas of RPE loss that coincided with abrupt edges of outer retinal atrophy on SD-OCT; crystals were generally situated on or in the RPE/Bruch's complex but could disappear over time with associated RPE disruption. These results support a role for the RPE in disease pathogenesis.

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Describe los problemas de contaminación identificados en 1979, producidos por cobre, fierro, y desechos domésticos e industriales frente al Callao y Chimbote y cómo se relacionan con los factores físicos y químicos del ambiente marino, así como también estudia sus efectos en la producción primaria.

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En el Laboratorio de Huachipa del Instituto del Mar del Perú, en el período comprendido entre octubre de 1980 y agosto de 1982, se realizaron varios experimentos a fin de determinar el efecto del tipo de estanque, densidad de carga y calidad y cantidad de fertilizante en el crecimiento y la producción de Tilapia nilotica. Estos experimentos arrojaron una diferencia no significativa entre los tratamientos, por lo cual se halló una cifra general promedio de crecimiento y producción que permitió su comparación con las cifras de producción obtenidas en otras áreas del mundo, un peso individual promedio de 203.4 g, una producción total de 2,038 Kg/ha/272 días, y una producción neta de 5.6 Kg/ha/día. Cifras que quedan dentro del rango reportado por el ICA (International Center for Aquaculture) para clima templado; similares a las obtenidas en países de Europa Central y la China, y notablemente bajas comparadas con los 20 Kg/ha/día producidos en Israel. Se identifican la mala condición de los estanques utilizados, la baja densidad de carga aplicada, la baja calidad del fertilizante y el clima de la zona, específicamente la presencia de nubosidad, como los factores de mayor incidencia en los resultados poco satisfactorios.

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La distribución y la talla de la merluza Merluccius gayi peruanus, frente a la costa peruana, exhiben dos patrones: (a) La distribución está determinada por la variación de la Corriente de Cromwell, causada por cambios estacionales (invierno - verano) y a efectos interanuales relacionados con El Niño; (b) Las tallas están relacionadas a la latitud, con individuos grandes en el norte y más pequeños al sur. Desde el inicio de la fuerte pesquería de arrastre de fondo en 1973, la merluza peruana ha sufrido reducción en la biomasa, además de cambios en la distribución y en la estructura poblacional. En este estudio se ha utilizado información obtenida en los cruceros de los años 1970, y también la frecuencia de longitudes y características biológicas anotadas por las flotas activas en diferentes latitudes, y colectadas por el Instituto del Mar del Perú (IMARPE) en Paita (5°S), Chimbote (9°S) y Callao (12°S). Los datos sobre distribución de la merluza adulta obtenidos de cruceros científicos en diferentes períodos, y un tratamiento separado de longitudes registradas en varios puertos, permitieron reconstruir la distribución de tallas en la serie de tiempo para los tres puertos de desembarque mencionados. Durante los años 1970 se halló merluzas grandes, con talla media >40 cm (edad 4+), hasta el Callao por el sur. Se discute la presencia de estas tallas en aquella área con relación al efecto directo de las pesquerías combinadas de arrastre y cerco, sobre la biomasa de esta especie y su rango de distribución. Se discuten posibles efectos indirectos sobre la merluza, a corto y largo plazo, ocasionados por cambios en biomasa y distribución de la anchoveta, y por los cambios a largo plazo (decadales) del ambiente físico.

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Estudio de los restos estomacales obtenidos de los cruceros bio-oceanográficos, Eurekas y otras operaciones

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En el ecosistema marino peruano, los peces pelágicos pequeños como la anchoveta, Engraulis ringens y sardina, Sardinops sagax sagax constituyen los principales recursos pesqueros bajo explotación, por sus altos niveles de abundancia y capturas. La importancia socio-económica que representa para el Perú la pesquería de sardina, hace necesario mantener una vigilancia permanente sobre la situación de su stock y sobre todo los efectos que generan las condiciones ambientales anómalas y la actividad pesquera. El objetivo principal es analizar el efecto de los cambios ambientales sobre el crecimiento de la sardina, a fin de considerar el impacto de estas variaciones en la evaluación de sus stocks; para este fin se realizó el análisis del crecimiento de la sardina proveniente del sotck norte-centro (03°-16°S), en la serie histórica desde 1978 a1998, en base a la lectura e interpretación de incrementos de crecimiento en otolitos, teniéndose en cuenta que en ese lapso de tiempo ocurrieron cambios drásticos en las condiciones ambientales propias de los eventos El Niño 1982-83, La Niña 1996 y El Niño 1997-98. Los análisis de los incrementos de sardinas de 4 años de edad, es decir con 4 incrementos o marcas, en relación con el radio total del otolito, han permitido demostrar que los cambios ambientales drásticos ocurridos durante los períodos El Niño y la Niña, no han modificado el patrón de formación de estos incrementos (r1, r2, r3); el Test de Student-Newman-Keuls demostró que no existen diferencias significativas en el patrón de formación de los incrementos.

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Gestión del Conocimiento