Evaluation of oxacillin and cefoxitin disks for detection of resistance in coagulase negative staphylococci

Coagulase-negative Staphylococcus spp. was considered nonpathogenic until the emergence of multiresistance and the demonstration of their participation as infectious agents. In Brazil, oxacillin resistance may be present in over 80% of isolates, and the Clinical and Laboratory Standards Institute standardized a disk-diffusion method to predict this resistance in Staphylococcus. The aim of this study was to evaluate the variability among commercial disks of oxacillin (1 µg) and cefoxitin (30 µg) widely used in clinical laboratories of microbiology, compared with mecA gene and minimum inhibitory concentration (MIC) of oxacillin. The use of oxacillin and cefoxitin disks simultaneously allowed the detection of important differences, particularly, in less frequent species such as S. cohnii, S. haemolyticus, S. saprophyticus, and S. sciuri. Disks of cefoxitin of the brand 2 displayed good correlation with the mecA gene (98.7%) and oxacillin MIC (97.8%), while major discrepancies were observed using disks of brand 1. One of the critical points in the diffusion disk test is the quality of the disks: the use of better quality disks associated with molecular methods lead to better results to define the best antibiotic therapy.

Comparative evaluation of different immunoassays for the detection of Taenia solium cysticercosis in swine with low parasite burden

Seven swine were experimentally infected with Taenia solium eggs and blood samples from each animal were periodically collected. At the end of the experiment (t140) the animals did not show clinical aspects of cysticercosis or parasites in tongue inspection. All animals were slaughtered and cut into thin slices in searching for cysts. The number of cysts found in each animal varied from 1 to 85. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) tests for antibody (Ab) detection and for antigen (Ag) detection were performed, which presented respectively 71 and 57% of positivity. By immunoblot (IB), using 18/14(T. crassiceps Ag) or lentil-lectin-purified glycoproteins from T. solium Ag (LLGP) as Ag, five (71%) and six (86%) animals were positive, respectively. The association between Ag-ELISA with any IB (18/14 or LLGP) allowed the detection of all animals at 140 days post-experimental infection (days p.e.i.). The use of IB 18/14 combined to the Ag-ELISA allowed the detection of all animals since 70 days p.e.i., and the association between IB LLGP and Ag-ELISA allowed the detection of all animals since 112 days p.e.i. While all animals could be considered healthy by conventional screening tests, the use of immunoassays for detecting Ab and Ag showed better accuracy; therefore it would be more useful than usual clinical examination for screening cysticercosis in slightly infected pigs.

A new species of the genus Panstrongylus from French Guiana (Heteroptera; Reduviidae; Triatominae)

Panstrongylus mitarakaensis n. sp. is described from French Guiana. Morphological characters are provided. This small species, less robust than other Panstrongylus species, shows a pronotum shape similar to species of the "P. lignarius complex". However, others characters such as the postocular part of head, the obsolete tubercle on the anterior lobe of pronotum, and the lateral process on the antenniferous tubercle distinguish it from the species in that complex. The taxonomic key of the genus Panstrongylus is actualized.

Description of a new phlebotomine species, Evandromyia gaucha sp. nov. (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae), from Rio Grande do Sul, Brazil

The present paper describes a new phlebotomine species, Evandromyia gaucha sp. nov., based on seven females found in the municipality of Caçapava do Sul, state of Rio Grande do Sul, Brazil. The new species belong to rupicola series and differs from other sand flies of the genus Evandromyia due to the presence of a rounded spermatheca head with its size very close to that of the spermatheca body.

Mapping the molecular characteristics of Brazilian human T-cell lymphotropic virus type 1 Env (gp46) and Pol amino acid sequences for vaccine design

This study was carried out to evaluate the molecular pattern of all available Brazilian human T-cell lymphotropic virus type 1 Env (n = 15) and Pol (n = 43) nucleotide sequences via epitope prediction, physico-chemical analysis, and protein potential sites identification, giving support to the Brazilian AIDS vaccine program. In 12 previously described peptides of the Env sequences we found 12 epitopes, while in 4 peptides of the Pol sequences we found 4 epitopes. The total variation on the amino acid composition was 9 and 17% for human leukocyte antigen (HLA) class I and class II Env epitopes, respectively. After analyzing the Pol sequences, results revealed a total amino acid variation of 0.75% for HLA-I and HLA-II epitopes. In 5 of the 12 Env epitopes the physico-chemical analysis demonstrated that the mutations magnified the antigenicity profile. The potential protein domain analysis of Env sequences showed the loss of a CK-2 phosphorylation site caused by D197N mutation in one epitope, and a N-glycosylation site caused by S246Y and V247I mutations in another epitope. Besides, the analysis of selection pressure have found 8 positive selected sites (w = 9.59) using the codon-based substitution models and maximum-likelihood methods. These studies underscore the importance of this Env region for the virus fitness, for the host immune response and, therefore, for the development of vaccine candidates.

Sexually transmitted infections, bacterial vaginosis, and candidiasis in women of reproductive age in rural Northeast Brazil: a population-based study

Population-based data on sexually transmitted infections (STI), bacterial vaginosis (BV), and candidiasis reflect the epidemiological situation more accurately than studies performed in specific populations, but such data are scarce. To determine the prevalence of STI, BV, and candidiasis among women of reproductive age from a resource-poor community in Northeast Brazil, a population-based cross sectional study was undertaken. All women from seven hamlets and the centre of Pacoti municipality in the state of Ceará, aged 12 to 49 years, were invited to participate. The women were asked about socio-demographic characteristics and genital symptoms, and thereafter examined gynaecologically. Laboratory testing included polymerase chain reaction (PCR) for human papillomavirus (HPV), ligase chain reaction (LCR) for Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae, ELISA for human immunodeficiency virus (HIV), venereal disease research laboratory (VDRL) and fluorescent treponema antibody absorption test (FTA-ABS) for syphilis, and analysis of wet mounts, gram stains and Pap smears for trichomoniasis, candidiasis, and BV. Only women who had initiated sexual life were included in the analysis (n = 592). The prevalences of STI were: HPV 11.7% (95% confidence interval: 9.3-14.7), chlamydia 4.5% (3.0-6.6), trichomoniasis 4.1% (2.7-6.1), gonorrhoea 1.2% (0.5-2.6), syphilis 0.2% (0.0-1.1), and HIV 0%. The prevalence of BV and candidiasis was 20% (16.9-23.6) and 12.5% (10.0-15.5), respectively. The most common gynaecological complaint was lower abdominal pain. STI are common in women in rural Brazil and represent an important health threat in view of the HIV pandemic.

Effects of Trypanosoma brucei tryptophanyl-tRNA synthetases silencing by RNA interference

The kinetoplast genetic code deviates from the universal code in that 90% of mitochondrial tryptophans are specified by UGA instead of UGG codons. A single nucleus-encoded tRNA Trp(CCA) is used by both nuclear and mitochondria genes, since all kinetoplast tRNAs are imported into the mitochondria from the cytoplasm. To allow decoding of the mitochondrial UGA codons as tryptophan, the tRNA Trp(CCA) anticodon is changed to UCA by an editing event. Two tryptophanyl tRNA synthetases (TrpRSs) have been identified in Trypanosoma brucei: TbTrpRS1 and TbTrpRS2 which localize to the cytoplasm and mitochondria respectively. We used inducible RNA interference (RNAi) to assess the role of TbTrpRSs. Our data validates previous observations of TrpRS as potential drug design targets and investigates the RNAi effect on the mitochondria of the parasite.

Parasitism of two zoonotic reservoirs Dasyprocta leporina and D. fuliginosa (Rodentia) from Amazonas, with Trichostrongylina nematodes (Heligmonellidae): description of a new genus and a new species

A new genus and a new species of Heligmonellidae nematodes are described parasiting the stomach of three agoutis (two Dasyprocta fuliginosa and one D. leporina) captured in the middle and high Negro river microregion, state of Amazonas, Brazil. The new genus, as well as its type-species, are closely related to the trichostrongylids included in Fuellebornema, particularly on what concerns the pattern of the caudal bursa, but differing from them by the characteristics of the synlophe, that presents a poorly developed carene, when compared to the referred number of body ridges in Freitastrongylus n. gen. and consequently in F. angelae n. sp.,in which the ridges are well developed and the carene at mid-body has a similar size when compared to the ridge situated in front of the right field (ridge no. 5). Caudal bursa is of the type 1-4, with rays 9 shorter than rays 10, with a very long genital cone.

Immunological and microbiological activity of Davilla elliptica St. Hill. (Dilleniaceae) against Mycobacterium tuberculosis

Mycobacterium tuberculosis is responsible for over 8 million cases of tuberculosis (TB) annually. Natural products may play important roles in the chemotherapy of TB. The immunological activity of Davilla elliptica chloroform extract (DECE) was evaluated in vitro by the determination of hydrogen peroxide (H2O2), nitric oxide (NO), and tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) release in peritoneal macrophages cultures. DECE was also tested for its antimycobacterial activity against M. tuberculosis using the microplate alamar blue assay. DECE (50, 150, 250 µg/ml) stimulated the production of H2O2 (from 1,79 ± 0,23 to 7,27 ± 2,54; 15,02 ± 2,86; 20,5 ± 2,1 nmols) (means ± SD), NO (from 2,64 ± 1,02 to 25,59 ± 2,29; 26,68 ± 2,41; 29,45 ± 5,87 µmols) (means ± SD) and TNF-alpha (from 2,44 ± 1,46 to 30,37 ± 8,13; 38,68 ± 1,59; 41,6 ± 0,90 units/ml) (means ± SD) in a dose-dependent manner and also showed a promising antimycobacterial activity with a minimum inhibitory concentration of 62,5 µg/ml. This plant may have therapeutic potential in the immunological and microbiological control of TB.

Recognition of the epidemiological significance of Neisseria meningitidis capsular serogroup W135 in the Rio de Janeiro region, Brazil

Neisseria meningitidis retains its ability to cause endemic and hiperendemic disease in human population living in any environment, as well as localized outbreaks and massive epidemics in civilians and military personnel. In Rio de Janeiro it has been reported in the 1990s as prolonged outbreak of serogroup B and at least one epidemic of serogroup C was well defined, both demanding quick action by the Public Health authorities. We report here the emergence of serogroup W135 meningococcal disease causing endemic and case cluster in Rio de Janeiro during the first years of this new century.

Kilpailija-analyysi Keravan ruokaravintoloista

Opinnäytetyön tavoitteena oli luoda kilpailija-analyysi Keravan keskustan ruokaravintoloista. Opinnäytetyön toimeksiantaja oli perheyritys HS Ravintolat KY jolla on ollut alustavia suunnitelmia perustaa lounasravintola esimerkiksi Keravalle. Ennen ravintolan perustamista yritys halusi selvittää minkälaisia ravintoloita kyseisillä markkinoilla on. Opinnäytetyössä haluttiin myös tutkia Keravan keskustan ruokaravintoloiden kilpailutilannetta. Lisäksi haettiin vastausta kysymykseen, onko näillä ruokaravintolamarkkinoilla tilaa uudelle yksityiselle lounasravintolalle. Tutkimuksessa kartoitettiin kaikki Keravalla sijaitsevat ravintolat ja jaettiin ne seuraaviin ryhmiin: baarit, pizzeriat, kebabravintolat, pikaruokalat, grillit, kahvilat, kahvilaravintolat, lounasravintolat ja ravintolat. Kilpailija-analyysi tehtiin niistä ravintoloista ja kahviloista jotka sijaitsivat 04200 postitoimialueella eli noin kilometrin säteellä toisistaan Keravan keskustassa. Kaikissa keskustan ravintoloissa ja kahviloissa vierailtiin ja vierailujen aikana vastattiin etukäteen laadittuun kyselylomakkeeseen. Lomakkeessa selvitettiin muun muassa ravintoloiden asiakaskuntaa, tuotevalikoimaa, tavoitteita, oletuksia ja arvomaailmaa. Perustettavan ravintolan tärkeimmistä kilpailijoista tehtiin myös SWOT-analyysi. Tutkimus suoritettiin Keravalla kahtena päivänä syksyllä 2006 ja yhtenä päivänä keväällä 2007. Tutkimustuloksista selvisi, että Keravalla on yhteensä 58 ravintolaksi luokiteltavaa paikkaa joista yli 62% sijaitsee keskustan alueella. Kilpailija-analyysiin kelpuutettiin keskustassa sijaitsevat ravintolat ja kahvilat. Toimipaikkoja löytyi yhteensä 17 ja niistä seitsemän oli kahviloita. Keskustan 10:stä ravintolasta peräti kuusi oli teemaravintoloita ja seitsemästä kahvilasta vain kaksi oli perinteisiksi kahviloiksi luokiteltavia. Lisäksi keskustan ravintolat ja kahvilat olivat erilaistaneet toimintaansa muun muassa pitopalvelulla, kabinettien ja astioiden vuokrauksella sekä yksityistilaisuuksilla. Nämä erilaistamisen toimet kertoivat ravintoloiden välisestä kovasta kilpailusta. Opinnäytetyön teoreettinen osuus käsitteli kilpailija-analyysiä ja erilaisia kilpailija-analyysimalleja. Analyysimalleissa keskityttiin eniten Porterin malliin. Teoriaosuudessa käsiteltiin myös asiakasmarkkinointia ja erityisesti markkinoinnin osa-alueita segmentointia ja asemointia. Opinnäytetyön pohdintaosuudessa mietittiin, minkälaisella ravintolalla tai kahvilalla olisi mahdollisuuksia menestyä Keravan ruokaravintolamarkkinoilla.

Intervalo hídrico ótimo no monitoramento da compactação e da qualidade física de um latossolo vermelho cultivado com soja

A qualidade física do solo é essencial ao crescimento das plantas e à sustentabilidade dos sistemas agrícolas. O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência do intervalo hídrico ótimo (IHO) no monitoramento da compactação e qualidade física do solo para soja em cultivo de sequeiro e irrigado. O experimento foi realizado em Latossolo Vermelho eutroférrico (21 ° 14 ' 53 " S; 48 ° 17 ' 20 " W; 540 m de altitude). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado em esquema fatorial 6 x 2, com quatro repetições. Os tratamentos de compactação foram: T1 = sem compactação; T2 = 1 passada de trator de 4 t; T3 = 1; T4 = 2; T5 = 4; e T6 = 6 passadas de um trator de 11 t, no mesmo local. Foi semeada a soja (Glycine max (L.) Merrill), cultivar IAC Foscarim 31. Foram coletadas amostras indeformadas de solo nas camadas de 3-6, 8-11, 15-18 e 22-25 cm, para determinação dos atributos físicos. Na colheita, foi avaliada a produtividade de soja em microparcela de 3,37 m². No cultivo de soja sequeiro e irrigado, a produtividade diminui a partir da resistência à penetração (RP) de 1,30 e 1,64 MPa e da densidade do solo (Ds) de 1,26 e 1,29 kg dm-3, com perdas de 19,15 e 11,71 % no maior nível de compactação (RP = 2,84 MPa; Ds = 1,45 kg dm-3), respectivamente. O IHO foi reduzido pela RP até atingir a Dsc(IHO = 0) de 1,33 e 1,38 kg dm-3, no cultivo de soja sequeiro e irrigado. O IHO é adequado no monitoramento da compactação e da qualidade física do solo para soja, quando sua aplicação é realizada com base no valor de resistência à penetração limitante e no valor de densidade crítica do solo (IHO = 0). A soja em cultivo irrigado tolera maior compactação.

Correlação linear e espacial entre a produtividade de forragem, a porosidade total e a densidade do solo de Pereira Barreto (SP)

Em relação aos sistemas de manejo adotados pelo homem, a porosidade total e a densidade do solo são atributos ativamente alterados, refletindo decisivamente sobre a produtividade vegetal agrícola. No ano agrícola de 2005, na Fazenda Bonança, no município de Pereira Barreto, Estado de São Paulo, Brasil, foram analisadas a produtividade de forragem do milho outonal (MSF) no sistema plantio direto irrigado, a porosidade total (PT) e a densidade do solo (DS) em profundidade, em um Latossolo Vermelho distrófico. O objetivo foi estudar a variabilidade e as correlações lineares e espaciais entre os atributos da planta e do solo, visando selecionar um indicador da qualidade física do solo de boa representatividade para produtividade da forragem. Foi instalada a malha geoestatística, para coleta de dados do solo e planta, contendo 125 pontos amostrais, numa área de 2.500 m². Os atributos estudados, além de não terem variado aleatoriamente, apresentaram variabilidade dos dados entre média e baixa e seguiram padrões espaciais bem definidos, com alcance entre 6,8 e 23,7 m. Por sua vez, a correlação linear entre o atributo da planta e os do solo, em razão do elevado número de observações, foi baixa. As observações de melhor correlação com a MSF foram a DS1 e a PT1. Entretanto, do ponto de vista espacial, houve excelente correlação inversa entre a MSF e a DS1, assim como entre a DS1 e a PT1. Nos sítios onde a DS1 aumentou (1,45-1,64 kg dm-3) a MSF variou entre 11.653 e 14.552 kg ha-1; já naqueles onde diminuiu (1,35-1,45 kg dm-3) a MSF, ficou entre 14.552 e 17.450 kg ha-1. Portanto, a densidade global, avaliada na camada de 0-0,10 m (DS1), apresentou-se como satisfatório indicador da qualidade física do solo de Pereira Barreto (SP), quando destinado à produtividade de forragem do milho outonal.

Planejamento amostral da pressão de preconsolidação de um latossolo vermelho distroférrico

Atualmente, a pressão de preconsolidação (sigmap) tem sido utilizada como uma ferramenta no estudo do processo de compactação do solo. O objetivo deste trabalho foi determinar a configuração e o número adequado de amostras para determinação da sigmap em um Latossolo Vermelho distroférrico, bem como caracterizar sua variabilidade e distribuição espacial, utilizando métodos da Estatística Clássica e da Geoestatística. O estudo foi realizado em uma área experimental, no município de Lavras-MG, sob plantio convencional nos últimos 30 anos, no qual são realizados anualmente uma aração e duas gradagens. A área experimental possui dimensões de 32 x 160 m (5.120 m²), com 68 pontos distanciados a 10 m no eixo X e a 8 m no eixo Y, mais seis transectos, sendo quatro com pontos distanciados de 2 m e dois com pontos distanciados de 1 m, visando detectar variações a pequenas distâncias. Foram coletadas 98 amostras indeformadas na profundidade de 0-3 cm, as quais foram submetidas ao ensaio de compressão uniaxial, para obtenção das sigmap. Por meio dos parâmetros da Estatística Clássica, estabeleceu-se o número adequado de amostras para determinar a sigmap, que foi igual a 10 pontos. A maior variabilidade foi obtida para a sigmap (CV 14,8 %), e a menor, para a umidade do solo (CV 12,0 %). Ambas as variáveis apresentaram distribuição normal, com modelo esférico ajustado, e moderada estrutura de dependência espacial, com alcance de 19,5 e 90,0 m, respectivamente. Em futuras amostragens para determinação da sigmap, em condições similares às da área estudada, sugere-se dispor os pontos de coleta com intervalo igual ao alcance de dependência espacial, visando associar menor esforço de amostragem com maior representatividade da área. Apesar de a razão de dependência espacial encontrada para as variáveis estudadas ter sido moderada, seu alcance deve ser considerado no planejamento de novas amostragens. A declividade do solo influenciou indiretamente os valores de sigmap. O mapeamento da área permitiu observar zonas de maior e menor suscetibilidade à compactação, possibilitando a tomada de decisão sobre onde começar a trafegar para evitar danos à estrutura do solo.

Caracterização de agregados em um Latossolo Vermelho distroférrico típico submetido a diferentes doses de vinhaça

A distribuição de classes de tamanho, a quantidade e a estabilidade dos agregados constituem importantes critérios para avaliação da estrutura, a qual desempenha papel relevante nas relações entre o solo e as plantas. A vinhaça, quando aplicada ao solo, provoca aumento na atividade microbiana em conseqüência da adição da matéria orgânica nela contida. Essa atividade é acompanhada pelo aumento na produção de mucilagem, que pode favorecer a agregação e promover aumento na estabilidade estrutural do solo. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estabilidade de agregados em um Latossolo Vermelho distroférrico típico textura muito argilosa tratado com diferentes doses de vinhaça. O experimento foi conduzido na Fazenda-Escola da Universidade Estadual de Londrina no período de agosto de 1997 a agosto de 1999, num delineamento de blocos ao acaso com cinco tratamentos (doses de vinhaça) e quatro repetições. Amostras de solo foram coletadas nas profundidades de 0-10, 10-20, 20-30 e 30-40 cm. As avaliações do presente trabalho são referentes à quinta colheita (quarta soca), realizada em agosto de 1999. As doses de vinhaça foram de 0, 150, 300, 450 e 600 m³ ha-1, e os índices de agregação determinados foram diâmetro médio ponderado (DMP), diâmetro médio geométrico (DMG) e índice de estabilidade de agregados (IEA). Os resultados mostraram que as diferentes doses de vinhaça não promoveram mudanças significativas nos índices de agregação nas profundidades estudadas.