A tecnologia de microarray no estudo do câncer de cabeça e pescoço

(Microarray technology in study of head neck cancer). The microarray technology is a tool for global analysis of gene expression that allows investigating hundreds or thousands of genes in a sample using a hybridization reaction. This technology is based on hybridization between labeled targets derived from biological samples and an array of many DNA probes immobilized on a solid matrix, representing the genes of interest. The simultaneous study of hundreds of genes became the microarray technique a very important tool of global analysis, with applications in several areas, including the study of the development of cancer. Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the fifth most common cancer worldwide, with a global annual incidence of 780,000 new cases. Large-scale studies involving microarrays have identified specific gene expression signatures associated with expression changes in HNSCC samples compared to normal tissue, as well as genes involved in clinical outcome and metastasis. However, the considerable heterogeneity among these studies occurs due to experimental design, number of samples, disease sites and stage, choice of microarray platform and results validation. Thus, there is much to be validated, before the technique has clinical utility. In relation to head and neck neoplasia, the large-scale gene analysis is very important, since the clinical and histopathological methods currently used appear to be insufficient to predict clinical progression and response to treatment. Thus, this approach could result in more effective diagnostic and prognostic and most appropriate therapy for this neoplasia.

O papel da proteína TET2 no enriquecimento do DNA genômico em 5-hidroximetilcitosina em lesões elanocíticas pré-malignas e pré-metastáticas com fenótipo stem cell-like

Durante a transformação maligna dos melanócitos, padrões de metilação do DNA encontram-se alterados, afetando a expressão gênica. As citosinas metiladas (5mC) podem ser hidroxiladas pelas dioxigenases dependentes de 2-oxoglutarato e Fe(II), Tet1, 2 e 3, resultando na formação de 5-hidroximetilcitosina (5hmC) (Globisch et al., 2010; Ko et al., 2010). A 5hmC pode agir tanto como um produto intermediário na desmetilação ativa do DNA quanto na desmetilação passiva ao longo de sucessivas replicações, o que pode contribuir com a dinâmica da metilação do DNA (Tahiliani et al., 2009). Além disso, demonstrou-se que Tet1 e Tet2 são expressas em células tronco embrionárias (Ito et al., 2010) e que 5hmC desempenha importante papel na manutenção e diferenciação destas células (Koh et al., 2011). No entanto, o papel da 5hmC e das proteínas Tet tanto na fisiologia normal quanto em doenças como o câncer ainda não está claro. Utilizando um modelo linear de progressão do melanoma, observamos aumento na expressão gênica de Tet1 nas linhagens celulares correspondendo a melanócitos pré-malignos (4C) e células de melanoma não metastático (4C11-), comparado a melanócitos não tumorigênicos (melan-a) e células de melanoma metastático (4C11+). Em relação à expressão proteica, há um aumento da expressão de Tet1 nas linhagens 4C e 4C11+, o que pode ser relacionado às fases de transição epitélio-mesênquima (EMT) e mesênquima-epitélio (MET), respectivamente. Além disso, constatamos aumento na expressão gênica e proteica de Tet2 na linhagem metastática 4C11+, o que pode indicar diferenças funcionais entre as proteínas Tet1 e Tet2. Também verificamos aumento significativo do conteúdo de 5hmC na linhagem 4C11+, o que se correlaciona com maior expressão gênica e proteica de Tet2. Por fim, linhagens humanas de melanoma metastático menos agressivas apresentaram aumento significativo na expressão dos genes TET1 ...

Análise funcional das proteínas desacopladas mitocondriais de plantas utilizando RNA-seq e mutantes de inserção

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudos funcionais da rgs-CaM, uma calmodulina envolvida na supressão de silenciamento por RNA

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Receptor tipo quinase de tomate: caracterização molecular e implicações nas infecções virais

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Bidens pilosa L: efeitos protetores na inflamação intestinal

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Resposta imune inata em sistema nervoso central de camundongos experimentalmente infectados com amostras de vírus rábico isoladas de diferentes espécies

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Identificação de regiões com variação no número de cópias de segmentos de DNA em bovinos de raças autóctones espanholas

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Investigação do perfil de metilação de genes candidatos a biomarcadores na endometriose

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Alterações epigenéticas do gene RASSF1 e investigação de modulação gene-específica por non-coding RNA em linhagens celulares derivadas de carcinomas mamários

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Alterações epigenéticas e do número de cópias do gene SFN em carcinomas mamários

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Caracterização de osteoblastos diferenciados de células-tronco mesenquimais da medula óssea de ratos espontâneamente hipertensos (SHR)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Correlação das características ultrassonográficas com perfil imunoistoquímico dos tumores mamários malignos

Pós-graduação em Ginecologia, Obstetrícia e Mastologia - FMB

Busca de novos alvos terapêuticos no tratamento de câncer de pulmão utilizando ferramentas de biologia de sistemas

A quimioterapia e uma das formas de tratamentos para o câncer, cujo processo e pela aplicação de medicamentos que alteram a síntese de DNA, interrompendo a divisão celular. No caso do câncer de pulmão, a difículdade está no fato de que as células cancerígenas criam quimiorresistência após um determinado período de tempo. Se o indivíduo desenvolver o câncer de pulmão novamente, deverá ser aplicado outro quimioterápico no paciente, e assim por diante. Nos tratamentos atuais são utilizados combinações de drogas para contornar o problema da quimiorresistência. Este trabalho utilizou a biologia de sistemas para encontrar novos alvos protéicos para auxiliar no desenvolvimento de novos quimioterápicos para o tratamento do câncer de pulmão. Foi construída uma rede baseada nos alvos protéicos já conhecidos. A rede foi expandida com o intuito de buscar quais são as proteínas que interagem com os alvos protéicos á conhecidos. Após a expansão, foram utilizadas análises de centralidades para evidenciar as proteínas mais importantes na rede, e correlacionamos com informação de expressão gênica para verificar se as proteínas mais importantes do ponto de vista topológico estão diferencialmente sub ou super expressas. A análise de centralidade junto a mostra dos dados de expressão gênica convergiu para um bom resultado, foi possível evidenciar algumas proteínas que podem ser utilizadas como novos alvos quimioterápicos

Análise funcional do gene GPC3 em carcinoma renal de células claras

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)