Estudos estruturais experimentais e teóricos com proteínas do veneno da serpente Bothrops jararacussu

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Fabricação e caracterização estrutural de filmes evaporados de ftalocianinas

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise da potencialidade a condução do BDT através da densidade eletrônica de estados via tight binding e desenvolvimento de software (B3J)

Neste trabalho nos propomos a fazer um estudo acerca da potencialidade de condução eletrônica no polímero BDT (1,3-benzoditiol 4H-ciclopenta[2,1-b:3,4b’]). O estudo usual de polímeros conjugados é feito de modo a obter sua densidade de estados com diversos tipos e níveis de dopagem. O método de Huckel é o mais utilizado e se baseia na separabilidade das ligações sigma e pi que é possível quando a molécula estudada é plana. Os polímeros conjugados são em sua maioria planos e estão inseridos nesta aproximação. O monômero do BDT apresenta sua geometria fora do plano por apresentar ligações com orbitais sp3. Para contornar esse problema foi desenvolvido o programa B3J, que considera todos os orbitais de valencia (s, px, py e pz). O programa B3J calcula a densidade de estados de sistemas poliméricos. O estudo das bandas do BDT foi feito com este software. Calculamos a densidade de estados do sistema neutro e com diversos níveis de dopagem, com distribuição aleatória e ordenada dos defeitos, dopagem do tipo n e do tipo p. O comportamento do quadrado do coeficiente da expansão da função de onda foi obtido para polímeros de até 20 monômeros. Estes cálculos foram obtidos com geometrias dos métodos AM1 e PM3. Obtivemos os espectros de absorção de oligômeros a fim de inferir seu comportamento para um polímero. Foram utilizados cálculos de otimização de geometria através dos métodos semi-empíricos AM1 e PM3 e ZINDO/S e o método DFT. Em outro objetivo desta monografia há o estudo do aproveitamento de tetrâmeros de BDT como dispositivos eletrônicos. Tais oligômeros foram otimizados em diversos valores de potencial elétrico, com a inserção em suas cadeias de moléculas doadoras e aceitadoras para induzir um aumento no momento de dipolo da mesma.

Obtenção e caracterização de hidrogéis de poliacrilamida-co-metilcelulose como sistemas carreadores de cloridrato de propranolol

Matrizes poliméricas como os hidrogéis são sistemas de liberação controlada que estão sendo largamente utilizados na indústria farmacêutica. Neste trabalho os hidrogéis de PAAm-co-MC foram obtidos e caracterizados afim de carrear o propranolol, fármaco anti-hipertensivo. Os hidrogéis compostos pelos monômeros AAm e MC foram sintetizados por polimerização via radical livre, sendo investigada quatro concentrações de AAm (3,6%; 7,2%; 14,7% e 21,7% m/v). A caracterização dos hidrogéis foi realizada com os estudos de grau de intumescimento, potencial zeta, IR-FT, MEV e análises térmicas (TG, DTA, DTG e DSC). O hidrogel 3,6% apresentou maior grau de intumescimento em todos os meios de análise. O potencial zeta revelou que todos os hidrogéis permanecem próximo do ponto isoelétrico. O espectro de absorção do infravermelho permitiu identificar bandas características, tanto do hidrogel como do propranolol. As curvas de TG dos hidrogéis evidenciaram a degradação dos mesmos em dois estágios, sendo observado na curva DTG a maior perda de massa em torno de 400ºC e as curvas DTA e DSC confirmaram os três eventos endotérmicos. Já o propranolol apresentou um único estágio de degradação e seu pico de fusão foi em 163,4ºC. As microfotografias relevaram a disposição da rede tridimensional dos hidrogéis. A relação da adsorção propranolol/hidrogel foi de 573 mg/g, seguindo o modelo da isoterma de Langmuir. No estudo da cinética de liberação in vitro a liberação do propranolol a partir da matriz do hidrogel foi de aproximadamente 80% do fármaco em 424 horas, apresentando um modelo bimodal. A realização deste trabalho demonstrou que o hidrogel de PAAm-co-MC é um grande promissor para aplicação em sistemas carreadores de fármacos.

Adhesive systems: important aspects related to their composition and clinical use

This literature review article addresses the types and the main components of different etch-and-rinse and self-etch adhesive systems available in the market, and relates them to their function, possible chemical interactions and influence of handling characteristics. Scanning electron microscopy (SEM) images are presented to characterize the interface between adhesives and dentin. Adhesive systems have been recently classifed according to their adhesion approaches in etch-and-rinse, self-etch and glass ionomer. The etch-and-rinse systems require a specifc acid-etch procedure and may be performed in two or three steps. Self-etch systems employ acidic monomers that demineralize and impregnate dental substrates almost at the same time. These systems are separated in one or two steps. Some advantages and defciencies were noted for etch-and-rinse and self-etch approaches, mainly for the simplifed ones due to some chemical associations and interactions. The SEM micrographs illustrate different relationships between adhesive systems and dental structures, particularly dentin. The knowledge of composition, characteristics and mechanisms of adhesion of each adhesive system is of fundamental importance to permit the adoption of ideal bonding strategies under clinical conditions.

Adesão e grau de conversão: efeito das cores da cerâmica e do agente de fixação resinoso

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Production of medium-chain-length polyhydroxyalkanoate by Pseudomonas oleovorans grown in sugary cassava extract supplemented with andiroba oil

Pseudomonas oleovorans were grown on sugary cassava extracts supplemented with andiroba oil for the synthesis of a mediumchain- length polyhydroxyalkanoate (PHA_MCL). The concentration of total sugars in the extract was approximately: 40 g/L in culture 1, 15 g/L in cultures 2 and 3, and 10 g/L in culture 4. Supplementation with 1% andiroba oil and 0.2 g/L of (NH₄)₂HPO₄ was performed 6.5 hours after growth in culture 3, and supplementation with the same amount of andiroba oil and 2.4 g/L of (NH₄)₂HPO₄ was performed at the beginning of growth in culture 4. The synthesis resulted mainly in 3-hydroxy-decanoate and 3-hydroxy-dodecanoate units; 3-hydroxy-butyrate, 3-hydroxy-hexanoate; and 3-hydroxy-octanoate monomers were also produced but in smaller proportions. P. oleovorans significantly accumulated PHA_MCL in the deceleration phase of growth with an oxygen limitation but with sufficient nitrogen concentration to maintain cell growth. The sugary cassava extract supplemented with andiroba oil proved to be a potential substrate for PHA_MCL production.

Síntese e caracterização de novos materiais compósitos orgânicos/inorgânicos, fotopolimerizáveis, para uso em restaurações odontológicas

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Efetividade de vernizes fotopolimerizáveis experimentais na redução da hidrofobicidade e adesão de Candida albicans em uma resina para base de prótese

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Simulação computacional e síntese de polímero molecularmente impresso para extração em fase sólida (MISPE) de ciprofloxacina em urina

Pós-graduação em Química - IQ

Modificação da superfície de óxidos de ferro por dextrana derivatizada para aplicações em liberação de fármaco

Pós-graduação em Química - IQ

Temperature-enhanced synthesis of DMSO-Melanin

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Vegetable Oil Derived Solvent, and Catalyst Free Click Chemistry'' Thermoplastic Polytriazoles

Azide-alkyne Huisgen click chemistry provides new synthetic routes for making thermoplastic polytriazole polymers-without solvent or catalyst. This method was used to polymerize three diester dialkyne monomers with a lipid derived 18 carbon diazide to produce a series of polymers (labelled C18C18, C18C9, and C18C4 based on monomer chain lengths) free of residual solvent and catalyst. Three diester dialkyne monomers were synthesized with ester chain lengths of 4, 9, and 18 carbons from renewable sources. Significant differences in thermal and mechanical properties were observed between C18C9 and the two other polymers. C18C9 presented a lower melting temperature, higher elongation at break, and reduced Young's modulus compared to C18C4 and C18C18. This was due to the odd-even effect induced by the number of carbon atoms in the monomers which resulted in orientation of the ester linkages of C18C9 in the same direction, thereby reducing hydrogen bonding. The thermoplastic polytriazoles presented are novel polymers derived from vegetable oil with favourable mechanical and thermal properties suitable for a large range of applications where no residual solvent or catalyst can be tolerated. Their added potential biocompatibility and biodegradability make them ideal for applications in the medical and pharmaceutical industries.

Thermoplastic polyesters and Co-polyesters derived from vegetable oil: synthesis and optimization of melt polycondensation for medium and long chain poly(omega-hydroxyfatty acid)s and their ester derivatives

The synthesis of a series of omega-hydroxyfatty acid (omega-OHFA) monomers and their methyl ester derivatives (Me-omega-OHFA) from mono-unsaturated fatty acids and alcohols via ozonolysis-reduction/crossmetathesis reactions is described. Melt polycondensation of the monomers yielded thermoplastic poly(omega-hydroxyfatty acid)s [-(CH2)(n)-COO-](x) with medium (n = 8 and 12) and long (n = 17) repeating monomer units. The omega-OHFAs and Me-omega-OHFAs were all obtained in good yield (>= 80%) and purity (>= 97%) as established by H-1 NMR, Fourier Transform infra-red spectroscopy (FT-IR), mass spectroscopy (ESI-MS) and high performance liquid chromatography (HPLC) analyses. The average molecular size (M-n) and distribution (PDI) of the poly(omega-hydroxyfatty acid)s (P(omega-OHFA)s) and poly(omega-hydroxyfatty ester) s (P(Me-omega-OHFA) s) as determined by GPC varied with organo-metallic Ti(IV) isopropoxide [Ti(OiPr)(4)] polycondensation catalyst amount, reaction time and temperature. An optimization of the polymerization process provided P(omega-OHFA) s and P(Me-omega-OHFA) s with M-n and PDI values desirable for high end applications. Co-polymerization of the long chain (n = 12) and medium chain (n = 8) Me-omega-OHFAs by melt polycondensation yielded poly(omega-hydroxy tridecanoate/omega-hydroxy nonanoate) random co-polyesters (M-n = 11000- 18500 g mol(-1)) with varying molar compositions.

Comparative analysis of tandem repeats from hundreds of species reveals unique insights into centromere evolution

Background: Centromeres are essential for chromosome segregation, yet their DNA sequences evolve rapidly. In most animals and plants that have been studied, centromeres contain megabase-scale arrays of tandem repeats. Despite their importance, very little is known about the degree to which centromere tandem repeats share common properties between different species across different phyla. We used bioinformatic methods to identify high-copy tandem repeats from 282 species using publicly available genomic sequence and our own data.Results: Our methods are compatible with all current sequencing technologies. Long Pacific Biosciences sequence reads allowed us to find tandem repeat monomers up to 1,419 bp. We assumed that the most abundant tandem repeat is the centromere DNA, which was true for most species whose centromeres have been previously characterized, suggesting this is a general property of genomes. High-copy centromere tandem repeats were found in almost all animal and plant genomes, but repeat monomers were highly variable in sequence composition and length. Furthermore, phylogenetic analysis of sequence homology showed little evidence of sequence conservation beyond approximately 50 million years of divergence. We find that despite an overall lack of sequence conservation, centromere tandem repeats from diverse species showed similar modes of evolution.Conclusions: While centromere position in most eukaryotes is epigenetically determined, our results indicate that tandem repeats are highly prevalent at centromeres of both animal and plant genomes. This suggests a functional role for such repeats, perhaps in promoting concerted evolution of centromere DNA across chromosomes.