Determinação de genes potencialmente responsivos à radiação ionizante através de aprendizado de máquina

A predição da resposta do tumor a radioterapia e a questão mais importante durante o tratamento de pacientes com câncer. Como consequência, a predição de genes que sejam responsivos a radiação ionizante e uma possibilidade para a melhoria dos resultados clínicos e a otimização das doses as quais os pacientes são submetidos ao longo do tratamento. Juntamente com esses dados, é possível obter respostas sobre os mecanismos de resistência a radiação dos tumores e até mesmo a identificação de biomarcadores responsáveis pela resistência a radiação ionizante que podem ser potenciais para o desenvolvimento de novas drogas visando a proteção de tecidos saudáveis. A determinação experimental dos genes que sejam responsivos à radiação ionizante é algo caro e que demanda muito tempo e trabalho; porém, se utilizarmos uma forma computacional de direcionar os estudos experimentais diretamente aos genes que têm mais potencial para serem responsivos à radiação ionizante, as pesquisas podem ser mais direcionadas e específicas. Para determinar essa característica, construímos, analisamos e determinamos os dados da topologia da rede integrada de interações moleculares entre genes humanos, contendo interações físicas entre proteínas, interações metabólicas e interações de regulação transcricional. Os dados topológicos foram utilizados como atributos de treinamento para o aprendizado de máquina, no qual os genes conhecidamente responsivos à radiação ionizante foram apresentados a um algoritmo de árvore de decisão que gerou modelos de predição com índices de sensibilidade e precisão de 5% e 72%, respectivamente. Os índices de acerto obtidos para os conjuntos de teste foram satisfatórios, retornando 91% dos genes conhecidos como responsiveis à radiação ionizante utilizados para o treinamento da árvore de decisão. Nós aplicamos o modelo de predição na rede integrada e atribuímos probabilidades ...

Modelagem espacial de áreas de recarga subterrânea em região de afloramento do sistema aquífero guarani (sag), em Brotas/SP

Pós-graduação em Agronomia (Irrigação e Drenagem) - FCA

Seleção genômica para características de carcaça em bovinos da raça Nelore

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Utilizações de informações genômicas para o melhoramento genético de características de crescimento em bovinos da raça Nelore

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Utilização de informações genômicas para o melhoramento genético de características da carne em bovinos da raça Nelore

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Modelagem do equilíbrio térmico de frangos de corte: um estudo da geração e transferência de calor

Pós-graduação em Zootecnia - FCAV

Qualidade de vida de crianças e adolescentes com epilepsia no município de Maringá

Pós-graduação em Saúde Coletiva - FMB

Qualidade do serviço público odontológico no Brasil: a percepção de usuários e profissionais da saúde

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Mapeamento de QTL e análises de espectroscopia para teor de óleo visando aplicação em programas de melhoramento de soja

Pós-graduação em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) - FCAV

Comportamento locomotor, quadro clínico, incidência de quedas e nível de atividade física em pacientes com doença de Parkinson: um estudo longitudinal de dois anos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Uso de variáveis relacionadas com a produção embrionária, em camundongos, como fatores preditivos

Mouse embryo production by superstimulation is a multifactorial process. To minimize the number of sacrificed animals and to maximize the results of the superstimulatory treatment, it should be possible to predict the risk of do not get embryos from such a treated animal. This work aimed to evaluate if the variables - hormone concentration and the timing of its administration, the copulatory plug presence and individual male used to mating – could be predictive factors on the mouse embryo production. Females were distributed in four groups (cross-over design) related to scheduled superstimulation treatment (1300h or 1700h) and eCG/hCG administered concentration (5 or 10IU). After the hCG treatment, females were put to mate. On the next morning it was verified the presence of a copulatory plug (D0.5). Embryo recovery was performed from D2.5 to D4.5 by flushing the oviducts and uterine horns. Total structures recovered (TSR) and the viable embryos (VE) were classified by its morphology. Viability rate (VR) was calculated with VE in relation to TSR (x100). Group comparison was analyzed with 5% of significance. There were no significant differences among groups, even when only main effects were analyzed (hormone concentration and timing of its administration). There was significant difference in VR from animals with or without plug and from the worst and best males used. It was concluded that neither the hormone concentration nor timing of its administration - or their association – was significant as predictive factors for the embryo production. However, the plug presence was related to higher VR.

Estudo da Estrutura da Proteína SH do Vírus Sincicial Respiratório Humano: análise funcional da estrutura pentamérica por ferramentas de bioinformática

Pós-graduação em Biofísica Molecular - IBILCE

Aplicação da análise de séries temporais para detecção e prognóstico de danos em estruturas inteligentes

Pós-graduação em Engenharia Mecânica - FEIS

Avaliação da lipocalina associada à gelatinase de neutrófilos (NGAL) em idosos após osteossíntese de fêmur

Pós-graduação em Anestesiologia - FMB

Mutações putativo-causais em genes candidatos associadas à fertilidade de bovinos de corte e bubalinos

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV