New genes for focal epilepsies with speech and language disorders.

The last 2 years have seen exciting advances in the genetics of Landau-Kleffner syndrome and related disorders, encompassed within the epilepsy-aphasia spectrum (EAS). The striking finding of mutations in the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor subunit gene GRIN2A as the first monogenic cause in up to 20 % of patients with EAS suggests that excitatory glutamate receptors play a key role in these disorders. Patients with GRIN2A mutations have a recognizable speech and language phenotype that may assist with diagnosis. Other molecules involved in RNA binding and cell adhesion have been implicated in EAS; copy number variations are also found. The emerging picture highlights the overlap between the genetic determinants of EAS with speech and language disorders, intellectual disability, autism spectrum disorders and more complex developmental phenotypes.

Nouveautés dans l'ostéogenèse imparfaite: de la recherche à la prise en charge multidisciplinaire [News in osteogenesis imperfecta: from research to clinical management]

Osteogenesis imperfecta (OI) is a rare genetic disease. Today we are able to propose an adapted and efficient management to the patients with this rare disorder (and their families) thanks to a strong collaboration of clinicians and researchers. Recent knowledge regarding the genetics of OI permits an accurate diagnosis of the specific type of OI and its own molecular mechanism, a genetic counseling for family planning and prenatal diagnosis, and in addition more targeted therapeutic options. A specific support with re-education for patients with OI is necessary and efficient. To optimize patient care, a multidisciplinary consultation is proposed at the CHUV, moreover a web site is available for patients, families and therapists: www.infomaladiesrares.ch

The risk factors for fractures and trabecular bone-score value in patients with endogenous Cushing's syndrome.

In a cohort study of 182 consecutive patients with active endogenous Cushing's syndrome, the only predictor of fracture occurrence after adjustment for age, gender bone mineral density (BMD) and trabecular bone score (TBS) was 24-h urinary free cortisol (24hUFC) levels with a threshold of 1472 nmol/24 h (odds ratio, 3.00 (95 % confidence interval (CI), 1.52-5.92); p = 0.002). INTRODUCTION: The aim was to estimate the risk factors for fracture in subjects with endogenous Cushing's syndrome (CS) and to evaluate the value of the TBS in these patients. METHODS: All enrolled patients with CS (n = 182) were interviewed in relation to low-traumatic fractures and underwent lateral X-ray imaging from T4 to L5. BMD measurements were performed using a DXA Prodigy device (GEHC Lunar, Madison, Wisconsin, USA). The TBS was derived retrospectively from existing BMD scans, blinded to clinical outcome, using TBS iNsight software v2.1 (Medimaps, Merignac, France). Urinary free cortisol (24hUFC) was measured by immunochemiluminescence assay (reference range, 60-413 nmol/24 h). RESULTS: Among enrolled patients with CS (149 females; 33 males; mean age, 37.8 years (95 % confidence interval, 34.2-39.1); 24hUFC, 2370 nmol/24 h (2087-2632), fractures were confirmed in 81 (44.5 %) patients, with 70 suffering from vertebral fractures, which were multiple in 53 cases; 24 patients reported non-vertebral fractures. The mean spine TBS was 1.207 (1.187-1.228), and TBS Z-score was -1.86 (-2.07 to -1.65); area under the curve (AUC) was used to predict fracture (mean spine TBS) = 0.548 (95 % CI, 0.454-0.641)). In the final regression model, the only predictor of fracture occurrence was 24hUFC levels (p = 0.001), with an increase of 1.041 (95 % CI, 1.019-1.063), calculated for every 100 nmol/24-h cortisol elevation (AUC (24hUFC) = 0.705 (95 % CI, 0.629-0.782)). CONCLUSIONS: Young patients with CS have a low TBS. However, the only predictor of low traumatic fracture is the severity of the disease itself, indicated by high 24hUFC levels.

Determinação do teor de cálcio em comprimido à base de lactato de cálcio utilizado no tratamento da osteoporose

The present study utilized thermogravimetry (TG) and optical emission spectrometry with inductively coupled plasma (ICP/OES) to determine the amount of calcium in calcium lactate tablets used in the treatment of osteoporosis. Thermogravimetry results indicated that the decomposition temperature of CaCO3 occurred at 603.9 and 609.4 ºC in the samples of calcium lactate and tablets, respectively. The calcium content obtained by TG for the tablets sample showed a similar result to that disclosed by ICP-OES, indicating a value of 8.93% for both techniques.

Concepts in plant disease resistance

Resistance to nearly all pathogens occurs abundantly in our crops. Much of the resistance exploited by breeders is of the major gene type. Polygenic resistance, although used much less, is even more abundantly available. Many types of resistance are highly elusive, the pathogen apparently adapting very easily them. Other types of resistance, the so-called durable resistance, remain effective much longer. The elusive resistance is invariably of the monogenic type and usually of the hypersensitive type directed against specialised pathogens. Race-specificity is not the cause of elusive resistance but the consequence of it. Understanding acquired resistance may open interesting approaches to control pathogens. This is even truer for molecular techniques, which already represent an enourmously wide range of possibilities. Resistance obtained through transformation is often of the quantitative type and may be durable in most cases.

Uusintamurtumien ehkäisy kaatumisen aiheuttaman yläraajamurtuman kokeneilla yli 50-vuotiailla henkilöillä

Tarkoitus: Tarkoituksena oli selvittää murtumien tehostetun ehkäisyohjelman vaikutuksia yläraajamurtuman saaneiden yli 50-vuotiaiden henkilöiden elämäntapoihin, murtumien riskitekijöihin, kaatumisiin, kaatumisvammoihin ja elämänlaatuun. Aineisto: 219 yli 50-vuotiasta kotona asuvaa, kaatumisen seurauksena yläraajamurtuman saanutta henkilöä satunnaistettiin koe- (n = 105) ja kontrolliryhmiin (n = 114). Menetelmä: Koeohjelma sisälsi yksilöllisen, yhdessä lääkärin, terveydenhoitajan ja tutkittavan kanssa laaditun hoito- ja kuntoutussuunnitelman sekä kutsun murtumien ehkäisyn koulutusohjelmaan. Kontrolliryhmän tutkittavat saivat kehotuksen hakeutua murtumahoitajan ohjaukseen. Seuranta-aika oli 14 kuukautta. Tulokset analysoitiin ryhmissä tapahtuneina muutoksina alkuja loppumittausten välillä sekä ryhmien välisenä erona muutoksissa. Tulokset: Keskimääräinen luun tiheys lannerangassa lisääntyi koeryhmässä (p<0,001) ja kontrolliryhmässä (p = 0,038), ryhmien välinen ero ei ollut tilastollisesti merkitsevä (p = 0,134). Reisiluun kaulassa luun tiheys ei muuttunut kummassakaan ryhmässä. Päivittäinen kalsiumin saanti lisääntyi koeryhmässä keskimäärin 167 mg (p<0,001) ja kontrolliryhmässä 30 mg (p = 0,475), ryhmien välinen ero oli tilastollisesti merkitsevä (p = 0,031). Kala-ateriat ja päivittäinen D-vitamiinilisä sekä kenkien liukuesteiden säännöllinen käyttö liukkaalla lisääntyivät molemmissa ryhmissä, mutta ryhmien välillä ei ollut eroa. Viiteen tuolilta nousukertaan käytetty aika vähentyi koeryhmässä keskimäärin 0,49 sekuntia (p = 0,185) ja lisääntyi kontrolliryhmässä 0,39 (p = 0,475), ero ryhmien välillä oli tilastollisesti merkitsevä (p = 0,02). Kymmenen metrin kävelyssä ei tapahtunut tulosten keskiarvossa muutoksia kummassakaan ryhmässä. Ortostatismi vähentyi kontrolliryhmässä (p = 0,049), ja masentuneisuus vähentyi koeryhmässä (p = 0,041), mutta ryhmien välillä ei näissä ollut merkitsevää eroa. Osteoporoosilääkkeiden käyttö lisääntyi molemmissa ryhmissä, ryhmien välillä ei ollut eroa. Alkoholin käytössä oli vähäisiä mutta ei merkittäviä muutoksia. Muissa testatuissa muuttujissa, kuten liikunnan viikoittainen määrä, tupakointi, näkökyky, tasapaino ja elämänlaatu, ei ollut merkitseviä muutoksia ryhmissä tai ryhmien välillä. Kaatumisten (koeryhmä 33, kontrolliryhmä 35) ja murtumien (koeryhmä 5 ja kontrolliryhmä 3) määrissä ei myöskään ollut merkitseviä eroja ryhmien välillä. Johtopäätökset: Noin neljällä viidestä kaatumisen seurauksena yläraajamurtuman saaneista, yli 50 vuotta täyttäneistä henkilöistä oli alentunut luun tiheys, ja noin joka toisella oli lisääntynyt kaatumisriski. Kaatumisen riskitekijöiden kliiniset mittaukset olivat nopeita toteuttaa ja auttoivat ehkäisytoimenpiteiden suunnittelussa. Murtuman saaneet olivat motivoituneita murtumien riskitekijöiden selvittämiseen ja myös toteuttamaan annettua lääkehoitoa. Elämäntavoissa helpoimmin toteutuivat muutokset ruokailutottumuksissa. Liikuntatottumuksien muuttaminen sen sijaan onnistui melko huonosti. Ryhmien välillä oli merkitsevä ero ainoastaan kalsiumin päivittäisessä käytössä ja tuolilta nousutestissä. Murtumariskien tunnistaminen, niiden syiden selvittäminen ja toimenpiteiden käynnistäminen riskien vähentämiseksi tulisi kuulua jokaisen pienienergisen murtuman saaneen potilaan kokonaisvaltaiseen hyvään hoitoon.

Parathyroid hormone secretion in chronic human endogenous hypercortisolism

Osteoporosis is a common manifestation of Cushing's syndrome, but the mechanisms responsible for this abnormality have not been defined. With the objective of analyzing parathyroid hormone (PTH) secretion in chronic hypercortisolism (CH), we evaluated 11 healthy subjects and 8 patients with CH, 6 with Cushing's disease and 2 with adrenal adenoma. These volunteers were submitted to tests of PTH stimulation through hypocalcemia (EDTA), PTH suppression through hypercalcemia (iv and oral calcium), and evaluation of bone mineral density (BMD) by DEXA. During the test of PTH stimulation, the calcium and magnesium concentrations of the normal and CH groups were similar. Patients with CH showed an increased PTH response to the hypocalcemic stimulus compared to controls. PTH values were significantly higher in the CH group at 70 (17.5 ± 3.5 vs 10.2 ± 1.3 pmol/l, P = 0.04), and 120 min (26.1 ± 5.9 vs 11.3 ± 1.9 pmol/l, P = 0.008) of EDTA infusion. The area under the curve for PTH during EDTA infusion was also significantly higher in patients with CH than in normal subjects (1867 ± 453 and 805 ± 148 pmol l-1 2 h-1, P = 0.02). During the test of PTH suppression, calcium, magnesium and PTH levels of the patients with hypercortisolism and controls were similar. BMD was decreased in patients with hypercortisolism in the spine (0.977 ± 0.052 vs 1.205 ± 0.038 g/cm² in controls, P<0.01). In conclusion, our results show that subjects with CH present decreased bone mass mainly in trabecular bone. The use of dynamic tests permitted the detection of increased PTH secretion in response to a hypocalcemic stimulus in CH patients that may probably be involved in the occurrence of osteoporosis in this state.

Electrical field stimulation improves bone mineral density in ovariectomized rats

Osteoporosis and its consequent fractures are a great social and medical problem mainly occurring in post-menopausal women. Effective forms of prevention and treatment of osteoporosis associated with lower costs and the least side effects are needed. Electrical fields are able to stimulate osteogenesis in fractures, but little is known about their action on osteoporotic tissue. The aim of the present study was to determine by bone densitometry the effects of electrical stimulation on ovariectomized female Wistar rats. Thirty rats (220 ± 10 g) were divided into three groups: sham surgery (SHAM), bilateral ovariectomy (OVX) and bilateral ovariectomy + electrical stimulation (OVX + ES). The OVX + ES group was submitted to a 20-min session of a low-intensity pulsed electrical field (1.5 MHz, 30 mW/cm²) starting on the 7th day after surgery, five times a week (total = 55 sessions). Global, spine and limb bone mineral density were measured by dual-energy X-ray absorptiometry (DXA Hologic 4500A) before surgery and at the end of protocol (84 days after surgery). Electrical stimulation improved (P < 0.05) global (0.1522 ± 0.002), spine (0.1502 ± 0.003), and limb (0.1294 ± 0.003 g/cm²) bone mineral density compared to OVX group (0.1447 ± 0.001, 0.1393 ± 0.002, and 0.1212 ± 0.001, respectively). The OVX + ES group also showed significantly higher global bone mineral content (9.547 ± 0.114 g) when compared to both SHAM (8.693 ± 0.165 g) and OVX (8.522 ± 0.207 g) groups (P < 0.05). We have demonstrated that electrical fields stimulate osteogenesis in ovariectomized female rats. Their efficacy in osteoporosis remains to be demonstrated.

Bone metabolism and vascular calcification

Osteoporosis and atherosclerosis are chronic degenerative diseases which have been considered to be independent and whose common characteristic is increasing incidence with age. At present, growing evidence indicates the existence of a correlation between cardiovascular disease and osteoporosis, irrespective of age. The morbidity and mortality of osteoporosis is mainly related to the occurrence of fractures. Atherosclerosis shows a high rate of morbidity and especially mortality because of its clinical repercussions such as angina pectoris, acute myocardial infarction, stroke, and peripheral vascular insufficiency. Atherosclerotic disease is characterized by the accumulation of lipid material in the arterial wall resulting from autoimmune and inflammatory mechanisms. More than 90% of these fatty plaques undergo calcification. The correlation between osteoporosis and atherosclerosis is being established by studies of the underlying physiopathological mechanisms, which seem to coincide in many biochemical pathways, and of the risk factors for vascular disease, which have also been associated with a higher incidence of low-bone mineral density. In addition, there is evidence indicating an action of antiresorptive drugs on the reduction of cardiovascular risks and the effect of statins, antihypertensives and insulin on bone mass increase. The mechanism of arterial calcification resembles the process of osteogenesis, involving various cells, proteins and cytokines that lead to tissue mineralization. The authors review the factors responsible for atherosclerotic disease that correlate with low-bone mineral density.

Women with primary ovarian insufficiency have lower bone mineral density

The aim of the present study was to assess the prevalence of osteoporosis in a sample of 32 patients with spontaneous primary ovarian insufficiency (POI) in comparison to reference groups of 25 pre- and 55 postmenopausal women. Hip (lumbar) and spinal bone mineral density (BMD) measurements were performed by dual-energy X-ray absorptiometry in the three groups. The median age of POI patients at the time of diagnosis was 35 years (interquartile range: 27-37 years). The mean ± SD age of postmenopausal reference women (52.16 ± 3.65 years) was higher than that of POI (46.28 ± 10.38 years) and premenopausal women (43.96 ± 7.08; P = 0.001) at the time of BMD measurement. Twenty-seven (84.4%) POI women were receiving hormone replacement therapy (HRT) at the time of the study. In the postmenopausal reference group, 30.4% were current users of HRT. Lumbar BMD was significantly lower in the POI group (1.050 ± 0.17 g/cm²) compared to the age-matched premenopausal reference group (1.136 ± 0.12 g/cm²; P = 0.040). Moreover, 22 (68.7%) POI women had low bone density (osteopenia/osteoporosis by World Health Organization criteria) versus 47.3% of the postmenopausal reference group (P = 0.042). In conclusion, the present data indicate that BMD is significantly lower in patients with POI than in age-matched premenopausal women. Also, the prevalence of osteopenia/osteoporosis is higher in POI women than in women after natural menopause. Early medical interventions are necessary to ensure that women with POI will maintain their bonemass.

Cues to action : do they result in belief and behavioural change in women?

With incidence rates of osteoporosis increasing (Osteoporosis Canada, 2007), preventative efforts to minimize costs associated with condition diagnosis are a public health priority. Cues to action are specific internal (e.g., physical symptoms, family member with a condition) or external stimuli (e.g., public service announcements, health education campaigns) that are necessary to trigger appropriate health behaviours and serve to create an awareness of the health threat (Mattson, 1999). To date, limited understanding of the scope of influence cues to action have on health beliefs and behaviour associated with osteoporosis is known. The present investigation was designed to address this gap in the literature. More specifically, the influence of cues to action, a public service announcement (PSA) developed by Osteoporosis Canada and a bone screening by way of Quantitative Ultrasound, on health beliefs and health-enhancing physical activity (HEPA) across a four week period was investigated. Peri-and postmenopausal women (N= 174) were randomly assigned to one of three conditions 1) an osteoporosis public service announcement (PSA) condition; 2) a bone screening condition via quantitative ultrasound techniques, and 3) a PSA attention control condition. Health beliefs associated with osteoporosis were taken at three time points: prior to the cue to action intervention, immediately following the intervention, and four weeks post intervention. Knowledge of osteorporosis risk factors and HEP A were assessed pre and post-intervention only. Results of a regression analysis suggested that baseline health beliefs predicted baseline HEPA (R2 adj = .24; F (9, 161) = 6.49,p = .000; 95% CI = .12 - .35) with exercise barriers (p = -.33) being a negative predictor and health motivation (p = .21) being a positive predictor of HEP A. Baseline health beliefs predicted With incidence rates of osteoporosis increasing (Osteoporosis Canada, 2007), preventative efforts to minimize costs associated with condition diagnosis are a public health priority. Cues to action are specific internal (e.g., physical symptoms, family member with a condition) or external stimuli (e.g., public service announcements, health education campaigns) that are necessary to trigger appropriate health behaviours and serve to create an awareness of the health threat (Mattson, 1999). To date, limited understanding of the scope of influence cues to action have on health beliefs and behaviour associated with osteoporosis is known. The present investigation was designed to address this gap in the literature. More specifically, the influence of cues to action, a public service announcement (PSA) developed by Osteoporosis Canada and a bone screening by way of Quantitative Ultrasound, on health beliefs and health-enhancing physical activity (HEPA) across a four week period was investigated. Peri-and postmenopausal women (N= 174) were randomly assigned to one of three conditions 1) an osteoporosis public service announcement (PSA) condition; 2) a bone screening condition via quantitative ultrasound techniques, and 3) a PSA attention control condition. Health beliefs associated with osteoporosis were taken at three time points: prior to the cue to action intervention, immediately following the intervention, and four weeks post intervention. Knowledge of osteorporosis risk factors and HEP A were assessed pre and post-intervention only. Results of a regression analysis suggested that baseline health beliefs predicted baseline HEPA (R2 adj = .24; F (9, 161) = 6.49,p = .000; 95% CI = .12 - .35) with exercise barriers (p = -.33) being a negative predictor and health motivation (p = .21) being a positive predictor of HEP A. Baseline health beliefs predicted

Interventions visant à améliorer la détection et le traitement de l’ostéoporose en soins de première ligne

Introduction : L’ostéoporose constitue un problème de santé publique important vu les conséquences graves des fractures ostéoporotiques. Toutefois, le dépistage et le traitement de l’ostéoporose sont grandement sous-optimaux. De nouvelles interventions visant à améliorer le dépistage et le traitement de l’ostéoporose sont donc nécessaires. Objectifs : L’objectif global de ce programme de recherche était d’évaluer quelles avenues devraient être privilégiées pour le développement de futures interventions visant à améliorer le dépistage et le traitement de l’ostéoporose en soins de première ligne. Pour ce faire, trois projets ont été réalisés, dont les objectifs étaient les suivants : 1) évaluer l’impact d’un atelier de formation offert à des médecins de famille sur les pratiques préventives associées à l’ostéoporose (premier projet de recherche); 2) évaluer l’efficacité globale des interventions dans le domaine de l’ostéoporose en soins de première ligne (deuxième projet de recherche); et 3) explorer les perceptions des pharmaciens communautaires, des directeurs d’agences de santé publique et du Ministère de la santé et des services sociaux du Québec (MSSSQ) concernant le rôle des pharmaciens dans la prévention des maladies et la promotion de la santé et spécifiquement dans le domaine de l’ostéoporose et de la prévention des chutes (troisième projet de recherche). Méthodologie : D’abord, une étude de cohorte a été réalisée avec les données administratives de la Régie de l’assurance maladie du Québec (premier projet de recherche). Ensuite, une revue systématique avec méta-analyse concernant l’efficacité des interventions visant à améliorer le dépistage et le traitement de l’ostéoporose en soins de première ligne a été effectuée (deuxième projet de recherche). Finalement, une étude transversale avec volet qualitatif a été réalisée chez des pharmaciens communautaires, des directeurs d’agences de santé publique et la directrice de la prévention des maladies chroniques du MSSSQ (troisième projet de recherche). Résultats : Dans le premier projet de recherche, bien que la participation des médecins de famille à l’atelier entraînait une amélioration des pratiques préventives liées à l’ostéoporose, celles-ci sont demeurées grandement sous-optimales. Au niveau du deuxième projet de recherche, il a été observé que les interventions comprenant plusieurs composantes et ciblant les médecins de famille et leurs patients pouvaient améliorer les pratiques préventives de l’ostéoporose, mais ces améliorations étaient souvent modestes du point de vue clinique. Finalement, le troisième projet de recherche a démontré que les pharmaciens communautaires, les directeurs d’agences de santé publique et la direction de la prévention des maladies chroniques du MSSSQ considèrent que les pharmaciens devraient jouer un rôle significatif dans la prévention des maladies et la promotion de la santé et spécifiquement dans le domaine de l’ostéoporose et de la prévention des chutes. Néanmoins, à cause de nombreuses barrières organisationnelles, un large écart existe entre le niveau d’implication idéal et réel des pharmaciens dans l’offre de ces services. Conclusion : Les futures interventions à être développées devront être multidisciplinaires, comprendre plusieurs composantes et cibler les barrières à l’application des recommandations des guides de pratiques cliniques. L’implication plus intensive des pharmaciens communautaires et des infirmières cliniciennes constitue une avenue particulièrement intéressante pour le développement de futures interventions.

Finding genetic elements that head to the autistic phenotype

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.

Identification et caractérisation d’une souris mutante Skam26Jus comme un nouveau modèle des anomalies du tube neural

Les anomalies du tube neural (ATN) sont des malformations congénitales très fréquentes chez l’humain en touchant 1-2 nouveau-nés sur 1000 naissances. Elles résultent d’une fermeture incomplète du tube neural lors de l’embryogenèse. L’étiologie des ATN est complexe impliquant des facteurs environnementaux et des facteurs génétiques. La souris représente un outil puissant afin de mieux comprendre la génétique des ATN. Particulièrement, la souris modèle a impliqué fortement la voie de la polarité cellulaire planaire (PCP) dans ces malformations. Dans cette étude, nous avons identifié et caractérisé une nouvelle souris mutante, Skam26Jus dans le but d’identifier un nouveau gène causant les ATN. Skam26Jus a été générée par l’agent mutagène N-Ethyl-N-Nitrosuera. Cette souris est caractérisée par une queue en forme de boucle ou de crochet, soit un phénotype associé aux ATN. La complémentation génétique de la souris Skam26Jus avec une souris mutante d’un gène de la voie PCP Vangl2 (Looptail) a montré une interaction génétique entre le gène muté chez Skam26Jus et Vangl2, suggérant que ces deux gènes fonctionnent dans des voies de signalisation semblables ou parallèles. Un total de 50% des embryons doubles hétérozygotes avec un phénotype de la queue présentent un spina bifida. La cartographie par homozygotie du génome entier suivie par un clonage positionnel a permis d’identifier Lrp6 comme le gène muté chez Skam26Jus. Une mutation homozygote, p.Ile681Arg, a été identifiée dans Lrp6 chez les souris ayant une queue en boucle/crochet. Cette mutation était absente dans 30 souches génétiques pures indiquant que cette mutation est spécifique au phénotype observé. Une étude de phénotype-génotype évalue la pénétrance à 53 % de la mutation Ile681Arg. Lrp6 est connu pour activer la voie canonique Wnt/β-caténine et inhiber la voie non canonique Wnt/PCP. Le séquençage de la région codante et de la jonction exon-intron de LRP6 chez 268 patients a mené à l’identification de quatre nouvelles rares mutations faux sens absentes chez 272 contrôles et de toutes les bases de données publiques. Ces mutations sont p.Tyr306His ; p.Tyr373Cys ; p.Val1386Ile; p.Tyr1541Cys et leur pathogénicité prédite in silico indiquent que p.Val1386Ile est bénigne, et que p.Tyr306Hiset p.Tyr373Cys et p.Tyr1541Cys sont i possiblement dommageables. Les mutations p.Tyr306His, p.Tyr373Cys et p.Tyr1541Cys ont affecté l’habilité de LRP6 d’activer la voie Wnt/β-caténine en utilisant le système rapporteur luciférase de pTOPflash. Nos résultats suggèrent que LRP6 joue un rôle dans le développement des ATN chez une petite fraction de patients ayant une ATN. Cette étude présente aussi Skam26Jus comme un nouveau modèle pour étudier les ATN chez l’humain et fournit un outil important pour comprendre les mécanismes moléculaires à l’origine des A TN.

Approches bio-informatiques appliquées aux technologies émergentes en génomique

Les études génétiques, telles que les études de liaison ou d’association, ont permis d’acquérir une plus grande connaissance sur l’étiologie de plusieurs maladies affectant les populations humaines. Même si une dizaine de milliers d’études génétiques ont été réalisées sur des centaines de maladies ou autres traits, une grande partie de leur héritabilité reste inexpliquée. Depuis une dizaine d’années, plusieurs percées dans le domaine de la génomique ont été réalisées. Par exemple, l’utilisation des micropuces d’hybridation génomique comparative à haute densité a permis de démontrer l’existence à grande échelle des variations et des polymorphismes en nombre de copies. Ces derniers sont maintenant détectables à l’aide de micropuce d’ADN ou du séquençage à haut débit. De plus, des études récentes utilisant le séquençage à haut débit ont permis de démontrer que la majorité des variations présentes dans l’exome d’un individu étaient rares ou même propres à cet individu. Ceci a permis la conception d’une nouvelle micropuce d’ADN permettant de déterminer rapidement et à faible coût le génotype de plusieurs milliers de variations rares pour un grand ensemble d’individus à la fois. Dans ce contexte, l’objectif général de cette thèse vise le développement de nouvelles méthodologies et de nouveaux outils bio-informatiques de haute performance permettant la détection, à de hauts critères de qualité, des variations en nombre de copies et des variations nucléotidiques rares dans le cadre d’études génétiques. Ces avancées permettront, à long terme, d’expliquer une plus grande partie de l’héritabilité manquante des traits complexes, poussant ainsi l’avancement des connaissances sur l’étiologie de ces derniers. Un algorithme permettant le partitionnement des polymorphismes en nombre de copies a donc été conçu, rendant possible l’utilisation de ces variations structurales dans le cadre d’étude de liaison génétique sur données familiales. Ensuite, une étude exploratoire a permis de caractériser les différents problèmes associés aux études génétiques utilisant des variations en nombre de copies rares sur des individus non reliés. Cette étude a été réalisée avec la collaboration du Wellcome Trust Centre for Human Genetics de l’University of Oxford. Par la suite, une comparaison de la performance des algorithmes de génotypage lors de leur utilisation avec une nouvelle micropuce d’ADN contenant une majorité de marqueurs rares a été réalisée. Finalement, un outil bio-informatique permettant de filtrer de façon efficace et rapide des données génétiques a été implémenté. Cet outil permet de générer des données de meilleure qualité, avec une meilleure reproductibilité des résultats, tout en diminuant les chances d’obtenir une fausse association.