Supressividade a fitopatógenos habitantes do solo.

2009

Desvendando a resposta dos eosinófilos, dos neutrófilos e dos monócitos nas parasitoses intestinais, na asma e na associação de ambas em crianças

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Pós-graduação em Medicina Tropical, 2015.

L'inscription des genres et de l'intertexte dans Les Bergères de l'apocalypse de Françoise d'Eaubonne

Les bergères de l'Apocalypse est le récit de la protagoniste Ariane qui projette de réécrire, en marge du discours officiel, les événements qui ont conduit à la création d'une société gynocentrique. À la diversité des préoccupations qui alimentent cette vision utopiste de la société répond une indétermination générique qui rend le récit difficile à classer. Mettant en scène une société idéale qui n'en est pas une (puisque les femmes, après l'extermination des hommes, ont reproduit certaines structures de pouvoir patriarcales), l’ouvrage ne peut pas être identifié uniquement comme un roman de science-fiction puisqu'il emprunte à la fois à l'essai, à l’utopie féministe et au récit apocalyptique. Cette hybridation apparaît comme l’un des traits de cet ouvrage éclaté qui multiplie les techniques narratives et les récits dans un cadre où l’intertextualité joue un rôle important. L'hypothèse que je propose pour expliquer une telle variation générique est que le roman représente ici une forme modulable qui marie à la complexité des propositions apportées au discours féministe ambiant. Grâce au mélange des genres et des discours, l'auteure, à travers Ariane, parvient à dialoguer avec une panoplie d'intertextes dont le contrepoint original et touffu ne peut que déconcerter la lectrice. Afin d'analyser le roman, j'observerai comment l’oeuvre exploite les potentiels de généricité dans la forme, les techniques narratives, leur liens avec les motifs écoféministes, ainsi que le mode d'inscription des différents discours.

Variations développementales chez les poissons hybrides clonaux Chrosomus eos-neogaeus : transgressions phénotypiques en 3D

Le succès écologique des organismes dépend principalement de leur phénotype. Une composante important du phénotype est la morphologie fonctionnelle car elle influence la performance d’un organisme donné dans un milieu donné et donc reflète son écologie. Des disparités dans la morphologie fonctionnelle ou dans le développement entre espèces peuvent donc mener à des différences écologiques. Ce projet évalue le rôle des mécanismes de variation morphologique dans la production de différences écologiques entre espèces au sein des poissons hybrides du complexe Chrosomus eos-neogaeus. En utilisant la microtomodensitométrie à rayons X et la morphométrie géométrique 3D, la forme des éléments des mâchoires est décrite pour comparer la variation morphologique et les différences développementales entre les membres du complexe C. eos neogaeus. Les hybrides présentent autant de variation phénotypique que les espèces parentales et présentent des phénotypes nouveaux, dit transgressifs. Les hybrides présentent aussi des différences marquées avec les espèces parentales dans leur allométrie et dans leur intégration phénotypique. Finalement, ceux-ci semblent être plastiques et en mesure de modifier leur phénotype pour occuper plusieurs environnements. L’entièreté de ces résultats suggère que des changements dans le développement des hybrides entraînent une différenciation phénotypique et écologique avec les espèces parentales.

L'inscription des genres et de l'intertexte dans Les Bergères de l'apocalypse de Françoise d'Eaubonne

Les bergères de l'Apocalypse est le récit de la protagoniste Ariane qui projette de réécrire, en marge du discours officiel, les événements qui ont conduit à la création d'une société gynocentrique. À la diversité des préoccupations qui alimentent cette vision utopiste de la société répond une indétermination générique qui rend le récit difficile à classer. Mettant en scène une société idéale qui n'en est pas une (puisque les femmes, après l'extermination des hommes, ont reproduit certaines structures de pouvoir patriarcales), l’ouvrage ne peut pas être identifié uniquement comme un roman de science-fiction puisqu'il emprunte à la fois à l'essai, à l’utopie féministe et au récit apocalyptique. Cette hybridation apparaît comme l’un des traits de cet ouvrage éclaté qui multiplie les techniques narratives et les récits dans un cadre où l’intertextualité joue un rôle important. L'hypothèse que je propose pour expliquer une telle variation générique est que le roman représente ici une forme modulable qui marie à la complexité des propositions apportées au discours féministe ambiant. Grâce au mélange des genres et des discours, l'auteure, à travers Ariane, parvient à dialoguer avec une panoplie d'intertextes dont le contrepoint original et touffu ne peut que déconcerter la lectrice. Afin d'analyser le roman, j'observerai comment l’oeuvre exploite les potentiels de généricité dans la forme, les techniques narratives, leur liens avec les motifs écoféministes, ainsi que le mode d'inscription des différents discours.

Variations développementales chez les poissons hybrides clonaux Chrosomus eos-neogaeus : transgressions phénotypiques en 3D

Le succès écologique des organismes dépend principalement de leur phénotype. Une composante important du phénotype est la morphologie fonctionnelle car elle influence la performance d’un organisme donné dans un milieu donné et donc reflète son écologie. Des disparités dans la morphologie fonctionnelle ou dans le développement entre espèces peuvent donc mener à des différences écologiques. Ce projet évalue le rôle des mécanismes de variation morphologique dans la production de différences écologiques entre espèces au sein des poissons hybrides du complexe Chrosomus eos-neogaeus. En utilisant la microtomodensitométrie à rayons X et la morphométrie géométrique 3D, la forme des éléments des mâchoires est décrite pour comparer la variation morphologique et les différences développementales entre les membres du complexe C. eos neogaeus. Les hybrides présentent autant de variation phénotypique que les espèces parentales et présentent des phénotypes nouveaux, dit transgressifs. Les hybrides présentent aussi des différences marquées avec les espèces parentales dans leur allométrie et dans leur intégration phénotypique. Finalement, ceux-ci semblent être plastiques et en mesure de modifier leur phénotype pour occuper plusieurs environnements. L’entièreté de ces résultats suggère que des changements dans le développement des hybrides entraînent une différenciation phénotypique et écologique avec les espèces parentales.

Le journalisme informatique au Québec : Expansion du journalisme ou nouveau territoire professionnel?

Le journalisme informatique est une pratique émergente qui consiste en l’emploi de méthodes et d’outils empruntés au domaine de l’informatique dans la cueillette, le traitement, l’analyse ou la présentation en ligne de l’information, dans le respect des valeurs fondamentales du journalisme (Diakopoulos, 2010). Cette recherche caractérise le journalisme informatique tel qu’il se pratique au Québec en 2015 au moyen d’une série d’entrevues semi-dirigées avec 30 participants : des praticiens, bien sûr, mais aussi des responsables des principales entreprises de presse où le journalisme informatique est pratiqué ou a été pratiqué, ainsi que des professionnels de l’informatique afin d’avoir un point de vue extérieur. Elle met notamment en relief deux attitudes à l’égard de cette pratique, attitudes qui s’expriment par un travail-frontière. Il y a, d’une part, les tenants d’une ségrégation entre le journalisme et l’informatique, et, d’autre part, les partisans d’une hybridation entre les deux disciplines. Pour ces derniers, le journalisme informatique occupe un territoire professionnel distinct, à la frontière du journalisme et de l’informatique. Cette recherche décrit de façon détaillée les motivations, les compétences et les activités des journalistes informatiques québécois et fait valoir qu’ils participent à une certaine « re-professionnalisation » du journalisme. Mots-clés : journalisme; informatique; technologie; journalisme informatique; journalisme de données; datajournalisme; journalisme assisté par ordinateur; professionnalisme; identité professionnelle; compétences professionnelles; travail-frontière; innovation en journalisme; Canada; Québec

Les trois petits cochons et le grand méchant loup : stratégies visant la pérennité des populations de loups du Québec

L’objectif premier de cet essai est de prioriser des stratégies visant la pérennité des populations de loups au Québec. Ces stratégies visent à diminuer les pressions actuelles que subissent les loups. Les loups sont peu charismatiques. Il est donc difficile d’aller chercher l’appui du public. Si les loups du Québec parvenaient à gagner le cœur des Québécois, ils pourraient alors servir de levier afin que les dirigeants mettent en place un plan de conservation pour préserver ces espèces ou sous-espèces. C’est pourquoi d’ailleurs des stratégies sont proposées afin de rallier la population à cette cause. D’abord, un portrait des différentes espèces ou sous-espèces de loups et de coyotes est effectué pour bien comprendre dans quel contexte les loups évoluent actuellement. Ensuite, les menaces planant sur les populations sont identifiées, il s’agit de : l’hybridation avec le coyote ainsi que la compétition pour les ressources alimentaires, la fragmentation du territoire, les activités humaines, tels la chasse et le braconnage, les routes, ainsi que les activités touristiques. Les impacts économiques, sociaux et environnementaux reliés au déclin potentiel des loups sont ensuite énumérés. Cette partie démontre à quel point la situation est complexe et souligne toutes les répercussions potentielles que peut avoir la disparition du loup sur le Québec. Le rôle de l’appui du public dans le rétablissement d’espèces à statut précaire est ensuite discuté. Par la suite, une liste exhaustive des stratégies est mise en place. En tout, 43 stratégies ont été trouvées. Ces stratégies, visant l’atténuation des menaces sur le loup ou essayant de rallier l’appui du public, ont été classées dans 4 grandes orientations pour ensuite être priorisées selon leur performance. Par parcimonie, seules les 3 meilleures stratégies de chaque orientation seront présentées. Les 3 meilleures stratégies de l’orientation #1 sont de réduire le taux de mortalité des meutes de loups québécois, de ne pas clôturer les dépotoirs forestiers et de mettre au point un programme de suivi. Les 3 stratégies les plus performantes de l’orientation #2 sont de protéger les tanières, d’optimiser l’aménagement agricole et routier. Les 3 meilleures stratégies de l’orientation #3 sont d’utiliser la méthode de Fladry, de gérer les sorties guidées d’écoute nocturne et d’ajouter le loup de l’Est à la liste des espèces menacées du Québec. Les trois stratégies les plus performantes de l’orientation #4 sont d’informer la population de sa capacité à participer et à aider à conserver les loups, d’encourager les parcs et les réserves à inclure le loup dans leurs indicateurs de l’intégrité écologique des écosystèmes et d’informer la population sur les avantages découlant de la conservation des loups. Dans le cadre des recommandations, il faut aussi combiner diverses stratégies de différentes orientations, utiliser le marketing social sur la majorité des stratégies prioritaires, mener une campagne d’éducation populaire à propos du loup et inclure l’ensemble des parties prenantes pouvant avoir un impact sur les différentes stratégies. Pour terminer, l’intérêt d’introduire le loup sur l’île d’Anticosti est évoqué, car cette avenue pourrait être une solution intéressante afin de remédier aux problématiques qu’entraînent les fortes densités de cerfs de Virginie sur cette île.

The influence of actions on auditory perception: cognitive and neural mechanisms

It is well known that self-generated stimuli are processed differently from externally generated stimuli. For example, many people have noticed since childhood that it is very difficult to make a self-tickling. In the auditory domain, self-generated sounds elicit smaller brain responses as compared to externally generated sounds, known as the sensory attenuation (SA) effect. SA is manifested in reduced amplitudes of evoked responses as measured through MEEG, decreased firing rates of neurons and a lower level of perceived loudness for self-generated sounds. The predominant explanation for SA is based on the idea that self-generated stimuli are predicted (e.g., the forward model account). It is the nature of their predictability that is crucial for SA. On the contrary, the sensory gating account emphasizes a general suppressive effect of actions on sensory processing, regardless of the predictability of the stimuli. Both accounts have received empirical support, which suggests that both mechanisms may exist. In chapter 2, three behavioural studies concerning the influence of motor activation on auditory perception were presented. Study 1 compared the effect of SA and attention in an auditory detection task and showed that SA was present even when substantial attention was paid to unpredictable stimuli. Study 2 compared the loudness perception of tones generated by others between Chinese and British participants. Compared to externally generated tones, a decrease in perceived loudness for others generated tones was found among Chinese but not among the British. In study 3, partial evidence was found that even when reading words that are related to action, auditory detection performance was impaired. In chapter 3, the classic SA effect of M100 suppression was replicated with MEG in study 4. With time-frequency analysis, a potential neural information processing sequence was found in auditory cortex. Prior to the onset of self-generated tones, there was an increase of oscillatory power in the alpha band. After the stimulus onset, reduced gamma power and alpha/beta phase locking were found. The three temporally segregated oscillatory events correlated with each other and with SA effect, which may be the underlying neural implementation of SA. In chapter 4, a TMS-MEG study was presented investigating the role of the cerebellum in adapting to delayed presentation of self-generated tones (study 5). It demonstrated that in sham stimulation condition, the brain can adapt to the delay (about 100 ms) within 300 trials of learning by showing a significant increase of SA effect in the suppression of M100, but not M200 component. Whereas after stimulating the cerebellum with a suppressive TMS protocol, the adaptation in M100 suppression disappeared and the pattern of M200 suppression reversed to M200 enhancement. These data support the idea that the suppressive effect of actions on auditory processing is a consequence of both motor driven sensory predictions and general sensory gating. The results also demonstrate the importance of neural oscillations in implementing SA effect and the critical role of the cerebellum in learning sensory predictions under sensory perturbation.

Effect of castor cake and elephant grass composting on edaphic fauna

Elephant grass and castor cake when combined can make a promising organic fertilizer. However, castor cake contains potentially toxic chemicals, such as ricin and ricinine. To test potential effects of these chemicals, compost piles of elephant grass ( Pennisetum purpureum Schum.) with castor cake were prepared with different C:N ratios (T1 = 40, T2 = 30, T3 = 20; T4 = 30 [control, elephant grass + crotalaria]) to evaluate colonization by edaphic fauna and any suppressive effects of castor cake. Soil organisms were collected with Berlese-Tullgren funnels. There were temporal differences between the treatments, and the epigeous fauna was mainly represented by members of the Acari and Entomobryomorpha. Elapsed time is the major factor in determining the composition of the epigeous fauna community associated with composting, indicating that castor cake has no suppressive effect.

Winter cover crops on weed infestation and maize yield.

The establishment of commercial crops in succession to winter cover crops that leaves a dense straw layer provides significantly suppression of weeds. The objective of this work was to evaluate the suppressive potential of winter cover crops on weed infestation in maize and its effect on the yield of the maize sown in succession.

Fontes de matéria orgânica para inibição de fitopatógenos habitantes do solo.

Podridões radiculares e murchas, causadas respectivamente por Cylindrocladium spathiphylli e Verticillium dahliae, podem inviabilizar a produção comercial de espatifilo e da berinjela. Com o reconhecido potencial de fontes de carbono na indução de supressividade de solos e de substratos a diversos patógenos habitantes do solo, o presente trabalho teve como objetivos: 1) avaliar o potencial de seis fontes de carbono (esterco bovino de curral, cama de frango, torta de mamona, casca de camarão, hidrolisado de peixe e lodo de esgoto compostado) na inibição do crescimento micelial de C. spathiphylli; 2) avaliar o potencial de hidrolisado de peixe e cama de frango na indução de supressividade de substrato a C. spathiphylli; e 3) avaliar o efeito do hidrolisado de peixe no controle da murcha de verticilio em berinjela e no desenvolvimento das plantas. Para avaliar a inibição do crescimento micelial de C. spathiphylli, extratos aquosos das matérias orgânicas foram incorporados ao meio BDA nas concentrações de 0, 5, 10, 15, 20, 25 e 30% (v/v). Além disso, ao substrato padrão para espatifilo foram incorporados as matérias orgânicas nas concentrações de 0, 5, 10, 15, 20 e 25% (v/v) e as misturas colocadas em placas de petri e recobertas com uma camada de Agar-água. No centro das placas foi colocado um disco de micélio do patógeno em pleno desenvolvimento e avaliado o crescimento micelial. O extrato aquoso do hidrolisado de peixe, não autoclavado, a 25% reduziu o crescimento micelial. Os extratos autoclavados não inibiram o crescimento do patógeno. Nos substratos autoclavados apenas o hidrolisado de peixe, nas concentrações de 15 a 25%, inibiram completamente o crescimento micelial. Nos substratos não autoclavados o hidrolisado de peixe a 15, 20 e 25%, a torta de mamona a 15 e 25% e a casca de camarão a 20 e 25% inibiram complemente o crescimento micelial de C. spathiphylli. O hidrolisado de peixe na concentração de 20 e 30% do volume da capacidade de retenção de água do substrato induziu a supressividade ao patógeno, controlando completamente a incidência da doença. Por outro lado, a cama de frango não apresentou efeito na indução de supressividade. Nas maiores concentrações do hidrolisado de peixe e da cama de frango a condutividade elétrica do substrato foi responsável por alta fitotoxicidade para as plantas. No estudo sobre o potencial do hidrolisado de peixe em controlar Verticillium em berinjela, foram coletados cinco solos naturalmente infestados com o patógeno e tratados com o hidrolisado na concentração de 0, 5, 10, 15, 20, 25 e 30% do volume de água necessário para atingir a capacidade de campo dos solos, contidos em vasos de 4 litros. Após 15 dias de incubação foram transplantadas três mudas de berinjela para cada vaso, sendo que os vasos foram mantidos em condições de campo, sob telado e biofumigado mantidos sob telado. O hidrolisado de peixe não apresentou efeito sobre a severidade da doença, nem sobre o desenvolvimento das plantas. O principal efeito foi das condições ambientais da condução do ensaio. Na avaliação, aos 72 dias após o plantio, os tratamentos apresentaram resultados distintos para cada tipo de solo e em cada condição em que as plantas foram mantidas. As plantas que permaneceram no campo apresentaram severidades mais elevadas do que nas demais condições independentemente do tipo de solo. Os resultados demonstram a influência dos fatores ambientais sobre a severidade de V. dahliae em berinjela.

Studies of sustainable strategies to control phytopathogen agents

Choosing natural enemies to suppress pest population has been for a long the key of biological control. Overtime the term biological control has also been applied to the use of suppressive soils, bio-disinfection and biopesticides. Biological control agents (BCA) and natural compounds, extracted or fermented from various sources, are the resources for containing phytopathogens. BCA can act through direct antagonism mechanisms or inducing hypovirulence of the pathogen. The first part of the thesis focused on mycoviruses infecting phytopathogenic fungi belonging to the genus Fusarium. The development of new approaches capable of faster dissecting the virome of filamentous fungi samples was performed. The semiconductor-based sequencer Ion Torrent™ and the nanopore-based sequencer MinION have been exploited to analyze DNA and RNA referable to viral genomes. Comparison with GeneBank accessions and sequence analysis allowed to identify more than 40 putative viral species, some of these mycovirus genera have been studied as inducers of hypovirulence in several phytopathogenic fungi, therefore future works will focus on the comparison of the morphology and physiology of the fungal strain infected and cured by the viruses identified and their possible use as a biocontrol agent. In a second part of the thesis the potential of botanical pesticides has been evaluated for the biocontrol of phloem limited phytopathogens such as phytoplasmas. The only active compounds able to control phytoplasmas are the antibiotic oxytetracyclines and in vitro direct and fast screening of new antimicrobials compounds on media is almost impossible due to the difficulty to culture phytoplasmas. For this reason, a simple and reliable screening method was developed to evaluate the effects of antimicrobials directly on phytoplasmas by an “ex-vivo” approach. Using scanning electron microscopy (SEM) in parallel with molecular tools (ddRT-PCR), the direct activity of tetracyclines on phytoplasma cells was verified, identifying also a promising compound showing similar activity.

A phase II, single arm study of CarbopLatin plus Etoposide with Bevacizumab and Atezolizumab in patients with exTEnded-disease small-cell lung cancer (SCLC) – CeLEBrATE trial

Small cell lung cancer (SCLC) is an aggressive neuroendocrine tumor diagnosed at extended disease SCLC (ES-SCLC) stage in about 70% of cases. The new standard of treatment for patients with ES-SCLC is a combination of platinum-etoposide chemotherapy and atezolizumab or durvalumab, two programmed cell death ligand 1 (PD-L1) inhibitory monoclonal antibodies (mAb). However, the benefit derived from the addition of PD-L1 inhibitors to chemotherapy in ES-SCLC was limited and restricted to a subset of patients. The vascular endothelial growth factor (VEGF) is the most important pro-angiogenic factor implicated in cancer angiogenesis, which is abundant in SCLC and associated with poor prognosis. Antiangiogenic agents, such as bevacizumab, a humanized mAb against VEGF, added to platinum-etoposide chemotherapy improved progression-free survival in SCLC in two trials, but it did not translate into a benefit in overall survival. Nevertheless, VEGF has also acts as a mediator of an immunosuppressive microenvironment and its inhibition can revert the immune-suppressive tumor microenvironment and potentially enhance the efficacy of immunotherapies. Based on available preclinical data, we hypothesized that VEGF inhibition by bevacizumab could improve atezolizumab efficacy in a synergistic way and designed a phase II single-arm trial of bevacizumab in combination with carboplatin, etoposide, and atezolizumab as first-line treatment in ES-SCLC. The trial, which is still ongoing, enrolled 53 patients, including those with treated or untreated asymptomatic brain metastases (provided criteria are met), who received atezolizumab, bevacizumab, carboplatin and etoposide for 4-6 cycles (induction phase), followed by maintenance with atezolizumab and bevacizumab for a maximum of 18 total cycles or until disease progression, patient refusal, unacceptable toxicity. The evaluation of efficacy of the experimental combination in terms of 1-year overall survival rate is not yet mature (primary objective of the trial). The combination was feasible and the toxicity profile manageable (secondary objective of the trial).