Spanish multicenter study of the epidemiology and mechanisms of amoxicillin-clavulanate resistance in Escherichia coli.

We conducted a prospective multicenter study in Spain to characterize the mechanisms of resistance to amoxicillin-clavulanate (AMC) in Escherichia coli. Up to 44 AMC-resistant E. coli isolates (MIC ≥ 32/16 μg/ml) were collected at each of the seven participant hospitals. Resistance mechanisms were characterized by PCR and sequencing. Molecular epidemiology was studied by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and by multilocus sequence typing. Overall AMC resistance was 9.3%. The resistance mechanisms detected in the 257 AMC-resistant isolates were OXA-1 production (26.1%), hyperproduction of penicillinase (22.6%), production of plasmidic AmpC (19.5%), hyperproduction of chromosomic AmpC (18.3%), and production of inhibitor-resistant TEM (IRT) (17.5%). The IRTs identified were TEM-40 (33.3%), TEM-30 (28.9%), TEM-33 (11.1%), TEM-32 (4.4%), TEM-34 (4.4%), TEM-35 (2.2%), TEM-54 (2.2%), TEM-76 (2.2%), TEM-79 (2.2%), and the new TEM-185 (8.8%). By PFGE, a high degree of genetic diversity was observed although two well-defined clusters were detected in the OXA-1-producing isolates: the C1 cluster consisting of 19 phylogroup A/sequence type 88 [ST88] isolates and the C2 cluster consisting of 19 phylogroup B2/ST131 isolates (16 of them producing CTX-M-15). Each of the clusters was detected in six different hospitals. In total, 21.8% of the isolates were serotype O25b/phylogroup B2 (O25b/B2). AMC resistance in E. coli is widespread in Spain at the hospital and community levels. A high prevalence of OXA-1 was found. Although resistant isolates were genetically diverse, clonality was linked to OXA-1-producing isolates of the STs 88 and 131. Dissemination of IRTs was frequent, and the epidemic O25b/B2/ST131 clone carried many different mechanisms of AMC resistance.

Prospective multicenter study of the impact of carbapenem resistance on mortality in Pseudomonas aeruginosa bloodstream infections.

The impact of antimicrobial resistance on clinical outcomes is the subject of ongoing investigations, although uncertainty remains about its contribution to mortality. We investigated the impact of carbapenem resistance on mortality in Pseudomonas aeruginosa bacteremia in a prospective multicenter (10 teaching hospitals) observational study of patients with monomicrobial bacteremia followed up for 30 days after the onset of bacteremia. The adjusted influence of carbapenem resistance on mortality was studied by using Cox regression analysis. Of 632 episodes, 487 (77%) were caused by carbapenem-susceptible P. aeruginosa (CSPA) isolates, and 145 (23%) were caused by carbapenem-resistant P. aeruginosa (CRPA) isolates. The median incidence density of nosocomial CRPA bacteremia was 2.3 episodes per 100,000 patient-days (95% confidence interval [CI], 1.9 to 2.8). The regression demonstrated a time-dependent effect of carbapenem resistance on mortality as well as a significant interaction with the Charlson index: the deleterious effect of carbapenem resistance on mortality decreased with higher Charlson index scores. The impact of resistance on mortality was statistically significant only from the fifth day after the onset of the bacteremia, reaching its peak values at day 30 (adjusted hazard ratio for a Charlson score of 0 at day 30, 9.9 [95% CI, 3.3 to 29.4]; adjusted hazard ratio for a Charlson score of 5 at day 30, 2.6 [95% CI, 0.8 to 8]). This study clarifies the relationship between carbapenem resistance and mortality in patients with P. aeruginosa bacteremia. Although resistance was associated with a higher risk of mortality, the study suggested that this deleterious effect may not be as great during the first days of the bacteremia or in the presence of comorbidities.

Lactococcus garvieae endocarditis in a native valve identified by MALDI-TOF MS and PCR-based 16s rRNA in Spain: A case report.

Lactococcus garvieae is a Gram-positive, catalase negative coccus arranged in pairs or short chains, well-known as a fish pathogen. We report a case of Infective Endocarditis (IE) by L. garvieae in a native valve from a 68-year-old male with unknown history of contact with raw fish and an extensive history of heart disease. This case highlights the reliability of MALDI-TOF MS compared to conventional methods in the identification of rare microorganisms like this.

Impact of inadequate empirical therapy on the mortality of patients with bloodstream infections: a propensity score-based analysis.

The impact of the adequacy of empirical therapy on outcome for patients with bloodstream infections (BSI) is key for determining whether adequate empirical coverage should be prioritized over other, more conservative approaches. Recent systematic reviews outlined the need for new studies in the field, using improved methodologies. We assessed the impact of inadequate empirical treatment on the mortality of patients with BSI in the present-day context, incorporating recent methodological recommendations. A prospective multicenter cohort including all BSI episodes in adult patients was performed in 15 hospitals in Andalucía, Spain, over a 2-month period in 2006 to 2007. The main outcome variables were 14- and 30-day mortality. Adjusted analyses were performed by multivariate analysis and propensity score-based matching. Eight hundred one episodes were included. Inadequate empirical therapy was administered in 199 (24.8%) episodes; mortality at days 14 and 30 was 18.55% and 22.6%, respectively. After controlling for age, Charlson index, Pitt score, neutropenia, source, etiology, and presentation with severe sepsis or shock, inadequate empirical treatment was associated with increased mortality at days 14 and 30 (odds ratios [ORs], 2.12 and 1.56; 95% confidence intervals [95% CI], 1.34 to 3.34 and 1.01 to 2.40, respectively). The adjusted ORs after a propensity score-based matched analysis were 3.03 and 1.70 (95% CI, 1.60 to 5.74 and 0.98 to 2.98, respectively). In conclusion, inadequate empirical therapy is independently associated with increased mortality in patients with BSI. Programs to improve the quality of empirical therapy in patients with suspicion of BSI and optimization of definitive therapy should be implemented.

Use of Granada medium to detect group B streptococcal colonization in pregnant women.

Direct inoculation onto Granada medium (GM) in plates and tubes was compared to inoculation into a selective Todd-Hewitt broth (with 8 microg of gentamicin per ml and 15 microg of nalidixic acid per ml) for detection of group B streptococci (GBS) in pregnant women with 800 vaginal and 450 vaginoanorectal samples. Comparatively, GM was found to be as sensitive as the selective broth for the detection of GBS in vaginal specimens and more sensitive than selective broth for the detection of GBS in vaginoanorectal samples (96 versus 82%). The use of GM improved the time to reporting of a GBS-positive result by at least 24 h and reduced the direct cost of screening. We have also found that the inconvenience of anaerobic incubation of GM plates can be avoided when a cover slide is placed upon the inoculum, because aerobic incubation in GM plates with cover slides causes GBS to develop the same pigmentation that it develops with incubation under anaerobic conditions. These data support the routine use of GM plates or tubes as a more accurate, easier, and cheaper method of identification of GBS-colonized women compared to the enrichment broth technique.

Endocarditis caused by nonhemolytic group B streptococcus.

We report a case of bacterial endocarditis caused by nonhemolytic group B streptococcus (GBS) in a 67-year-old man with no predisposing risk factors. Nonhemolytic GBS strains rarely cause illness and are usually detected in perinatal infections. We believe this to be the first reported case of endocarditis caused by a nonhemolytic strain of GBS.

Prospective multicenter study of the impact of carbapenem resistance on mortality in Pseudomonas aeruginosa bloodstream infections.

The impact of antimicrobial resistance on clinical outcomes is the subject of ongoing investigations, although uncertainty remains about its contribution to mortality. We investigated the impact of carbapenem resistance on mortality in Pseudomonas aeruginosa bacteremia in a prospective multicenter (10 teaching hospitals) observational study of patients with monomicrobial bacteremia followed up for 30 days after the onset of bacteremia. The adjusted influence of carbapenem resistance on mortality was studied by using Cox regression analysis. Of 632 episodes, 487 (77%) were caused by carbapenem-susceptible P. aeruginosa (CSPA) isolates, and 145 (23%) were caused by carbapenem-resistant P. aeruginosa (CRPA) isolates. The median incidence density of nosocomial CRPA bacteremia was 2.3 episodes per 100,000 patient-days (95% confidence interval [CI], 1.9 to 2.8). The regression demonstrated a time-dependent effect of carbapenem resistance on mortality as well as a significant interaction with the Charlson index: the deleterious effect of carbapenem resistance on mortality decreased with higher Charlson index scores. The impact of resistance on mortality was statistically significant only from the fifth day after the onset of the bacteremia, reaching its peak values at day 30 (adjusted hazard ratio for a Charlson score of 0 at day 30, 9.9 [95% CI, 3.3 to 29.4]; adjusted hazard ratio for a Charlson score of 5 at day 30, 2.6 [95% CI, 0.8 to 8]). This study clarifies the relationship between carbapenem resistance and mortality in patients with P. aeruginosa bacteremia. Although resistance was associated with a higher risk of mortality, the study suggested that this deleterious effect may not be as great during the first days of the bacteremia or in the presence of comorbidities.

Factor pronóstico del estado mutacional de BRAF en pacientes afectos de melanoma metastásico

Las mutaciones del BRAF sobreactivan la vía MAPK, estimulando así el crecimiento de las células de melanoma. En este estudio retrospectivo analizamos el estado mutacional de BRAF de 25 pacientes con melanoma metastásico con el objetivo de determinar su frecuencia y su repercusión clínica. El 52% de los pacientes presentaban mutación del BRAF, siendo estos diagnosticados a unas edades más jóvenes y en estadios más tempranos. Sin embargo, en nuestra experiencia, en los pacientes afectos de melanoma metastásico el estatus de portador de mutación de BRAF no confería una mayor supervivencia global.

Understanding the two-component sensing System of virulent bacteria

Report for the scientific sojourn carried out at the l’ Institute for Computational Molecular Science of the Temple University, United States, from 2010 to 2012. Two-component systems (TCS) are used by pathogenic bacteria to sense the environment within a host and activate mechanisms related to virulence and antimicrobial resistance. A prototypical example is the PhoQ/PhoP system, which is the major regulator of virulence in Salmonella. Hence, PhoQ is an attractive target for the design of new antibiotics against foodborne diseases. Inhibition of the PhoQ-mediated bacterial virulence does not result in growth inhibition, presenting less selective pressure for the generation of antibiotic resistance. Moreover, PhoQ is a histidine kinase (HK) and it is absent in animals. Nevertheless, the design of satisfactory HK inhibitors has been proven to be a challenge. To compete with the intracellular ATP concentrations, the affinity of a HK inhibidor must be in the micromolar-nanomolar range, whereas the current lead compounds have at best millimolar affinities. Moreover, the drug selectivity depends on the conformation of a highly variable loop, referred to as the “ATP-lid, which is difficult to study by X-Ray crystallography due to its flexibility. I have investigated the binding of different HK inhibitors to PhoQ. In particular, all-atom molecular dynamics simulations have been combined with enhanced sampling techniques in order to provide structural and dynamic information of the conformation of the ATP-lid. Transient interactions between these drugs and the ATP-lid have been identified and the free energy of the different binding modes has been estimated. The results obtained pinpoint the importance of protein flexibility in the HK-inhibitor binding, and constitute a first step in developing more potent and selective drugs. The computational resources of the hosting institution as well as the experience of the members of the group in drug binding and free energy methods have been crucial to carry out this work.

Situação epidemiológica das meningites por haemophilus influenzae b na Direção Regional de Piracicaba - São Paulo

O presente estudo objetivou caracterizar a população acometida por meningites por Hib em relação às variáveis demográficas e relativas ao processo saúde-doença, no período de 1992 a 2001, na DIR de Piracicaba, SP, Brasil. Os dados foram coletados a partir de fichas de notificação compulsória, sendo sistematizados através do Programa SINAN. Observou-se que ocorreu um pico de incidência da doença em 1994, e um pico de óbitos em 1999, anteriores à introdução da vacina. Os mais acometidos foram crianças menores de 5 anos, do sexo masculino, confirmando dados de literatura. A maioria dos pacientes foi atendida em unidades hospitalares públicas de Piracicaba e Limeira, referências para as comunidades desses municípios, concretizando um dos princípios do Sistema Único de Saúde (SUS): a regionalização. A introdução da vacina promoveu redução dos casos em cerca de 73%, o que corrobora a sua importância e impele à necessidade de estimular a adesão à vacinação.

Aspectos epidemiológicos da ocorrência do Enterococcus resistente a Vancomicina

Estudo descritivo realizado em um hospital público, de maio de 2005 a outubro de 2007. Objetivou-se determinar os aspectos epidemiológicos que envolvem o Enterococcus resistente à vancomicina (VRE) e descrever a evolução dos pacientes. Os dados foram coletados de registros em prontuários. Após a coleta, as informações foram processadas no SPSS. Usou-se a distribuição de frequência e medidas de tendência central. Participaram do estudo 122 pacientes. A maioria foi do sexo masculino, com idade média de 43 anos (DP= 18,8). A infecção por VRE foi desenvolvida por 16,3%. O antimicrobiano mais usado previamente à identificação do VRE foi a vancomicina (62,3%); 97,5% foram submetidos aos procedimentos invasivos; 45,0% eram dependentes de cuidados intensivos de enfermagem; 77,9% tinham pelo menos uma ferida aberta, e 50,8% evoluíram a óbito. Esses dados sugerem que recomendações de controle da resistência bacteriana devem ser encorajadas diuturnamente, visando à redução da mortalidade, morbidade, custos hospitalares e, consequentemente, uma melhor qualidade da assistência ao paciente.

Superfícies do ambiente hospitalar como possíveis reservatórios de bactérias resistentes: uma revisão

O principal objetivo deste estudo é identificar, na literatura, artigos sobre a ocorrência de contaminação das superfícies inanimadas e uma possível disseminação de bactérias resistentes no ambiente hospitalar. Realizou-se um levantamento bibliográfico de artigos publicados nas bases de dados LILACS, MEDLINE, Science Direct, SCOPUS e ISI Web of Knowledge, entre 2000 e 2008. Foram selecionados e analisados vinte e um artigos. Nos estudos analisados, realçou-se a presença de bactérias em monitores, grades de cama, mesas, torneiras, telefones, teclados de computador e outros objetos. Houve predominância de Staphylococcus aureus resistente à meticilina, Clostridium difficile, Acine-to-bacter baumannii e Enterococcus resistentes à vancomicina, sendo fator preditivo a ocupação prévia por pacientes colonizados por tais microrganismos. Verificou-se semelhança entre as cepas isoladas de pacientes colonizados e/ou infectados e as cepas do ambiente por tipificação molecular. Essas evidências reforçam a necessidade de conhecimento e controle de fontes de patógenos no ambiente hospitalar.

Classificação Internacional das Práticas de Enfermagem em Saúde Coletiva - CIPESC®: instrumento pedagógico de investigação epidemiológica

A CIPESC® é um instrumento de trabalho do enfermeiro em Saúde Coletiva, que visa apoiar a sistematização de sua prática assistencial, gerencial e de investigação. É também, instrumental pedagógico potente para a formação e qualificação de enfermeiros comprometidos com o SUS. No ensino das doenças transmissíveis, o uso da CIPESC® auxilia a análise sobre as intervenções, ao estimular o raciocínio clínico e epidemiológico do processo saúde-doença e das necessidades de saúde dos indivíduos, famílias e grupos sociais. Com o propósito de desenvolver recursos didáticos para graduação de enfermagem e estimular a reflexão sobre o processo de trabalho de enfermagem, este artigo apresenta o relato de uma experiência de aplicação da CIPESC®, tomando como exemplo a meningite meningocócica.

Corrimentos vaginais em gestantes: comparacao da abordagem sindromica com exames da pratica clinica da enfermagem

Estudo avaliativo de abordagem quantitativa, com amostra de 104 gestantes, com o objetivo de comparar os achados de infecções vaginais em gestantes obtidos por meio do fluxograma de corrimento vaginal com exames presentes na prática clínica da Enfermagem. Os dados foram coletados por meio de entrevista e exame ginecológico realizados de janeiro a julho de 2011. O fluxograma não se mostrou eficaz na identificação de candidíase e tricomoníase, apresentou baixa sensibilidade (0,0%; 50%) e valor preditivo positivo (0,0%; 3,6%) para as duas infecções e baixa especificidade para tricomoníase (46%). Mostrou-se satisfatório para vaginose bacteriana, com alta sensibilidade (100%), valor preditivo negativo (100%) e acurácia (74%). Conclui-se que o emprego do fluxograma precisa ser reavaliado, visto que não foi eficaz em identificar infecções importantes em gestantes. Os esforços para o desenvolvimento de testes eficazes devem ser contínuos, com intuito de prevenir a disseminação de infecções e reduzir tratamentos desnecessários.

Caracterização laboratorial de amostras de expectoração e pesquisa de Bacilo Álcool-ácido Resistente na Delegacia de saúde da Praia

As infecções do tracto respiratório (ITR) são responsáveis por números significativos de morbidade e mortalidade. Dentre as doenças causadas por infecção bacteriana, a tuberculose é a que mais preocupa as autoridades de saúde pública, uma vês que possui risco de proliferar para diferentes órgãos (tuberculose extrapulmonar) e também ser transmitido principalmente por via aérea. A análise de expectoração através da observação directa é a primeira etapa no diagnóstico de série de infecções de tracto respiratório, tanto através da coloração de Gram como a coloração de Ziehl- Neelsen, sendo um método simples, económico, rápido e de fácil execução, servindo de base para a avaliação da amostra de expectoração através da coloração de gram. Este estudo teve como principal objectivo a caracterização laboratorial de amostra de expectoração e pesquisa de bacilo de tuberculose nas amostras recebidas no laboratório da Delegacia de Saúde da Praia e outros agentes patogénicos respiratórios através da coloração de gram e coloração de Ziehl Neelsen nas amostras. Aplicou-se também um questionário à população em estudo. Foram analisadas 513 amostras de expectoração no período compreendido entre Junho a Setembro de 2011. Das amostras analisadas detectou-se 39 casos positivos de tuberculose, sendo a maioria pertencentes aos pacientes do sexo masculino e idade compreendida entre 1457 anos, residentes em Achada Santo António e Ponta D`Agua, e a maioria declaram consumir bebidas alcoólicas. Em maioria das amostras positivas observou-se grande quantidade de Bacilos Álcool-ácido resistente correspondendo ao critério 2 + e 3 + da OMS e score +1, +2 e +3 de Bartlett. A maioria das amostras positiva possuía cor esverdeada e muito viscosa. Através da coloração de gram detectou-se em maioria das amostras presença de diplococos gram positivos lanceolados sugestivos de Streptococcus pneumoniae. Conclui-se que 8% dos casos positivos estava associada a presença elevada de leucócitos (superior de 25 leucócitos por campo) e a maioria das amostras verificou-se presença de outros microrganismos patogénicos (não bacilo álcool ácido resistente), revelando assim a importância da coloração de gram na análise de expectoração.