Estimation of Parameters in Random Effect Models with Incidence Matrix Uncertainty

Random effect models have been widely applied in many fields of research. However, models with uncertain design matrices for random effects have been little investigated before. In some applications with such problems, an expectation method has been used for simplicity. This method does not include the extra information of uncertainty in the design matrix is not included. The closed solution for this problem is generally difficult to attain. We therefore propose an two-step algorithm for estimating the parameters, especially the variance components in the model. The implementation is based on Monte Carlo approximation and a Newton-Raphson-based EM algorithm. As an example, a simulated genetics dataset was analyzed. The results showed that the proportion of the total variance explained by the random effects was accurately estimated, which was highly underestimated by the expectation method. By introducing heuristic search and optimization methods, the algorithm can possibly be developed to infer the 'model-based' best design matrix and the corresponding best estimates.

Association between levels of pentraxin 3 and incidence of chronic kidney disease in the elderly

OBJECTIVE: Higher levels of the novel inflammatory marker pentraxin 3 (PTX3) predict cardiovascular mortality in patients with chronic kidney disease (CKD). Yet, whether PTX3 predicts worsening of kidney function has been less well studied. We therefore investigated the associations between PTX3 levels, kidney disease measures and CKD incidence. METHODS: Cross-sectional associations between serum PTX3 levels, urinary albumin/creatinine ratio (ACR) and cystatin C-estimated glomerular filtration rate (GFR) were assessed in two independent community-based cohorts of elderly subjects: the Prospective Investigation of the Vasculature in Uppsala Seniors (PIVUS, n = 768, 51% women, mean age 75 years) and the Uppsala Longitudinal Study of Adult Men (ULSAM, n = 651, mean age 77 years). The longitudinal association between PTX3 level at baseline and incident CKD (GFR <60 mL( ) min(-1)  1.73 m(-) ²) was also analysed (number of events/number at risk: PIVUS 229/746, ULSAM 206/315). RESULTS: PTX3 levels were inversely associated with GFR [PIVUS: B-coefficient per 1 SD increase -0.16, 95% confidence interval (CI) -0.23 to -0.10, P < 0.001; ULSAM: B-coefficient per 1 SD increase -0.09, 95% CI -0.16 to -0.01, P < 0.05], but not ACR, after adjusting for age, gender, C-reactive protein and prevalent cardiovascular disease in cross-sectional analyses. In longitudinal analyses, PTX3 levels predicted incident CKD after 5 years in both cohorts [PIVUS: multivariable odds ratio (OR) 1.21, 95% CI 1.01-1.45, P < 0.05; ULSAM: multivariable OR 1.37, 95% CI 1.07-1.77, P < 0.05]. CONCLUSIONS: Higher PTX3 levels are associated with lower GFR and independently predict incident CKD in elderly men and women. Our data confirm and extend previous evidence suggesting that inflammatory processes are activated in the early stages of CKD and drive impairment of kidney function. Circulating PTX3 appears to be a promising biomarker of kidney disease.

Funding social sector activity in Brazil: a case study analysis of agency risk incidence and mitigation

Empresas e organizações sociais têm um papel cada vez mais importante no mercado brasileiro. Essas organizações - sejam elas com ou sem fins lucrativos –têm como objetivocausar um profundo e positivo impacto social.Ambas enfrentamtambém o mesmo desafio: financiar as suas operações. Recentemente, dois modelos inovadores de financiamento, o fundo de venture capitalVox Capital e o fundo de empréstimo social SITAWI, entraram no mercado brasileiro para solucionar esse desafio. Este estudo analisa ambos os fundos,associando o problema do financiamento de empresas e organizações sociais às teorias tradicionais de negócio. Mais especificamente, por meio de um estudo de caso,é avaliado se o risco de agência (agency risk) explica as práticas e o designcontratual utilizados pelos fundos. A pesquisa é baseada num estudo de Alemany e Scarlata (2010) sobre a estruturação dos negócios de fundos filantrópicos de capital empreendedor (PhVC, na sigla em inglês) na América do Norte e na Europa. Uma definição chave desse estudo é que organizações sem fins lucrativos, ao contrário daquelas com fins lucrativos, estão sujeitas a uma restrição de distribuição de lucros. Embora Alemany e Scarlata (2010) tivessem descobertoque parceria (stewardship), mais do que o problema de agência (agency problem), explica a estrutura dos negócios dos fundos PhVC, as implicações do presente estudo de caso para o Brasil são diferentes. Os resultados sugerem que o problema de agência,mais do que a parceria,descreve adequadamente os contratos analisados de financiamento. Detectou-seque cláusulas contratuais não foram apenas usadas para mitigar o risco de agênciaresultanteda ausência de uma restrição de distribuição de lucros, mas também para reger as estruturas cooperativas com organizações sem fins lucrativos. No caso de SITAWI, a restrição dos destinatários de fundos de distribuir lucros provou-se uma ferramenta efetiva para alinhar os interesses entre os financiadores e os destinatários dos fundos. Apesar daimplicação da presença de parceria, os contratos do fundo social contiveram cláusulas geralmente usadas para reduzir o risco de agência. No caso de Vox Capital, os destinatários dos fundos eram empresas com fins lucrativos, portanto não sujeitas à restrição de distribuição de lucros. O modelo de negócio de Vox Capital é organizado para impedir qualquer incidência potencial do problema de agência. Ambos os fundos, independentemente da estrutura jurídica dos beneficiários destes fundos, evidenciaram o intuito de garantir a aplicação de práticas de negócio utilizadas pelas empresas tradicionais do setor corporativo em vez daquelas utilizadas no setor social.

The effectiveness of community-based interventions to improve maternal and infant health in the Northeast of Brazil

EMOND, Alan et al. The effectiveness of community-based interventions to improve maternal and infant health in the Northeast of Brazil. Revista Panamericana de Salud Pública/ Pan American Journal of Public Health , v.12, n.2, p.101-110, 2002

Multidrug-resistant Shiga toxin-producing Escherichia coli in dogs with diarrhea

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Etiology of acute diarrhea among children in Ribeirão Preto-SP, Brazil

Com o objetivo de caracterizar os principais enteropatógenos causadores de diarréia na região de Ribeirão Preto, quanto aos sorogrupos e sorotipos, por um período de 4 anos foram estudadas fezes de 1836 crianças, menores de 10 anos de idade, de ambos os sexos, portadoras de gastrenterite aguda no IAL de Ribeirão Preto, SP. Foram pesquisados os seguintes enteropatógenos: Escherichia coli, Salmonella sp., Shigella sp., Campylobacter sp., Yersinia sp., e Cryptosporidium sp., identificados através de metodologia tradicional. Foram positivas 419 (22,8%) amostras, com 1,7% de associação entre enteropatógenos. Houve predomínio na faixa etária de 0 a 11 meses. Destacou-se a E.coli enteropatogênica (EPEC) (8,7%), sendo mais frequente o sorogrupo O119 (40,2%), seguida do gênero Shigella (6,2%), dos quais 63,2% corresponderam à S. sonnei.

Digestibilidade, desempenho e características morfofisiológicas do trato digestório de leitões desmamados sob dietas com mananoligossacarídeo

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da adição do prebiótico mananoligossacarídeo (MOS) nas dietas de leitões sobre a digestibilidade dos nutrientes, o desempenho e as características morfofisiológicas do trato digestório. No primeiro experimento, foram utilizados 16 leitões com peso de 24,8±2,79 kg. Utilizou-se o método de coleta total de fezes para determinar a digestibilidade das rações controle e com 0,5% de prebiótico. No segundo experimento, avaliaram-se o desempenho e a incidência de diarreia em 30 leitoas com idade entre 22 e 63 dias e peso inicial de 6,28±1,40 kg. No terceiro experimento, foram avaliados a morfometria intestinal, os pesos relativos do fígado e do pâncreas e o pH dos conteúdos do estômago, intestino delgado e ceco em 15 leitoas com idade entre 22 e 63 dias e peso inicial de 5,74±0,93 kg. No segundo e terceiro experimentos, os tratamentos foram: controle positivo (dieta basal + sulfato de neomicina); controle negativo (dieta basal) e os tratamentos dieta basal acrescida de 0,25, 0,50 ou 0,75% de MOS. Utilizou-se o delineamento em blocos ao acaso. A utilização de diferentes níveis de mananoligassacarídeo nas dietas dos leitões não promove melhorias na digestibilidade dos nutrientes, no desempenho ou nas características morfofisiológicas do trato digestório.

Incidence of non-01 Vibrio cholerae and Aeromonas spp. in fresh water in Araraquara, Brazil

The occurrence of Aeromonas spp., Vibrio cholerae, and Plesiomonas shigelloides in fresh water from various sources in Araraquara, State of São Paulo, Brazil was determined. Samples from ten distinct irrigation systems used in vegetable cultivation, from five distinct streams, from two reservoirs, from one artificial lake, and from three distinct springs were analyzed. All isolates were serotyped and tested for hemolysin, cytotoxin, heat-stable (ST) and heat-labile (LT) enterotoxins production; presence of plasmid; autoagglutination and drug resistance. V. cholerae isolates were also tested for cholera enterotoxin (CT) production, and Aeromonas isolates for suicide phenomenon. No P. shigelloides was found. V. cholerae non 01 was found in five irrigation water samples and in three stream samples. Aeromonas sp. were isolated in two samples of irrigation water, in three streams, and in one reservoir. All the V. cholerae and Aeromonas isolates were positive for P-hemolysin production, and all Aeromonas isolates were positive for suicide phenomenon; cytotoxic activities were observed in two Aeromonas strains. Cholera enterotoxin was not found in eight V. cholerae non-01 isolates tested by the Y-1 mouse adrenal cell. All isolates were also negative for the other virulence markers. Ii cholelerae isolates were found to be sensitive to the majority of drugs tested, while Aeromonas strains presented multiple drug resistance..

Antidiarrheal activity of Guazuma ulmifolia Lam. (Sterculiaceae)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Incidence and prevalence rates of inflammatory bowel diseases, in midwestern of São Paulo State, Brazil

CONTEXTO: No Brasil, a incidência e prevalência populacionais das doenças inflamatórias intestinais são desconhecidas. OBJETIVO: Neste trabalho, estimou-se esses parâmetros na área que abrange a antiga região de saúde DIR 11, no centro-oeste do Estado de São Paulo. MÉTODOS: Usou-se um registro sequencial de 115 pacientes (>15 anos de idade) com doenças inflamatórias intestinais, residindo na área de estudo, atendidos durante período de 20 anos (1986-2005) em hospital de referência. Estimou-se, para quatro períodos consecutivos de 5 anos, as incidências e prevalências de acordo com os tipos de doença e do sexo de doentes. As suas inter-relações foram analisadas utilizando o modelo de regressão linear de Poisson. RESULTADOS: Na região, as doenças inflamatórias intestinais foram predominantes em mulheres jovens, da raça branca, residindo na zona urbana.A incidência da retocolite foi maior que a da doença de Crohn e das colites não classificadas, e diferentemente dessas duas ultimas, mostrou decréscimo no último período (2001-2005). Neste mesmo período, a taxa da incidência para a retocolite foi de 4,48 casos/100.000 habitantes, para a doença de Crohn atingiu 3,50 casos/100.000 habitantes e a das colites não classificadas foi de 1,75 casos/100.000 habitantes. As prevalências atingiram os valores de 14,81 casos/100.000 habitantes para a retocolite, 5,65 casos/100.000 habitantes para a doenças de Crohn e 2,14 casos/100.000 habitantes. Considerando todas as doenças inflamatórias a prevalência atingiu o valor de 22,61 casos/100.000 habitantes. CONCLUSÃO:A incidência dessas doenças inflamatórias intestinais nessa região é baixa, igualando-se aos países da América Latina e do sul da Europa e sua crescente prevalência justifica políticas de saúde para as suas abordagens.

Antimicrobial use and incidence of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa in a teaching hospital: an ecological approach

Introduction: Multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa is a major threat in healthcare settings. The use of antimicrobials can influence the incidence of resistant strains by direct and indirect mechanisms. The latter can be addressed by ecological studies. Methods: Our group attempted to analyze the relation between the use of antipseudomonal drugs and the incidence of MDR-PA among 18 units from a 400-bed teaching hospital. The study had a retrospective, ecological design, comprising data from 2004 and 2005. Data on the use of four antimicrobials (amikacin, ciprofloxacin, ceftazidime and imipenem) were tested for correlation with the incidence of MDR-PA (defined as isolates resistant to the four antimicrobials of interest) in clinical cultures. Univariate and multivariate linear regression analyses were performed. Results: Significant correlations were determined between use and resistance for all antimicrobials in the univariate analysis: amikacin (standardized correlation coefficient = 0.73, p = 0.001); ciprofloxacin (0.71, p = 0.001); ceftazidime (0.61, p = 0.007) and imipenem (0.87, p < 0.001). In multivariate analysis, only imipenem (0.67, p = 0.01) was independently related to the incidence of multidrug-resistant strains. Conclusions: These findings share similarities with those reported in individual-based observational studies, with possible implications for infection control.

Incidence of high blood pressure in a group of tannery workers in Brazil

O objetivo deste estudo foi medir a incidência de hipertensão arterial sistêmica em um curtume de médio porte em Botucatu, São Paulo, Sudeste do Brasil, onde havia sido observada, em estudo prévio, uma correlação positiva entre tempo de trabalho e níveis pressóricos, bem como uma alta prevalência de hipertensão. Para tanto, uma coorte de trabalhadores desse curtume foi acompanhada durante sete anos. Ao final do seguimento, estimou-se a taxa de incidência de hipertensão arterial como 0,0964.ano-1, valor considerado elevado se comparado com o encontrado em outros grupos profissionais.