Expressão protéica diferencial entre plântulas apomíticas e zigóticas de citros

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Chalcopyrite and bornite differentially affect protein synthesis in planktonic cells of Acidithiobacillus ferrooxidans

Acidithiobacillus ferrooxidans is used in bioleaching industrial operations to recover metal ions from mineral sulfides. Chalcopyrite and bornite are copper sulfides that have the same elemental composition, but differ in their susceptibility to the bioleaching process. Our objective was to identify differentially expressed proteins in A. ferrooxidans LR cells exposed to chalcopyrite or bornite, as a sole energy source, for 24 hours. Compared to the control (without minerals), proteins were induced or repressed in planktonic cells after contact with chalcopyrite or bornite by 24 hours. These results demonstrated that the time of exposure to the copper minerals was enough to trigger distinct responses in the A. ferrooxidans metabolism. © 2007 Trans Tech Publications.

Morphology, sex ratio and gene expression of Day 14 in vivo and in vitro bovine embryos

The present study was designed to compare Day 14 bovine embryos that were produced entirely in vitro using the post-hatching development (PHD) system with in vivo-derived embryos without or with transient PHD culture from Day 7 to Day 14. Embryos on Day 14 were used for sex determination and gene expression analysis of PLAC8, KRT8, CD9, SLC2A1, SLC2A3, PGK1, HSF1, MNSOD, HSP70 and IFNT using real-time quantitative (q) polymerase chain reaction (PCR). First, Day 7 in vivo-and in vitro-produced embryos were subjected to the PHD system. A higher rate of survival was observed for in vitro embryos on Day 14. Comparing Day 14 embryos produced completely in vivo or completely in vitro revealed that the mean size of the former group was greater than that of the latter (10.29±1.83 vs 2.68±0.33mm, respectively). Expression of the HSP70 and SLC2A1 genes was down-and upregulated, respectively, in the in vitro embryos. The present study shows that in vitro embryos cultured in the PHD system are smaller than in vivo embryos and that of the 10 genes analysed, only two were differentially expressed between the two groups. These findings indicate that, owing to the poor survival rate, the PHD system is not reliable for evaluation of in vitro embryo quality. © 2013 CSIRO.

Global analysis of the sugarcane microtranscriptome reveals a unique composition of small RNAs associated with axillary bud outgrowth

Axillary bud outgrowth determines shoot architecture and is under the control of endogenous hormones and a fine-tuned gene-expression network, which probably includes small RNAs (sRNAs). Although it is well known that sRNAs act broadly in plant development, our understanding about their roles in vegetative bud outgrowth remains limited. Moreover, the expression profiles of microRNAs (miRNAs) and their targets within axillary buds are largely unknown. Here, we employed sRNA next-generation sequencing as well as computational and gene-expression analysis to identify and quantify sRNAs and their targets in vegetative axillary buds of the biofuel crop sugarcane (Saccharum spp.). Computational analysis allowed the identification of 26 conserved miRNA families and two putative novel miRNAs, as well as a number of trans-acting small interfering RNAs. sRNAs associated with transposable elements and protein-encoding genes were similarly represented in both inactive and developing bud libraries. Conversely, sequencing and quantitative reverse transcription-PCR results revealed that specific miRNAs were differentially expressed in developing buds, and some correlated negatively with the expression of their targets at specific stages of axillary bud development. For instance, the expression patterns of miR159 and its target GAMYB suggested that they may play roles in regulating abscisic acid-signalling pathways during sugarcane bud outgrowth. Our work reveals, for the first time, differences in the composition and expression profiles of diverse sRNAs and targets between inactive and developing vegetative buds that, together with the endogenous balance of specific hormones, may be important in regulating axillary bud outgrowth. © 2013 © The Author(2) [2013].

Expressão gênica das adesinas e fatores de virulência da fase miceliar e leveduriforme do complexo paracoccidioides e de sua interação com células epiteliais e fagócitos

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise por técnica de RDA (Representational Difference Analysis) da expressão gênica diferencial, para a identificação de fatores genéticos associados à produção de etanol em linhagem de Saccharomyces cerevisae

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Expressão gênica diferencial em resposta aos efeitos da proteína anti-inflamatória Anexina A1 nas células epiteliais pigmentadas da retina humana

Pós-graduação em Genética - IBILCE

Expressão gênica diferencial por cDNA-AFLP em raízes de cana-de-açúcar submetida ao déficit hídrico

Pós-graduação em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) - FCAV

Isolamento, caracterização e expressão em sistema bacteriano de um gene que codifica uma proteína transportadora de lipídeos de Piper nigrum

A pimenteira-do-reino (Piper nigrum L.) constitui uma das espécies de pimenta mais amplamente utilizadas no mundo, pertencendo à família Piperaceae, a qual compreende cerca de 1400 espécies distribuídas principalmente no continente americano e sudeste da Ásia, onde esta cultura originou. A pimenteira-do-reino foi introduzida no Brasil no século XVII, e tornou-se uma cultura de importância econômica desde 1933. O Estado do Pará é o principal produto brasileiro de pimenta-do-reino, contudo sua produção vem sendo afetada pela doença fusariose causada pelo fungo Fusarium solani f. sp. piperis. Estudos prévios revelaram a identificação de sequencias de cDNA diferencialmente expressas durante a interação da pimenteira-do-reino com o F. solani f. sp. piperis. Entre elas, uma sequencia de cDNA parcial que codifica para uma proteína transportadora de lipídeos (LTP), a qual é conhecida por seu importante papel na defesa de plantas contra patógenos e insetos. Desta forma, o objetivo principal deste trabalho foi isolar e caracterizar as sequencias de cDNA e genômica de uma LTP de pimenteira-do-reino, denominada PnLTP. O cDNA completo da PnLTP isolado por meio de experimentos de RACE apresentou 621 bp com 32 pb and 235 bp nas regiões não traduzidas 5‘ e 3‘, respectivamente. Este cDNA contem uma ORF de 354 bp codificando uma proteína deduzida de 117 resíduos de aminoácidos que apresentou alta identidade com LTPs de outras espécies vegetais. Análises das sequencias revelou que a PnLTP contem um potencial peptídeo sinal na extremidade amino-terminal e oito resíduos de cisteína preditos por formar quatro pontes de dissulfeto, as quais poderiam contribuir para a estabilidade desta proteína. O alinhamento entre as sequencias de cDNA e genômica revelou a ausência de introns na região codificante do gene PnLTP, o que está de acordo ao encontrado em outros genes de LTPs de plantas. Por último, a PnLTP madura foi expressa em sistema bacteriano. Experimentos adicionais serão realizados com o objetivo de avaliar a habilidade da PnLTP recombinante em inibir o crescimento do F. solani f. sp. piperis.

Perfil de expressão gênica de cana-de-açúcar submetida a estresse biótico com Xanthomonas albilineans

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise da expressão gênica global da bactéria Xylella fastidiosa em laranja doce por microarranjos de DNA

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Validação de um microarranjo para avaliação da expressão gênica diferencial no músculo esquelético de bovinos

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Criotolerância de embriões Bos Taurus Indicus e Bos Taurus Taurus produzidos in vitro e in vivo

Pós-graduação em Medicina Veterinária - FMVZ

Expressão de microRNAs cardíacos induzida por treinamento físico durante insuficiência cardíaca

Pós-graduação em Biologia Geral e Aplicada - IBB

Post-partum anoestrus in tropical beef cattle: A systems approach combining gene expression and genome-wide association results

The length of the post-partum anoestrous interval affects reproductive efficiency in many tropical beef cattle herds. In this study, results from genome-wide association studies (Experiment 1: GWAS) and gene expression (Experiment 2: microarray) were combined in a systems approach to reveal genetic markers, genes and pathways underlying the physiology of post-partum anoestrus in tropically adapted cattle. The microarray study measured the expression of 13,964 genes in the hypothalamus of Brahman cows. A total of 366 genes were differentially expressed (DE) in the post-partum period, when acyclic cows were compared to cows that had resumed ovarian cycles. Associated markers (P < 0.05) from a high density GWAS pointed to 2829 genes that were associated with post-partum anoestrous interval (PPAI) in two populations of beef cattle: Brahman and Tropical composite. Together the experiments provided evidence for 63 genes that are likely to influence the resumption of ovulation post-partum in tropically adapted beef cattle. Functional annotation analysis revealed that some of the 63 genes have known roles in hormonal activity, energy balance and neuronal synapse plasticity. Polymorphisms within candidate genes identified by this systems approach could have biological significance in post-partum anoestrus and help select Zebu (Bos indicus) influenced cattle with genetic potential for shorter post-partum anoestrus. Crown Copyright (C) 2014 Published by Elsevier B.V. All rights reserved.