Circulation of Different Lineages of Dengue Virus 2, Genotype American/Asian in Brazil: Dynamics and Molecular and Phylogenetic Characterization

The American/Asian genotype of Dengue virus type 2 (DENV-2) was introduced into the Americas in the 80′s. Although there is no data showing when this genotype was first introduced into Brazil, it was first detected in Brazil in 1990. After which the virus spread throughout the country and major epidemics occurred in 1998, 2007/08 and 2010. In this study we sequenced 12 DENV-2 genomes obtained from serum samples of patients with dengue fever residing in São José do Rio Preto, São Paulo (SJRP/SP), Brazil, in 2008. The whole open reading frame or envelope sequences were used to perform phylogenetic, phylogeographic and evolutionary analyses. Isolates from SJRP/SP were grouped within one lineage (BR3) close to isolates from Rio de Janeiro, Brazil. Isolates from SJRP were probably introduced there at least in 2007, prior to its detection in the 2008 outbreak. DENV-2 circulation in Brazil is characterized by the introduction, displacement and circulation of three well-defined lineages in different times, most probably from the Caribbean. Thirty-seven unique amino acid substitutions were observed among the lineages, including seven amino acid differences in domains I to III of the envelope protein. Moreover, we dated here, for the first time, the introduction of American/Asian genotype into Brazil (lineage BR1) to 1988/89, followed by the introduction of lineages BR2 (1998-2000) and BR3 (2003-05). Our results show a delay between the introduction and detection of DENV-2 lineages in Brazil, reinforcing the importance and need for surveillance programs to detect and trace the evolution of these viruses. Additionally, Brazilian DENV-2 differed in genetic diversity, date of introduction and geographic origin and distribution in Brazil, and these are important factors for the evolution, dynamics and control of dengue. © 2013 Drumond et al.

Comparison of the population biology of Epialtus bituberculatus from two rocky shores with distinct hydrodynamic patterns

The population biology of Epialtus bituberculatus was compared between two different intertidal localities with differing levels of wave exposure. Sampling was conducted monthly between January and December, 2001 on seaweed banks of Sargassum cymosum in the intertidal zone of the rocky shores Grande (GR) (23°23′S-45°03′W) and Domingas Dias (DD) (23°29′S-45°08′W). Four hundred and twenty-eight crabs were captured at the GR site: 111 juvenile males, 106 adult males, 57 juvenile females, 17 adult females and 137 ovigerous females; while 455 specimens were obtained at the DD site: 76 juvenile males, 113 adult males, 37 juvenile females, 40 adult females and 189 ovigerous females. The population from GR showed a non-normal distribution and from DD a normal distribution. The sex-ratio (female/male) was 1:0.97 at GR (χ2 = 0.77, P = 0.084), whereas it was 1:1.41 at DD (χ2 = 13.03, P < 0.001). The largest individuals occurred at DD (U = 78249.0, P < 0.001). The estimated size at sexual maturity was 6.3 and 5.0 mm carapace width (CW) for males, and 5.4 and 5.2 mm CW for females, from GR and DD, respectively. The observed differences in E. bituberculatus between the studied localities might be explained by the different degrees of wave exposure between sites. However, other factors that might also explain the observed differences (e.g. temperature, salinity and food availability) cannot be discarded as relevant in influencing the population structure between sites herein studied. © 2012 Marine Biological Association of the United Kingdom.

Efeito da redução do diâmetro interno sobre o desempenho de um reator aeróbio de leito fluidizado no tratamento de esgoto sanitário

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Influência da relação entre diâmetros no comportamento hidrodinâmico de reatores aeróbios de leito fluidizado com circulação em tubos concêntricos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Uso de flutuadores como ferramenta de avaliação da influência do vento na circulação de uma lagoa de estabilização facultativa primária

Pós-graduação em Engenharia Civil - FEIS

Hydrodynamic modeling and morphological analysis of Lake Água Preta: one of the water sources of Belém-PA-Brazil

The main contribution from this paper includes the hydrodynamic modeling and morphological analysis of Lake Água Preta in Belém city, Pará State, Brazil. The lake bathymetry was taken through the data provided by COSANPA (the local sanitation and water supply company) dating back to 1975, and from a 2009 field study. Both bathymetries produced two terrain elevation models, which were used for morphological analysis and hydrodynamic simulations. The morphological analysis has revealed that, from 1975 to 2009, the annual mean rate of sedimentation varies between 23,065 and 29,081 m3/year. Through this result, the sedimentation time of Lake Água Preta, from 2009, has been calculated, which varies between 295 and 381 years, maintaining the same rate of sedimentation, water consumption and pumping. The hydrodynamic model simulated the depths and velocities, showing a slight flow with velocities ranging from 0 to 33 cm/s. This flow is established between water input and output of the lake, which is used as reservoir of Belém city.

Foraminifera, thecamoebians and palynomorphs as hydrodynamic indicators in Araguari Estuary, Amazonian Coast, Amapá State - Brazil

O regime de macromaré e a pororoca controlam a dinâmica estuarina do Araguari, na qual é muito diferente dos modelos tradicionais dos estuários sob este regime de maré. Objetivando estabelecer zonas estuarinas no Araguari com base em assembléias de foraminíferos, tecamebas, palinomorfos e parâmetros físico-químicos, foram estabelecidas dezesseis estações amostrais ao longo do estuário. A turbidez e a temperatura foram os parâmetros ambientais que permitiram determinar gradiente estuarino. Dezoito espécies de foraminíferos, dez espécies de tecamebas e quatorze espécies de palinomorfos foram identificadas. A análise de agrupamento em modo-R mostrou a existência de assembléias de foraminíferos e quatro de palinomorfos. A análise em CCA demonstrou que a turbidez e a matéria orgânica como os parâmetros de maior influência na distribuição dos foraminíferos tecamebas no Araguari. A análise de agrupamento em Modo-Q usando todos os dados formou quarto grupos de estações que sugerem a existência de três zonas estuarinas: Zona I - composta por tecamebas e palinomorfos continentais; Zona II - compostas por foraminíferos de manguezal, acritacos e todas as assembléias de palinomorfos; e Zona III - composta por foraminíferos de manguezal e estuarinos e por todas as assembléias de palinomorfos.

Circulation and salt intrusion in the Piaçaguera Channel, Santos (SP)

A análise de dados termohalinos e correntes medidos em uma estação fixa no Canal de Piaçaguera (Estuário de Santos) no inverno foi feita em termos de condições cíclicas da maré (quadratura e sizígia) e quase-estacionária, com o objetivo de caracterizar a estratificação da massa de água estuarina, sua circulação e transporte de sal forçados pela modulação quinzenal da maré. Foram utilizados métodos clássicos de análise de dados observacionais horários e quase sinóticos e de simulações analíticas de perfis estacionários de salinidade e do componente longitudinal da velocidade. Durante o ciclo de maré de quadratura as velocidades de enchente (v<0) e vazante (v>0) variaram de -0.20 m/s a 0.30 m/s, associadas à pequena variação de salinidade entre a superfície e o fundo (26.4 psu a 30.7 psu). No ciclo de sizígia a velocidade aumentou de -0.40 m/s a 0.45 m/s, mas a estratificação de salinidade permaneceu praticamente a mesma. Os perfis estacionários teóricos de salinidade e de velocidade apresentaram boa concordância (Skill próximo a 1,0) quando comparados aos perfis observacionais. Durante a modulação quinzenal da maré não houve alteração na classificação do canal estuarino (tipo 2a-parcialmente misturado e fracamente estratificado), pois a taxa de aumento da energia potencial não foi suficiente para ocasionar a erosão da haloclina. Esses resultados, associados à alta estabilidade vertical (RiL >20) e ao número de Richardson estuarino (1,6), permitem as seguintes conclusões: i) o mecanismo que forçou a circulação e os processos de mistura foi principalmente o balanço da descarga fluvial com a maré, associado ao componente baroclínico da força de gradiente de pressão; ii) não houve variações nas principais características termohalinas e da circulação devido à modulação quinzenal da maré; e iii) os perfis quase estacionários de salinidade e da velocidade foram adequadamente simulados com um modelo analítico clássico.

Prediction of the combustion process in fluidized bed based on physical-chemical properties of biomass particles and their hydrodynamic behaviors

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Sildenafil citrate on retrobulbar and retinal circulation of rabbits

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)