Cabernet Sauvignon in tropical semi-arid climate (Pernambuco - Brasil): adaptation of some clones and their affinity to different rootstocks.

2011

Compatibilidade genética entre clones de cupuaçuzeiro do Pará, Amazonas e Rondônia, avaliada em Tomé Açu - PA.

O objetivo desse trabalho foi avaliar, preliminarmente, a compatibilidade genética entre clones de cupuaçuzeiro, selecionados pelas Unidades da Embrapa, no Pará, Amazonas e Rondônia. Os materiais encontravam-se plantados na Base Física da Embrapa Amazônia Oriental, no município de Tomé Açu. A pesquisa foi realizada no período de agosto a novembro de 2015. A técnica de polinização manual controlada foi desenvolvida no início de abertura dos botões florais, das 12 às 16 horas, e envolveu sete clones do programa de melhoramento genético da Embrapa Amazônia Oriental, utilizados como mãe; cinco clones do programa da Embrapa Amazônia Ocidental e três da Embrapa Rondônia, que foram empregados como pai. Os resultados demonstraram boa compatibilidade geral entre os clones pesquisados. Dois clones não puderam ser avaliados devido não apresentarem sincronismo de floração com os demais clones

Incidência de podridão carpelar em clones de macieira 'Gala' e 'Fuji' sobre porta-enxerto Marubakaido interenxertado com EM-9 na região de Fraiburgo/SC.

2011

Avaliação da indução de brotações em vitroplantas de cafeeiro arabica como opção para amplificação de clones.

A micropropagação de cafeeiros é técnica importante para obtenção simultânea de um grande número de plantas clonadas utilizando fragmentos pequenos de matrizes selecionadas. No entanto, o tempo necessário para a conclusão do processo de embriogênese somática encarece as mudas. O manejo das vitroplantas após a aclimatização pode melhorar o custo-benefício da técnica. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da indução de brotações em vitroplantas de cafeeiro arábica utilizando o regulador de crescimento ácido tri-iodobenzóico (TIBA), para amplificar os clones obtidos in vitro. As vitroplantas foram geradas por embriogênese somática induzida em segmentos foliares de cafeeiros Siriema clone 3 e de Catucaí 567, cultivares produtivas resistentes à ferrugem, seguindo o protocolo utilizado pelo Laboratório de Cultura de Tecidos da SAPC/Fundação Procafé, Varginha/MG.

Manejo de vitroplantas aclimatizadas como forma de propagação dos clones.

A micropropagação de cafeeiros é técnica importante para o btenção simultânea de um grande número de plantas clonadas, utilizando fragmentos pequenos de matrizes se lecionadas. No entanto, o tempo necessário para a conclusão do processo de embriogênese somática e desenvolv imento das plântulas in vitro, até o estádio em que possam ser aclimatizadas ex vitro, encarece as mudas. O manejo das vitroplantas, após a aclimatização, pode melhorar o custo - benefício da técnica. Experimentos com o objetivo de avaliar a eficiência da indução de brotações em vitroplantas de cafeeiro arábica, utilizando o regulador de crescimento ácido tri-iodobenzóico (TIBA), têm sido conduzidos na Fundação Procafé Varginha/MG), com o objetivo de amplificar os clones obtidos in vitro , ou seja, de multiplicar as vitroplantas logo após sua aclimatização.

Biomassa e área foliar de clones de eucalipto em ILPF: implicações para a desrama

O objetivo do trabalho foi estudar a partição da biomassa na copa de clones comerciais de eucaliptos em Integração Lavoura Pecuária Floresta (ILPF) e recomendar práticas de desrama. Os dados foram coletados na Fazenda Guarantã em Juara, MT, e foram avaliados cinco clones implantados em renques duplos e triplos em espaçamento de 21 x 3,5 x 2,5 m aos 15 meses de idade. Para o estudo da biomassa na parte aérea das plantas foram selecionadas duas árvores amostras de cada clone, que foram abatidas e tiveram a biomassa da copa, tronco e densidade básica determinados. Concluiu-se que a distribuição da biomassa e área foliar ao longo da copa variou em função do material genético e da configuração de plantio. Para todos os materiais genéticos avaliados, foi observada a presença de galhos mortos na copa, indicando a necessidade de se fazer desramas antes dos 15 meses de idade se o objetivo for produzir madeira para serraria. A definição da intensidade de desrama com base na proporção da altura da copa viva mostrou-se inadequada quando empregada de forma genérica sem o estudo prévio da arquitetura da copa.

Emissão de fluxos foliares, floração e ciclagem de nutrientes em clones de copa de Hevea pauciflora.

A fenologia foliar tem sido utilizada como uma característica importante na seleção dos clones de Hevea spp., enquanto o teor de nutrientes na serapilheira é um bom indicador da ciclagem de nutrientes. O objetivo deste trabalho foi verificar o efeito da periodicidade de emissão de fluxos foliares na floração de copa de Hevea pauciflora, estado nutricional e qualidade da serapilheira. Foram avaliadas 15 plantas de 10 anos de idade dos clones de copa CNS G 112, CNS G 124 e CBA 2. Nas condições edafoclimáticas da Amazônia tropical úmida, a emissão de folhas e de floração de H. pauciflora ocorre com maior intensidade no segundo semestre (início do período chuvoso). A H. pauciflora apresenta maior acúmulo de serapilheira que a floresta primária e os teores foliares de 22,18 g kg-1 de N, 1,47 g kg-1 de P, 5,77 g kg-1 de K, 3,79 g kg-1 de Ca, 2,09 g kg-1 de Mg, 16,15 mg kg-1 de B, 6,14 mg kg-1 de Cu, 53,87 mg kg-1 de Fe, 66,20 mg kg-1 de Mn e 48,44 mg kg-1 de Zn podem ser utilizados como referência para essa espécie de seringueira.

Seleção de clones de aceroleira por meio de técnicas multivariadas aplicadas a características físico-químicas de frutos.

A aceroleira (Malpighia emarginata DC.) é uma das principais espécies frutíferas cultivadas 9 no Submédio do Vale do São Francisco e representa uma atividade estratégica para pequenos e médios produtores familiares, uma vez que sua produção é bem distribuída ao longo do ano, permitindo até oito colheitas anuais. Desse modo, compreende-se que essa cultura tem destacado valor para o desenvolvimento social, considerando a sua capacidade de geração de empregos e renda. Estima-se que a área plantada com aceroleiras na região ocupe cerca de 1000 ha (SOUZA et al., 2013). As acerolas são excelentes fontes naturais de vitamina C, com teores de ácido ascórbico que podem alcançar mais de 4000 mg.100g-1 de polpa, nos frutos imaturos. Para efeito de comparação, registra-se que, em laranjas, o teor médio de vitamina C é de 60 mg.100g-1 (USDA, 2015). Além disso, a acerola é uma excelente fonte de vitamina A e outras substâncias antioxidantes importantes na prevenção de doenças relacionadas a processos degenerativos. Desde 2012, a Embrapa Semiárido mantém uma coleção de acessos de germoplasma de aceroleira oriundos de diferentes regiões do Brasil e desenvolve um programa de melhoramento, que tem como um de seus alvos a obtenção de clones que produzam acerolas com características organolépticas mais adequadas ao consumo in natura (SOUZA et al., 2013). Neste contexto, a avaliação dos genótipos disponíveis quanto à qualidade dos frutos é fundamental para a seleção de clones promissores. O presente trabalho objetivou selecionar genótipos de aceroleira, utilizando a técnica de agrupamento por variáveis canônicas, baseado em caracteres físico-químicos dos frutos.

Ssr-based Genetic Diversity And Structure Of Garlic Accessions From Brazil.

Garlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in 'developing' new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of redundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide.

Development And Characterization Of 32 Microsatellite Loci In Genipa Americana (rubiaceae).

• Microsatellite primers were developed for the tree species Genipa americana (Rubiaceae) for further population genetic studies. • We identified 144 clones containing 65 repeat motifs from a genomic library enriched for (CT)8 and (GT)8 motifs. Primer pairs were developed for 32 microsatellite loci and validated in 40 individuals of two natural G. americana populations. Seventeen loci were polymorphic, revealing from three to seven alleles per locus. The observed and expected heterozygosities ranged from 0.24 to 1.00 and from 0.22 to 0.78, respectively. • The 17 primers identified as polymorphic loci are suitable to study the genetic diversity and structure, mating system, and gene flow in G. americana.

Bioremediation Potential Of Microorganisms Derived From Petroleum Reservoirs.

Bacterial strains and metagenomic clones, both obtained from petroleum reservoirs, were evaluated for petroleum degradation abilities either individually or in pools using seawater microcosms for 21 days. Gas Chromatography-Flame Ionization Detector (GC-FID) and Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) analyses were carried out to evaluate crude oil degradation. The results showed that metagenomic clones 1A and 2B were able to biodegrade n-alkanes (C14 to C33) and isoprenoids (phytane and pristane), with rates ranging from 31% to 47%, respectively. The bacteria Dietzia maris CBMAI 705 and Micrococcus sp. CBMAI 636 showed higher rates reaching 99% after 21 days. The metagenomic clone pool biodegraded these compounds at rates ranging from 11% to 45%. Regarding aromatic compound biodegradation, metagenomic clones 2B and 10A were able to biodegrade up to 94% of phenanthrene and methylphenanthrenes (3-MP, 2-MP, 9-MP and 1-MP) with rates ranging from 55% to 70% after 21 days, while the bacteria Dietzia maris CBMAI 705 and Micrococcus sp. CBMAI 636 were able to biodegrade 63% and up to 99% of phenanthrene, respectively, and methylphenanthrenes (3-MP, 2-MP, 9-MP and 1-MP) with rates ranging from 23% to 99% after 21 days. In this work, isolated strains as well as metagenomic clones were capable of degrading several petroleum compounds, revealing an innovative strategy and a great potential for further biotechnological and bioremediation applications.

Molecular Diversity Of Fungal And Bacterial Communities In The Marine Sponge Dragmacidon Reticulatum.

The present work aimed to investigate the diversity of bacteria and filamentous fungi of southern Atlantic Ocean marine sponge Dragmacidon reticulatum using cultivation-independent approaches. Fungal ITS rDNA and 18S gene analyses (DGGE and direct sequencing approaches) showed the presence of representatives of three order (Polyporales, Malasseziales, and Agaricales) from the phylum Basidiomycota and seven orders belonging to the phylum Ascomycota (Arthoniales, Capnodiales, Dothideales, Eurotiales, Hypocreales, Pleosporales, and Saccharomycetales). On the other hand, bacterial 16S rDNA gene analyses by direct sequencing approach revealed the presence of representatives of seven bacterial phyla (Cyanobacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Lentisphaerae, Chloroflexi, and Planctomycetes). Results from statistical analyses (rarefaction curves) suggested that the sampled clones covered the fungal diversity in the sponge samples studied, while for the bacterial community additional sampling would be necessary for saturation. This is the first report related to the molecular analyses of fungal and bacterial communities by cultivation-independent approaches in the marine sponges D. reticulatum. Additionally, the present work broadening the knowledge of microbial diversity associated to marine sponges and reports innovative data on the presence of some fungal genera in marine samples.

Cultivares de batata para sistemas orgânicos de produção

Informações a respeito de cultivares adaptadas ao sistema de cultivo orgânico são escassas. O objetivo deste estudo foi avaliar, sob sistema de cultivo orgânico, genótipos nacionais e estrangeiros desenvolvidos para o cultivo convencional, quanto ao potencial produtivo, em condições de campo. O experimento foi conduzido em 2008, no Pólo APTA Leste Paulista, em Monte Alegre do Sul-SP. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso, com 18 tratamentos e quatro repetições. Cada parcela foi constituída por 80 batatas-semente, dispostas em quatro linhas de 5 m de comprimento, espaçadas de 80 cm, com 25 cm entre tubérculos. Os genótipos avaliados foram Agata, Asterix, Caesar, Cupido, Éden, Melody, Novella e Vivaldi, de origem estrangeira; e Apuã, Aracy, Catucha, IAC Aracy Ruiva, Itararé, Monte Alegre 172, IAC 6090, APTA 16.5, APTA 15.20 e APTA 21.54, nacionais. Foram avaliadas as características de produtividade total e comercial de tubérculos, massa média total e comercial de tubérculos, teor de matéria seca e severidade da pinta-preta (Alternaria solani). Os clones APTA 16.5, APTA 21.54 e IAC 6090, e as cultivares Cupido, Apuã, Itararé e Monte Alegre 172 foram os mais produtivos. 'APTA 21.54' superou os demais em relação a produtividade comercial (18,07 t ha-1), sendo que 'APTA 16.5', 'Cupido', 'IAC 6090' e 'Itararé' formaram o segundo grupo. As maiores massas médias de tubérculos foram apresentadas pelas cultivares Itararé e Cupido. O clone IAC 6090 e as cultivares Aracy e Aracy Ruiva foram as que apresentaram maiores teores de matéria seca, com valor médio de 22,91%. 'APTA 16.5', 'Apuã', 'Aracy', 'Aracy Ruiva', 'Éden', 'Ibituaçú' e 'Monte Alegre 172' apresentaram alto nível de resistência à pinta-preta. As cultivares Itararé, Apuã e Cupido são adaptadas ao cultivo orgânico, e os clones avançados APTA 16.5, APTA 21.54 e IAC 6090 apresentam potencial de cultivo no sistema orgânico.

Array-CGH testing in spontaneous abortions with normal karyotypes

In about 50% of first trimester spontaneous abortion the cause remains undetermined after standard cytogenetic investigation. We evaluated the usefulness of array-CGH in diagnosing chromosome abnormalities in products of conception from first trimester spontaneous abortions. Cell culture was carried out in short- and long-term cultures of 54 specimens and cytogenetic analysis was successful in 49 of them. Cytogenetic abnormalities (numerical and structural) were detected in 22 (44.89%) specimens. Subsequent, array-CGH based on large insert clones spaced at ~1 Mb intervals over the whole genome was used in 17 cases with normal G-banding karyotype. This revealed chromosome aneuplodies in three additional cases, giving a final total of 51% cases in which an abnormal karyotype was detected. In keeping with other recently published works, this study shows that array-CGH detects abnormalities in a further ~10% of spontaneous abortion specimens considered to be normal using standard cytogenetic methods. As such, array-CGH technique may present a suitable complementary test to cytogenetic analysis in cases with a normal karyotype.

A closer look at multiple-clone Plasmodium vivax infections: detection methods, prevalence and consequences

The naturally occurring clonal diversity among field isolates of the major human malaria parasite Plasmodium vivax remained unexplored until the early 1990s, when improved molecular methods allowed the use of blood samples obtained directly from patients, without prior in vitro culture, for genotyping purposes. Here we briefly review the molecular strategies currently used to detect genetically distinct clones in patient-derived P. vivax samples, present evidence that multiple-clone P. vivax infections are commonly detected in areas with different levels of malaria transmission and discuss possible evolutionary and epidemiological consequences of the competition between genetically distinct clones in natural human infections. We suggest that, when two or more genetically distinct clones are present in the same host, intra-host competition for limited resources may select for P. vivax traits that represent major public health challenges, such as increased virulence, increased transmissibility and antimalarial drug resistance.