The sea-level conundrum: case studies from palaeo-archives

Uncertainties in sea-level projections for the 21st century have focused ice sheet modelling efforts to include the processes that are thought to be contributing to the recently observed rapid changes at ice sheet margins. This effort is still in its infancy, however, leaving us unable to make reliable predictions of ice sheet responses to a warming climate if such glacier accelerations were to increase in size and frequency. The geological record, however, has long identified examples of nonlinear ice sheet response to climate forcing (Shackleton NJ, Opdyke ND. 1973. Oxygen isotope and paleomagnetic stratigraphy of equatorial Pacific core V28–239, late Pliocene to latest Pleistocene. Geological Society of America Memoirs145: 449–464; Fairbanks RG. 1989. A 17,000 year glacio-eustatic sea level record: influence of glacial melting rates on the Younger Dryas event and deep ocean circulation. Nature342: 637–642; Bard E, Hamelin B, Arnold M, Montaggioni L, Cabioch G, Faure G, Rougerie F. 1996. Sea level record from Tahiti corals and the timing of deglacial meltwater discharge. Nature382: 241–244), thus suggesting an alternative strategy for constraining the rate and magnitude of sea-level change that we might expect by the end of this century. Copyright © 2009 John Wiley & Sons, Ltd.

Actinomyces canis sp. nov., isolated from dogs

Three strains of a previously undescribed catalase-positive Actinomyces-like bacterium were isolated from dogs. Biochemical testing and PAGE analysis of whole-cell proteins indicated that the strains were phenotypically highly related to each other but different from previously described Actinomyces and Arcanobacterium species. Sequencing of 16S rRNA showed that the unknown bacterium represents a new subline within a cluster of species which includes Actinomyces hyovaginalis, Actinomyces georgiae, Actinomyces meyeri, Actinomyces odontolyticus, Actinomyces radingae and Actinomyces turicensis. On the basis of phenotypic evidence and 16S rRNA sequence divergence levels (greater than 5% with recognized Actinomyces species) it is proposed that the unknown strains from canine sources be classified as a new species with the name Actinomyces canis sp. nov. The type strain of Actinomyces canis is CCUG 41706T (= CIP 106351T).

In vitro fermentation of rice bran combined with Lactobacillus acidophilus 14 150B or Bifidobacterium longum 05 by the canine faecal microbiota

The fermentability of rice bran (RB), alone or in combination with one of two probiotics, by canine faecal microbiota was evaluated in stirred, pH-controlled, anaerobic batch cultures. RB enhanced the levels of bacteria detected by probes Bif164 (bifidobacteria) and Lab158 (lactic acid bacteria); however, addition of the probiotics did not have a significant effect on the predominant microbial counts compared with RB alone. RB sustained levels of Bifidobacterium longum 05 throughout the fermentation; in contrast, Lactobacillus acidophilus 14 150B levels decreased significantly after 5-h fermentation. RB fermentation induced changes in the short-chain fatty acid (SCFA) profile. However, RB combined with probiotics did not alter the SCFA levels compared with RB alone. Denaturing gradient gel electrophoresis analysis of samples obtained at 24 h showed a treatment effect with RB, which was not observed in the RB plus probiotic systems. Overall, the negative controls displayed lower species richness than the treatment systems and their banding profiles were distinct. This study illustrates the ability of a common ingredient found in pet food to modulate the canine faecal microbiota and highlights that RB may be an economical alternative to prebiotics for use in dog food.

Effects of a novel galactooligosaccharide on the faecal microbiota of healthy and inflammatory bowel disease cats during a randomized, double-blind, cross-over feeding study

Inflammatory bowel disease (IBD) is a common gastrointestinal disorder of cats with no known aetiological agent. Previous work has suggested that the faecal microbiota of IBD cats is significantly different from that of healthy cats, including significantly lower bifidobacteria, bacteroides and total counts in IBD cats and significantly lower levels of sulfate-reducing bacteria in healthy cats. Prebiotics, including galactooligosaccharides (GOS), have been shown to elicit a bifidogenic effect in humans and other animals. The purpose of the current study was to examine the impact of a novel GOS supplementation on the faecal microbiota of healthy and IBD cats during a randomized, double-blind, cross-over feeding study. Eight oligonucleotide probes targeting specific bacterial populations and DAPI stain (total bacteria) were used to monitor the feline faecal microbiota. Overall, inter-animal variation was high; while a trend of increased bifidobacterial levels was seen with GOS supplementation it was not statistically significant in either healthy or IBD cats. No significant differences were observed in the faecal microbiota of IBD cats and healthy cats fed the same diet. Members of the family Coriobacteriaceae (Atopobium cluster) were found to be the most abundant bacteria in the feline microbiota.

In vitro effects of synbiotic fermentation on the canine faecal microbiota.

Stirred, pH-controlled anaerobic batch cultures were used to investigate the in vitro effects of galacto-oligosaccharides (GOS) alone or combined with the probiotic Bifidobacterium bifidum 02 450B on the canine faecal microbiota of three different donors. GOS supported the growth of B. bifidum 02 450B throughout the fermentation. Quantitative analysis of bacterial populations by FISH revealed significant increases in Bifidobacterium spp. counts (Bif164) and a concomitant decrease in Clostridium histolyticum counts (Chis150) in the synbiotic-containing vessels compared with the controls and GOS vessels. Vessels containing probiotic alone displayed a transient increase in Bifidobacterium spp. and a transient decrease in Bacteroides spp. Denaturing gradient gel electrophoresis analysis showed that GOS elicited similar alterations in the microbial profiles of the three in vitro runs. However, the synbiotic did not alter the microbial diversity of the three runs to the same extent as GOS alone. Nested PCR using universal primers, followed by bifidobacterial-specific primers illustrated low bifidobacterial diversity in dogs, which did not change drastically during the in vitro fermentation. This study illustrates that the canine faecal microbiota can be modulated in vitro by GOS supplementation and that GOS can sustain the growth of B. bifidum 02 450B in a synbiotic combination.

Investigation of the faecal microbiota associated with canine chronic diarrhoea.

Diarrhoea is a common problem in dogs and can result in disturbance of the normal intestinal microbiota. However, little is known about the gastrointestinal microbiota of dogs with chronic diarrhoea and controlled canine studies of dietary management are scarce. The aims of this study were to investigate the predominant faecal microbiota of chronic diarrhoea dogs and to examine the effect(s) of a fibre blend on the canine faecal microbiota. A 3-week fibre supplementation feeding study was performed in nine chronic diarrhoea and eight control dogs. Atopobium cluster, Lactobacillus-Enterococcus group and Clostridium cluster XIV were the predominant bacterial groups in all dogs. Chronic diarrhoea dogs had significantly higher Bacteroides counts at baseline and significantly lower Atopobium cluster counts following fibre supplementation compared with control dogs. Atopobium cluster levels increased significantly in control dogs, while counts of sulphate-reducing bacteria decreased significantly and Clostridium clusters I and II counts increased significantly in chronic diarrhoea dogs during fibre supplementation. Microbial profiles (detected by denaturing gradient gel electrophoresis) demonstrated interindividual variation, with greater similarity seen between the chronic diarrhoea and control dogs' profiles after fibre supplementation compared with baseline. In conclusion, fibre supplementation induced changes in the canine faecal microbiota, with greater resemblance between the microbiota of chronic diarrhoea and control dogs after this dietary modulation.

Determinação simultânea de Rifampicina, Isoniazida, Pirazinamida e Etambutol em comprimidos com doses fixas combinadas

Os comprimidos utilizados no tratamento da tuberculose possuem quatro fármacos associados, isoniazida, pirazinamida, etambutol e rifampicina, e são distribuídos gratuitamente pelo Sistema Único de Saúde. Os métodos analíticos oficiais para analisar este medicamento estão especificados na Farmacopeia Americana 36a edição e na Farmacopeia Internacional 4a edição. Porém, estes compêndios oficiais não possuem monografias para análise simultânea dos quatro fármacos. O objetivo deste estudo foi desenvolver uma metodologia para determinar simultaneamente os princípios ativos em comprimidos dose fixa combinada, utilizando-se cromatografia a líquido de alta eficiência com detector de ultravioleta-visível, pois é de grande importância para o controle da qualidade do medicamento. O método desenvolvido utilizou coluna cromatográfica C18 (250 x 4,6) mm e 5 μm, fase móvel constituída de fase aquosa (85 % tampão formiato de amônio 0,3 mol/L pH 5, 15 % metanol e 0,005 mol/L de Cu2+ ou 250 mg/L de CuSO4.5H2O) e fase orgânica (metanol, 0,1 % de trietilamina e 0,2 % de ácido fórmico). O fluxo foi de 1,0 mL/min e comprimento de ondade 265 nm para isoniazida, pirazinamida e o etambutol e de 335 nm para rifampicina. Este método apresentou desvio padrão relativo inferior a 2,0 % na precisão e linearidade para os quatro fármacos estudados.

Avaliação dos conhecimentos e procedimentos em biossegurança de trabalhadores de laboratórios nível de biossegurança 3

A Biossegurança constitui um campo do conhecimento com limites amplos e em constante construção. Entretanto, no Brasil, sua evolução teve fraco acompanhamento, especialmente em relação aos conhecimentos e procedimentos dos profissionais e infraestrutura dos laboratórios nível de Biossegurança 3, com poucos dados que possam indicar o grau de desenvolvimento e aplicabilidade de suas normas nas diversas instituições de saúde. Contudo, não bastam a adequação e funcionabilidade da infraestrutura predial, mas sim o conhecimento das necessidades dos usuários no sentido de propiciar aceitação das normas de Biossegurança por meio da conscientização dos riscos levando à mudança na conduta e no comportamento. Para isto, torna-se imprescindível a elaboração de treinamentos teóricos e práticos com atualizações constantes dos profissionais da área de saúde que deverão ser avaliados periodicamente para que haja melhorias nos programas de treinamentos oferecidos, uma vez que esses programas visam a garantir a qualidade e a segurança dos profissionais, dos ambientes internos e externos, à população em geral e a qualidade dos resultados pretendidos. Neste contexto, este trabalho teve, como objetivo principal, avaliar, a partir da pesquisa descritiva com abordagem qualitativa e exploratória, os dados coletados por questionários e entrevistas estruturadas, aplicadas aos 37 profissionais e nove gestores dos seis laboratórios NB3 participantes. A análise dos dados foi feita pela abordagem da multirreferencialidade, considerando os conhecimentos e procedimentos em Biossegurança e os possíveis impactos das estratégias dos últimos treinamentos oferecidos a esses profissionais, assim como as condições das instalações laboratoriais no país Dentre as respostas obtidas, há constatações importantes: alguns profissionais relataram não ter recebido treinamento específico para o início dos trabalhos, demonstrando falta de organização e critérios, por parte das instituições e gestores, para o ingresso de novos trabalhadores em laboratórios NB3; não houve padronização de conceitos e percepções relacionados à Biossegurança dentre os profissionais avaliados; mais da metade dos laboratoristas, incluindo gestores, alegaram trabalhar sozinhos em ambientes nível 3; a maior parte dos profissionais relatou que os laboratórios foram bem construídos mas todos, incluindo usuários e gestores, afirmaram que gostariam que a situação atual fosse melhor. Em relação à gestão dos laboratórios, foram relatadas várias falhas, tais como falta ou não atualização de POP específico para o trabalho em NB3, ausência de documentos de notificação de acidentes, falta de acompanhamento dos profissionais destinados à limpeza do laboratório NB3, ausência de realização de exames clínicos, imunizações e armazenamento de soro base como controle. De acordo com as respostas apresentadas, observamos que nem todos os indivíduos, incluídos neste estudo, trabalham da maneira correta ou seguem uma metodologia de trabalho padronizada, deficiência relatada, inclusive, pela maioria dos próprios profissionais A realização dos cursos de Biossegurança e treinamentos somente não garantem preparo pleno dos profissionais para o exercício de suas obrigações em laboratórios NB3. Esta atividade e o monitoramento das instalações NB3 devem ser contínuos e de responsabilidade dos profissionais e das instituições, garantindo que as rotinas de trabalho estejam de acordo com as normas de Biossegurança